Məlumat

27.2: Zülalların sintezi - Biologiya

27.2: Zülalların sintezi - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

27.2: Protein sintezi

Fəsil 27 - Prokaryotlar

  • İnsanlar sabah planetdən yoxa çıxsalar, Yer kürəsində həyat digər canlıların əksəriyyəti üçün davam edəcək.
  • Ancaq prokaryotlar biosfer üçün o qədər əhəmiyyətlidir ki, yox olsaydılar, başqa bir həyatın sağ qalma perspektivləri qaranlıq olardı.

Prokaryotlar ekosistemlərdəki kimyəvi elementlərin geri çevrilməsində əvəzolunmaz halqalardır.

  • Bütün canlılarda üzvi molekulları təşkil edən atomlar bir zamanlar torpaqda, havada və suda olan qeyri-üzvi birləşmələrin bir hissəsi idi.
  • Həyat, ekosistemlərin bioloji və kimyəvi komponentləri arasındakı kimyəvi elementlərin təkrar istifadəsindən asılıdır.
    • Prokaryotlar bu prosesdə mühüm rol oynayır.
    • Chemoheterotrophic prokaryotlar, cəsədləri, ölü bitkiləri və tullantıları parçalayaraq karbon, azot və həyat üçün vacib olan digər elementlərin tədarükünü açaraq parçalayıcı funksiyasını yerinə yetirirlər.
    • Prokaryotlar həmçinin elementlərin ətraf mühitin cansız komponentlərindən üzvi birləşmələr hovuzuna qayıtmasına vasitəçilik edirlər.
    • Ototrofik prokaryotlar, karbon dioksiddən istifadə edərək üzvi birləşmələr əmələ gətirir və daha sonra qida zəncirlərindən keçir.
    • Dəmir, kükürd, azot və hidrogen kimi elementləri olan qeyri -üzvi molekulları metabolizə edə bilən yeganə orqanizmlərdir.
    • Siyanobakteriyalar nəinki qida sintez edir və atmosferə oksigeni bərpa edir, həm də azotu fiksasiya edir.
      • Bu, torpağı və suyu digər orqanizmlərin zülal etmək üçün istifadə edə biləcəyi azotlu birləşmələrlə saxlayır.

      Bir çox prokaryot simbiotikdir.

      • Prokaryotlar tez -tez tamamlayıcı maddələr mübadiləsi olan digər prokaryotlar və ya eukaryotlar ilə qarşılıqlı təsir göstərir.
      • Birbaşa təmasda olan orqanizmlər arasındakı ekoloji əlaqəyə simbioz deyilir.
        • Simbiotik orqanizmlərdən biri digərindən daha böyükdürsə, ona ev sahibi deyilir, ən kiçiyinə isə simbiont deyilir.
        • Bu növlərin bir çoxu öz bağırsağımızın edə bilmədiyi qidaları həzm edən qarşılıqlıdır.
        • Genom, karbohidratların, vitaminlərin və insanlar üçün lazım olan digər qidaların sintezində iştirak edən geniş bir sıra genləri ehtiva edir.
        • Bakteriyadan gələn siqnallar qida qəbul etmək üçün zəruri olan bağırsaq qan damarlarının şəbəkəsini quran insan genlərini aktivləşdirir.
        • Digər siqnallar insan hüceyrələrini B. tetaiotaomikronun həssas olmadığı antimikrob birləşmələr istehsal etməyə vadar edir və bakteriyanı rəqiblərindən qoruyur.

