Məlumat

8.14A: Crenarchaeota-nın yaşayış yerləri və enerji mübadiləsi - Biologiya

8.14A: Crenarchaeota-nın yaşayış yerləri və enerji mübadiləsi - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Crenarchaeota geniş yaşayış mühitində mövcuddur və maddələr mübadiləsində çox müxtəlif kimyəvi reaksiyalar nümayiş etdirir.

Öyrənmə Məqsədləri

  • Crenarchaeota tərəfindən istifadə edilən müxtəlif enerji mübadiləsi növlərini təsvir edin

Əsas Nöqtələr

  • İlk kəşf edilən arxeylər ekstremofillər idi.
  • Extremophile archaea dörd əsas fizioloji qrupun üzvləridir: halofillər, termofillər, qələvilər və asidofillər.
  • Bəzi arxeylər enerjini kükürd və ya ammonyak kimi qeyri-üzvi birləşmələrdən əldə edirlər (onlar litotroflardır).
  • Arxeyaların digər qrupları günəş işığından enerji mənbəyi (fototroflar) və ya atmosferdə karbon mənbəyi (avtotroflar) kimi CO2 kimi istifadə edirlər.

Əsas Şərtlər

  • ekstremofil: Ekstremal temperatur, duzluluq və s. şəraitdə yaşayan orqanizm. Onlar oxşar şəraitdə fəaliyyət göstərən fermentlərin mənbəyi kimi kommersiya baxımından vacibdir.
  • fototrof: Enerji əldə etmək üçün foton tutma həyata keçirən orqanizm. Müxtəlif hüceyrə metabolik prosesləri həyata keçirmək üçün işıq enerjisindən istifadə edirlər.
  • avtotrof: Enerji mənbəyi kimi istilik və ya işıqdan istifadə edərək qeyri-üzvi maddələrdən qidasını sintez edə bilən hər hansı bir orqanizm.

Crenarchaeota ya Arxe krallığının bir filumu, ya da öz krallığında təsnif edilən Arxeylərdir. Arxeyalar geniş yaşayış mühitində mövcuddur və qlobal ekosistemlərin əsas hissəsi kimi onlar yerin biokütləsinin 20%-ni təşkil edə bilər.

İlk kəşf edilən arxeylər ekstremofillər idi. Həqiqətən də, bəzi arxeya geyzerlərdə, qara siqaret çəkənlərdə və neft quyularında olduğu kimi, çox vaxt 100 °C-dən (212 °F) yuxarı olan yüksək temperaturda sağ qalır. Digər ümumi yaşayış yerlərinə çox soyuq yaşayış yerləri və yüksək duzlu, turşu və ya qələvi su daxildir. Bununla belə, arxeya mülayim şəraitdə, bataqlıqda, kanalizasiya sularında, okeanlarda və torpaqlarda böyüyən mezofilləri də əhatə edir.

Extremophile archaea dörd əsas fizioloji qrupun üzvləridir. Bunlar bunlardır:

  • halofillər
  • termofillər
  • alkalifillər
  • asidofillər

Bəzi arxeyalar bir neçə qrupa aid olduğu üçün bu qruplar hərtərəfli və ya filum-spesifik deyil, nə də bir-birini istisna edir. Buna baxmayaraq, onlar halofillərin duz gölləri kimi həddindən artıq duzlu mühitlərdə yaşadığı təsnifat üçün faydalı başlanğıc nöqtəsidir. Termofillər 45 °C-dən (113 °F) yuxarı temperaturda, məsələn, isti bulaqlar kimi yerlərdə daha yaxşı inkişaf edir; hipertermofil arxelər 80 °C-dən (176 °F) yüksək temperaturda optimal şəkildə böyüyür. Digər arxeylər çox turşu və ya qələvi şəraitdə mövcuddur.

Bu yaxınlarda bir sıra tədqiqatlar göstərdi ki, arxelər təkcə mezofil və termofilik mühitlərdə mövcud deyil, həm də soyuq okean mühitlərində olduğu kimi bəzən yüksək sayda, aşağı temperaturda da mövcuddur.

Kimyəvi reaksiyalar və enerji mənbələri

Arxeya maddələr mübadiləsində çox müxtəlif kimyəvi reaksiyalar nümayiş etdirir və bir çox enerji mənbəyindən istifadə edir. Bu reaksiyalar enerji və karbon mənbələrindən asılı olaraq qida qruplarına təsnif edilir.

