Məlumat

Nukleotidlə əlaqəli zülalların və RNT-polimeraza bağlı zülalların tərifi

Nukleotidlə əlaqəli zülalların və RNT-polimeraza bağlı zülalların tərifi


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Nukleotidlə əlaqəli zülallarRNT-polimeraza ilə əlaqəli zülallar, bu iki termini bir məqalədə tapdım, lakin onların tam olaraq nə demək olduğunu başa düşmədim, bu terminlər arasında hər hansı əlaqə varmı?DNT bağlayıcı zülallar?

Məqalə: DNA supercoiling-enterobakteriyaların böyüməsi üçün qlobal bir transkripsiya tənzimləyicisi?


Qısa:

Nukleotidlə əlaqəli zülallar, DNT-ni bağlayan DNT bağlayan zülallardır. RNT-polimeraza ilə əlaqəli zülallar RNT-polimerazaları bağlayır və onun funksionallığı üçün tələb olunur.

Daha ətraflı:

DNT-ni bağlayan zülal hamısını ehtiva edən daha yüksək səviyyəli bir termindir DNT-yə bağlanan zülallar. İnsanların bu termini çox istifadə etdiyini eşitməsəm də, bunlar DNT zəncirindəki nukleotidlərlə qarşılıqlı əlaqədə olduqları üçün nukleotidlə əlaqəli zülallar olaraq görülə bilər. İki növ bağlama var:

  • Xüsusi ardıcıllıqla DNT ardıcıllığına bağlanmayan qeyri-spesifik DNT bağlayan zülallar, məs. struktur zülalları.

  • Xüsusi DNT sekanslarına bağlanan xüsusi DNT bağlayan zülallar, məsələn. transkripsiya faktorları. Bu zülallar əsasən sink barmaqları və ya sarmal-dönmə-sarmal motivləri kimi spesifik DNT bağlayıcı motivlərə malikdir.

RNT-polimeraza (RNAP) ilə əlaqəli zülallar bundan fərqlidir. RNAP özü DNT bağlayan bir proteindir, lakin Tam funksional olması üçün RNAP -a bağlanan zülallar lazımdır. Tam işləyən RNAP o zaman bir holoenzimdir. Məsələn, RNAP II, bakteriyalarda sigma adlı bir başlanğıc faktoru və ökaryotlarda bir neçə ümumi transkripsiya faktoru və tənzimləyici zülal tələb edir.


“Nükleotidlə əlaqəli zülal” və ya “RNT-polimeraza ilə əlaqəli zülal” terminlərinin heç biri molekulyar biologiyada standart deyil yox istinad Gen Ontologiyasında müəyyən edilmişdir. (Əksinə olaraq, "DNT bağlama".)

İnternet axtarışı əvvəlki istifadənin bir çox nümunəsini gətirmir (ən azından) və gətirdiyi nümunələrdə bu müəyyən edilmir. Müəllifin zülalın funksiyası haqqında məhdud məlumatlara sahib olması ehtimal edildiyinə görə, dediklərinin tam mənasını ifadə edir və bundan artıq deyil. (Orijinal istinad olmadan əmin ola bilmərəm.)

Buna görə də "nukleotidlə əlaqəli zülal" "nükleotidlə müəyyən şəkildə qarşılıqlı əlaqədə olan bir zülaldır". On, onun nukleotidi bağlaya biləcəyini təsəvvür edə bilər, lakin bu birləşmənin təbiəti dəqiqləşdirilməmişdir və zülalın bir növ kinaz olduğunu və ATP (və ya GTP və s.) bir substrat olduğunu əks etdirə bilər. Buna görə də lazım deyil @AlexDeLarge-dən qəbul edilmiş cavabdakı ifadədən fərqli olaraq, DNT bağlayan zülal olun. Əslində bu termin çox güman ki, mononükleotid bağlayan bir zülal, yəni ATP və ya tsiklikAMP bağlayan bir protein, ÜDM və ya dUDP və s. Bir polinükleotidi bağlasaydı, bu eyni dərəcədə DNT olaraq RNT ola bilər.

Eyni şəkildə, "RNT-polimeraza ilə əlaqəli zülal" "müəyyən şəkildə RNT-polimeraza ilə qarşılıqlı əlaqədə olan bir zülaldır". Çox güman ki, bu, RNT-polimeraza ilə kompleks əmələ gətirən, yəni birləşən zülaldır, lakin müəllifin “bağlama” ifadəsini işlətməməsi onun ehtiyatlı olduğunu göstərir, çünki onun bununla bağlı heç bir sübutu yoxdur. . Bəlkə də hər iki zülal eyni immunopresipitdədir.


Transkripsiyanın uzanması və dayandırılması zamanı nə baş verdiyini təsvir edin

  • RNA polimeraz II (RNAPII), ökaryotik genlərin böyük hissəsini transkripsiya edir.
  • Uzanma zamanı, transkripsiya aparatı, hər dəfə bir nukleosomla qarşılaşanda histonları yoldan çıxarmalıdır.
  • Transkripsiya uzanması, RNA Polimerazanın 5 -ci və 3 -cü və əsas istiqamətdə yeni bir RNT ipinin sintezini katalizasiya etmək üçün şablon olaraq bir DNT zəncirindən istifadə etdiyi açılmamış DNT baloncuğunda meydana gəlir.
  • RNA Polimeraz I və RNT Polimeraz III ya transkripsiyaya uğramış DNT-də (RNT Polimeraz I), ya da yeni sintez edilmiş RNT-də (RNT Polimeraz III) spesifik sonlanma ardıcıllığına cavab olaraq transkripsiyanı dayandırır.
  • RNT Polimeraz II, transkripsiya edilən genin sonundan keçmiş təsadüfi yerlərdə transkripsiyanı dayandırır. Yeni sintez edilən RNT ardıcıllıqla müəyyən edilmiş yerdə kəsilir və transkripsiya bitməmiş buraxılır.

