Məlumat

Bir obyektdəki SARS-CoV-2 virusuna nə olur?

Bir obyektdəki SARS-CoV-2 virusuna nə olur?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Bir çox məqalədə deyilir ki, "koronavirus" - ehtimal ki, SARS -CoV -2 -dən bəhs edirlər - bəzi səthlərdə bu qədər saatlar, digər səthlərdə isə bir neçə gün "sağ qala" bilərlər. Məsələn, "virus şüşə üzərində 5 gün yaşayır".

Düşünürəm ki, bu, pis bir söz seçimidir. Bütün bu məqalələr sanki canlı bir varlıq kimi SARS-CoV-2 virusundan bəhs edir. Amma məncə canlı deyil. SARS-CoV-2 virusu şüşə səthdə “yaşamır”. Sadəcə oradadır.

Bir obyekt üzərində SARS-CoV-2 virusu olanda nə olur? 5 gündən sonra artıq yoxdursa, niyə? Zaman virusa nə edir?


Bu məqalələr sadəcə virusun həyat qabiliyyətinə, yəni bundan sonra da bir ev sahibinə yoluxa biləcəyinə işarə edir. (Bəzən buna virusun "sağ qalması" da deyilir.)

Yaşamayan virion, yoluxmayan bir ev sahibi baxımından belə olsa da, "orada deyil" ilə tamamilə eyni deyil.

Bu canlılıq [ətraf mühitdə] tədqiqatları, bir müddət sonra bir səthdə (və ya hətta "havada") nə qədər virüsün (yəni neçə virionun) hələ də həyat qabiliyyətli olduğuna dair kəmiyyət ölçüsü istifadə edir.

SARS-CoV-2, sınaq müddətimizdə (3 saat) aerozollarda canlı olaraq qaldı, 10-dan infeksion titr azaldı.3.5 10 -a qədər2.7 TCID50 litr havaya. […]

SARS-CoV-2 mis və kartondan daha plastik və paslanmayan poladda daha dayanıqlı idi və virus titri xeyli azalsa da (10-dan) bu səthlərə tətbiq edildikdən 72 saat sonra canlı virus aşkar edilmişdir [… ]3.7 10 -a qədər0.6 TCID50 plastikdə 72 saatdan sonra və 10-dan bir mililitr mühitə3.7 10 -a qədər0.6 Paslanmayan poladdan 48 saat sonra millilitrdə TCID50).

Beləliklə, vaxtı [seçilmiş] bəzi canlılıq statistik həddinə qədər ölçürlər. Onların xüsusi metoduna istinad üçün:

TCID50 (Median Doku Kültürü Yoluxucu Doz), virus titrinin yoxlanılması zamanı istifadə edilən üsullardan biridir.

TCID50, hüceyrələrin yetişdirildiyi sınaq borusu və ya quyu boşqabına viral mayenin seyreltilmiş məhlulu ilə aşılandıqda hüceyrələrin 50%-nin yoluxduğu konsentrasiyanı bildirir.


Virus mexanizminin hansı hissəsinin əvvəlcə pozulacağı ətraf mühitdən asılı ola bilər. Mis üzərində, məsələn, "ümumi soyuqdəymə" koronavirusları (məsələn, HuCoV-229E) üçün aşkar edilmişdir:

Misə məruz qalma virus genomlarını məhv etdi və virusun morfologiyasına dönməz şəkildə təsir etdi, o cümlədən zərflərin parçalanması və səth sünbüllərinin yayılması. Cu(I) və Cu(II) hissələri inaktivasiyaya cavabdeh idi, bu, ərinti səthlərində reaktiv oksigen növlərinin əmələ gəlməsi ilə gücləndirildi və bu, mis üzərində örtülməmiş viruslarla müqayisədə daha sürətli inaktivasiya ilə nəticələndi.

[… ]

Koronavirus metal səthlərə məruz qaldı və sağaldı və pozitiv viruslu RNT genomu çıxarılıb təmizləndi. Qeyri-struktur zülal 4 (nsp4) daxilində ORF1-in 139-bp bölgəsini aşkar etmək üçün bir addımlı əks transkriptaza real vaxt kəmiyyət PCR (RTqPCR) yerinə yetirildi. Mis və pirinç səthlərə məruz qalan virus, təmas müddətlərinin artması ilə bu parçanın kopyalanma sayının azaldığını nümayiş etdirdi. […]. Bütün viral genomun agaroz gel elektroforezi ilə müqayisəsi, mis və pirinç üzərində qeyri -spesifik parçalanmanın meydana gəldiyini, təmas müddəti artdıqca parçaların kiçildiyini təsdiqlədi.

Fərqli bir inaktivasiya mexanizmindən şübhələnilən kiçik damlalarda virusun sağ qalması ilə əlaqədar q -a da baxın.

Ümumiyyətlə, bütün viruslar öz sahiblərindən kənarda -20C-dən yuxarı temperaturda, hətta bəzi daha spesifik ekoloji stress amilləri (əlverişsiz rütubət, Cu kimi reaktiv səthlər və s.) olmadıqda belə deqradasiyaya başlayır. virusun vurulması ilə əvəzlənməkdən daha çox.


Ölümünə səbəb olan viruslara nə olur ?:

TL; DR: UV işığı və istilik kimi faktorlar virusların meydana gəlməsinə səbəb olan RNT, yağlı membran və zülalın qarışmasına səbəb olur.


Daha ətraflı:

https://www.sciencefocus.com/nature/do-viruses-die/:

Düzünü desək, viruslar ölə bilməz, çünki onlar ilk növbədə canlı deyillər. DNT (və ya əlaqəli molekul, RNT) şəklində genetik göstərişlər ehtiva etsələr də, viruslar müstəqil olaraq inkişaf edə bilməz. Bunun əvəzinə, bir ev sahibi orqanizmi işğal etməli və onun genetik göstərişlərini qaçırmalıdırlar.

https://www.sciencealert.com/how-long-does-coronavirus-last-on-surfaces:

Sadəcə atmosferdə asılı olaraq, UV işığı və istilik kimi amillərin təsiri [virusları] təşkil edən RNT, yağlı membran və zülalın qarışığının bir neçə saat ərzində [və ya daha az/daha çox] davamlı şəkildə parçalanmasına səbəb olur.

https://www.statnews.com/2020/03/19/coronavirus-survives-on-surfaces-how-to-protect-yourself/ (güzgü):

"Zərflərlə" örtülmüş viruslar, canlı hüceyrədən kənarda yaşamaqda ən çox çətinlik çəkirlər. Səthlərdə, ətrafdakı işıq, istilik və quruluq zərfi parçalayaraq virusu öldürür. (Məsaməli səthlər üzərinə düşən viruslardan nəm çəkərək zərfin məhv olmasını sürətləndirir.) Rinovirusların əksəriyyətində belə zərflər var; bəzi qrip virusları da. Norovirus deyil, ətraf mühitdə daha uzun müddət qalmasına imkan verir.


Lab-sızma nəzəriyyəsi doğrudursa, növbəti nə olacaq?

Ssenarinin mümkün olduğunu qəbul etmək üçün kifayət qədər məlumatımız var və buna görə də həqiqət kimi davranmalıyıq.