Bəzi arxeylər əldə edirlər qeyri-üzvi birləşmələrdən enerji məsələn, kükürd və ya ammonyak (onlar litotroflardır). Bunlara nitrifikatorlar, metanogenlər və anaerob metan oksidləşdiricilər daxildir. Bu reaksiyalarda bir birləşmə elektronları digərinə keçir (redoks reaksiyasında), hüceyrənin fəaliyyətini təmin etmək üçün enerji buraxır. Bir birləşmə elektron donor, digəri isə elektron qəbuledici rolunu oynayır. Buraxılan enerji, eukaryotik hüceyrələrin mitoxondrisində baş verən eyni əsas prosesdə kemiosmoz vasitəsilə adenozin trifosfat (ATP) yaradır.

Arxeylərin digər qruplarından istifadə edirlər enerji mənbəyi kimi günəş işığı (fototroflar). Bununla belə, oksigen yaradan fotosintez bu orqanizmlərin heç birində baş vermir. Bir çox əsas metabolik yollar həyatın bütün formaları arasında paylaşılır; məsələn, arxeylər qlikolizin dəyişdirilmiş formasından (Entner-Doudoroff yolu) və ya tam və ya qismən limon turşusu dövründən istifadə edirlər. Digər orqanizmlərlə olan bu oxşarlıqlar, yəqin ki, həm həyatın ilkin mənşəyini, həm də onların yüksək effektivlik səviyyəsini əks etdirir.

Bəzi Euryarchaeota var metanogenlər bataqlıqlar kimi anaerob mühitlərdə yaşayır. Maddələr mübadiləsinin bu forması erkən inkişaf etmişdir və hətta ilk sərbəst yaşayan orqanizmin metanogen olması da mümkündür. Ümumi bir reaksiya hidrogeni oksidləşdirmək üçün karbon dioksidin elektron qəbuledicisi kimi istifadəsini əhatə edir. Metanogenez koenzim M və metanofuran kimi bu arxeyalara xas olan bir sıra koenzimləri əhatə edir. Bu reaksiyalar bağırsaqda yaşayan arxeyalarda yaygındır. Sirkə turşusu həm də asetotrofik arxelərlə birbaşa metana və karbon qazına parçalanır. Bu asetotroflar Methanosarcinales sırasındakı arxeylərdir və bioqaz istehsal edən mikroorqanizmlər icmasının əsas hissəsidir.

Arxeyanın digər istifadəsi CO2 atmosferdə karbon mənbəyi kimi, karbon fiksasiyası adlanan prosesdə (onlar avtotroflardır). Bu proses ya Kalvin dövrünün yüksək dərəcədə dəyişdirilmiş formasını, ya da 3-hidroksipropionat/4-hidroksibutirat dövrü adlanan bu yaxınlarda kəşf edilmiş metabolik yolu əhatə edir. Crenarchaeota da əks Krebs dövründən istifadə edir, Euryarchaeota da reduktiv asetil-KoA yolundan istifadə edir. Karbon fiksasiyası qeyri-üzvi enerji mənbələri hesabına həyata keçirilir. Heç bir məlum arxeya fotosintez aparmır.

Arxeal enerji mənbələri son dərəcə müxtəlifdir və ammonyakın Nitrosopumilales tərəfindən oksidləşməsindən tutmuş, elektron qəbulediciləri kimi oksigen və ya metal ionlarından istifadə edərək, Sulfolobus növləri tərəfindən hidrogen sulfid və ya elementar kükürdün oksidləşməsinə qədər dəyişir.

Fototrofik arxeylərdən istifadə kimyəvi enerji istehsal etmək üçün işıq ATP şəklində. Halobakteriyalarda bakteriorhodopsin və halorhodopsin kimi işıqla aktivləşdirilmiş ion nasosları plazma membranı vasitəsilə hüceyrədən ionları çıxararaq ion qradiyenti yaradır. Bu elektrokimyəvi qradiyentlərdə saxlanılan enerji daha sonra ATP sintaza (fotofosforilasiya) tərəfindən ATP-yə çevrilir.

