Məlumat

Reproduktiv müvəffəqiyyət və təsirli populyasiya ölçüsündə fərqlilik

Reproduktiv müvəffəqiyyət və təsirli populyasiya ölçüsündə fərqlilik


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Fon

Effektiv əhali sayı $ N_e $, nəzərdən keçirilən populyasiyadan eyni miqdarda sürüşmə yaşayan Wright-Fisher populyasiyasının ölçüsüdür.

Fərdlər arasında reproduktiv müvəffəqiyyət fərqi nə qədər yüksək olsa, təsirli əhali o qədər aşağıdır. Məsələn, reproduktiv müvəffəqiyyətdəki fərqin o qədər yüksək olduğu bir hadisəni nəzərdən keçirək ki, yalnız bir fərd çoxalır (məsələn, öz -özünə) və gələcək nəslə töhfə verir. Belə bir vəziyyətdə, reproduktiv müvəffəqiyyət fərqi o qədər yüksəkdir ki, effektiv populyasiya sayı 1 -ə endirilir.

Görüş zamanı mən populyasiyanın ölçüsü $N$, effektiv populyasiya ölçüsü $Ne$ və reproduktiv müvəffəqiyyətdə $V$ fərqi arasında aşağıdakı əlaqə ilə qarşılaşdım.

$$ N_e = frac {N} {V} $$

Mənim üçün intuitiv məna kəsb edir. $V≈0$ olan ekstremal vəziyyətdə, sürüşmənin olmadığı və buna görə də müxtəliflik itkisinin olmadığı halda, hər kəs gələcək nəslə çox töhfə verir və buna görə də $N_e=infty$. Tərifə görə, Wright-Fisher populyasiyasında $ N = N_e $ və buna görə də $ V = 1 $ düzgün olmalıdır.

Suallar

  • $ N_e = frac {N} {V} $ tənliyi haradan gəlir? Necə əldə etmək olar? Bu təxmindir, yoxsa bərabərlik?

  • Wright-Fisher populyasiyasında $ V = 1 $ olduğu doğrudurmu?


Reproduktiv müvəffəqiyyət və effektiv populyasiya ölçüsündə fərq - Biologiya

Siz verilənlər bazalarımızdan seçilmiş məzmunun maşın tərcüməsini tələb etmisiniz. Bu funksiya yalnız sizin rahatlığınız üçün verilir və heç bir şəkildə insan tərcüməsini əvəz etmək məqsədi daşımır. Nə BioOne, nə də məzmun sahibləri və nəşrçiləri tərcümə xüsusiyyətinin funksionallığı və ya dəqiqliyi və ya tamlığı ilə əlaqədar heç bir məhdudiyyət qoyulmadan hər hansı bir açıq və ya zəmanət və ya zəmanət vermirlər və açıq şəkildə rədd edirlər. tərcümələr.

Tərcümələr sistemimizdə saxlanmır. Bu xüsusiyyətdən və tərcümələrdən istifadə etməyiniz BioOne veb saytının İstifadə Şərtlərində göstərilən bütün istifadə məhdudiyyətlərinə tabedir.

ÜRƏM ÜÇÜN UĞURLARDA VAR N.e/N. NİSBƏT

1 Həyat Elmləri Məktəbi, Arizona Dövlət Universiteti, Tempe, Arizona 85287-4501 [email protected]

Mövcud olduqda PDF və HTML daxildir

Bu məqalə yalnız mövcuddur abunəçilər.
Fərdi satış üçün mövcud deyil.

Effektiv əhali sayının böyüklər (və ya siyahıyaalma) əhalinin sayına nisbəti (N.e/N.) populyasiyada gözlənilən genetik variasiya dərəcəsinin göstəricisidir. Hedgecock effekti kimi tanınan reproduktiv uğur üçün lotereya kimi şansın olduğu yüksək məhsuldar növlər üçün bu nisbətin olduqca aşağı ola biləcəyi irəli sürülüb. Burada bir neçə müvəffəqiyyətli yetişdirici olduqda nisbətin necə kiçik ola biləcəyini nəzəri olaraq göstərirəm (N.b) və bu halda N.e/N. nisbəti təxminən N.b/N.. Başqa sözlə, bir nəsil ərzində reproduktiv müvəffəqiyyətdə yüksək fərq, çox sayda yetkin olan bir orqanizmdə çox aşağı effektiv populyasiya ölçüsü ilə nəticələnə bilər və nəticədə çox aşağı N.e/N. nisbət. Tam iki nəsil olan ailələrin böyük bir hissəsi olduqda və ya bu ailələr arasında nəsil sayında təsadüfi bir dəyişiklik olduqda bu tapıntı sağlam görünür.

Philip Hedrick "REPRODUKTİV UĞURDA BÖYÜK FARKLILIQ VƏ N.e/N. RATIO," Evolution 59(7), 1596-1599, (1 iyul 2005). https://doi.org/10.1554/05-009

Alındı: 6 Yanvar 2005 Qəbul edildi: 16 Aprel 2005 Nəşr: 1 İyul 2005

Bu məqalə yalnız mövcuddur abunəçilər.
Fərdi satış üçün mövcud deyil.


1. Giriş

Çiftleşme sistemi populyasiyaların genetik quruluşuna çox təsir edə bilər. Qohumlar arasında çarpazlaşmalar və öz-özlüyündə çox yerli heterozigotluğu (MLH) azaldır və nəticədə yaranan nəsillərdə gametik tarazlığı artırır (Hedrick, Reference Hedrick 2000). Əhali səviyyəsində, eyni zamanda təsirli ölçülərin azalmasına və əhali arası fərqliliyinin artmasına səbəb olur. Üstəlik, demoqrafik dalğalanmalar (dəyişkən ekoloji şəraitdən qaynaqlanır) əhalinin müxtəlifliyinə və fərqlənməsinə eyni təsir göstərəcəyi gözlənilən keçici darboğazlarla nəticələnə bilər (Cornuet & amp Luikart, Reference Cornuet və Luikart 1996). İstiridyələr (Elm-istiridyə modeli Williams, Reference Williams 1975) kimi yüksək məhsuldarlığa və yüksək erkən ölümə malik dəniz növləri gametik (qamet keyfiyyəti və sperma-yumurtanın qarşılıqlı əlaqəsi) və zigotik (qametlərin keyfiyyəti və sperma-yumurta qarşılıqlı əlaqəsi) səbəbindən reproduktiv müvəffəqiyyətdə böyük fərqlər nümayiş etdirməyə xüsusilə meyllidir. zigotik rəqabət və genotiplərin diferensial həyat qabiliyyəti) təsirləri (Boudry və s., Referans Boudry, Collet, Cornette, Hervouet və Bonhomme 2002), təsirli əhali sayının azalmasına kömək edir. Buna görə də, bir çox dəniz növünün yüksək məhsuldarlıq və yumurtlama müvəffəqiyyəti üçün dar şərtlərin birləşməsi var ki, bu da illik kohortun yalnız bir neçə yumurtlama hadisəsinin və ya fərdin nəticəsidir (Hedgecock, Reference Hedgecock) və Beaumont 1994).