Viral polimerazalar

Viral polimerazlar viral genom replikasiyası və transkripsiyasında mərkəzi rol oynayır. Genom tipinə və xüsusi virusun xüsusi ehtiyaclarına əsaslanaraq, müxtəlif viruslarda RNT-dən asılı RNT polimeraz, RNT-dən asılı DNT polimeraz, DNT-dən asılı RNT polimeraz və DNT-dən asılı RNT polimerazlar tapılır. Viral polimerazlar ümumiyyətlə viral genom sintezi ilə əlaqəli bir çox funksiyanı yerinə yetirə bilən tək bir protein olaraq aktivdirlər. Xüsusilə, viral polimerazlar ilkin bağlanma sahələrini tanımaq, proses uzanmasını təmin etmək, genomun sonunda replikasiyanı dayandırmaq və nuklein turşusu sintezinin kimyəvi addımlarını digər enzimatik fəaliyyətlərlə əlaqələndirmək üçün müxtəlif mexanizmlərdən istifadə edirlər. Bu araşdırma müxtəlif virus genomunun replikasiyası və transkripsiya strategiyalarına və genom sintezini tamamlamaq üçün zəruri olan müxtəlif viral zülallarla polimeraza qarşılıqlı təsirinə yönəlmişdir.

Rəqəmlər

Baltimore virus təsnifat sxeminə əsaslanaraq…

Genom tipinə və mRNA sintez üsuluna əsaslanan Baltimore virus təsnifat sxemi ...

Polimerazların istifadə etdiyi iki metal mexanizm…

Nukleotidil transfer reaksiyasını kataliz etmək üçün polimerazlar tərəfindən istifadə edilən iki metal mexanizm. Şablon, astar,…

RNT-dən asılı polimeraz ardıcıllığı motivləri…

RNT-dən asılı və DNT-dən asılı polimerazalarda polimeraza ardıcıllığı motivləri. ( a ) Hizalanma…

Başlama mexanizmlərinin sxematik diaqramı…

Viral polimerazaların başlama mexanizmlərinin sxematik diaqramı. ( a ) Primerdən asılı başlanğıc.…

Poliovirus genomunun replikasiyası. ( a…

Poliovirus genomunun replikasiyası. ( a ) Genom replikasiya addımları. (i) VPg uridilasiyası. Terminal…

3D polimerazın kristal quruluşları…

VPg ilə əlaqəli primerlərdən istifadə edən 3D polimerazın kristal quruluşları. ( a ) FMDV…

Flavivirus genomunun replikasiyası. ( a…

Flavivirus genomunun replikasiyası. ( a ) Minus-zəncirli RNT sintezi. Viral RdRp istifadə edir…

The Flaviviridae RNT-dən asılı RNT polimerazalar…

The Flaviviridae De novo başlanğıc mexanizmindən istifadə edən RNT-dən asılı RNT polimerazları. (…

RNT-dən asılı RNT-nin domen tənzimlənməsi…

Mənfi mənalı ssRNA viruslarından RNT-dən asılı RNT polimerazalarının domen quruluşu. Qrip virusu polimeraza…

HİV-1-in tərs transkripsiyası…

HİV-1 genomunun əks transkripsiyası. ( a ) Minus-zəncirli DNT sintezi. Mənfi mənada…

HİV tərs transkriptazının strukturları...

HİV-in əks transkriptazasının strukturları. ( a p66 alt vahidi ( üst )…

protein29 zülal əsaslı DNT replikasiyası. The…

protein29 zülal əsaslı DNT replikasiyası. Φ29 xətti dsDNA genomu bir terminala malikdir ...

ϕ29 DNT-dən asılı DNT strukturları...

DNA29 DNT-dən asılı DNT polimerazın strukturları. ( a ) ϕ29 polimeraza. N-terminal…

T7 DNT-dən asılı olaraq RNT transkripsiyası…

T7 DNT-dən asılı RNT polimeraz ilə RNT transkripsiyası. ( a ) RNT -nin başlanğıcı…

T7 RNT polimeraza başlanğıcı və…

T7 RNT polimeraz başlanğıc və uzanma kompleksləri. ( a ) Tərkibində…

T7 polimeraz reaksiyasının sxematik…

T7 polimeraza reaksiya dövrünün sxemi ( üst ) və T7 strukturları…


Niyə ki RNT vacib?

DNT və RNT qədimdir, lakin onların kəşfi nisbətən yeni olmuşdur. 1869-cu ildə kimyaçı Fridrix Mişer əvvəllər heç vaxt öyrənilməmiş bir növ molekulu - nuklein turşusunu sənədləşdirdi. Təxminən 1930 -cu illərə qədər bu termin deyildi DNT ilə istifadə olunmağa başladı RNT 1940 -cı illərdə. 1950 -ci illərdə biofizik Rosalind Franklin və bioloqlar James Watson və Francis Crickin işləri DNT -nin cüt sarmal quruluşunu ortaya qoydu. -nin funksiyası RNT 1950-60 -cı illərdə elm adamları xəbərçinin rolunu anlamağa başladıqca daha da başa düşülməyə başladı RNT.

Bu anlayış hələ də inkişaf etməkdədir. Son vaxtlara qədər, RNT-lər rolun əsasən xəbərçi olaraq zülal sintezinə kömək etməklə məhdudlaşdığı düşünülürdü RNT, köçürmə RNT, və ribosomal RNT. Ancaq elm adamları yeni növləri kəşf etməyə davam edirlər RNT və daha çox funksiya RNT bədəndə ifa edir. Məsələn, son kəşflər bir neçə növün olduğunu göstərir RNT ribosomların nə qədər zülal istehsal etdiyini tənzimləyir.


Paylaşılan Flash Kart Dəsti

Aşağıdakılardan hansıdır yalan DNT?

D. Fərqli növlər arasında sabit olaraq qalır

E. Növlər arasında dəyişkənliyə malikdir

D. Fərqli növlər arasında sabit olaraq qalır

Aşağıdakılardan hansı DNT-də olan nukleotid deyil?