        Konsepsiya 27.5 Prokaryotların insanlara həm zərərli, həm də faydalı təsirləri var

        • Patojenik prokaryotlar, prokaryotik növlərin yalnız kiçik bir hissəsini təmsil edir.
          • Digər prokaryotlar kənd təsərrüfatında və sənayedə əsas vasitələr kimi xidmət edir.
          • Müalicə edilməzsə, Lyme xəstəliyi zəiflədən artrit, ürək xəstəliyi və əsəb pozğunluqlarına səbəb ola bilər.
          • Vibrio cholerae tərəfindən istehsal olunan ekzotoksin, şiddətli ishal ilə xarakterizə olunan ciddi bir xəstəlik olan vəba xəstəliyinə səbəb olur.
            • Ekzotoksin bağırsaq hüceyrələrini osmozun ardından bağırsaq suyuna xlor ionlarını (Cl?) Buraxmasını stimullaşdırır.
            • Salmonella cinsindən olan endotoksin istehsal edən bakteriyalar normal olaraq sağlam heyvanlarda olmur.
            • Salmonella typhi tifo atəşinə səbəb olur.
            • Digər quşçuluq növlərində də daxil olmaqla digər Salmonella növləri qida zəhərlənməsinə səbəb olur.
            • E. coli ümumiyyətlə insan bağırsaqlarında zərərsiz bir simbiontdur.
            • Qanlı ishala səbəb olan patogen suşlar ortaya çıxdı.
              • Ən təhlükəli suşlardan biri O157: H7 adlanır.
              • Bu gün qlobal bir təhlükədir, hər il təkcə ABŞ -da 75,000 hadisə baş verir.
              • 2001 -ci ildə beynəlxalq alimlər qrupu O157: H7 genomunu sıraladı və E. coli zərərsiz suşunun genomu ilə müqayisə etdi.
              • O157: H7 -dəki 5416 gendən 1387 -nin zərərsiz suda heç bir analoqu yoxdur.
              • Bu 1387 gen üfüqi gen transferi yolu ilə, çox güman ki, bakteriofaqların təsiri ilə O157:H7 genomuna daxil edilmiş olmalıdır.
              • İdxal edilən genlərin bir çoxu, patojenin ev sahibinə hücumu ilə əlaqədardır.
              • Məsələn, bəzi genlər O157:H7-nin bağırsaq divarına yapışmasını və qida maddələrini çıxarmasını təmin edən ekzotoksinləri kodlayır.

              İnsanlar tədqiqat və texnologiyada prokaryotlardan istifadə edirlər.

              • İnsanlar elmi tədqiqat və praktiki məqsədlər üçün prokaryotların müxtəlif metabolik qabiliyyətlərindən istifadə etməyi öyrənmişlər.
                • Maddələr mübadiləsi və molekulyar biologiya haqqında bildiklərimizin çoxu sadə model sistemlər olaraq prokaryotlardan, xüsusən də E. coli istifadə edərək öyrənildi.
                • Ətraf mühit problemlərini həll etmək üçün prokaryotlar getdikcə daha çox istifadə olunur.
                • Ən tanış nümunə, insan çirkab sularını təmizləmək üçün prokaryot parçalayıcılarının istifadəsidir.
                • Anaerob bakteriyalar üzvi maddələri çamura (çirkab suda bərk maddələr) parçalayır, aerob mikroblar da maye tullantıları ilə eyni şeyi edirlər.
                • Digər bioremediasiya tətbiqlərinə radioaktiv tullantıların parçalanması və neft sızmalarının təmizlənməsi daxildir.
                • Digər prokaryotlar filizdən qızıl çıxara bilər.

                Campbell/Reece Biology, 7 Edition, ecture Outline, © Pearson Education, Inc. 27-1


                Endofitik göbələklərdən istifadə edərək qızıl nanohissəciklərin yaşıl sintezi və xarakteristikası Fusarium solani və onun in vitro antikanser və biotibbi tətbiqləri