Düz istiridye, Ostrea edulis, endemik Avropa növü, təbii olaraq Norveçdən Mərakeşə qədər Şimal-Şərqi Atlantikada və bütün Aralıq dənizində rast gəlinir. Ən az 6000 ildir biçilir (Goulletquer & amp Héral, Reference Goulletquer və Héral 1997). Lakin, həddindən artıq yığım və son zamanlarda 1960 -cı illərdə ardıcıl olaraq meydana gələn iki protozoa xəstəliyi Marteilia refringensBonamia ostreae istehsalını kəskin azaldıb. Məsələn, Fransa istehsalı 1950-ci illərdəki 20 000 tondan hazırda 1 900 tona endirilmişdir (FAO, 2007). Beləliklə, yerli Avropa düz istiridye, OSPAR (Oslo-Paris) Şimal-Şərqi Atlantik dəniz mühitinin qorunması haqqında Konvensiyada (növlərin və yaşayış mühitinin qorunması) verilmişdir. Avropa sahillərində potensial bərpa kontekstində (Laing və s., Referans Laing, Walker və Areal 2005), kuluçkada yayılan ehtiyatların genetik dəyişkənliyə və vəhşi populyasiyaların təsirli populyasiya sayına potensial təsirini qiymətləndirmək vacibdir (Gaffney, Reference Gaffney 2006). Buna görə də, inkubatoriyada yayılmış ehtiyatların (Lallias) genetik dəyişkənliyi haqqında məlumat lazımdır və s., Referans Lallias, Lapègue, Boudry, King and Beaumont 2010) və populyasiyaların və balıqçılıq istehsalının düzgün idarə olunmasını təmin etmək üçün vəhşi populyasiyaların quruluşu və dinamikası.

Vəhşi heyvanların genetik quruluşu O. edulis populyasiyalar mikrosatellit DNT ilə analiz edilmişdir (Launey və s., Reference Launey, Ledu, Boudry, Bonhomme və Naciri-Graven 2002) və mitoxondrial DNT (12S) markerləri (Diaz-Almela) və s., Referans Diaz-Almela, Boudry, Launey, Bonhomme and Lapègue 2004). Mitokondriyal məlumatlara əsaslanan genetik fərqlənmə 10 qat daha böyük idi (F st= 0 · 224 Diaz-Almela və s., Referans Diaz-Almela, Boudry, Launey, Bonhomme and Lapègue 2004) mikropeyk məlumatlarında qurulandan (F st= 0 · 019 Launey və s., Reference Launey, Ledu, Boudry, Bonhomme and Naciri-Graven 2002). Nüvə və mitoxondrial arasında müşahidə edilən 10 faktorun bu kəmiyyət fərqi F st azalmış qadınların təsirli əhali sayına aid olması təklif edilmişdir. Bunu bir neçə faktorla izah etmək olar: (i) növlərin protandriyası və oogenezdə daha yüksək enerji xərcləri (Ledantec & amp Marteil, Reference Ledantec və Marteil 1976) səbəbiylə kişilərə qarşı qərəzli təsirli cinsiyyət nisbəti. qadın olmaqdan. Bu vəziyyət tərəfindən ağırlaşdırılır B. ostreae-2-3 yaşlı böyüklər arasında yüksək ölümlərə səbəb olan xəstəlik (Culloty & amp Mulcahy, Reference Culloty və Mulcahy 1996), (ii) qadınlarda kişilərin reproduktiv müvəffəqiyyətindən daha yüksək bir fərqlilik (Boudry) və s., Referans Boudry, Collet, Cornette, Hervouet və Bonhomme 2002 Taris və s., İstinad Taris, Boudry, Bonhomme, Camara and Lapègue 2009). Digər izahatlar bunlardır: (1) N. məs dörddə bir hissəsidir N. e və (2) F st ilə mütənasibdir (H SH T) (H S Hardy -Weinberg heterozigotluğunun orta subpopulyasiyasıdır H T ümumi əhalinin heterozigotluğu olmaqla) və H S istifadə edilən mikropeyklərdə 1·0 yaxınlaşdı (Hedrick, Reference Hedrick 2005)a).

Hardy -Weinberg tarazlıq gözləntiləri ilə əlaqədar heterozigot çatışmazlıqları dəniz ikibaşlı populyasiyalarda yaygındır (Zouros & amp Foltz, Referans Zouros və Foltz 1984 Huvet və s., Referans Huvet, Boudry, Ohresser, Delsert və Bonhomme 2000 Hare və s., Referans Hare, Allen, Bloomer, Camara, Carnegie, Murfree, Luckenbach, Meritt, Morrison, Paynter, Reece and Rose 2006) və O. edulis allozimlər üçün (Wilkins & Mathers, Reference Wilkins and Mathers 1973 Saavedra və s., İstinad Saavedra, Zapata, Guerra və Alvarez 1987 Alvarez və s., İstinad Alvarez, Zapata, Amaro və Guerra 1989) və mikropeyklər (Launey) və s., Referans Launey, Ledu, Boudry, Bonhomme və Naciri-Graven 2002). Mikrosatellit markerləri, ümumiyyətlə müşahidə edilən heterozigot çatışmazlıqlarından məsul olan null allellərin və yuxarı allellərin düşməsi kimi PCR artefaktlarına xüsusilə meyllidir. Bundan əlavə, MLH ilə böyümə və ya sağ qalma kimi həyat tarixi xüsusiyyətləri arasında müsbət korrelyasiya bildirildi. O. edulis Allozimlərə əsaslanır (Alvarez və s., Referans Alvarez, Zapata, Amaro və Guerra 1989 Launey, Reference Launey 1998) və mikropeyk markerləri (Bierne) və s., İstinad Bierne, Launey, Naciri-Graven və Bonhomme 1998). Heterozigot çatışmazlıqlarını və heterozigotluq-artım əlaqələrini izah etmək üçün iki növ arqument qeyd edildi. Birinci hipotez, həddindən artıq üstünlük, seçimin allozimin neytrallığını şübhə altına allozimik genotiplərə təsir etdiyini nəzərdə tutur. Bu fərziyyə mikropeyklər kimi neytral markerlərlə baş verən eyni fenomenin sübutu ilə təkzib edildi (Bierne və s., Reference Bierne, Launey, Naciri-Graven və Bonhomme 1998 Launey & Hedgecock, Reference Launey and Hedgecock 2001). İkinci hipotez, assosiativ həddindən artıqlıq, marker polimorfizminin neytral olduğunu, lakin genetik korrelyasiyalarla fitneslə əlaqəli lokusların dəyişməsini dolayı olaraq əks etdirdiyini göstərir. Genetik markerlər, istər allozimlər, istərsə də mikrosatellitlər, buna görə də ya seçim altında fiziki olaraq yaxın lokuslarla gametik tarazlıqda neytral yerləri təmsil edə bilər (yerli təsir) və ya ümumi genomik heterozigotluğun neytral markerlərini təmsil edə bilər (ümumi təsir, David və s., Referans David, Delay, Berthou and Jarne 1995). Yerli və ya ümumi olmasından asılı olmayaraq, assosiativ həddindən artıq dominantlıq fərziyyəsi bu növlərin reproduktiv biologiyasının və dinamikasının xüsusiyyətlərində kök salır. Həqiqətən, Bierne görə və s. (İstinad Bierne, Launey, Naciri-Graven və Bonhomme, 1998), ani azalmış effektiv populyasiya ölçüsü, genetik markerlər və uyğunluqla əlaqəli lokuslar arasında gametik tarazlığa səbəb ola bilər (yerli təsir), qismən qohumluq isə qlobal genomik heterozigotluqda dəyişiklik yarada bilər. fərdlər (ümumi təsir). Li & amp Hedgecock (Referans Li və Hedgecock 1998) in Crassostrea gigas və Hedgecock və s. (İstinad Hedgecock, Launey, Pudovkin, Naciri, Lapègue and Bonhomme 2007) O. edulis yerli şəraitdə, təsirli populyasiya sayının, reproduktiv müvəffəqiyyətdəki yüksək bir fərqlə kəskin şəkildə azalda biləcəyini və bu da müvəqqəti gametik faza tarazlığının pozulmasına səbəb ola biləcəyini (assosiativ həddindən artıq üstünlük hipotezini gücləndirir) vurğuladı.