Bir bioloq olsaydınız və purinlər öyrənirsinizsə, aşağıdakı molekullardan hansını öyrənərdiniz?

Aşağıdakılardan hansı DNT -də tapılmayacaq?

Aşağıdakılardan hansı nukleotidin kimyəvi tərkibini ən yaxşı təsvir edir?

A. azot tərkibli əsas və pentoza şəkəri

B. azot tərkibli əsas, fosfat və pentoza şəkər

C. fosfat və pentoz şəkər

D. azot tərkibli bir baz, fosfat və heksoz şəkərdir

B. azot tərkibli bir baz, fosfat və pentoz şəkər

Bir bioloq DNT -nin necə kopyalanması prosesini araşdırır. Aşağıdakılardan hansını oxuyacaqdı?

Transkripsiya zamanı aşağıdakı məlumatlar verilir:

A. Protein RNT məlumatına çevrilir

B. RNT protein məlumatına çevrilir

C. RNT DNT məlumatına çevrilir

D. DNT RNT məlumatına çevrilir

E. DNT protein məlumat çevrilir

D. DNT, RNT məlumatına çevrilir

Aşağıdakı proseslərdən hansı tərcümə zamanı baş vermir?

A. Ribosomun mRNT-yə bağlanması

B. mRNT-də kodonların sayı

C. Amin turşusunu tRNA -ya bağlayan ferment

D. rRNT ilə əlaqəli zülallar

E. antikodonların ardıcıllığı

E. Antikodonların ardıcıllığı

Bir zülaldakı amin turşularının ardıcıllığından ən çox məsuliyyət daşıyan hansıdır?

A. mRNA -dakı kodonların ardıcıllığı

B. mRNT-də kodonların sayı

C. amin turşusunu tRNT-yə bağlayan ferment

D. rRNA ilə əlaqəli zülallar

E. antikodonların ardıcıllığı

A. mRNA -dakı kodonların ardıcıllığı

Hər bir kodon bu sayda əsasdan ibarətdir:

Bir biokimyaçı zülal zəncirinin necə yığılması prosesini öyrənir. Onlar aşağıdakılardan hansını öyrənəcəkdilər?

Nüvədən zülalların istehsal olunduğu yerə genetik məlumat daşıyan molekulu təcrid etməyə çalışsaydınız, aşağıdakı molekullardan hansını öyrənərdiniz?

Transfer RNT -nin funksiyası:

A. amin turşularını ribosomlara daşıyır

B. nukleotidləri nüvəyə köçürür

C. kodlanmış məlumatları sitoplazmaya ötürür

E. zülal sintezi üçün yer kimi çıxış edir

A. amin turşularını ribosomlara daşıyır

tRNT molekulunun ________ bir mRNT molekulunun kodonunu cəlb edəcəkdir.

C. mino ac id bağlama yeri

Müasir biokimyəvi genetikada irsi məlumat axını aşağıdakılardan qaynaqlanır:

Aşağıdakılardan hansı ekoloji mutagen ola bilməz?

E. hamısı mutagen hesab olunur

Hansı seriyalar ən böyükdən kiçiyə qədər sıralanmışdır?

A. xromosom, nüvə, hüceyrə, DNT, nukleotid

B. hüceyrə, nüvə, xromosom, DNT, nukleotid

C. nukleotid, xromosom, hüceyrə, DNT, nüvə

D. hüceyrə, nukleotid, nüvə, DNT, xromosom

E. DNT, nukleotid, nüvə, hüceyrə, xromosom

B. hüceyrə, nüvə, xromosom, DNT, nukleotid

Azot əsasları bir -biri ilə əlaqəli zəif bağlarla tutulur:

Şəkər və fosfat molekullarını hansı bağlar bağlayır?

Amin turşuları bir -birinə bağlanaraq hansı növ bağlarla zülallar əmələ gətirir?

Aşağıdakı xromosom mutasiyalarını düzgün ardıcıllıqla dəyişdirin.

Niyə genetik kod "unviersal kod" adlanır?

hər şeylə işlədiyi üçün hər canlı onu ehtiva edir və bütün canlılarda eyni azot əsasları vardır.


Kvorum Algılama

Marijke Frederix, J. Allan Downie, Mikrobial Fiziologiyada Avanslar, 2011

7.1.3 Azotun məhdudlaşdırılması

Sigma faktorları, gen transkripsiyasının baş verməsi üçün lazım olan RNA polimerazının alt hissələridir. Bir bakteriya hüceyrəsindəki genlərin əksəriyyətinin ifadəsi "ev qulluğu" siqma faktoru σ 70 -in ifadəsindən asılıdır, lakin bakteriyalar fərqli mühit şərtlərinə cavab olaraq fərqli siqma faktorlarını ifadə edə bilir. Bu alternativ siqma amilləri eukaryotik ev sahibləri ilə qarşılıqlı əlaqə kimi müəyyən nişlərə uyğunlaşmada iştirak edir. Bir çox bakteriyalarda bu alternativ siqma faktorlarından biri ilə QS geninin tənzimlənməsi arasında əlaqə aşkar edilmişdir. Azot aclığı şəraitində alternativ sigma faktoru RpoN (σ 54) aktivləşir və azot assimilyasiyasında iştirak edən genlərin ifadəsinə səbəb olur (Hendrickson) və b., 2001 ).

Daxilində V. xoleraeV. harveyi, cavab tənzimləyicisinin fəaliyyəti LuxO-P Qrr sRNT transkripsiyasını stimullaşdırmaq üçün RpoN tələb edir ( Klose və b., 1998 Lilley və Bassler, 2000 Lenz və b., 2004). Transkripsiyasının artması qrr genlər QS master tənzimləyicisinin sabitliyinin pozulmasına səbəb olur və beləliklə, RpoN QS ilə tənzimlənən genlərin ifadəsinə mənfi təsir göstərir (Şəkil 5 A və B).