Müəllif haqqında: Daniel Engber baş redaktordur Atlantik.

jarun011 / Getty Katie Martin / Atlantik

Yaz aylarında, Michigan Universitetinin virusoloqu və Bioloji Təhlükəsizlik üzrə Milli Elm Məsləhət Şurasının 10 illik üzvü Michael Imperiale, koronavirus pandemiyası fonunda bəzi əsas tədqiqat-təhlükəsizlik təcrübələrini "yenidən düşünməyin" zəruriliyinə dair bir esse yayımladı. Ancaq o və həmmüəllifi-başqa bir biyogüvenlik şurasının veteranı-bir şeyi aydınlaşdırmaq istədilər: SARS-CoV-2 virusunun yayılması ilə yarıtmaz və ya zərərli elmin heç bir əlaqəsi olmadığını düşünmək üçün heç bir səbəb yox idi. əksini "elmi cəhətdən inandırıcı bir fərziyyədən daha çox bir sui -qəsd nəzəriyyəsinə bənzəyir."

Doqquz ay sonra, Imperiale bir qədər fərqli bir baxışa sahibdir. "Fikrimcə, sübutların üstünlüyü hələ də təbii mənşəyə işarə edir" dedi bu həftənin əvvəlində. “Ancaq o delta arasında təbiət sübut və laboratoriyadan qaçmaq dəlillər azalır ”.

Həqiqətən də, COVID-19-un mənşəyinə dair şübhələrin yavaş-yavaş çökməsi-səbəb olan virusun birbaşa yarasalardan və ya digər vəhşi heyvanlardan atlaması və ya Çinin Wuhan şəhərindəki bir laboratoriya skamyasında pit-stop etməsi son vaxtlar selə çevrildi. Yalnız son iki həftədə deltalar təkcə ölkənin aparıcı biosafety mütəxəssisləri arasında deyil, həm də böyük gündəlik qəzetlərində ictimai səhiyyə işçiləri, ekspertlər və jurnalistlər arasında da axışa uğradı. Fevral ayında Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatının müstəntiqlərinin pandemiyanın laboratoriya sızmasının mənşəyinin "çox çətin" olduğu iddiasına ÜST-nin baş direktoru Tedros Qebreyesus mayın 14-də göndərdiyi məktubla etiraz etdi. Elm 18 elm adamının imzaladığı jurnal, keçən həftə David Frumun təklif etdiyi "düzgün bir araşdırma" və "bu çətin, lakin əhəmiyyətli mövzuda elmə söykənən diskussiya" çağırışı etdi. Atlantik Bayden administrasiyasının "virus haqqında həqiqətə sahib olması" lazım olduğunu və seçki proqnozlaşdırıcısı Neyt Silver bazar günü onun laboratoriya mənşəli olma ehtimalının yarıya qədər artaraq 60 faizə çatdığını bildirdi. Bu gün Prezident Joe Biden, Amerika Birləşmiş Ştatları kəşfiyyat birliyinin hələ də hansı hipotezin daha uyğun olduğuna qərar vermədiyini və Avqustun sonuna qədər "qəti bir nəticəyə yaxınlaşmaq" istədiyini söylədi.

Bu dəyişiklik hər hansı əsas əlaqəli açıqlamaların olmaması ilə daha diqqətəlayiqdir. "Laboratoriya sızıntısı hipotezi" lehinə olan mübahisələr, əvvəllər olduğu kimi, Çinin cənub-qərbindəki bir mağaradan yarasalar tərəfindən törədilən bir koronavirusun 18 ay əvvəl, birdən-birə ortaya çıxması ilə bağlı çox şübhəli bir həqiqətdə olduğu kimi, əsaslı olaraq qalır. Çinin cənub-qərbindən çox uzaq bir şəhərdə-tədqiqatçıların mağara yarasalarından qaynaqlanan koronavirusların bir arxivini topladığı yer. Qalanların çoxu pəncərə örtüyüdür. Laboratoriya sızması fərziyyəsinin faktlar eyni qalmasına baxmayaraq, valyuta qazanması faydalı təsir göstərir. Bu, qəti sübutun mütləq tələb olmadığını göstərir. SARS-CoV-2 epidemiyası milyonlarla insanın ölümünə səbəb oldu. Təbiətdə və ya laboratoriyada başlamış ola bilər. İkinci ssenarinin mümkün olduğunu qəbul etmək üçün kifayət qədər məlumatımız var və buna görə də bu həqiqət kimi davranmalıyıq.

14 May məktubuna görə Elm, COVID-19-un mənşəyinin "düzgün araşdırılmasını" tələb edən, "COVID-19-un necə ortaya çıxdığını bilmək, gələcək epidemiyaların riskini azaltmaq üçün qlobal strategiyaları məlumatlandırmaq üçün vacibdir."

Demək olar ki, hər bir jurnal hekayəsi, Substack yazısı və laboratoriya sızması fərziyyəsi ilə bağlı şərh parçası tüstü bombası kimi yuxarıya doğru atılan bu kimi bir xətt ehtiva edir. COVID-19 vəhşi təbiətdən çıxdı və ya virus laboratoriyadan çıxdı? "Bu təcili sual, SARS-CoV-3 və ya COVID-29-un ortaya çıxmasının qarşısını almaq üçün açardır" deyən bir xüsusiyyət mart ayından başladı. "Çox vacibdir, çünki virusa əsaslanan bir pandemiyanın necə başladığını bilmək, diqqətimizi oxşar vəziyyətlərin qarşısının alınmasına yönəldir" deyə aprel ayında başqa bir məqalədə deyilir. Elm jurnalisti Nicholas Wade bu ayın əvvəlində geniş oxunan bir essedə "ikinci belə bir hadisənin qarşısını almağa ümid etsək, bu, çox vacibdir" dedi.

Bu sadə, inandırıcı olmayan bir anlayışdır. Koronavirus pandemiyasının mənbəyini müəyyən etmək layihəsi, şübhəsiz ki, mənəvi, hüquqi və siyasi əhəmiyyətə malikdir, lakin qlobal ictimai sağlamlıq baxımından və gələcək üçün pandemiyaya qarşı mübarizənin vacib layihəsi ilə nəticəsi yalnız kənarda önəmlidir. SARS-CoV-3-dən qorunmaq üçün siyasətlər təyin etmək üçün SARS-CoV-2-nin dəqiq mənşəyini bilməliyik desək, bizi geridə qalan qərəzli yolda öhdəsinə götürür: Bu, son müharibə ilə mübarizəni davam etdirmək üçün bir girovdur. növbəti Maginot Xəttinin tikintisi üçün plan olmasa da, ortaya çıxan patogenlərə qarşı.

Həqiqətən, "düzgün araşdırmadan" hansı məlumatları əldə edə bilərik? Ən yaxşı halda, təbii dağılmaları və ya daha bir fəlakətli qəza növünü axtarmaq üçün bir yer daha təyin edəcəyik: faydalı məlumatlar, amma daha geniş mənada, kiçik bir dəstə əlavə edilən başqa bir nümunə araşdırma. Keçən əsrdə pandemiya ilə əlaqədar olaraq, 1977 -ci il Rus qripi, bir laboratoriya qəzasının mümkün nəticəsi olaraq göstərildi. COVID-19-un genezisi ilə bağlı nə kəşf edə bilsək də (və ümumiyyətlə bir şey kəşf edib-etməsək də), bu tarixi rekord az və ya çox eyni görünməyə məcburdur: Demək olar ki, bütün pandemiyaların təbii mənbəsi var, ehtimal ki, bir və ya ikisi yaranıb. və daha çoxu gələcəkdə bunu tədqiqat parametrlərindən edə bilər.