Valideynlər arasında fərdi reproduktiv müvəffəqiyyətdəki fərqlilik, nəzarət edilən keçiddən istifadə edərək eksperimental şəraitdə də sənədləşdirilmişdir (məsələn Hedgecock & amp Sly, Reference Hedgecock və Sly 1990 Hedgecock və s., İstinad Hedgecock, Chow and Waples 1992 və burada istinadlar Petersen və s., İstinad Petersen, Ibarra, Ramirez və May 2008). Ən birbaşa dəlil Sakit okean istiridyəsi araşdırmalarından gəlir. C. gigasfaktorial çarpazlıqlar nəticəsində nəsillərdə ailə təmsilçiliyində baş verən dəyişikliklər, valideynlik analizləri üçün mikrosatellit markerlərindən istifadə olunmaqla təhlil edilmişdir (Boudry və s., İstinad Boudry, Collet, Cornette, Hervouet and Bonhomme 2002 Taris və s., İstinad Taris, Ernande, McCombie and Boudry 2006). Onların nəticələri bir neçə inkişaf mərhələsində valideyn töhfələrində böyük fərqlər göstərdi və bu, dörd əsas amillə əlaqələndirilə bilən eksperiment miqyasında effektiv populyasiya ölçüsünün güclü azalmasına gətirib çıxardı: gamet keyfiyyəti, sperma-yumurta qarşılıqlılığı, sperma rəqabəti və ailələr arasında diferensial sağ qalma.

Həm təbii, həm də inkubatoriyada istehsal olunan populyasiyalarda çoxalma müvəffəqiyyətindəki fərqlilik hadisələrini daha da sənədləşdirmək üçün. O. edulis, iki suala cavab vermək üçün iki tamamlayıcı araşdırma apardıq: (1) Reproduktiv müvəffəqiyyətdə təsirli populyasiya sayının azalması ilə nəticələnə biləcək bir fərqi aşkar etmək mümkündürmü? (2) Bu fərqlilik müvəqqəti olaraq necə ifadə olunur? Bu suallara cavab vermək üçün ilk növbədə vəhşi təbiətdə cücərən dişilərdən nümunə götürüldü və mikrosatellit allel tezlikləri əsasında hər dişi mayalandıran erkəklərin sayı təxmin edildi. Daha sonra, böyük təbii populyasiyalarla işləmək və bir çox ekoloji faktorlara xas olan çatışmazlıqlardan yaxa qurtarmaq üçün eksperimental şəraitdə valideynlik təhlili aparıldı: genotipləri məlum olan inkubatoriyada saxlanılan potensial ata -baba populyasiyasından ardıcıl kohortlar toplandı. nəticə çıxarmaq a posteriori hər birinin nisbi töhfəsi. Bu iki tədqiqatın nəticələri əvvəllər yabanı və ya inkubatoriyada yetişdirilmiş yastı istiridyələr üzərində aparılan tədqiqatlar əsasında müzakirə olunur.


Effektiv seleksiyaçıların sayı, effektiv populyasiya ölçüsü və onların iteropar növlərdə siyahıyaalma ölçüsü ilə əlaqəsi, Salvelinus fontinalis

Effektiv yetişdiricilərin sayı (Nb) ilə nəsillərin effektiv ölçüsü (Ne) arasındakı əlaqə nadir hallarda nəsilləri üst -üstə düşən və iteroparitet olan növlərdə empirik olaraq araşdırılmışdır. 11 mikrosatellit marker dəstinə əsaslanaraq, Nova Scotia'daki 12 kiçik dərədə yaşayan və 2009-2015 -ci illər arasında ən azı iki dəfə nümunə götürülmüş 14 dərə alabalığı (Salvelinus fontinalis) populyasiyalarında Nb, Ne və siyahıyaalma populyasiyalarının sayı (Nc) arasındakı əlaqəni araşdırırıq. İlk olgunlaşma yaşına (α) və yetkinlərin ömrünə (AL) əsaslanaraq düzəldilmiş bir qrupun fərdləri ilə əldə edilən Nb -nin qərəzsiz hesablamaları, qarışıq fərdlərin təsadüfi nümunələri ilə əldə edilən Ne -nin orta hesablamalarının 1,66 ilə 0,24 dəfə çox idi. yaşlar (yəni [Formula: mətnə ​​baxın]). Öz növbəsində, bu fərqlər qarışıq yaşlı fərdlərdən əldə edilən təxminlərdən təxminən 5-0,7 dəfə çox olan düzəliş edilmiş Ne təxminlərinə gətirib çıxardı. Bu fərqlər populyasiyalar daxilində effektiv əhalinin siyahıyaalınmasına nisbətdə eyni dəyişmə diapazonuna çevrilir [Formula: mətnə ​​baxın]. Daha dəqiq və qərəzsiz hesablamalar olaraq [Formula: mətnə ​​bax] qəbul edərək, bu çay alabalığının populyasiyaların sayına təsirli olaraq əhəmiyyətli dərəcədə fərqləndiyini gördük (təxminən 0,3 ilə 0,01 aralığında). AgeNe istifadə edərək, daha sonra göstərdik ki, reproduktiv müvəffəqiyyət və ya reproduktiv əyilmə fərqi populyasiyalar arasında Vk/k ≈ 5 ilə 200 arasında 40 dəfə dəyişdi. yoldaşlara və ya reddlərə daxil olmaq üçün rəqabətin intensivliyi və beləliklə, reproduktiv əyrilik. Ne, Nb və Nc arasındakı əlaqəni və bunların populyasiya dinamikası və əhali sayındakı dalğalanmalarla necə əlaqəli olduğunu başa düşmək, nəsillərin üst -üstə düşməsi və iteroparity ilə kiçik populyasiyalarda sağlam konservasiya strategiyalarının tərtib edilməsi üçün vacibdir.