RpoN-in RhlI və LasI istehsalı olan AHL istehsalını azaltdığı bildirildi P. aeruginosa yəqin ki, dolayı təsirlərə görə, RpoN-in induksiya etdiyi ifadə kimi vfr və ifadəsi gacA (Heurlier və b., 2003 ). Bunun əksinə olaraq, RpoN-in induksiya yolu ilə Rhl-AHL istehsalını artırdığı müşahidə edildi rl ifadə (Tompson və b., 2003) və RpoN-in aktivləşdirilmiş ifadəsi rhlR (Mədinə və b., 2003b).


Nüvə məsaməsinin tərifi

Nüvə məsamələri kiçik deşiklər hüceyrə koordinasiyası üçün nukleositoplazmik mübadiləni istiqamətləndirərək nüvənin sitoplazma ilə əlaqə saxlamasına kömək edir. Kiçik ionlar və molekullar (5000 Daltondan kiçik) edə bilər sərbəst şəkildə yayılır hüceyrə daxilində, xüsusi biomoleküllər zülal vasitəsi ilə hüceyrənin yuxarı və aşağı hərəkət edə bilər aktiv nəqliyyat. Nüvə məsamələrinin diametri və qalınlığı sırasıyla 120nm və 50nm -dir.

Nüvə Məsamələri Kompleksinin Quruluşu

The silindrik çox proteinli komplekslər Hər nüvə məsaməsini əhatə edən və nukleositoplazmik mübadiləni idarə edənlərə NPC deyilir. Nüvə zərfinin hər iki konsentrik membranı 30 fərqli zülal ilə özünü göstərən çoxlu protein kompleksi ilə birləşir. NUP -lar və ya nukleoporinlər. Nüvə məsamə kompleksi bir xüsusiyyətə malikdir səkkizbucaqlı simmetriya. Nüvə məsamə kompleksinin strukturu aşağıdakı əsas elementlərdən ibarətdir:

Nukleoporin iskele: Nukleoporinlər əsasən kütləvi şəkildə nüvə məsamə kompleksinin əmələ gəlməsini təşkil edir. dolaşıq hüceyrə daxilində seçmə mübadiləsini təmin etmək. Tərkibinə daxildir sitoplazmiknukleoplazmik üzük, onun arasında a mərkəzi çıxış etdi üzük təşkil olunur. NPC, bir neçə nukleoporinin iskele edilməsi səbəbiylə səkkizbucaqlı bir halqa kimi görünür.

Mərkəzi kanal və ya daşıyıcı: Bəzi nukleoporinlər xoşlayır FG təkrarlayır mərkəzi kanalın formalaşması ilə əlaqədardır. Mərkəzi kanalın nukleoporinləri bir funksiyanı yerinə yetirir seçici maneəyalnız xüsusi amin turşusu ardıcıllığını daşıyan iki qatlı nüvə zərfindən böyük biomoleküllərin idxalına və ixracına icazə verir. Eni 36-38 nm-dir. Mərkəzi kanal səkkiz qatlı simmetrik dirsəklərlə əhatə olunmuşdur.

Sitoplazmik filamentlər: Qısa və qalın ipli strukturlar ilə əlaqələndirilir sitoplazmik halqa sitoplazmatik filamentlər adlanır. Onun diametri 3,3 nm-dir və sitoplazmaya doğru uzanır. Bir kimi işləyir sensor nüvəyə idxal edilməli olan molekullara bağlı siqnal zülalları ilə xüsusi olaraq bağlanır. Bunlar səkkiz ədəd və sitoplazmanın sonuna doğru daha az yer tutur.

Nüvə səbəti: Böyük bir çöpə bənzər bir quruluş nüvə halqası. Nukleoporinlərin nüvənin lümeninə daxil olmasını təmin edir. Bu səbət biomolekulların ixracında mühüm rol oynayır.

Makromolekulların nəqli

Nüvə selektiv ikiqatlı nüvə membranı ilə əhatə olunmuşdur ki, bu da bir funksiyanı yerinə yetirir maneə ölçülü makromolekullar üçün & lt50 kDa lakin kiçik ionların və ya metabolitlərin sərbəst yayılmasına imkan verir. Ancaq RNT polimeraz kimi makromolekullar, histon zülalları daxil ola bilər nüvəyəvə RNT və ribosomal alt birimlər kimi biomoleküllər ixrac edilə bilər sitozola daxil olur aktiv nəqliyyat vasitəsi ilə.

Beləliklə, nüvə ilə sitoplazma arasındakı mübadilədir ikitərəfli nukleoplazmik və sitoplazmatik məzmunların hərəkət etməsini təmin edir. Həmişə yadda saxlamalı olduğumuz bir şey var zəruri makromolekullar yalnız ayrı bir amin turşusu ardıcıllığı olan nüvəyə girə və çıxa bilər.

Xüsusi amin turşusu ardıcıllığına malik olan molekullar ya nüvə lokalizasiyası ilə işarələnir (NLS) və ya nüvə ixrac siqnalları (NES). Seçici nəqliyyat üçün xüsusi nüvə reseptorları yük zülallarına xüsusi amin turşusu ardıcıllığı ilə bağlanır və kompleksi sabitləşdirir. RAN makromoleküllərin aktiv nəqli üçün sərbəst enerji verən başqa bir zülal qrupudur.

RNT polimeraz və histon zülalları etiketlənir nüvə lokalizasiya siqnalları üçün bağlayıcı sayt kimi çıxış edir idxal (nüvə importin reseptoru), bu da öz növbəsində bu makromolekulları nüvəyə idxal edir. Buna görə də, nüvə lokalizasiyası siqnalları birbaşa idxal zülallarını nüvə.

NLS ilk dəfə viral zülalda müşahidə edilmişdir (T-antigen), ev sahibi hüceyrənin nüvəsi içərisində viral replikasiya üçün lazım olan. Nüvə lokalizasiya siqnalları zəngin olan parçalanmayan amin turşularıdır lys qalıqları.