Mənşəyi yeni və daha yaxşı araşdırmaq üçün çağırmaq əvəzinə, pandemiyaların təbii dağılmalardan və ya laboratoriya qəzalarından qaynaqlandığını və sonra nəticələrə keçəcəyik. Bir vacib sual artıq efir vaxtı qazanıb (ən azı sağçı mediadan): Elm adamları pandemiya səviyyəsində virulentliyə yüksəlməzdən əvvəl atmalı olduqları addımları ölçmək üçün patogen genomlarla məşğul olmalıdırlarmı? Milli Səhiyyə İnstitutu onlara maliyyə ayırmalıdırmı? Bu, 2012 -ci ildə başlayan viroloqlar arasında şiddətli, həll olunmamış bir müzakirə mövzusu idi və bu cür araşdırmaların dağıdıcı epidemiyaların qarşısını almağa nə dərəcədə kömək etdiyi və bunları yaratmaq üçün nə dərəcədə real bir risk yaratdığı hələ də aydın deyil.

Digər suallara aşağıdakılar daxildir: Vuhan Virologiya İnstitutunda olduğu kimi, vəhşi təbiətdən toplanan koronavirus nümunələri orta bio təhlükəsizlik baxımından öyrənilməlidirmi? Növbəti pandemiyaya hazırlıq baxımından daha tələbkar təhlükəsizlik qaydaları ilə müşahidə işini ləngitməkdən əhəmiyyətli bir xərc varmı? Və Çin, Wuhanda olduğu kimi, virus yüklü quanonun seyrək məskunlaşmış bölgələrdən əhali mərkəzlərinə daşınması praktikasına son qoymalıdır? (Biri də soruşa bilər: Ebola və ya digər yayılmağa hazır patogenlərin tədqiqatları Bostonda aparılmalıdırmı?) Bu həftə Broad Institute-un molekulyar bioloqu Alina Çanın mənə dediyi kimi, hələ də COVID-19 olduğunu öyrənə bilərik. 19 hekayəsi "şəhərə gətirilən və birdən ulduza çevrilən kiçik bir şəhər virusunun" variasiyasıdır.

Yoxsa elmi araşdırmaların riskləri ilə bağlı daha əhəmiyyətli bir araşdırma apara bilərik. Laboratoriyadan qaynaqlanan bir pandemiyanın mümkün olduğunu və nəticəsini görə biləcəyimizi qəbul etməyə hazırıqsa, o zaman “xalq sağlamlığı üçün növbəti böyük təhlükənin biologiyada başqa bir şeydən-bir şeydən qaynaqlana biləcəyini başa düşməliyik. bu, əkinləri məhv edən, okeanı dəyişdirən və ya atmosferi dəyişdirən," biotəhlükəsizlik-idarəetmə alimi Sam Weiss Evans mənə dedi. "Bu, daha geniş bioloji cəmiyyət üçün hesablaşma anı ola bilər."

Hal-hazırda, bu müzakirələr dayandırılır, elm adamları isə, ehtimal ki, boş yerə - laboratoriya sızması fərziyyəsini tam yoxlayırlar.

Onlar, nəhayət, COVID-19 işində birbaşa dəlil istəyən “sıçrayış” fərziyyəsinə gəldikdə, prosesə o qədər də bağlı deyillər. Stenford Universitetinin mikrobioloqu David Relman - təşkilatçılarından biri Elm məktubu və Michael Imperiale-nin Biotəhlükəsizlik üzrə Milli Elm Məsləhət Şurasındakı keçmiş həmkarı - bu həftə mənə dedi ki, tədqiqat cəmiyyəti təbii sızmaların baş verdiyini və onların təhlükəli epidemiyalara səbəb ola biləcəyini qəbul edir, ona görə də əlavə sübuta ehtiyac yoxdur. . Elm adamları, potensial təhlükəli viruslar daşıyan heyvanlarla insanların qarşılaşmalarının qarşısını almaq və gözləmək üçün səy göstərməli olduqlarını söylədi. "Bu, indi öyrəndiklərimizdən asılı olmayaraq baş verəcək."

Relman laboratoriya təhlükəsizliyinə bənzər bir yanaşma gözləmir. Laboratoriya qəzasının pandemiyaya səbəb ola biləcəyi fikri "bir çox elm adamının qəbul etməsi çox çətin və narahat bir ssenaridir" dedi. Laboratoriya sızıntısı hipotezinin lehinə daha konkret dəlillər olmadan, "insanlar əllərini sıxıb 2012-ci ildən bəri olduğu kimi danışacaqlar, amma riski azaltmaq üçün çox şeyin dəyişəcəyini düşünmürəm."

Daha konkret dəlillər, CIA və ya ÜST tərəfindən daha da araşdırıldıqdan sonra heç vaxt gələ bilməz. “Düzgün araşdırma” istənilən halda əks nəticə verə bilər. Gələcəyə doğru sürükləsə və heç vaxt konkret bir şeyə düşməsə nə olar? (Bəs əgər heç kim maddi sübutun nədən ibarət olduğu ilə razılaşa bilmirsə?) Və ya tədqiqatçılar SARS-CoV-2-nin həqiqətən etdi yarasalarda, pangolinlərdə və ya dondurulmuş ətdən başlayaq? Bu nəticələr laboratoriya sızıntısı riskini ortadan qaldırmayacaq, ancaq elmi ictimaiyyətin bu problemi həll etmək istəyini azaldar.

"Laboratoriyadan qaçma ehtimalı var" dedi Imperiale və nə olursa olsun, buna əməl etməliyik. "10 il sonra eyni sualları bir daha vermək istəmirik." Bu nöqtədə, daha çox araşdırma çağırışlarının, inandırmaq qədər gecikmə vasitəsi halına gəlmə ehtimalı var.


Koronavirus və onun törətdiyi xəstəlik olan COVID-19 haqqında mediada eşitmədiyiniz bəzi suallar bunlardır:

  • Nə üçün bir antibiotik COVID-19-un müalicəsində təsirli olmayacaq?
  • Sabun bir koronavirus virionunu kimyəvi olaraq necə məhv edə bilər?
  • Koronavirus ənənəvi biologiya modellərinə necə qarşı çıxır?

New York Dövlət Universitetinin Buffalo Universitetindəki Elmdə Case Tədqiqatı Milli Tədris Mərkəzi üçün Brandeis alimlərindən ibarət bir qrup tərəfindən hazırlanan dərs planının bir hissəsidir.

Mərkəz martın 19-da koronavirusla bağlı tədris vasitələri üçün təcili sorğu göndərdi. Üç gün sonra Brandeis komandası layihə təqdim etdi. Son versiya 30 Martda təşkilatın saytında dərc edildi.

Tədris qeydləri və cavab açarı ödənişli üzvlər üçün məhdudlaşdırılsa da, onu mərkəzin saytında yükləmək üçün pulsuz əldə etmək olar.

Layihə üzərində işləyən biologiya professoru Melissa Kosinski-Collins bildirib ki, bələdçi xüsusi olaraq distant təhsil üçün nəzərdə tutulub.

"Biologiya tələbələrinə baş verənləri öyrənmələrinə kömək etmək istədim" dedi. "Mən onlara başa salmaq istədim ki, onlarda hətta ev noutbuklarından belə bu problemi həll etmək üçün alətlər var."