Açar sözlər: Nb Ne olgunlaşma çağında alabalıq iteroparity kiçik populyasiyalarda.

Rəqəmlər

Şimal boyunca nümunə götürülmüş axınlar…

Yeni Şotlandiyadakı Şimal dağı boyunca nümunə götürülmüş axınlar. Axınlar axır…

Əsas koordinat təhlili (PCA) əsaslı…

Alabalıq alabalığı üçün 11 lokusa əsaslanan əsas koordinat analizi (PCA)…


Cins dəyişikliyi və effektiv populyasiya ölçüsü: dəniz balıqlarında populyasiya genetik tədqiqatları üçün təsirlər

Reproduktiv müvəffəqiyyətdə böyük fərqlilik təbii populyasiyalarda təsirli populyasiya sayını (Ne) azaldan əsas amildir. Ardıcıl olaraq hermafroditik (cinsi dəyişən) balıqlarda cinsiyyət nisbəti ümumiyyətlə "ilk" cinsə doğru əyilir və qərəzlidir, cinsiyyət dəyişikliyindən sonra isə reproduktiv uğur xeyli artır. Buna görə də, nəzəri olaraq cinsini dəyişən balıq populyasiyalarının gonoxoristlərdən (ayrı-ayrı cinslər) daha aşağı Ne-yə malik olması gözlənilir, bütün digər parametrlər mahiyyətcə bərabərdir. Bu araşdırmada biz Cənubi Afrikanın şərq sahillərində yaşayan iki ekoloji cəhətdən oxşar növdən toplanmış genetik məlumatlardan Ne-ni təxmin edirik: biri qonokoristik, 'santer' çipura Cheimerius nufar və bir protogin (qadın-birinci) cinsi dəyişdirici, ' çipura Chrysoblephus puniceus. Hər iki növ üçün, tədqiqat sahəsində genetik quruluşa dair heç bir dəlil və ya genetik müxtəliflikdə əhəmiyyətli bir dəyişiklik tapılmadı. Müasir Ne-nin təxminləri protogin növlərdə əhəmiyyətli dərəcədə aşağı idi, lakin eyni nümunə tarixi zaman miqyasında aydın deyildi. Ümumiyyətlə, əldə etdiyimiz nəticələr göstərir ki, ardıcıl hermafroditizm müxtəlif vaxtlarda Ne-yə fərqli təsir göstərə bilər və fərqli irsiyyət rejimi olan genetik markerlərdən çıxarılan demoqrafik imzalar da cinsi dəyişən həyat tarixçələri ilə əlaqədar olaraq ehtiyatla şərh edilməlidir.

Rəqəmlər

Xəritə: nümunə götürmə yerləri…

Xəritə: Cənubi Afrikanın KwaZulu-Natal sahilindən nümunə götürmə yerləri.

Effektiv əhali sayı təxminləri: təsirli…

Effektiv əhali ölçüsü təxminləri: effektiv əhali ölçüsü Cheimerius nufar (santer, qara)...

Tarixi qadınların təsirli əhali sayı:…

Tarixi qadın təsirli əhali sayı: tarixi qadın təsirli əhali sayı ( N. e…

Bayesian Skyline süjetləri: Bayesian Skyline…

Bayesian Skyline planları: Bayesian Skyline santer üçün Chemerius nufar və slinger Chrysoblephus…


  • Ekologiya, Təkamül, Davranış və Sistematika
  • Genetika
  • Kənd Təsərrüfatı və Biologiya Elmləri (hamısı)
  • APA
  • Standart
  • Harvard
  • Vankuver
  • Müəllif
  • BIBTEX
  • RIS

In: Evolution, Vol. 59, No 7, 07.2005, s. 1596-1599.

Araşdırma nəticəsi: Jurnala töhfə ›Məqalə› həmyaşıd baxış

T1 - Reproduktiv müvəffəqiyyətdə və Ne/N nisbətində böyük fərq

N2 - Effektiv populyasiya ölçüsünün yetkin (və ya siyahıyaalma) populyasiya ölçüsünə (Ne/N) nisbəti populyasiyada gözlənilən genetik variasiya dərəcəsinin göstəricisidir. Hedcecock effekti olaraq bilinən çoxalma şansına sahib olan çoxalma qabiliyyətli növlər üçün bu nisbətin olduqca aşağı ola biləcəyi irəli sürüldü. Burada nəzəri olaraq göstərirəm ki, yalnız bir neçə uğurlu damazlıq (Nb) olduqda bu nisbət olduqca kiçik ola bilər və bu halda Ne/N nisbəti təxminən Nb/N -dir. Başqa sözlə, bir nəsil içərisində reproduktiv müvəffəqiyyətdəki yüksək varyans, çox sayda yetkin olan bir orqanizmdə təsirli populyasiya sayının çox aşağı və nəticədə çox aşağı N/N nisbətinə səbəb ola bilər. Tam iki nəsil olan ailələrin böyük bir hissəsi olduqda və ya bu ailələr arasında nəsil sayında təsadüfi bir dəyişiklik olduqda bu tapıntı sağlam görünür.