Bəzi dəniz Crenarchaeota qadirdir nitrifikasiya, bu orqanizmlərin okean azot dövrünə təsir göstərə biləcəyini təklif edir, baxmayaraq ki, bu okean Crenarchaeota başqa enerji mənbələrindən də istifadə edə bilər. Dəniz dibini əhatə edən çöküntülərdə çoxlu sayda arxeya da rast gəlinir, bu orqanizmlər okean dibinin 1 metrdən çox dərinliklərində yaşayan canlı hüceyrələrin əksəriyyətini təşkil edir.


Termoproteallar

aid viruslar Tristromaviridae ailə Thermoproteales sırasının neytrofilik hipertermofillərini yoluxdurur və bir və ya hər iki ucuna bağlanmış terminal filamentləri olan bir qədər çevik filamentvari virionlara malikdir (Baquero et al., 2020 Rensen et al., 2016 Wang et al., 2020c) və hostun bağlanması ilə cavabdehdir. 4 pili yazın (Wang et al., 2020b). Başlanğıcda müəyyən edilə bilən ardıcıllıq oxşarlığının olmaması səbəbindən digər məlum viruslarla təkamüllə əlaqəsi olmadığı düşünülsə də (Rensen et al., 2016), Pyrobaculum filamentous virus 2-nin kriyo-EM strukturu rudiviruslar və lipotriks virusları ilə gözlənilməz əlaqəni üzə çıxarmışdır. və başqaları, 2020c). Tristromavirusların nukleokapsid nüvəsi lipotriksviruslarda olduğu kimi eyni ümumi prinsipdən istifadə edərək, eyni α-spiral qatı olan heterodimerlərdən qurulur (şək. 6 I–K). Xətti dsDNA genomu da sıxlaşdırılır və A-forma uyğunlaşmasında saxlanılır (Şəkil 6 J–L) (Wang et al., 2020c). A-formalı DNT-nin həm neytrofilik (Thermoproteales) və həm də asidofil (Sulfolobales) sahiblərini yoluxduran hipertermofil virusların (yəni, filamentli və ikozahedral virionlarla) təkamüllə əlaqəsi olmayan iki nəsildə olması A-formalı DNT-nin crenarchaeal adaptasiyası olduğunu göstərir. virusları aşağı pH-dan daha çox həddindən artıq temperaturlara (Wang et al., 2020c). Xüsusilə, lipotriksviruslardan fərqli olaraq, tristromavirusların zərfinin lipid seçimi üçün filamentli zərflənmiş virusların istifadə etdiyi mexanizmlərin müxtəlifliyini vurğulayaraq, ana membranla eyni qalınlığa və lipid tərkibinə malikdir (Rensen et al., 2016).


Nitrifikasiya və əlaqədar proseslər üzrə tədqiqat, B hissəsi

Graeme W. Nicol, James I. Prosser, Methods in Enzymology, 2011

2.6.2 Təhlili hcd genlər

4-Hidroksibutiril-KoA dehidratazası (4HCD) 4-hidroksibutiril-KoA-nın krotonil-KoA-ya çevrilməsini katalizləyir və krenarxeal sifarişlərdə bildirilmişdir. Sulfoloballar, Desulfurokokkalar , və Termoproteallar, euryarxeal sifarişlər ArxeoqloballarTermoplazmatallar (Berg və b., 2007), thaumarchaea (Hallam və b., 2006 Uoker və b., 2010) və bəzi bakteriyalar. Bununla belə, vacib olan odur ki, ACCase kodlayan genlərdən fərqli olaraq, 4HCD məcburi orqanotrofik arxelərdə tapılmamışdır və buna görə də avtotrof populyasiyaları aşkar etmək üçün daha uyğun bir marker ola bilər. Offre və b. (2010) üç dəst hazırlamışdır hcd klon kitabxanalarının qurulması üçün primerlər, DGGE tərəfindən icma təhlili və həm quru, həm də su mühitində ehtimal olunan avtotrof taumarxiyanın qPCR analizi. təfərrüatları hcd primerlər Cədvəl 1.1-də verilmişdir. hcd götürülən DNT üzərində analizlər aparılıb N. maritimus və torpaqlar və çöküntülər daxil olmaqla müxtəlif yaşayış yerlərindən. istifadə edərək klon kitabxanaları quruldu