Megan və Kat, analarının iş yoldaşı virus üçün müsbət test etdikdən sonra özlərini iki həftə evlərində karantində saxlayan bacılardır. Orta məktəb yaşlı qızların niyə içəridə ilişib qaldıqları ilə bağlı çoxlu sualları var və cavabları internetdə axtarırlar.

Buradan dərs planı virusun quruluşunu və hüceyrələrə necə yoluxduğunu əhatə edir. Kat virusla xəstəxanada qalxanda müalicələri ilə məşğul olur.

Son hissədə, tələbələr Katın futbol komandasının üzvlərinə Katın başına gələnləri izah edən və onlara infeksiyadan necə qorunmaq barədə məsləhətlər verən bir e-poçt hazırlayırlar.

Dərs üzərində işləyən biologiya elmləri namizədi, dosent Kene Piasta, həmmüəllifləri ilə birlikdə "şagirdləri məlumatlar haqqında tənqidi düşünməyə sövq etmək istədiklərini söylədi. Bu, onları əldə etmədikcə daha dərindən və daha dərinə getmələrini necə təmin edə biləcəyiniz haqqında. o an və konseptual bilikləri möhkəmləndirin."

Tədris kitabçasının digər müəllifləri biologiya tədris laboratoriyasının rəhbərləri Lindsay Mehrmanesh və Jessie Cuomodur.

Qrup bundan sonra yuxarı səviyyəli biologiya tələbələri üçün koronavirus haqqında tədris mənbələri yaratmağı planlaşdırır.

Niyə bir antibiotik COVID-19 müalicəsində təsirli olmadı?

COVID-19, SARS-CoV-2 virusundan qaynaqlanır. (Texniki olaraq, xəstəliyin adı COVID-19-dur.) Antibiotiklər viral infeksiyaları deyil, bakterial infeksiyaları müalicə edir.

Sabun bir koronavirus virionunu kimyəvi şəkildə necə məhv edə bilər?

Virion, ev sahibi hüceyrədən kənarda və yoluxucu olduqda virusun daha spesifik bir forması üçün texniki bir termindir. Misellər kimi tanınan kiçik kürələr şəklini alan sabun molekulları, özlərini virion membranına yapışdıraraq əslində parçalara ayırın. Virus membran olmadan mövcud ola bilməz.  

Koronavirus ənənəvi biologiya modellərinə necə qarşı çıxır?

Mərkəzi dogma, hüceyrə daxilində genetik məlumatların ötürülməsi prosesini təsvir edir. DNT, məlumatı RNA (mRNA) xəbərçisinə ötürür, sonra protein əmələ gətirmək üçün təlimat olaraq istifadə edildiyi ribozoma keçir. Lakin koronavirus DNT-dən istifadə etmir, proses RNT-nin mRNT-yə məlumat ötürməsi ilə başlayır. 


SARS-CoV-2-nin mənşəyi

Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı-Çin araşdırma hesabatı, COVİD-19 üçün laboratoriya mənşəyinin çox ehtimal olunmadığı qənaətinə gəlir, lakin şübhələr hələ də qalmaqdadır.

SARS-CoV-2 koronavirusunun ortaya çıxmasından və yaratdığı COVID-19 pandemiyasından bir ildən çox bir müddət sonra hələ də virusun mənşəyi haqqında mübahisə etdiyimiz qəribə görünə bilər. Sual yenə də vacib olaraq qalır və bu yaxınlarda Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı (ÜST) və Çinli alimlər bu mənşəylə bağlı araşdırmalarını yekunlaşdırdılar. Hesabat məyusluqla nəticədən daha az idi.

Araşdırma əslində 2020 -ci ilin may ayında başladı, təməl araşdırmalar iyul ayından başladı. Çində son araşdırmalar bu ilin əvvəlində tamamlandı və tam hesabat indicə dərc olundu. Məlumata görə:

Birgə beynəlxalq komanda, 17 Çinli və digər ölkələrdən olan 17 beynəlxalq mütəxəssisdən, Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı (ÜST), Qlobal Xəstəlik Alert və Müdaxilə Şəbəkəsi (GOARN) və Dünya Heyvan Sağlamlığı Təşkilatı (OIE) (Əlavə B) dən ibarət idi. BMT -nin Ərzaq və Kənd Təsərrüfatı Təşkilatı (FAO) müşahidəçi qismində iştirak edib. İlkin onlayn görüşlərdən sonra 14 yanvar - 10 fevral 2021-ci il tarixləri arasında Çin Xalq Respublikasının Uhan şəhərində 28 gün ərzində birgə araşdırma aparılıb.

Elmin çox vaxt ehtimal məsələsi olduğunu nəzərə alaraq əsas tapıntıları nəzərdən keçirək. Xüsusi bir mənşəyi sübut edən siqaret silahı yox idi və komanda elmi nəticəyə güvənmək məcburiyyətində qaldı.

İstintaqın bir istiqaməti sadəcə COVID-19-un ortaya çıxmasını izləmək idi. Komanda 2019-cu ilin sonunda Wuhanda xəstəliyin ortaya çıxmasından əvvəl pnevmoniyaya bənzər xəstəlik, bütün səbəblərdən ölüm halları və hətta qızdırma və ya tənəffüs simptomlarını müalicə etmək üçün dərmanların alınmasına dair heç bir sübut tapmadı. Xəstəxanaya yerləşdirmə və ölüm hallarında artım artmağa başladı. 2020 -ci ilin yanvar ayında Wuhan'da, daha sonra Wuhan xaricində, lakin Hubei əyaləti daxilində. Beləliklə, sübutlar Wuhan və ətrafında COVID-19-un ortaya çıxmasını dəstəkləyir. Bundan əlavə, xəstəxana qeydlərinin geniş araşdırılması, 2019-cu ilin oktyabr və ya noyabr aylarında Wuhan'da heç bir ehtimal olunan COVID-19 hadisəsi tapmadı, buna görə də dekabr ayında ortaya çıxmadan əvvəl yayılmadı.

Bu, epidemioloji sübut idi. Komandadakı elm adamları molekulyar sübutlara da baxdılar - virusun özünü araşdırdılar. Tapdılar:

İndiyə qədər aparılan sorğulardan və məqsədyönlü tədqiqatlardan əldə edilən sübutlar SARS-CoV-2 ilə ən çox əlaqəli olan koronavirusların yarasalarda və panqolinlərdə tapıldığını göstərdi və bu məməlilərin COVID-19-a səbəb olan virusun anbarı ola biləcəyini irəli sürdü. Bununla birlikdə, bu məməlilər növündən indiyə qədər müəyyən edilmiş virusların heç biri, birbaşa atası olaraq xidmət etmək üçün SARS-CoV-2 ilə kifayət qədər bənzəmir. Bu tapıntılara əlavə olaraq, vizon və pişiklərin SARS-CoV2-yə yüksək həssaslığı, əlavə heyvan növlərinin potensial su anbarı kimi çıxış edə biləcəyini göstərir.

Bu, SARS-CoV-2-nin bir heyvan rezervuarından gələn zoonotik bir virus olduğuna dair əvvəlki nəticəni dəstəkləyir. Alimlər hesab edirlər ki, virus yarasalarda yaranıb, lakin hələ naməlum olan başqa növ vasitəsilə insanlara keçib. Bu, SARS-CoV-2 ilə əlaqəli koronavirusların Cənub-Şərqi Asiyanın yarasa və panqolin populyasiyalarında endemik olduğunu aşkar edən digər araşdırmalarla da dəstəklənir. Bununla birlikdə, SARS-CoV-2 özü Çində heç bir vəhşi və ya ev heyvanı populyasiyasında tapılmadı. Beləliklə, o, birbaşa heyvan su anbarından gəlmədi, lakin SARS-CoV-2-yə çevrildi, ehtimal ki, bir vasitəçi növ vasitəsilə insanlara keçdi.