AB - Etkili populyasiya sayının böyüklər (və ya siyahıyaalma) populyasiya sayına (Ne/N) nisbəti bir populyasiyada gözlənilən genetik dəyişikliyin dərəcəsinin göstəricisidir. Hedcecock effekti olaraq bilinən çoxalma şansına sahib olan çoxalma qabiliyyətli növlər üçün bu nisbətin olduqca aşağı ola biləcəyi irəli sürüldü. Burada nəzəri olaraq göstərirəm ki, yalnız bir neçə uğurlu damazlıq (Nb) olduqda bu nisbət olduqca kiçik ola bilər və bu halda Ne/N nisbəti təxminən Nb/N -dir. Başqa sözlə, bir nəsil içərisində reproduktiv müvəffəqiyyətdəki yüksək varyans, çox sayda yetkin olan bir orqanizmdə təsirli populyasiya sayının çox aşağı və nəticədə çox aşağı N/N nisbətinə səbəb ola bilər. Bu tapıntı tam olaraq iki nəsli olan ailələrin böyük bir hissəsi olduqda və ya bu ailələr arasında nəsil saylarında təsadüfi dəyişiklik olduqda etibarlı görünür.


Aló, D. & T.F. Turner. 2004. Habitat parçalanması, ekoloji vaxtda təsirli ölçüləri siyahıyaalma ölçüsü nisbətini (Ne/N) aşağı salır: Nəsli kəsilməkdə olan Rio Grande gümüşü minnow, Hybognathus amarus nümunəsi. Qoruyucu. Biol.

C.S. Altenbach R.K. Dudley S.P. Platania (2000) Məqalə Başlıq Üzən yarıdaşıyan balıq yumurtalarını toplamaq üçün yeni cihaz Trans. Am. Balıq. Soc. 129 296–300 Oluşma Tutacağı 10.1577/1548-8659 (2000) 129 & lt0296: ANDFCD & gt2.0.CO2

K.R. Bestgen S.P. Platania (1991) Məqalə Başlıq Statusu və Rio Grande gümüşü minnow, Hybognathus amarusun qorunması Cənub -qərb. Nat. 36 225–232 Hadisə Dəstəyi 10.2307/3671925

P. Dimsoski G. Toth M. Bagley (2000) Məqalə Başlıq Mərkəzi daş rulonda mikrosatellit xarakteristikası Kampostoma anomaliyası (Balıqlar: Cyprinidae) Mol. Ekol. 9 2187–2189 Hadisə Dəstəyi 1:CAS:528:DC%2BD3MXot1Oqug%3D%3D Hadisə Dəstəyi 10.1046/j.1365-294X.2000.105318.x

L. Excoffier P.E. Smouse J.M. Quattro (1992) Məqalənin başlığı DNT haplotipləri arasında metrik məsafələrdən çıxarılan molekulyar dispersiyaların təhlili: İnsan mitoxondrial DNT məhdudlaşdırma məlumatlarına tətbiq Genetika 131 479–491 Baş vermə Dəstəyi 1:CAS:528:DyaK38XlsVCntro%3D

D.S. Falconer (1981) Longman Londonda Kəmiyyət Genetikasına Giriş

J.M.Çiçəklər C.Şroeter R.S. Burton (2002) Məqalə Başlığı İşə qəbul üzrə lotereyada çoxlu qaliblər var: Dəniz kirpisindən genetik sübut Strongylocentrotus purpuratus Təkamül 56 1445–1453 Olay Tutuşu 1: CAS: 528: DC%2BD38Xmsl2jsrg%3D Oluşma Tutacağı 10.1111/j.0014-3820.2002.tb01456.x

O.E. Gaggiotti R.D. Vetter (1999) Məqalə Adı Həyat tarixi strategiyasının, ətraf mühitin dəyişkənliyinin və həddindən artıq istismarın pelajik balıq populyasiyalarının genetik müxtəlifliyinə təsiri. Bacarmaq. J. Balıq. Aquat. Elmi. 56 1376–1388

J. Goudet (1995) Məqalənin adı FSTAT V1.2. F-Statistikanı hesablamaq üçün kompüter proqramı J. Hered. 86 485–486 Hadisə Dəstəyi 10.1093/oxfordjournals.jhered.a111627

S.W. Guo E.A. Thompson (1992) Məqalə Adı Çox allellər üçün Hardy -Weinberg nisbətinin dəqiq testini həyata keçirir. Biometrik 48 361–372 Hadisə Dəstəyi 1:STN:280:DyaK38zksFGgsA%3D%3D Hadisə Dəstəyi 10.2307/2532296

D. Hedgecock (1994) Reproduktiv müvəffəqiyyətdəki fərqlilik dəniz orqanizmlərinin təsirli populyasiya ölçülərini məhdudlaşdırırmı? A.R. Beaumont (Eds) Su orqanizmlərinin genetikası və təkamülü Chapman, Hall New York 122–134

PL. Leberg (2002) Məqalənin Başlığı Allelik zənginliyin qiymətləndirilməsi: Nümunə ölçüsünün və darboğazların təsiri Mol. Ekol. 11 2445–2449 Oluşma Sapı 1: CAS: 528: DC%2BD38XptlSlsLY%3D Oluşma Tutacağı 10.1046/j.1365-294X.2002.01612.x

G. Li D. Hedgecock (1998) Məqalə Başlıq Sakit okean istiridyələrinin sürfələri arasında PCR-SSCP tərəfindən aşkar edilən genetik heterojenlik (Crassostrea gigas) reproduktiv uğurun yüksək varyansını dəstəkləyir Bacarmaq. J. Balıq. Aquat. Elmi. 55 1025–1033 Hadisə Dəstəyi 1:CAS:528:DyaK1cXkslOhtro%3D Hadisə Dəstəyi 10.1139/f97-312

G.R. Luttrell A.A. Echelle W.L. Fisher D.J. Eisenhour (1999) Məqalə Adı İki növün statusu azalır Macrhybopsis aestivalis Arkanzas çayı hövzəsində kompleks (Teleostei: Cyprinidae) və su anbarlarının dağılma üçün maneələr kimi əlaqəli təsiri Copeia 1999 981–989 Baş vermə Dəstəyi 10.2307/1447973

W.L. Minckley G.K. Meffe D.L. Soltz (1991) Qısa ömürlü balıqların qorunması və idarə edilməsi: Kiprinodontoidlər W.L. Minkley J.E. Deacon (Eds) Tükənməyə Qarşı Mübarizə: Arizona Press West Tucson, Amerika Qərb Universitetində Yerli Balıq İdarəçiliyi, Arizona 247-279

W.L. Minckley P.C. Marsh J.E. Deacon T.E. Dowling P.W. Hedrick W.J. Matthews G. Mueller (2003) Məqalə Başlığı Aşağı Kolorado çayının yerli balıqları üçün qorunma planı Bioelm 53 219–234 Oluşma Tutacağı 10.1641/0006-3568 (2003) 053 [0219: ACPFNF] 2.0.CO2

W.L. Minckley J.E. Dicon (1968) Məqalənin başlığı Cənub-Qərb balıqları və “nəsli kəsilməkdə olan növlərin” müəmması. Elm 159 1424–1432 Oluşma Dəstəyi 1: STN: 280: DyaF1M3lt1ynsQ%3D%3D Oluşma Tutacağı 10.1126/elm.159.3822.1424