850-bp hcd Hcd-465F və hcd-1267R primerlərindən istifadə edərək, filogenetik analizi yerinə yetirməzdən əvvəl gücləndirilmiş PCR məhsulları (Şəkil 1.1). Fərqli yaşayış yerləri ilə əlaqəli fərqli filogenetik klasterlər müşahidə edildi ki, bu genin fərqli avtotrof taumarxeal icmaların filogenetik təhlili üçün uyğun bir marker olduğunu nümayiş etdirdi. Ətraf mühit nümunələrindən alınan DGGE profilləri, həmçinin primerlərin etibarlılığına inamı təmin edən filogenetik analizdən əldə edilənlərə ekvivalent olan potensial ətraf mühitə xas icmaları göstərdi. hcd-911F və hcd-1267R primerləri qPCR gücləndirilməsi üçün istifadə edilmişdir (bax. Bölmə 4), 400-bp fraqmenti yaradan hcd genlər və gücləndirmə effektivliyi 98,4%-dən çox olan SybrGreenI qPCR analizləri üçün uyğundur və r 2 dəyər > 0,999.

Şəkil 1.1. Craibstone torpağından (pH 7) və Ythan çayı intertidal estuarine çöküntüsündən əldə edilən HCD protein ardıcıllığının Bayesian filogenetik təhlili. Bu təhlil birmənalı şəkildə düzülmüş 260 mövqedə aparılıb və müxtəlif yaşayış yerləri ilə əlaqəli ardıcıllığın qruplaşdırılması göstərir ki, hcd gen müxtəlif avtotrof taumarxeal populyasiyaları ayırd etmək üçün olduqca uyğun bir markerdir. Arxa ehtimallar və üç yükləmə metodundan (ML, parsimony və məsafə) ən mühafizəkar dəyər müvafiq olaraq əsas ardıcıllıq qruplarının qovşaqlarının yuxarısında və altında göstərilir.

(Offre-dən uyğunlaşdırılmışdır və b., 2010, icazə ilə.)

Dizayn hcd primerlər hazırda mədəni thaumarchaea və ətraf mühit genomlarının olmaması ilə məhdudlaşır. Offre tərəfindən istifadə olunan primerlər və b. (2010) yaxşı spesifiklik göstərdi, lakin dəniz mənşəli yalnız yeddi ardıcıllığa əsaslanırdı. Onlar icma strukturunun və ətraf mühit nümunələrində bolluğun təhlili üçün səmərəli idi, lakin turşu torpaq nümunələri üçün təkrarlanma qabiliyyəti aşağı idi. Bu, torpaq ardıcıllığının əhatə dairəsinin aşağı ola biləcəyini və daha da inkişaf etdiyini göstərir hcd becərilən orqanizmlərdən və ətraf mühit tədqiqatlarından əlavə ardıcıllıqlar əldə olunduğu üçün geniş mühitlərdə tətbiq üçün primerlər tələb olunacaq.


Materiallar və metodlar

Filogenomik ağac quruluşu və molekulyar tarix təhlili

77 tək nüsxəli gen ailəsindən olan amin turşusu ardıcıllığı IQ-Tree (v1.6.2) [24] ilə maksimum ehtimallı (ML) filogenomik ağac quruluşu üçün birləşdirildi. Bu ailələrin hər biri əsasən 64 AOA Thaumarchaeota, 17 AOA Thaumarchaeota, 13 Aigarchaeota, 13 Bathyarchaeota, 21 Crenarchaeota və 38 Euryarchaeota tərəfindən paylaşıldı. İstifadə olunan genomların tam siyahısı Cədvəl S1-də, istifadə olunan tək gücləndirilmiş genomlar (SAGs) və metagenom yığılmış genomlar (MAG) üçün metaməlumatlar [25] Cədvəl S2-də verilmişdir.