Molekulyar analiz, virus suşlarının yayıldıqlarını da izləyə bilər. Xoşbəxtlikdən Hunan xəstəxanaları erkən xəstələrdən nümunələr saxlayırdı, buna görə də bu viruslar öyrənilə bilərdi. Onlar tapdılar ki, Huanan ət bazarından çox güman ki, bir qrup hal var, lakin bu, virusun mənşəyi deyildi, çünki müxtəlif suşlar artıq dövriyyədədir. Noyabrın sonundan 2019 -cu ilin dekabrının əvvəlinə təsadüf edən bütün erkən suşların ən son ortaq əcdadının vaxtını da hesabladılar. Bununla birlikdə, oktyabrda daha erkən bir mənşəyi istisna etmək olmaz.

Virusun mümkün mənşəyi kimi Huanan bazarına çox diqqət yetirildi. Onlar bazardan SARS-CoV-2 ilə çirklənmiş çoxlu nümunələr tapdılar. Onlar bazarda artıq COVID-19 xəstəsi olan insanlar tərəfindən çirklənmiş ola bilərdi. Həmçinin, bazara 20 müxtəlif ölkədən soyuq zəncirli ət və məhsullar daxil idi. Mümkündür ki, virus həmin bazara bu soyuq zəncirlərdən biri vasitəsilə gəlib, baxmayaraq ki, konkret çirklənmə mənbəyinə dair heç bir dəlil tapılmadı. Virus donmuş ətlərdə yaşaya bilər, buna görə də bu ehtimal inandırıcıdır.

Birbaşa araşdırma və dərc edilmiş ədəbiyyatı nəzərdən keçirərək, ÜST komandası COVID-19 üçün dörd mümkün mənbəni və hər birinin ehtimalını nəzərdən keçirdi:

  • birbaşa zoonotik yayılma mümkün bir yol hesab olunur
  • aralıq ev sahibi vasitəsilə giriş çox ehtimal olunan yol hesab olunur
  • Soyuq/qida zənciri məhsullarının tətbiqi mümkün bir yol hesab olunur
  • bir laboratoriya hadisəsi ilə giriş son dərəcə çətin bir yol hesab edildi

Əlbəttə ki, laboratoriya qəzasının “son dərəcə qeyri-mümkün yolu”, medianın çox diqqətini çəkdi, bu başa düşüləndir. Müstəntiqlər laboratoriya mənşəyini istisna edə bilmədilər, ancaq bunun üçün heç bir dəlil yox idi və epidemiologiya və molekulyar biologiyadan əldə edilən sübutların məcmusu bunu ən az ehtimal olunan ssenariyə çevirir. Ümumdünya Səhiyyə Təşkilatı-Çin tapıntıları bəzi beynəlxalq tənqidlərə məruz qaldı. ABŞ da daxil olmaqla 14 ölkənin birgə bəyanatında, ÜST və Çindən tam şəffaflığı təmin etmək istəndi və missiyanı tənqid etdi: “ əhəmiyyətli dərəcədə gecikmiş və tam, orijinal məlumatlara və nümunələrə girişin olmaması.

Bu, Çinin SARS-CoV-2 üçün laboratoriya mənşəli olduğuna işarə edən məlumatları gizlətdiyi qapını açıq qoyur. Bir çoxları yarasalardan alınan koronaviruslar üzrə dünyanın eksperti olan Wuhan Virusologiya İnstitutuna işarə etdi. Bu təsadüf kimi görünə bilər, amma dünyanın belə bir virusun mövcud olduğu bir hissəsində bir araşdırma laboratoriyasının olması təəccüblü deyil. Başqa sözlə, həm laboratoriyanın yeri, həm də COVID-19-un yayılması zoonotik koronavirusların bölgəyə endemik olması ilə əlaqəli ola bilər. Ancaq yenə də təsadüf qeyd olunur.

Virusun özünün müayinələri genetik manipulyasiyanın heç bir siqaret silahını aşkar etməyib. Ancaq nəticələr laboratoriya mənşəli olma ehtimalı ilə ziddiyyət təşkil edir. Bəzi nəşr olunan tədqiqatlar, virusun laboratoriya mənşəli ilə uyğun olmadığı qənaətinə gəldi. Digər tədqiqatlar genetik manipulyasiyanın istisna edilməyəcəyi qənaətinə gəlir. Buna görə də bir çoxları ÜST komandasına mübahisəni həll etmək üçün ümid bağladılar, lakin onlar qəti şəkildə etmədilər. Hələlik “ son dərəcə çətin ” ilə kifayətlənməliyik və nəhayət bu sualı yatağa salmaq üçün daha dolğun və daha şəffaf bir araşdırma çağırışlarına davam etməliyik.

Bütün bunlar müxtəlif səbəblərə görə vacibdir. Mütəxəssislər artıq COVID-19 kimi pandemiyaların gələcəkdə daha çox yayılacağı barədə xəbərdarlıq edirlər. Dünya hər zamankindən daha çox bir -birinə bağlıdır, təbii yaşayış yerlərinə daha yaxın yaşayırıq (bəziləri işğalçı deyirlər) və heyvanların hissələrində qlobal bir ticarət var. Bütün bu amillər zoonoz infeksiyaların baş verməsi və yayılması, o cümlədən tam pandemiyaya çevrilməsi ehtimalını artırmağa kömək edir. COVID-19, oradakı ən ölümcül xəstəlikdən uzaqdır və bu pandemiya, ehtimal ki, daha pis pandemiyaların gəlməsi üçün bir paltar sınağıdır.

Təbii ki, bəzi dəyişikliklər etməsək. ÜST tədqiqatının əsas məqsədlərindən biri, gələcək pandemiya riskini məhdudlaşdırmaq üçün təsirli maddələr istehsal etmək ümidi ilə, pandemiyanın mümkün mənbələrini müəyyənləşdirmək idi. Bundan əlavə, hesabat tam əməkdaşlıq və şəffaflıq üçün beynəlxalq çağırışa səbəb oldu. İndi hamımız çox uzaq bir şəkildə bilirik ki, dünyanın uzaq bölgələrində baş verənlər sahillərimizə gəlib bizə təsir edə bilər. Həqiqətən də, hamımız bir yerdəik və növbəti pandemiyaya daha yaxşı reaksiya vermək üçün birlikdə çalışmalıyıq.