G.A. Moore (1944) Məqalənin başlığı Erkən həyat tarixinə dair qeydlər Notropis girardi Copeia 1944 209–214 Oluşma Tutacağı 10.2307/1438675

P.B. Moyle J.E. Williams (1990) Məqalə Mülayim zonada bioloji müxtəlifliyin itkisi: Kaliforniyanın yerli balıq faunasının azalması Qoruyucu. Biol. 4 278–284 Hadisə Dəstəyi 10.1111/j.1523-1739.1990.tb00289.x

M. Nei (1987) Molekulyar Təkamül Genetiği Columbia Universiteti Press New York, ABŞ Ocurrence Handle 10.7312/nei-92038

R.J. Petit A. El Mousadik O. Pons (1998) Məqalə Başlığı Genetik markerlər əsasında qorunması üçün populyasiyaların müəyyən edilməsi Qoruyucu. Biol. 12 844–855 Oluşma Sapı 10.1046/j.1523-1739.1998.96489.x

S.P. Platania C. Altenbach (1998) Məqalə Başlığı Yeddi Rio Grande hövzəsindəki siprinidlərdə reproduktiv strategiyalar və yumurta növləri. Copeia 3 559–569 Baş vermə Dəstəyi 10.2307/1447786

D.İ. Rasmussen (1979) Məqalə Başlıq Qardaş qrupları və gen tezlikləri Am. Nat. 113 948-951 Oluşma Tutacağı 10.1086/283449

W.R. Rays (1989) Maddə Başlığı Statistik testlərin analiz cədvəlləri Təkamül 43 223–225 Hadisə Dəstəyi 10.1111/j.1558-5646.1989.tb04220.x

A. Robertson (1965) Məqalə Adı Ev heyvanları populyasiyalarında genotip nisbətlərinin təfsiri Anim. Yenidən. 7 319–324

D.E. Ruzzante C.T. Taggart D. Cook (1996) Məqalə Başlıq Sürfə treskasının genetik tərkibində məkan və zaman dəyişkənliyi (Gadus morhua) birləşmələr: Kohort töhfəsi və genetik sabitlik Bacarmaq. J. Balıq. Aquat. Elmi. 53 2695–2705 Oluşma Tutacağı 10.1139/f96-235

Schneider, S., D. Roessli & amp L. Excoffier, 2000. Arlequin: Populyasiya genetikası məlumatlarının təhlili üçün bir proqram. Ver 2.000. Genetika və Biometriya Laboratoriyası, Antropologiya Departamenti, Cenevrə Universiteti. 111 səh

P. Sunnucks A.C.C. Wilson L.B. Beheregaray K. Zenger J. French A.C. Taylor (2000) Məqalə SSCP o qədər də çətin deyil: tək təkilli konformasiya polimorfizminin təkamül biologiyası və molekulyar ekologiyada tətbiqi və faydası Mol. Ekol. 9 1699–1710 Hadisə Dəstəyi 1:CAS:528:DC%2BD3cXos1ymtL4%3D Hadisə Dəstəyi 10.1046/j.1365-294x.2000.01084.x

D.T. Trevino-Robinson (1959) Məqalənin adı Aşağı Rio Qrande, Texas və Meksikanın ixtiofaunası Copeia 1959 253–256 Oluşma Tutacağı 10.2307/1440404

T.F. Turner L.R. Richardson J.R. Gold (1999) Məqalə Başlığı Mitokondrial DNT -nin müvəqqəti genetik dəyişikliyi və qırmızı barabanın qadın təsirli populyasiya ölçüsü (Sciaenops ocellatus) Meksika körfəzinin şimalında Mol. Ekol. 8 1223–1229 Hadisə Tutacağı 10.1046/j.1365-294x.1999.00662.x

T.F. Turner T.E. Dowling R.E. Broughton J.R. Gold (2004) Məqalə Başlıq Dəyişkən mikrosatellit markerləri, siprinid balıqların (Leusicinae subfamily) fərqli soyları arasında genişlənir. Qoruyucu. Genet. 5 273–281

InstitutionalAuthorName ABŞ Daxili İşlər Departamenti (1994) Məqalə: Nəsli kəsilməkdə olan və təhlükə altında olan vəhşi təbiət və bitkilər başlığı Rio Grande gümüşü minnowu nəsli kəsilməkdə olan növlər siyahısına daxil etmək üçün son qayda. Fed Reg. 59 36988–36995

R.L. Vannote G.W. Minshall K.W. Cummins J.R. Sedell C.E. Cushing (1980) Məqalə Title River kontinuumu konsepsiyası Bacarmaq. J. Balıq. Aquat. Elmi. 37 130–137 Oluşma Tutacağı 10.1139/f80-017

S. Wahlund (1928) Məqalə Başlığı, korrelyasiya ilə əlaqələndirilməmiş bir mövzu ilə əlaqədardır. Hereditas 11 65–106 Hadisə Dəstəyi 10.1111/j.1601-5223.1928.tb02483.x


Materiallar və metodlar

Nümunə götürmə

C. puniceusC. nufar nümunələr 2007-ci ilin may və iyul ayları arasında KwaZulu-Natal sahili boyunca üç yerdə: Port Edvard, Park Rynie və Richards Bay (RB) (Şəkil 1) kommersiya xizək gəmisi xətti balıqçılarından toplanmışdır. Cəmi 138 C. puniceus (122 qadın və 16 kişi) və 139 C. nufar (69 qadın və 67 kişi) toplandı.

Xəritə: Cənubi Afrikanın KwaZulu-Natal Sahilində nümunə götürmə yerləri.

Çəngəl uzunluğu və çəkisi ölçüldü və cinsiyyət makroskopik gonad identifikasiyası ilə qiymətləndirildi. Hər ikisinin yaşını çəngəl uzunluğundan əldə etmək üçün əvvəllər nəşr olunan uzunluq -yaş əlaqələrindən istifadə etdik C. puniceus (Garratt et al., 1993) və C. nufar (Druzhinin, 1975 Coetzee and Baird, 1981). Üzgəc klipləri döş üzgəclərindən götürüldü və sonradan DNT-nin çıxarılması üçün mütləq etanolda saxlanıldı.