RNT və ribosom alt bölmələri ilə işarələnir nüvə ixrac siqnalları üçün bağlayıcı sayt rolunu oynayır ixrac olunur (nüvə ixracat reseptoru), bu da bu makromolekulları sitoplazmaya ixrac edir. Beləliklə, nüvə ixracı zülalları birbaşa ixrac edir sitozol. Bunlar zəngin olan qısa amin turşusu ardıcıllığıdır leu qalıqları.

Nüvə Reseptor Proteinləri

Xüsusi nüvə siqnalları xüsusi ilə qarşılıqlı təsir göstərəcək reseptor zülalları. NLS əsasən nüvə ixrac edən reseptorla, NES isə nüvə idxal edən reseptorla qarşılıqlı əlaqə quracaq. Eksportinlər nüvənin içindəki makromolekullarla birləşir və sitozola buraxırlar. Bunun əksinə olaraq, importinlər sitozoldakı molekullarla qarşılıqlı əlaqə quraraq nüvəyə buraxırlar.

Həm idxal, həm də ixracat yüksək olan nüvə reseptor zülallarıdır homoloji ardıcıllıqla və ailəsinə daxil edilmişdir karyoferinlər. Translokasiya zamanı importinlər və ixracatçılar birləşir FG bölgəsi nukleoporinlər üzərində. İçərisində bir bölgə phe-gly təkrarlanır FG təkrarları adlanır.

RAN Proteini

Nüvə reseptor zülallarından başqa adlı başqa bir zülal var RAN kiçik monomerik nüvə GTPazları ehtiva edir. RAN zülalı ümumiyyətlə iki uyğunlaşmada mövcuddur, yəni RAN-GTP kompleks və RAN-ÜDM kompleks RAN-GTP və RAN-GDP-nin meydana gəlməsi əsasən müvafiq olaraq nüvə lümenində və sitozolda mövcuddur.

Yuxarıdakı iki kompleks, iki zülalın asimmetrik paylanmasına görə fərqlənir GEFGAP. GEF və ya guanin nukleotid mübadiləsi faktoru Ran-ÜDM-ni Ran-GTP-yə əvəz edən nüvədə yerləşir. Əksinə, sitozolda mövcud olan GTPaz aktivləşdirən zülal və ya GAP GTP-nin ÜDM-ə hidrolizinə səbəb olur və beləliklə, Ran-GTP-ni Ran-ÜDM-ə çevirir.

RAN-GAP zülalı NPC-nin üstündə, yəni sitoplazmik səth. RAN-GSYİH və RAN-GTP idxal və ixrac komplekslərini sabitləşdirir. Buna görə də, RAN gradient ehtiyacını ödəyir sərbəst enerji makromolekulların aktiv daşınması üçün vasitəçilik edir istiqamətlilik translokasiya zamanı.

İdxal və ixrac dövrü

Nüvə məsamələri kompleksi vasitəsilə idxal və ixrac dövrü ilə əlaqəli addımlar daxildir:

Nüvə İdxal Dövrü

Nüvə importin reseptoru α və β alt birliyinə malikdir. Nüvənin içərisinə atılması nəzərdə tutulan bir protein yükü bağlayır α-alt vahid nüvə lokalizasiya siqnalı vasitəsilə. Sitozolda mövcud olan RAN-ÜDM kompleksi ilə birləşir β-alt vahid bir importin reseptoru.

Yuxarıdakı kompleks daha sonra nukleoporinlər NPC -nin və nəhayət lipid iki qatlı servislərin kənarında nüvə zərfi. Sonra bir protein yükü nüvə lümeninə atılır və qalan kompleks (RAN-GSYİH və idxal) keçir. konformasiya dəyişikliyi nüvə daxilində.

RAN-ÜDM RAN ilə qarşılıqlı əlaqədədirGEF, yəni RAN-GTP yaratmaq üçün RAN-ÜDM kompleksinə bir fosfat qrupu əlavə edən guanin nukleotid mübadiləsi faktoru. Bir importin reseptoru məsamə boyunca geri qaytarılır sitozol RAN-GTP ilə birlikdə.

Daha əvvəl də danışdığımız kimi, RAN-GAP (GTPase aktivləşdirən protein) NPC-nin sitoplazmik tərəfində lokallaşdırılmış zülallardır və GTP-nin hidrolizi. GTPase fermenti, fosfat qrupundan bir fosfat qrupunun silinməsinə səbəb olur RAN-GTP kompleksi və importin reseptorunun dissosiasiyası və RAN-ÜDM kompleksinin formalaşması ilə nəticələnir. Nəhayət, bir importin reseptoru başqa bir dövrə başlamaq üçün sərbəst olur.

Nüvə İxrac Dövrü

Nüvə ixracat reseptoru, bədənə atılması nəzərdə tutulan bir hədəf zülal ilə bağlanır sitozol. Sonra, RAN-GTP nüvə daxilində mövcud olan kompleks ilə birləşir ixrac olunur reseptor. Bütün sabit kompleks NPC -nin nukleoporinlərinə bağlanır və nəhayət iki qatlı fosfolipiddən kənara çıxır. nüvə zərfi.

NPC-nin sitoplazmik səthindəki RAN-GAP a konformasiya dəyişikliyi bir fosfat qrupunu çıxararaq RAN-GTP-də. Nəticədə, bir protein yükü sitozoldakı kompleksdən ayrılır. Qalan kompleks, yəni RAN-GSYİH və üstəgəl ixrac reseptoru, nüvənin içindəki gözenek boyunca geri qaytarılır.

The RAN-GEF RAN-ÜDM kompleksinə bir əlavə fosfat qrupu əlavə edən nüvənin içərisində olan bir protein sahəsidir. İxracat reseptorunun sərbəst buraxılması və əmələ gəlməsi ilə nəticələnir RAN-GTP kompleks Nəhayət, bir ixracin reseptoru yeni dövrə başlamaq üçün sərbəst olur.