Tək viruslu birləşmə ölçmələri SARS-CoV-2 füzyonu üçün fürsətçi bir model verir

SARS-CoV-2 virusu, bir çox koronaviruslar kimi, hüceyrə səthi reseptorlarına bağlanır və sonra proteolitik parçalanma yolu ilə membranın birləşməsi və hüceyrəyə daxil olması üçün aktivləşdirilir. Bəzi koronaviruslarda bu, ilk növbədə hüceyrə səthində, digərlərində isə əsasən endosomlarda baş verir. SARS-CoV-2 ilə bağlı əvvəlki məlumatlar, hüceyrə tipindən asılı olaraq hər ikisinin də baş verə biləcəyini və fizioloji cəhətdən uyğun giriş mexanizmi ilə bağlı mübahisələr olduğunu göstərir. Burada birbaşa proteaz aktivləşdirilməsi məsələsini araşdırmaq üçün təcrid olunmuş plazma membranı və ekzogen nəzarət olunan proteazlardan istifadə edərək tək viruslu qaynaşma təcrübələrindən istifadə edirik. Çoxlu proteazların SARS-CoV-2 psevdoviruslarını füzyon üçün aktivləşdirə biləcəyini, bunun pseudovirus genetik fonundan asılı olmadığını və proteaz aktivləşməsinin harada baş verməsindən asılı olmayaraq plazma membranının füzyonu dəstəkləmək qabiliyyətli olduğunu tapırıq. Əldə edilən məlumatlar SARS-CoV-2 tərəfindən fürsətçi birləşmə modelini təklif edir, burada girişin subcellular yeri hava yolu proteaz aktivliyindən, hüceyrə səthi proteaz aktivliyindən və endosomal proteaz aktivliyindən asılıdır, lakin hamısı infeksiyanı dəstəkləyə bilər. Bu paralel yollar, hədəflənmiş host proteaz inhibisyonunun niyə hüceyrə kultur modellərində güclü təsir göstərdiyini, lakin klinik sınaqlarda daha zəif təsir göstərdiyini izah etməyə kömək edir.


Yeni koronavirusla mübarizə

01 Professor Susan KaechQrip və indi COVID-19 kimi ağır virus infeksiyalarına qarşı toxunulmazlığı necə inkişaf etdirdiyini öyrənən, SARS-CoV-dən sonra ağciyərdə əmələ gələn yaddaş T və B hüceyrələrinin növlərini öyrənmək üçün The Scripps Research Institute və La Jolla Institute ilə əməkdaşlıq edəcək. -2 infeksiya, uzun müddətli toxunulmazlığın qurulub-qurulmayacağını anlamaq üçün bir yol kimi. Bu iş, qoruyucu toxunulmazlıq yaratmaq üçün meyarlar yaratmaq üçün COVID-19 peyvəndlərinin peyvənd edilmiş şəxslərdə yenidən yaratması lazım olan yaddaş T hüceyrələrinin növlərini anlamaq üçün çox vacib olacaq.

02 Koronavirusa qarşı qoruyucu peyvəndin yaradılması hazırda dünyanın ən böyük problemlərindən biridir. Kaech hesab edir ki, yaddaş B və T hüceyrələri adlanan immun hüceyrələri infeksiyaya nəzarət etmək üçün kritikdir və buna görə də uzunmüddətli toxunulmazlığı təmin etmək üçün peyvəndlər üçün əla hədəf ola bilər. Onun laboratoriyası, Scripps Araşdırma İnstitutu ilə birlikdə, COVID-19 infeksiyası zamanı ağciyərlərdəki yaddaş T hüceyrələrinin rolunu araşdıracaq.

03 Ayrı bir araşdırmada, UC San Diego və VA xəstəxanasının ağciyər həkimləri ilə birlikdə Kaech, COVID-19 xəstələrində səthi aktiv maddənin səviyyəsi və tərkibindəki dəyişiklikləri araşdıracaq. Səthi aktiv maddə ağciyərlərdə nəfəs almağımızı təmin edən bir maddədir. Tədqiqat, səthi aktiv maddələrin azalmasının daha ciddi bir xəstəliklə əlaqəli olub olmadığını müəyyən etmək üçün səthi aktiv maddələrin səviyyəsini COVID-19 xəstələrinin sağlamlıq nəticələri ilə müqayisə edəcək. Laboratoriyası, ağciyərlərdə səthi aktiv maddələrin səviyyəsini idarə edən yollarda genetik dəyişikliklərin xəstəliyin gedişatını dəyişdirib dəyişməyəcəyini də yoxlayacaq.

Kiçik Müalicələr, Böyük Nəticələr

01 Professor Juan Carlos Izpisua Belmonte nanohissəciklərdən istifadə edərək COVID-19 müalicələrini inkişaf etdirmək üçün San Diego biotexnologiya şirkəti ilə əməkdaşlıq edir. Tədqiqatçılar SARS-CoV-2 virusunun RNT-ni məhv etmək üçün RNT hədəfləyən CRISPR-Cas texnologiyasından istifadə edəcəklər. Bu müalicə, virusun bədəndə çoxalmasını maneə törədəcək və bununla da bir insanın COVID-19 infeksiyasının şiddətini azaltacaq və virusun yayılma şansını məhdudlaşdıracaq. Uğurlu olarsa, bu yanaşma gələcəkdə digər RNT viruslarını müalicə etmək üçün genişləndirilə bilər.

02 Bundan əlavə, İzpisua Belmonte çox institutlu alimlər qrupuna nəinki portativ, cib ölçülü maşınla bir neçə dəqiqə ərzində COVID-19 diaqnozunu qoya bilən, eyni zamanda digər virusları yoxlaya bilən yeni virus skrininq testi hazırlamağa rəhbərlik etmişdir. Koronavirusla səhv salına bilən qrip kimi viruslar. Eyni zamanda, klinisyenler COVID-19 mutasiyalarının və variantlarının yayılması haqqında dəyərli məlumatlar verərək virusu sıralaya bilərlər. Ətraflı burada oxuyun & raquo

Hər müalicə səndən başlayır.

Axtar və məhv et missiyası

Bir virusu öldürmək üçün bir virus lazım olacaq. Professor Clodagh O’Shea, Alan SaghatelianJoseph Noel are exploiting the atomic structures of the SARS-CoV-2 virus, together with proprietary synthetic virology and chemical biology platforms, to create transformative vaccines and gene therapies. Their pipeline will target i) SARS-CoV-2 prevention by creating synthetic live viral vaccines that induce broad and long-lasting immunity and ii) SARS-CoV-2 treatment through viral gene therapies that express synthetic nanoparticles that seek, neutralize and destroy SARS-CoV-2 and prevent pathology. This research will uncover underlying principles and overcome intractable clinical challenges, not just of SARS CoV- 2 today, but of SARS-CoV-3 tomorrow.

Helping Patients Tolerate Serious Infections

Sometimes the body’s immune response causes more damage than the pathogen it is fighting. In these cases, limiting damage and supporting affected organs—such as with drugs that manipulate normal metabolism and repair processes—is paramount. Using her knowledge of physiology and infectious disease, Professor Janelle Ayres studies ways to help patients better tolerate infections, such as pneumonia and the acute respiratory distress syndrome (ARDS) that occurs in COVID-19 patients.

Maintaining a Healthy Balance

Healthy immunity is a fine balance: too strong a response and autoimmune disease or other damage can occur too weak a response and cancer or infections can take hold. Professor Greg Lemke is delving into how receptors regulate the immune response and is studying ways to prevent the “cytokine storms” that develop in COVID-19, as the body produces such an overwhelming immune response in the lung that the collateral damage can be lethal for patients.

Every cure begins with you.

Averting Cytokine Storms and Designing New Tests and Treatments

01 In severe COVID-19 cases, immune cells in the infected windpipe and lungs can release high levels of damaging inflammatory proteins called cytokines, colloquially known as a “cytokine storm.” American Cancer Society Professor Tony Hunter previously showed that the cytokine LIF (leukemia inhibitory factor) plays a role in pancreatic cancer. He will test whether cytokines, like LIF, play a role in the immune overreaction seen in some COVID-19 patients.

02 Gerald Pao, a staff scientist in the Hunter lab, will work with the Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute to generate a virus system that expresses a spike protein that mimics the ones on the coronavirus. The team will then examine the immune response to these spike proteins.