Molekulyar analizlər

DNT, dəyişdirilmiş bir fenol -xloroform protokolu ilə çıxarılmışdır (Sambrook və Russell, 2001). DNT konsentrasiyası və keyfiyyəti NanoDropTM ND-1000 (Thermo Fisher Scientific Inc., Wilmington, DE, ABŞ) spektrofotometrində qiymətləndirilmişdir. Hər iki növün nümunələri, bu iş üçün xüsusi olaraq hazırlanmış 11 mikrosatellit lokusunda tarandı (Chopelet və digərləri, 2009a). Üçün nəzərdə tutulmuş 11 mikrosatellitdən C. puniceus, 5 çarpaz gücləndirilmiş C. nufar. Xüsusi olaraq altı əlavə mikrosatellit hazırlanmışdır C. nufar, Chopelet et al. (2009a) (ətraflı məlumat üçün Cədvəl 1-ə baxın). Mikrosatellitlər flüoresan işarəli irəli primerlərdən (Applied Biosystems, Waltham, MA, ABŞ) və 2X Multiplex PCR Master Mix (Qiagen, Hilden, Almaniya) 10 μl son həcmdə gücləndirildi. Ölçüdən və boyadan asılı olaraq fraqmentlər iki multipleks reaksiyaya çevrildi C. puniceus (Chopelet et al., 2009a), digər mikrosatellit (SL3) isə ayrıca gücləndirilmişdir. üçün C. nufar, bir reaksiyada SL25 və SA2, digərinə isə qalan doqquz lokus daxil idi (Cədvəl 1). Bütün gücləndirmələr eyni şərtlərdən istifadə etməklə həyata keçirilmişdir. 95 ° C -də 15 dəqiqəlik ilk addımı 94 ° C -də 45 s, 60 ° C -də 45 s və 72 ° C -də 45 s 30 dövr və 72 ° C -də 45 dəqiqə ərzində son uzatma addımı izlədi. PCR məhsulları GS600 nərdivanı ilə birlikdə ABI 3130xl ölçüsündə idi. Genemapper v 4 (Tətbiqi Biosistemlər) allellərin qiymətləndirilməsi üçün istifadə edilmişdir.

Universal primerlər Hsp1 və Lsp1 də mitoxondrial DNT (mtDNA) nəzarət bölgəsinin ilk hiperdəyişən bölgəsini gücləndirmək üçün istifadə edilmişdir (Ostellari et al., 1996). Hər bir reaksiya 25 μl yekun həcmdə Hazır Qarışıqda (Tətbiqi Biosistemlər) 300 ng genomik DNT istifadə edilərək həyata keçirildi. PCR dövrləri aşağıdakı kimidir: (a) 95 ° C (5 dəq) (b) 30 dövr 95 ° C (50 s), 56 ° C 1 dəq və 72 ° C (2 dəq) və (c) son 10 72 °C-də dəq uzama (10 dəq). Gücləndirilmiş məhsullar ekzonükleaza I və karides qələvi fosfatazası (Hanke & amp Wink 1994) ilə təmizləndi və GATC-Biotech-də (Konstanz, Almaniya) ardıcıllıqla sıralandı.

Statistik təhlillər

Genetik müxtəliflik

Genetik analizlər əvvəlcə məkan quruluşunun nümunələrini aşkar etmək və məkan daxilində və arasında müxtəlifliyi qiymətləndirmək üçün edildi. Mikropeyk məlumatları üçün sıfır allellərin tezlikləri FREENA istifadə edərək təxmin edilmişdir (Chapuis və Estoup, 2007). Hər bir yer nümunəsi üçün allellərin sayı (N.a), müşahidə (Ho) və gözlənilən (He) heterozigozluq və qohumluq əmsalı (FIS) GENEPOP WEB -də (http://genepop.curtin.edu.au/ Raymond və Rousset, 1995 Rousset, 2008) istifadə edərək qiymətləndirilmişdir. Marker neytrallığı LOSITAN -da sınaqdan keçirildi (Antao et al., 2008). Populyasiyalar arasında nümunə ölçüsündə fərqi düzəltmək üçün biz allel zənginliyini daha da qiymətləndirdik (AR) FSTAT 2.9.3 (Goudet, 1995) istifadə edərək minimum nümunə ölçüsünə (Cədvəl 1) və ADZE 1.0 -da (Szpiech və digərləri, 2008) tətbiq olunan nadir parçalanma metodundan istifadə edən özəl allellərin sayına (Kalinowski, 2005) əsaslanır. Əhali diferensiasiyasından istifadə etməklə təxmin edilmişdir θ qiymətləndiricisi FST (Weir və Cockerham, 1984) və GENETIX v.4.05.2 (Belkhir et al., 1996–2004) fərdlər üzərində 10 000 permütasyondan istifadə edərək nisbi güvən intervalları. Bizim vəziyyətimizdə mutasiya nisbəti, ehtimal ki, miqrasiya nisbətlərindən daha kiçik əmrlər olsa da, düzəldildi F'ST (Hedrick, 2005) və Jost's hesablandı Dest (Jost, 2008) SMOGD (Crawford, 2010) istifadə edərək təxmin edildi və genetik alt quruluş haqqında əlavə məlumat olaraq bildirdi. POWSIM, genetik fərqlənməni aşkar etmək üçün verilənlərin gücünü qiymətləndirmək üçün istifadə edilmişdir (Ryman və Palm, 2006). Beş yüz təkrar və fərqli N.e/t gözlənilən əmsalları əldə etmək üçün (500/0 2000/2 1000/5 1000/10 və 500/10) istifadə edilmişdir. FST bu tənliyə görə: FST=1−(1−1/2N.e) t , ilə t təcrid olunmuş nəsillərin sayıdır (Ryman və Palm, 2006). Bayes tapşırığı, ehtimal olunan genetik qrupların sayını çıxarmaq üçün STRUCTURE 2.3 (Pritchard et al., 2000 Falush et al., 2003, 2007) 'də yerinə yetirilmişdir.K) 50 000 yandırıldıqdan sonra qatışıq modeli və 500 000 təkrarlama istifadə edərək məlumat dəstlərində mövcuddur. Klasterlərin sayı, məlumatların orta posterior ehtimalını ortalamaqla hesablandı L(K) 10 -dan çox müstəqil qaçış.

Nukleotid və haplotip müxtəlifliyi DNASP v4.5 istifadə edərək mtDNT ardıcıllığından təxmin edilmişdir (Rozas et al., 2003). Median-Qoşulma şəbəkələri hər iki növ üçün POPART (http://popart.otago.ac.nz) istifadə edərək qurulmuşdur.