Nəticə

Nüvə məsamələri kompleksini bir kimi düşünək barrikada, böyük biomolekullara sahib olması lazım olan insanlar kimi onların keçmək ora girib çıxmaq. Eynilə, böyük molekullar yalnız işarələnmiş nüvə məsamə kompleksləri vasitəsilə daxil olub çıxa bilər nüvə reseptor zülalları.


SARS-koronavirus replikasiyası, dəyişdirilmiş endoplazmik retikulumun retikulovesikulyar şəbəkəsi tərəfindən dəstəklənir.

SARS-koronavirus (SARS-CoV) kimi insan patogenləri də daxil olmaqla böyük bir qrup olan müsbət zəncirli RNT virusları yoluxmuş ev sahibi hüceyrələrin sitoplazmasında çoxalır. Onların replikasiya kompleksləri ümumiyyətlə dəyişdirilmiş ana hüceyrə membranları ilə əlaqələndirilir. Viral RNT sintezini dəstəkləyən membran quruluşları, fərqli sferik membran invaginasiyalarından qablaşdırılmış membranların və veziküllərin daha mükəmməl şəbəkələrinə qədər dəyişir. Ümumiyyətlə, onların ultrastrukturu, morfogenezi və virusun təkrarlanmasında dəqiq rolu müəyyən edilməmişdir. Zəif xarakterizə olunan ikiqat membranlı veziküllər (DMV) əvvəllər SARS-CoV RNT sintezində iştirak edirdi. İndi koronavirusun yaratdığı membran dəyişikliklərinin yüksək qətnamədə üçölçülü görüntülənməsi üçün kriofiksə yoluxmuş hüceyrələrin elektron tomoqrafiyasını tətbiq etdik. Təhlilimiz, bükülmüş membranları, çoxsaylı bir-birinə bağlı DMV-ləri (diametri 200-300 nm) və yəqin ki, DMV birləşməsindən yaranan "vezikül paketlərini" birləşdirən dəyişdirilmiş endoplazmatik retikulumun unikal retikulovezikulyar şəbəkəsini müəyyən edir. Qıvrımlı membranlar ən çox viral replikaz alt bölmələri üçün immunolabeled edilmişdir. Bununla birlikdə, ehtimal ki, əsasən DMV interyerində lokalizə edilmiş viral RNT sintezinin yerini ortaya qoyan ikiqat telli RNT. DMV daxili və sitozol arasında əlaqəni ayırd edə bilmədiyimiz üçün təhlilimiz DMV əmələ gəlmə mexanizmi və SARS-CoV RNT sintezinin faktiki yeri ilə bağlı bir neçə sual doğurur. Verilərimiz, virusun çoxalmasını təşkil etmək və ehtimal ki, təkrarlanan RNT-ni antiviral müdafiə mexanizmlərindən gizlətmək üçün istifadə olunan bir şəbəkəyə sahib olan hüceyrə membranlarının geniş virus səbəbli yenidən qurulmasını sənədləşdirir. Viral ferment kompleksinin biokimyəvi tədqiqatları ilə birlikdə bu "replikasiya şəbəkəsinin" ultrastruktur təsviri koronavirusun həyat dövrünün ilkin mərhələlərini və onun virus-ev sahibi qarşılıqlı təsirlərini daha da tədqiq etməyə kömək edəcəkdir.

Maraqların toqquşması bəyanatı

Rəqabət edən maraqlar. Müəlliflər heç bir rəqabət aparan maraqların olmadığını bəyan ediblər.

Rəqəmlər

Şəkil 1. Koronavirus Replikazası Poliproteini

Şəkil 1. Koronavirus Replikazası Poliproteini

Domen təşkili və proteolitik emal xəritəsi…

Şəkil 2. Membran Strukturlarına İcmal...

Şəkil 2. SARS-CoV infeksiyasının səbəb olduğu membran quruluşlarına ümumi baxış

SARS-CoV-ə yoluxmuş Veronun elektron mikroqrafiyası…

Şəkil 3. Elektron Tomoqrafiya Bir-birinə bağlılığı aşkar edir…

Şəkil 3. SARS-CoV səbəbli DMV-lərin bir-birinə bağlı təbiətini ortaya qoyan elektron tomoqrafiya

Şəkil 4. SARS-CoV səbəbli CM-nin Elektron Tomoqrafiyası,…

Şəkil 4. SARS-CoV-in səbəb olduğu CM, DMV və VP-lərin elektron tomoqrafiyası

Şəkil 5. SARS-CoV səbəbli elektron tomoqrafiya…

Şəkil 5. Daha inkişaf etmiş bir mərhələdə SARS-CoV ilə əlaqəli Retikulovesikulyar Membran Şəbəkəsinin Elektron Tomoqrafiyası…

Şəkil 6. SARS-CoV-un immunoqold EM…

Şəkil 6. Yoluxmuş Hüceyrələrdə SARS-CoV Replikazasının İmmunogold EM

SARS-CoV-ə yoluxmuş Vero E6 hüceyrələri...

Şəkil 7. SARS-CoV-infeksiyasında dsRNA-nın aşkarlanması…

Şəkil 7. SARS-CoV ilə yoluxmuş hüceyrələrdə dsRNA-nın aşkarlanması

SARS-CoV-ə yoluxmuş Vero E6 hüceyrələri…

Şəkil 8. Immunogold EM, bol dsRNA aşkar edir…

Şəkil 8. İmmunoqold EM SARS-CoV-induksiya etdiyi DMV-lərin daxili hissəsində bol dsRNA etiketlənməsini aşkar edir

Şəkil 9. Elektron Tomoqrafiya Əsaslı Modeli…

Şəkil 9. SARS-CoV-ni Dəstəkləyən Modifikasiya edilmiş ER Membranları Şəbəkəsinin Elektron Tomoqrafiya Əsaslı Modeli…


Tibbi tərifi RNT

& mdash da ribonüklein turşusu adlanır

GÜNÜN SÖZÜ

Paltar

Günün Sözünü gündəlik e-poçtla əldə edin!