03 In collaboration with UC San Diego, USC and Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, Pao will develop a test to detect the presence of COVID-19 genomes in human nose and throat samples. He has designed this test, which will combine CRISPR with an imaging technology, so that it will only take a few minutes.

Halting Viral Production

01 Assistant Professor Dmitry Lyumkis will examine the molecular mechanisms by which the non-structural protein NSP1 halts host protein production. This process ultimately helps the virus in promoting the production of its own viral proteins and the development of COVID-19.

02 The Lyumkis lab will also explore how the nonstructural protein NSP2 affects host cells during the development of COVID-19.

Timing is Everything

Research from the lab of Professor Satchin Panda has found that the majority of our genes follow a day/night rhythm in many tissue types and brain regions. This has implications for many behaviors, including when it’s best to eat, exercise, and take medications. Because COVID-19 affects so many bodily systems, Panda is studying gene activity in COVID patients to see how day-to-day changes in this activity and the clinical symptoms of COVID predict treatment outcomes. The research findings will impact predictions of COVID patients’ disease course when they check in to the hospital and finding the right treatment to accelerate recovery.

Influencing Brain Development

Many more factors than DNA alone influence brain development. These include events that happen both in the womb as well as after birth. Research Professor Margarita Behrens is researching the effects of virus-induced maternal immune activation on brain development of offspring, which, given the number of COVID-19 infections worldwide, could reveal a significant effect.

Understanding the Spike Protein

Scientists have known for a while that SARS-CoV-2’s distinctive “spike” proteins help the virus infect its host by latching on to healthy cells. A new study co-led by Assistant Research Professor Uri Manor and UC San Diego shows that the proteins also play a key role in the disease itself. The study shows conclusively that COVID-19 is a vascular disease, demonstrating exactly how the SARS-CoV-2 virus damages and attacks the vascular system on a cellular level. The findings help explain COVID-19’s wide variety of seemingly unconnected complications, and could open the door for new research into more effective therapies.


Challenge 4: How do mutations cause viral evolution?

Mutations involve changes to the sequence of an organism’s genetic code. As you have learned, viruses typically mutate more rapidly than human cells do. This is because human cells have mechanisms to proofread the genome and also mechanisms to repair a sequence if an error is detected. Mutations can vary in severity from having zero consequence to majorly altering a protein and its function. Mutations can involve the substitution of one DNA base to another, a G for an A for instance. Or mutations can involve the insertion of additional DNA bases or the deletion of existing DNA bases. Once a mutation occurs, if it changes the function of a resulting protein, a virus or organism is then changed. Because cells and viruses interact with the environment or surrounding cells, this change is either going to give the mutated cell or virus an advantage, allowing it to thrive more easily in its environment, or will make it disadvantaged, making it more difficult to survive. This is a process called natural selection. If the mutation confers an advantage, the mutated sequence then spreads within a population and if the mutation confers a disadvantage, the mutated sequence dies out.

Consider the following scenarios (actual or hypothetical) and decide if the mutation in SARS-CoV-2 virus will be detected in an increasing portion of the population of viruses or will not be detected. Explain your answer choice.


No LAIs have been reported for SARS-CoV-2. However, four LAIs have been reported for SARS-CoV.

XNM
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/index.html
ÜST
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019
PubMed
https://discovery.ucl.ac.uk/id/eprint/10090633/1/1-s2.0-S1201971220300114-main.pdf
Canadian Pathogen Form https://www.canada.ca/en/public-health/services/laboratory-biosafety-biosecurity/pathogen-safety-data-sheets-risk-assessment.html

Understanding the origins of SARS-CoV-2

Dr. Jesse Bloom has begun focusing on understanding how the pandemic began. Photo by Robert Hood / Fred Hutch News Service

Over a year after the start of the COVID-19 pandemic, it’s still unclear exactly how it began. Dr. Jesse Bloom, an evolutionary biologist at Fred Hutchinson Cancer Research Center, has become one of the leading scientific voices calling for a more thorough investigation of SARS-CoV-2’s origins. Knowing how this pandemic began can help with thinking about how science can best mitigate the risk of future pandemics.

Before SARS-CoV-2, Bloom and his team in the Basic Sciences Division at Fred Hutch were focused on the evolution of flu viruses. But as SARS-CoV-2 became a worldwide threat last year, they switched gears to study how it was evolving and what that evolution could mean for applied questions about antibodies and vaccines used to treat and prevent infection with the virus.

As the pandemic increasingly comes under control in the U.S., Bloom and other scientists have begun focusing on understanding how the pandemic began. This spring, Bloom teamed up with other experts in his field to speak out publicly in support for a more thorough investigation. In a letter published in Science, Bloom and 17 other scientists argued that “greater clarity about the origins of this pandemic is necessary and feasible to achieve. We must take hypotheses about both natural and laboratory spillovers seriously until we have sufficient data."

Deleted sequences offer clues

On June 22, Bloom reported his discovery of SARS-CoV-2 sequences from early in the Wuhan outbreak that had been deleted from a National Institutes of Health database. In his non-peer-reviewed preprint and a complementary Twitter thread, he explained how he found and reconstructed 34 of these sequences and what he learned from his analysis of them.

He wrote that the sequences support other lines of evidence that SARS-CoV-2 was circulating in Wuhan before the December 2019 outbreak in a seafood market. They do not provide evidence either for or against either a natural animal origin for the virus or an accidental lab leak. More early sequences are probably out there, he wrote, and scientists should focus on identifying them and analyzing all available data to determine the origins of the pandemic.

As the pandemic increasingly comes under control in the U.S., Bloom and other scientists have begun focusing on understanding how the pandemic began. This spring, Bloom teamed up with other experts in his field to speak out publicly in support for a more thorough investigation. In a letter published in Science, Bloom and 17 other scientists argued that “greater clarity about the origins of this pandemic is necessary and feasible to achieve. We must take hypotheses about both natural and laboratory spillovers seriously until we have sufficient data."

In a Q&A, we asked Bloom to explain the significance of understanding pandemic origins in the context of understanding viruses and preventing future outbreaks.

Why is it important to figure out how the COVID-19 pandemic started?

Bloom: By understanding the origins of SARS-CoV-2, we can be informed about how to best use the power of science to mitigate the risk of possible future viral outbreaks.

Currently, there is a lack of clear evidence about how the SARS-CoV-2 virus emerged. The deep ancestors of SARS-CoV-2 are coronaviruses from bats, but so far no bat virus has been identified that is closely enough related to SARS-CoV-2 to be the immediate ancestor. There are two major theories about how the bat ancestor viruses could have led to the emergence of the pandemic in Wuhan. One theory is that there was a natural zoonosis, with the virus jumping directly from a bat to a human, or passing from a bat to an intermediate animal host and then to a human. The other theory is that there was some sort of accident in one of the labs in Wuhan that was working with bat coronaviruses.
Both theories are plausible given the currently available evidence. I also believe as a scientist it’s important to clearly convey that there is scientific uncertainty — especially because this is a hot-button topic. The job of scientists like myself is to take a more objective and dispassionate approach, and be sure that the discussion is framed in terms of scientific facts, rather than the many strong opinions that some people have about this topic. And unfortunately, at this point, the facts are limited.

Sizcə nə oldu? Was it an accidental lab leak or natural emergence?