Daha sonra, MCMCTree [26] ilə MCMCTree [26] ilə ML birləşdirilən ağac üzərində Thaumarchaeota divergensiya vaxtının Bayes hesablamaları aparıldı, kalibrləmə olaraq arxa kökün vaxtı və bir neçə krenarxeotalın diversifikasiya vaxtı kimi bir neçə müvəqqəti məhdudiyyətdən (Cədvəl S3) istifadə edildi. nəsillər. Ya 3,8-2,7 milyard il əvvələ aid olan yeni bir kök (Gya) [27], ya da 4,38-3,46 Gya [28] qədim kökdən istifadə edilmişdir. Krenarxeotal diversifikasiya hadisələrinin vaxt məhdudiyyətləri müxtəlif nəsillər üçün fərqləndirici xüsusiyyətlərdən irəli gəlirdi. Məsələn, hər ikisi TermoproteallarSulfoloballar Çox güman ki, Böyük Oksigenləşmə Hadisəsindən (GOE) sonra yaranmışdır, çünki onlar oksigeni terminal elektron qəbuledicisi kimi istifadə edirlər [29]. Bu kalibrləmələrin qeyri-müəyyənliyini nəzərə alaraq, biz tanışlıq təhlillərində bu iki növ məhdudiyyətin müxtəlif birləşmələrindən istifadə etdik. Euryarchaeota [29] üçün dərc edilmiş başqa məhdudiyyətlər də olmuşdur, lakin bu məhdudiyyətlər burada istifadə edilməmişdir, çünki Arxeyanın kökünün Euryarchaeota daxilində olub-olmaması olduqca mübahisəli olaraq qalır [30,31,32,33]. Əlavə texniki təfərrüatlar Əlavə Metodlarda verilmişdir.

Thaumarchaeota təkamülündə Bakteriyalardan LGT-nin rolunun qiymətləndirilməsi

Bakteriyalardan Thaumarchaeotaya qədər olan LGT hadisələrinin Thaumarchaeota-nın təkamülü və uyğunlaşması üçün həlledici əhəmiyyət kəsb etdiyi təklif edilmişdir [15,16,17, 34]. Potensial LGT hadisələrini çıxarmaq üçün iki tamamlayıcı yanaşmadan istifadə etdik. Birincisi, biz gen filogeniyasından asılı olmayan gen mövcudluğu/yoxluğu modelindən istifadə edərək potensial LGT hadisələri haqqında nəticə çıxardıq. Məsələn, LGT hadisələri həyat tərzinin qeyri-AOA üzvlərindən AOA-ya keçidi zamanı baş vermiş ola bilər ki, əgər gen ailəsi qeyri-AOA üzvlərindən olub, lakin AOA üzvləri arasında yayılmışdır. LGT hadisələri yaşayış mühitinin genişlənməsi (yerdən dayaz okeana və dayaz okeandan dərin okeana) zamanı da baş verə bilər, əgər gen ailəsi köhnə yaşayış mühitindəki üzvlərdə olmasa da, yeni yaşayış mühitindəki üzvlər arasında universal olaraq mövcuddursa. Maraqlanan gen ailəsi mövcudluq/yoxluq nümunəsinə əsaslanaraq potensial LGT kimi müəyyən edildikdən sonra, bu gen ailəsinin ehtimal olunan Bakteriya mənşəyi IQ-Tree istifadə edərək ML filogenetik analizi vasitəsilə müəyyən edilmişdir. İkinci üsul, Arxeal Clusters of Orthologous Groups (arCOGs) verilənlər bazasına uyğunlaşdırdığımız 1346 gen ailəsinin ML gen ağaclarını sistematik şəkildə təhlil edərək potensial LGT hadisələrini aşkar etdi [35]. Biz təhlilin bu hissəsini həyata keçirərkən Thaumarchaeota, Aigarchaeota və Bathyarchaeota genomlarının bir çoxu mövcud deyildi, beləliklə, 63 AOA Thaumarchaeota, 14 Crenarchaeota, 32 Euryarchaeota və 19 Bakteriyadan ibarət azaldılmış genomik məlumat dəsti istifadə edilmişdir. Bundan əlavə, Thaumarchaeota [17]-dən ehtimal edilən fosmid klon ardıcıllığının böyük kolleksiyası daxil edilmişdir. Əlavə texniki təfərrüatlar Əlavə Metodlarda verilmişdir.


Ekologiya

Bəzi diplomonadlar sərbəst yaşayır və durğun şirin suda ümumi ola bilər, lakin əksəriyyəti heyvanların bağırsaqlarında kommensaldır. Bəziləri parazitdir və insanlarda xəstəliyə səbəb olur, diplomonad Giardia bağırsağı yoluxdurur və ishala səbəb ola bilər (limblioz və ya "gəzinti ishali" kimi tanınan xəstəlik). Hexamita 50330 qızılbalıqda məlum parazitdir. Diplomonadlar çox müxtəlifdir, o cümlədən müxtəlif patogenlər və bir neçə sərbəst yaşayan formalar. Budur, balıqda tapılan bəzi diplomonadlar.