Estimating effective population size

We used the linkage disequilibrium (LD) method implemented in LDNe (Waples and Do, 2008) to estimate contemporary N.e for each location from the microsatellite data, both including and excluding the markers that were not under Hardy-Weinberg equilibrium according to the exact test performed in Genepop. The LD method is based on the theoretical relationship (Hill, 1981) between a measure of LD (r 2 =squared correlation of alleles at pairs of unlinked gene loci), sample size (N.) və N.e. LDNe implements a modification of Hill’s method that accounts for bias from ignoring second order terms in N and N.e. LDNe allows one to screen out rare alleles, which tend to upwardly bias N.e estimates, by selecting a minimum allowable allele frequency (PCrit). We focused especially on PCrit=0.02, which (given the minimum sample sizes of N.=39–45 Table 2) ensured that any alleles that occurred in a single copy were not used (Waples and Do, 2010). Another estimate of effective population size was obtained using the Approximate Bayesian Computation method implemented in DIYABC 2.01 (Cornuet və s., 2014). Calculations were performed for each species, pooling samples from all locations in order to reflect the lack of genetic substructure detected in our data. Three simple scenarios were simulated. Each one represented one single population whose N.e remained constant (scenario 1), one where N.e increased after a time t1 (scenario 2) and the third where N.e decreased after t1. Priors were as follows: effective population size was between 10 and 10 6 and t1 between 10 and 10 4 generations.

A longer-term view of effective population size was also obtained through estimates of historical female N.e from mtDNA data. We first used the Watterson estimator of the mutation parameter theta (θ) obtained from the number of polymorphic sites (S) (Watterson, 1975). In DNASP v4.5, θ is defined as 2N.eμ for mtDNA, where N.e effektiv populyasiya ölçüsüdür və μ is the mutation rate per DNA sequence per generation (Tajima 1996). We estimated the female effective population size (N.ef) from the haplotype mutation rate and generation time (T) according to this equation:

We assumed a widely accepted rate μ=11% per site per million year for the Sparid mtDNA control region (Bargelloni et al., 2003 Sala-Bozano et al., 2009 Coscia et al., 2012), equal to 0.055 substitutions per site per million years. The age at maximum egg production was estimated with Linf=47 cm for C. puniceusLinf=75 cm for C. nufar (where Linf, a parameter of the von Bertalanffy growth equation, is defined as the length that an individual would reach if it grew indefinitely). This, according to Beverton (1992), can be used as an approximation of generation time (T=5 for C. puniceus and 7 for C. nufar). Therefore, to account for life-history plasticity, we estimated N.e in both species with generation time encompassing these values: T=3, 5 and 8.

Furthermore, we applied the Bayesian Skyline Plot approach implemented in BEAST v 1.7 (Drummond et al., 2012) to estimate trends in past effective population size. Firstly, jModelTest 0.1.1 (Posada, 2008 Guindon and Gascuel, 2003) was used to select the best model of substitution for each data set via the AIC (Akaike Information Criterion): GTR (Generalised Time Reversible described in Tavaré (1986)) was selected for C. nufar and HKY (Hasegawa 1985) for C. puniceus. To avoid convergence issues, several independent runs (each 10 6 generations and 10% burn-in) were used for each species until each effective sample size value reached

200 as per the user’s manual.


Strong gender differences in reproductive success variance, and the times to the most recent common ancestors

The Time to the Most Recent Common Ancestor (TMRCA) based on human mitochondrial DNA (mtDNA) is estimated to be twice that based on the non-recombining part of the Y chromosome (NRY). These TMRCAs have special demographic implications because mtDNA is transmitted only from mother to child, while NRY is passed along from father to son. Therefore, the former locus reflects female history, and the latter, male history. To investigate what caused the two-to-one female–male TMRCA ratio r F / M = T F / T M in humans, we develop a forward-looking agent-based model (ABM) with overlapping generations. Our ABM simulates agents with individual life cycles, including life events such as reaching maturity or menopause. We implemented two main mating systems: polygynandry and polygyny with different degrees in between. In each mating system, the male population can be either homogeneous or heterogeneous. In the latter case, some males are ‘alphas’ and others are ‘betas’, which reflects the extent to which they are favored by female mates. A heterogeneous male population implies a competition among males with the purpose of signaling as alpha males. The introduction of a heterogeneous male population is found to reduce by a factor 2 the probability of finding equal female and male TMRCAs and shifts the distribution of r F / M to higher values. In order to account for the empirical observation of the factor 2, a high level of heterogeneity in the male population is needed: less than half the males can be alphas and betas can have at most half the fitness of alphas for the TMRCA ratio to depart significantly from 1. In addition, we find that, in the modes that maximize the probability of having 1.5 < r F / M < 2.5 , the present generation has 1.4 times as many female as male ancestors. We also tested the effect of sex-biased migration and sex-specific death rates and found that these are unlikely to explain alone the sex-biased TMRCA ratio observed in humans. Our results support the view that we are descended from males who were successful in a highly competitive context, while females were facing a much smaller female–female competition.

Vurğulanan məqamlar

► We develop a novel agent-based model (ABM) of a population of women and men. ► Our population has overlapping generation and different mating systems. ► We classify conditions reproducing the observed human female–male TMRCA ratio of 2. ► We find that high male–male competition is necessary to yield the TMRCA ratio of 2.


Population structure and variance effective size of red snapper (Lutjanus campechanus) in the northern Gulf of Mexico

We assayed allelic variation at 19 nuclear-encoded microsatellites among 1622 Gulf red snapper (Lutjanus campechanus) sampled from the 1995 and 1997 cohorts at each of three offshore localities in the northern Gulf of Mexico (Gulf). Localities represented western, central, and eastern subregions within the northern Gulf. Number of alleles per microsatellite per sample ranged from four to 23, and gene diversity ranged from 0.170 to 0.917. Tests of conformity to Hardy-Weinberg equilibrium expectations and of genotypic equilibrium between pairs of microsatellites were generally nonsignificant following Bonferroni correction. Significant genic or genotypic heterogeneity (or both) among samples was detected at four microsatellites and over all microsatellites. Levels of divergence among samples were low (FST ≤0.001). Pairwise exact tests revealed that six of seven “significant” comparisons involved temporal rather than spatial heterogeneity. Contemporaneous or variance effective size (N.eV) was estimated from the temporal variance in allele frequencies by using a maximum-likelihood method. Estimates of N.eV ranged between 1098 and >75,000 and differed significantly among localities the N.eV estimate for the sample from the northcentral Gulf was >60 times as large as the estimates for the other two localities. The differences in variance effective size could reflect differences in number of individuals successfully reproducing, differences in patterns and intensity of immigration, or both, and are consistent with the hypothesis, supported by life-history data, that different “demographic stocks” of red snapper are found in the northern Gulf. Estimates of N.eV for red snapper in the northern Gulf were at least three orders of magnitude lower than current estimates of census size (N.). The ratio of effective to census size (N.e/N.) is far below that expected in an ideal population and may reflect high variance in individual reproductive success, high temporal and spatial variance in productivity among subregions or a combination of the two.


Videoya baxın: ÇİNDE YENİ BİR İNSAN TÜRÜ DOĞDU (Yanvar 2023).