Bloom: Natural zoonosis is plausible because most pandemics start that way. For instance, four of the last five influenza pandemics started from natural zoonoses, while one (the 1977 influenza pandemic) was due to human error: either a misguided vaccine trial or a lab accident. In the case of coronaviruses, we know that in the past there have been other animal coronaviruses that have caused outbreaks in humans due to direct animal-to-human jumps. These include the original SARS-CoV-1 and MERS-CoV. My first assumption when I heard about SARS-CoV-2 back in January of 2020 was that it most likely had jumped from a bat.

But there have also been lab accidents. For instance, in 2004 a number of people in Beijing were infected with SARS-CoV-1 due to a lab accident. The reason that a lab accident is a plausible explanation for the origins of SARS-CoV-2 is that one of the leading labs studying SARS-like coronaviruses is located in Wuhan, and researchers there are known to have collected many coronaviruses, although at this point there is no evidence that they had collected any virus sufficiently similar to SARS-CoV-2 to be its direct ancestor.

That’s why I joined other scientists in an open letter published in Science calling for more investigation. We’re not taking an advocacy position on one scenario being more likely than another. We’re just pointing out that the existing scientific evidence is insufficient to know what happened. We need more investigation of this topic if we ever hope to get a clear answer.

Why was publishing an open letter in Science important and how did it come together?

Bloom: I am among 18 scientists who wrote and signed the letter that appeared May 13 in the journal Science.

We wanted a letter published in a scientific journal. Our goal in writing a letter by practicing scientists and publishing it in a scientific journal was to remind people that how the pandemic started is ultimately a scientific question, not a political one.

A few of us started drafting the letter to support calls from the World Health Organization and U.S. government to further investigate the origins of the virus. We reached out to other scientists with relevant expertise who were currently studying SARS-CoV-2 and virus evolution — and most other scientists we contacted agreed to sign the letter.

What has been the response to the letter?

Bloom: I’m still getting a lot of emails. Many from other scientists who are supportive of the need for more investigation, others saying that further investigation is a distraction. Almost everyone concurs that the science is unclear, but people differ in their assessments of the relative likelihoods of a lab accident versus a natural zoonosis. As a scientist, I’m used to the idea of dealing with uncertainty, but I’m not accustomed to dealing with uncertain topics where so many people istəmək one or the other possibility to be true even if the evidence remains unclear.

However, I’m encouraged by the growing consensus on the need for further investigation. Many basic facts about the earliest SARS-CoV-2 cases remain unclear, so of course scientists and experts have different guesses on the relative likelihoods of a lab accident versus a natural zoonosis. But there is a shared view that further careful scientific investigation is needed.

What would you want from another investigation? And how likely is that considering so much will have to happen in China?

Bloom: It’s clear further study is needed to determine the origins of the virus.

Ideally, we can get more access to underlying data about the sequences of the coronaviruses that were being studied in Wuhan labs and more insight on the earliest human cases of COVID-19.

There are complex and political dimensions, but that’s beyond the scope of what I can control. My job as a scientist is to focus on trying to get at the truth.

Some dismissed the lab leak idea as a conspiracy theory and others have wondered if it was intentional. What’s your view?

Bloom: We don’t have enough scientific evidence to rule anything out. In my view, an investigation should include study of both a possible natural zoonosis and a possible lab accident.

I do not think that intentional release is a plausible theory: There is no motive, and all indications are that the outbreak was a surprise to China just like the rest of the world, which would not be the case for an intentional release.


NIH researchers identify key genomic features that could differentiate SARS-CoV-2 from other coronaviruses that cause less severe disease

The full genomes of all human coronaviruses were aligned to identify regions (red) that might code for lethal differences in the virus that causes COVID-19 as well as SARS and MERS. These differences could be targets for testing or treatments. Donny Bliss, NLM

A team of researchers from the National Library of Medicine (NLM), part of the National Institutes of Health, identified genomic features of SARS-CoV-2, the virus that causes COVID-19, and other high-fatality coronaviruses that distinguish them from other members of the coronavirus family. This research could be a crucial step in helping scientists develop approaches to predict, by genome analysis alone, the severity of future coronavirus disease outbreaks and detect animal coronaviruses that have the potential to infect humans. The findings were published this week in the Proceedings of the National Academy of Sciences.

COVID-19, an unprecedented public health emergency, has now claimed more than 380,000 lives worldwide. This crisis prompts an urgent need to understand the evolutionary history and genomic features that contribute to the rampant spread of SARS-CoV-2.

“In this work, we set out to identify genomic features unique to those coronaviruses that cause severe disease in humans,” said Dr. Eugene Koonin, an NIH Distinguished Investigator in the intramural research program of NLM’s National Center for Biotechnology Information, and the lead author of the study. “We were able to identify several features that are not found in less virulent coronaviruses and that could be relevant for pathogenicity in humans. The actual demonstration of the relevance of these findings will come from direct experiments that are currently getting under way.”

Using integrated comparative genomics and machine learning techniques, the researchers compared the genome of the SARS-CoV-2 virus against the genomes of other members of the coronavirus family and identified protein features that are unique to SARS-CoV-2 and two other coronavirus strains with high fatality rates, SARS-CoV and MERS-CoV. The identified features correspond with the high fatality rate of these coronaviruses, as well as their ability to move from animal to human hosts.

These features include insertions of specific stretches of amino acids into two virus proteins, the nucleocapsid and the spike. These features are found in all three high-fatality coronaviruses and their closest relatives that infect animals, such as bats, but not in four other human coronaviruses that cause non-fatal disease. In particular, the insertions in the spike protein are predicted, from protein structure analysis, to facilitate the recognition of the coronavirus receptors on human cells and the subsequent penetration of the virus into those cells. Finding these features in animal coronavirus isolates could predict the jump to humans and the severity of disease caused by such isolates.

“This innovative research is critical to improve researchers’ understanding of SARS-CoV-2 and aid in the response to COVID-19,” said NLM Director Patricia Flatley Brennan, R.N., Ph.D. “Predictions made through this analysis can inform possible targets for diagnostics and interventions.”

Bu press -reliz əsas tədqiqat nəticələrini təsvir edir. Əsas tədqiqatlar insan davranışı və biologiya haqqında anlayışımızı artırır ki, bu da xəstəliklərin qarşısının alınması, diaqnozu və müalicəsinin yeni və daha yaxşı yollarını inkişaf etdirmək üçün əsasdır. Science is an unpredictable and incremental process — each research advance builds on past discoveries, often in unexpected ways. Fundamental fundamental tədqiqatların biliyi olmadan əksər klinik irəliləyişlər mümkün olmazdı.


Videoya baxın: Тест-система для выявления антител IgG. IgM к коронавирусу SARS-CoV-2 (Sentyabr 2022).


Şərhlər:

  1. Tujind

    Üzr istəyirəm, amma səhv etdiyinizi düşünürəm. Mən əminəm. Bunu müzakirə etməyi təklif edirəm. PM-də mənə e-poçt göndərin, danışacağıq.

  2. Memphis

    Mənə elə gəlir ki, bu artıq müzakirə olunub, forumda axtarışdan istifadə edin.

  3. Aleeyah

    Bilirəm ki, onlar sizə burada düzgün həlli tapmağa kömək edəcəklər.

  4. Hal

    Müdaxilə etdiyim üçün üzr istəyirəm, mən də fikrimi bildirmək istəyirəm.

  5. Aethretun

    Məncə yanılırsınız. araşdırmağı təklif edirəm.



Mesaj yazmaq