Lüğətinizi yoxlayın

Bu Rəngin Adının Qayıdışı!

10 suallıq viktorina ilə söz ehtiyatınızı sınayın!

Krossvord fanatları üçün gündəlik problem.

Amerikanın ən böyük lüğətinə abunə olun və minlərlə daha çox tərif və qabaqcıl axtarış və mdashad pulsuz əldə edin!


Yara müalicəsinin molekulyar biologiyası: Kondisioner fenomeni

1 Yaradan sonra Genlərin Aktivləşdirilməsi

Gen aktivləşdirilməsi, sağlam toxumalarda aktiv olan genlərin, yaradan sonra çox daha sürətli bir surətdə kopyalanması və ya zədələnmədən əvvəl bağlanmış genlərin zədədən sonra oxunduğunu ifadə edə bilər. Hər ikisinin yaralı bitki model sistemləri üçün doğru ola biləcəyinə dair sübutlar var. Hər şeydən əvvəl, RNT tərkibində böyük bir artım yara iyileşmesini müşayiət edir (Kahl, 1973, 1974a). Sintezin həqiqətən meydana gəldiyinə heç bir şübhə yoxdur. Bununla belə, indiyə qədər tədqiq edilən əksər sistemlərdə RNT sintezinin bir-birindən ayırd edilməli iki mərhələsi var. Yaralandıqdan sonra ilk 2-3 saat ərzində ribosomal RNT (rRNA) və transfer RNT (tRNA) sintezi həm Yerusəlim artishokunda, həm də kartof yumrularının toxumalarında əhəmiyyətsiz dərəcədə kiçikdir. Bunun əksinə olaraq, mesajçı-RNT (mRNA) olduğu ehtimal edilənə 3 H- və 14 C işarəli nukleotidlərin ağır şəkildə daxil olması var. Heterodispers RNT -nin əslində etiketlənməsi kartof yumrularının zədələnməsindən dərhal sonra başlayır (Sato və b., 1978) və Qüds artishok hüceyrələri (Byrne və Setterfield, 1977). Beləliklə, mRNT-yə unikal ardıcıllığın üstünlüklü transkripsiyası var. Bu nöqtədə vurğulanmalıdır ki, hətta istirahət edən hüceyrələrdə də bəzi mRNA var. Həm Qüds ənginarı, həm də daha az dərəcədə kartof kök yumruları. Bu əvvəlcədən mövcud olan mRNT olduqca açıq şəkildə tərcümə üçün istifadə olunur ( Byrne and Setterfield, 1978 Sato və b., 1980), lakin əsasən yaradan sonra sintez edilən zülalları kodlaşdırır (Sato və b., 1980). Buna görə də sanki sağlam hüceyrələrdə aktiv genlərin nümunəsi yaradan qısa müddət sonra saxlanılır.

Yeni sintez edilmiş mRNT sürətlə ribosomlarla əlaqələndirilir və şübhəsiz ki, həm polisomların əmələ gəlməsinə, həm də artan protein sintetik qabiliyyətinə cavabdehdir (Cədvəl I). Həm poliadenilləşmiş [poli (A) +], həm də qeyri -adiləşmiş RNT 's [poli (A) -] yaralı kartof hüceyrələrinin polisomlarında mövcuddur (R. K. Tripathi, şəxsi ünsiyyət Sato) və b., 1980). Dovşan retikulositlərindən (R. K. Tripathi, şəxsi ünsiyyət) və buğda mikroblarından (Sato) qaynaqlanan hüceyrəsiz tərcümə sistemlərində geniş çeşidli polipeptidləri proqramlaşdıra bilirlər. və b., 1980). Bununla belə, poli(A) + - və poli(A) - –RNT-lərin kodlaşdırma fərqləri var. Təxminən beş fərqli polipeptid (yəni 22.000 və 23.000 dalton komponenti) yalnız poly (A) + -RNA (Sato) ilə kodlanır. və b., 1980). Kartof yumru toxumalarını yaraladıqdan təxminən 6 saat sonra, polisomların poli (A) + -RNA -sı, əslində, ümumi polisomal RNT -nin tərcümə qabiliyyətinin təxminən 70% -ni təşkil edir. Bu keyfiyyət fərqlərinə baxmayaraq, iki RNT sinfi arasındakı molekulyar ölçü payı olduqca oxşardır, təxminən 6S ilə 30S arasında dəyişir (Sato və b., 1980). Messenger-RNA sintezi yaradan təxminən 10-15 saat sonra davam edir, bu da sonradan xüsusi mesajların əmələ gəlməsini istisna etmir (yəni, suberin induksiyası üçün peyğəmbər, bax. Bölmə III, D, 3).

Yaralanmadan təxminən 3-6 saat sonra etiket ribosomal RNT-yə (rRNT) daxil olur. Yaralı yerkökü kökü, eləcə də bütün digər bitki toxumaları üçün təmsil olunan Yerusəlim artishok kök yumruları toxumalarında əvvəlcə təxminən 2,3 × 10 6 daltonluq bir prekursor transkripsiya edilir, lakin 1,4 × 10 6 və 0,9 × 10 6 dalton əldə etmək üçün sürətlə parçalanır. komponent Bu ara molekullar daha sonra müvafiq olaraq 1.3 × 10 6 və 0.7 × 10 6 dalton olan RNT molekullarına, böyük və kiçik ribosomal alt bölmələrin RNT-lərinə çevrilir (Rogers və b., 1970 Leaver və Key, 1970). Kiçik 18S rRNA, nukleolusdan ixrac edildikdən sonra 25S rRNA -dan daha sürətli sitoplazmaya daxil olur və bu da etiketləmə təcrübələrində kiçik komponentin daha yüksək spesifik aktivliyinə səbəb olur (Kahl, 1971a).