Staphylothermus marinusun tam genom ardıcıllığı heterotrof Crenarchaeota arasında kükürd mübadiləsində fərqləri aşkar edir.

Fon
Staphylothermus marinus, Crenarchaeota arxeal filumunun anaerob, kükürd azaldan peptid fermentatorudur. O, üçüncü heterotrof, məcburi kükürd azaldan krenarxeotdur və üç genomun müqayisəli təhlili üçün imkan yaradır.

Nəticələr
Hipertermofil crenarchaeote Staphylothermus marinusun 1,57 Mbp genomu tamamilə ardıcıllıqla sıralanıb. Əsas enerji yaradan yollar, ehtimal ki, 2-oksoturşu: ferredoksin oksidoreduktazaları və ADP əmələ gətirən asetil-KoA sintazalarını əhatə edir. S. marinus digər krenarxeotlarda olmayan bir neçə fermentə malikdir, o cümlədən amin turşularının parçalanmasında iştirak edə bilən natrium ionunu köçürən dekarboksilaza. S. marinus-da sekvensləşmiş digər iki kükürd azaldan krenarxeotlarda olan kükürd azaldan fermentlər yoxdur - Thermofilum pendens və Hyperthermus butylicus. Əvəzində Pyrococcus furiosusun mbh və mbx operonlarına bənzər üç operona malikdir, bu da kükürdün azaldılması və/və ya hidrogen istehsalında rol oynaya bilər. İki dəniz orqanizmi, S. marinus və H. butylicus, T. pendens-dən daha çox natriumdan asılı daşıyıcıya malikdir və kaliumun udulması üçün simporterlərdən istifadə edir, T. pendens isə ATP-dən asılı kalium daşıyıcısından istifadə edir. T. pendens qida ilə zəngin mühitə uyğunlaşdı, H. butylicus isə qida ilə zəngin mühitə uyğunlaşdı və S. marinus bu iki ifrat arasında yerləşir.

Nəticə
Üç heterotrofik kükürd reduksiya edən krenarxeotlar daşıyıcı tərkibinə görə öz yaşayış yerlərinə, quruya və dənizə uyğunlaşdılar və onlar həmçinin müxtəlif səviyyəli qida maddələrinə malik mühitlərə uyğunlaşdılar. Onların hamısının kükürddən elektron qəbuledicisi kimi istifadə etməsinə baxmayaraq, onların kükürdün azaldılması üçün müxtəlif yolları ola bilər.


Təşəkkürlər

MDU-dan olan müəlliflər Enerji Departamentinin (DOE) - Birgə Genom İnstitutu İcma Sıralama Proqramının (CSP 787081), NASA Exobiology (Termal Biologiya İnstitutu, MSU vasitəsilə), NSF IGERT (0654336), DOE-Sakit Okean Şimal-Qərb Milli Laboratoriyasının dəstəyini yüksək qiymətləndirirlər. subpodrat № 112443), Montana Kənd Təsərrüfatı Təcrübə Stansiyası (911300), konfokal mikroskopiyada yardım və təlim üçün B Pitts (Biofilm Mühəndisliyi Mərkəzi) və YNP-də bu işə icazə vermək üçün C Hendrix və T Olliff (İcazə YELL-2007 -SCI-5068). Birgə Genom İnstitutu (DE-AC02-05CH11231) və Sakit Okeanın Şimal-Qərb Milli Laboratoriyası (Foundational Scientific Focus Area) tərəfindən aparılan iş Genomik Elm Proqramı, Bioloji və Ətraf Mühitin Tədqiqatları İdarəsi, ABŞ DOE tərəfindən dəstəklənir.


16S rRNT-nin ardıcıllığı Termosfera bu təcridin qrupun üzvü olduğunu göstərdi Crenarchaeota və yaxından bağlıdır StafilotermDesulfurococcus.