Bütün bu hadisələr həm elektron mikroskopik, həm də avtoradioqrafik məlumatlarla yaxşı uyğun gəlir. Beləliklə, ribosomal RNT transkripsiyasının və emalının yeri kimi nukleollar yaradan sonra rRNT sintezində dramatik dəyişiklikləri göstərməlidir. Onlar edir. Sakit hüceyrələrdə bu orqanoidlər nisbətən kiçik və yığcam strukturlardır. İxtisaslaşdırılmış xromatin kütlələrinə yerləşdirilmiş yalnız nazik bir periferik dənəvər zona ola bilər. və b., 1972 Jordan and Chapman, 1973 Barckhausen, 1978). Nukleolar vakuollar, əgər varsa, sayı və ölçü baxımından kiçikdir (Barckhausen, 1978). Bütün xüsusiyyətlər bütöv toxumalarda qeyri-aktiv nüvəyə işarə edir ki, bu da biokimyəvi analizlərlə mütləq şəkildə təsdiqlənir.

Yaradan qısa bir müddət sonra, təxminən 2-4 saat ərzində, nüvələrin həcmi ölçülə bilər və maksimum 24 saata qədər artır. Sonra azalır (Gül və b., 1972 Jordan and Chapman, 1971, 1973 Kahl and Wielgat, 1976 Barckhausen, 1978). Bu həcm artımını struktur təşkilatında fərqli dəyişikliklər müşayiət edir. Fibrillar bölgələri ilə qarışan müəyyən bir dənəvər zona inkişaf edir. Nüvə vakuolları yaranır və ya tədricən ölçüdə böyüyür və bütün yaranın sağalması dövründə ritmik pulsasiyalar nümayiş etdirir. Sitoplazmaya ribonükleoprotein daşıma funksiyası təyin edilmiş "nəhəng vakuollar" (Barckhausen, 1978) kimi meydana gələ bilər. Eyni zamanda nüvə ilə əlaqəli xromatin (L zonası: Jordan və Chapman, 1971) çox dağılır ki, bu da ribosomal sistronların bu xüsusi xromatində aktiv transkripsiyasının göstəricisidir (Setterfield). və b., 1978). Deməli, bütün dəlillər yaralı toxumalarda yüksək aktivliyə malik nukleollara işarə edir.

Yenə avtoradioqrafik təcrübələr göstərdi ki, tətbiq olunan [3 H] uridin etiketinin çoxu təzə yaralı Qüds artishok hüceyrələrinin nüvəsində deyil, xromatin bölgəsindədir. Yalnız 1 saatdan sonra etiket nüvədə də görünür. Aydındır ki, yaradan sonra rRNA sintezinin başlanğıcı olduqca sürətlidir. The processing of the precursor molecules, however, evidently is so time-consuming, that they do not appear as ribosomal constituents before 3–4 hr after injury ( Byrne and Setterfield, 1977 ).

Transfer-RNA (tRNA) synthesis is also a characteristic feature of wounded tissues ( Kahl, 1971a Frazer, 1975 ). Obviously the tRNA in intact tissues of sugar beet roots is undermethylated and hence probably inactive. Wounding induces a rapid and extensive methylation of the tRNA ( Stone and Cherry, 1972 King and Chapman, 1973 ), and at the same time the tRNA's develop an increased amino acid acceptor activity. So the rapid wound-induced methylation of pre-existing tRNA's may well be a factor in early protein synthesis.

Wounding then in some way must trigger the synthesis of various messenger, ribosomal, and transfer RNA's or, in other words, the readout of unique sequences as well as the multiple tDNA and rDNA genes. It is still an enigma how this is achieved both in animal and plant organisms. So all we know is that intact organs, in general, do not possess much of the capability to support DNA-dependent RNA synthesis, which is consequently low in intact wound model systems, such as sugar beet ( Duda and Cherry, 1971 ), Jerusalem artichoke ( Kamisaka and Masuda, 1971 ), and potato tuber ( Kahl and Wielgat, 1976 ). However, template availability for exogenous E. coli RNA polymerase by far exceeds the actual chromatin activity with endogenous polymerase. This may mean that endogenous RNA polymerase concentration is limiting, although this is far from conclusive. In any event, wounding activated DNA-dependent RNA polymerases in all model systems ( Duda and Cherry, 1971 Kahl and Wielgat, 1976 Kahl and Wechselberger, 1977 ), both RNA polymerase I (rRNA synthesis) and polymerase II (hnRNA and hence presumably mRNA synthesis) are affected. Polymerase I usually shows a vigorous, about fourfold increase in activity some 18 hr after wounding potato tuber tissue. Polymerase II only doubles its activity in the same period ( Kahl and Wielgat, 1976 ). It can be proved that the polymerases of wounded tissues read out a set of other genes than their counterparts in intact organs. This has conclusively been demonstrated for potato tuber ( Kahl and Wielgat, 1976 Kahl and Wechselberger, 1977 ) and sugar beet tissues ( Duda and Cherry, 1971 ) by nearest neighbor frequency analyses. Consequently, the overall base composition of the RNA synthesized on isolated chromatin in vitro is distinctly different between quiescent and wounded tissues. For example, the frequency with which AMP serves as nearest neighbor for AMP is definitely higher in wounded tissues: indicative of the wound-induced formation of poly(A) + -RNA ( Fig. 6 ).

Şəkil 6. Wound-induced changes in chromatin-bound protein phosphokinases (○—○) and DNA-dependent RNA polymerase I (open bars) and II (black bars) activity in potato tuber tissues. For nearest neighbor frequency analysis the RNA synthesized on purified chromatin in the presence of adenosine 5′-α-[ 32 P]triphosphate was isolated and hydrolized and the different 2′,3′-mononucleotides separated by high voltage paper electrophoresis. The distribution of label in each 2′,3′-mononucleotide (mole%) is presented below for resting (left) and wounded tissue after a 36-hr wound-healing period (right). Standard deviation ± 1.0 mole%.


Videoya baxın: Zulal sintezi (Yanvar 2023).