Hüceyrələri Termosfera kokklar (sferik) olur və eksponensial artım fazasında üzüməbənzər aqreqatlar əmələ gətirirlər. Gec loqarifmik və stasionar böyümə fazalarında bəzi tək hüceyrələr də daxil olmaqla daha kiçik qruplar görünürdü. Aqreqatların bir neçə flagella tək hüceyrəsinin səkkizə qədər ola biləcəyi göstərildi. Hüceyrə zərfi sitoplazmatik membranı örtən amorf təbəqədir. 92 C-dən yuxarı olan temperatur, kükürd və hidrogen kimi böyüməni maneə törədir. Termosfera hüceyrələr heterotrofdur, mayadan enerji emal edir.


Müəllif məlumatı

Bu müəlliflər bərabər töhfə verdilər: Zheng-Shuang Hua, Yan-Ni Qu.

Əlaqələr

Dövlət Əsas Bionəzarət Laboratoriyası, Guangdong Əsas Bitki Resursları Laboratoriyası, Həyat Elmləri Məktəbi, Sun Yat-Sen Universiteti, 510275, Quançjou, Çin

Zheng-Shuang Hua, Yan-Ni Qu, En-Min Zhou, Yan-Ling Qi, Yi-Rui Yin, Yang-Zhi Rao, Ye Tian, ​​Yu-Xian Li, Lan Liu & Wen-Jun Li

Pediatriya şöbəsi, Kaliforniya Universiteti San Dieqo, La Jolla, CA, 92093, ABŞ

Yer və Planet Elmləri Bölməsi, Kaliforniya Universiteti, Berkeley, Berkeley, CA, 94720, ABŞ

Həyat Elmləri Məktəbi, Nevada Universiteti Las Vegas, Las Vegas, NV, 89154, ABŞ

Nevada Fərdi Tibb İnstitutu, Nevada Universiteti Las Vegas, Las Vegas, NV, 89154, ABŞ

Həyat Elmləri Məktəbi, Cənubi Çin Normal Universiteti, 510631, Guangzhou, Çin

Kompüter Elmləri və Mühəndisliyi Departamenti, Kaliforniya Universiteti, San Dieqo, La Jolla, CA, 92093, ABŞ

Mikrobiom İnnovasiyaları Mərkəzi, Kaliforniya Universiteti, San Dieqo, La Jolla, CA, 92093, ABŞ

Balıqçılıq Kolleci, Henan Normal Universiteti, 453007, Xinxiang, Çin

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Siz həmçinin bu müəllifi PubMed Google Scholar-da axtara bilərsiniz

Töhfələr

Z.S.H., Y.N.Q., R.K. W.S.S. və W.J.L. tədqiqatı düşündü. L.L. fiziokimyəvi parametrlərin ölçülməsini həyata keçirdi. Y.R.Y. və Y.T. DNT ekstraksiyasını həyata keçirdi. Z.S.H. Y.N.Q., Y.X.L., Y.Z.R, C.J.C., E.M.Z. və Y.L.Q. metagenomik analizi, genom birləşməsini və funksional annotasiyanı həyata keçirdi. Z.S.H. və Q.Z. üfüqi köçürülmüş genlərin aşkar edilməsini və əlaqəli təkamül analizini həyata keçirdi. Z.S.H., Y.N.Q., W.J.L., R.K., B.P.H. və Q.Z. əlyazmasını yazdı. Bütün müəlliflər nəticələri müzakirə etdilər və əlyazmanı şərh etdilər.

Müvafiq müəllif


Dipnotlar

    l Yazışmalar kimə ünvanlanmalıdır: Lehrstuhl für Mikrobiologie, Universität Regensburg, Universitätstrasse 31, 93343 Regensburg, Germany. E-poçt: karl.stetterbiologie.uni-regensburg.de

Müəllif töhfələri: J.G.E., P.R., M.K. və K.O.S. tərtib edilmiş tədqiqat J.G.E., M.P., B.P.H., A.L., E.G., K.B. və G.W. tədqiqat aparmışlar J.G.E., M.P., D.E.G., K.S.M., Y.W., L.R., C.B.-A., V.K., I.A., E.V.K., P.H., N.K. və K.O.S. məlumatları təhlil etdi və J.G.E., D.E.G., E.V.K. və K.O.S. kağız yazdı.

Müəlliflər maraqların toqquşması olmadığını bəyan edirlər.

Məlumatların yerləşdirilməsi: Bu sənəddə bildirilmiş ardıcıllıqlar GenBank məlumat bazasında saxlanılmışdır (giriş nömrəsi CP000968).