                Bu araşdırma, endofitik bir suş istifadə edərək yaşıl sintez üsulu ilə əldə edilən qızıl nanohissəciklərinin (NP) xərçəng əleyhinə potensialını araşdırmaq məqsədi daşıyır. Fusarium solani ATLOY - 8 zavoddan təcrid olunub Chonemorpha ətirləri. NP-lərin formalaşması UV, FTIR, SEM və XRD ilə təhlil edilmişdir. Sintez edilmiş NP-lər çəhrayı-yaqut qırmızı rənglər göstərdi və 510 ilə 560 nm arasında yüksək pik plazmon diapazonu müşahidə edildi. Emilim intensivliyinin dalğa uzunluğunu durmadan artırdığı və bandın 551 nm -də sabitləşdiyi müşahidə olunur. XRD nümunəsi, açıları sırasıyla 19, 38.32, 46.16, 57.50 və 76.81 ° açdı. Maraqlıdır ki, 1413 sm -1, 1041 sm -1 və 690 sm -1-də qeyd olunan FTIR zolağının udulması nanohissəciklərin amin II zolaqlarının, C-N və C-H uzanan vibrasiyalarının mövcudluğunu izah etdi. SEM analizi göstərdi ki, sintez edilmiş nanohissəciklərin orta diametri 40 ilə 45 nm arasındadır. Bu NP-lər uşaqlıq boynu xərçəngi hüceyrələrinə (He La) və insan döş xərçəngi hüceyrələrinə (MCF-7) qarşı sitotoksiklik göstərmiş və NP-lər dozadan asılı sitotoksik təsir göstərmişdir. IC50 dəyəri MCF-7 hüceyrə xəttində 0.8 ± 0.5 μg/ml idi və MCF-7 hüceyrə xətlərində 1.3 ± 0.5 μg/ml olduğu təsbit edildi. Sintez edilmiş NP -lər bu xərçəng hüceyrə xətlərində apoptozu induksiya edir. Müxtəlif konsentrasiyalara 12 saat məruz qaldıqdan sonra MCF-7 xərçəng hüceyrələrində hüceyrə dövrünün sub G0 və G1 fazalarında apoptotik hüceyrələrin toplanmasının 55,13%, 52,11% və 51,10% olduğu müəyyən edilmişdir. Nəticələr ümumilikdə az sistemli toksikliyi olan daha təhlükəsiz kemoterapevtik agent üçün aşkar və çox yönlü biotibbi tətbiqi təmin edir.

                Açar sözlər: Camptothecin Hüceyrə dövrü Chonemorpha fragrans Cytotoxicity DAPI boyama Fusarium solani.

                Rəqəmlər

                Camptothecin XRD nümunəsi yükləndi...

                Camptothecin yüklü qızıl nanohissəciklərin XRD modeli.

                Camptothecin FT-IR tədqiqatları yükləndi ...

                Camptothecin yüklü qızıl nanohissəciklərinin FT-IR tədqiqatları.

                Kamptotesinin UV-Görünən spektrləri yüklənir...

                UV - Camptothecin yüklü qızıl nanohissəciklərin görünən spektrləri.

                Camptothecinin SEM görüntüsü yükləndi ...

                Camptothecin yüklü qızıl nanohissəciklərin SEM görüntüsü.

                Camptothecin hissəcik ölçüsü paylanması ...

                Camptothecin yüklü qızıl nanohissəciklərin hissəcik ölçüsü paylanması.

                Zeta potensial tədqiqatları Camptothecin yükləndi ...

                Zeta potensial tədqiqatları Camptothecin yüklü qızıl nanohissəcikləri.

                MTT-nin sitotoksik təsiri...

                IC göstərən MTT azaldılması analizinin sitotoksik təsiri 50 dəyərlər…

                MCF-7-nin morfoloji xarakteristikası...

                0.5 μg/ml ilə işlənmiş (b-d işlənmiş) MCF-7 hüceyrələrinin morfoloji xarakteristikası, 1…

                Müxtəlif üsullarla müalicə olunan MCF-7 hüceyrələri…

                MCF-7 hüceyrələri fərqli konsentrasiyalarda (0,5 μg/ml, 1 μg/ml və 2…

                Müxtəlif üsullarla müalicə olunan MCF-7 hüceyrələri…

                MCF-7 hüceyrələri müxtəlif konsentrasiyalarla (0,5 μg/ml, 1 μg/ml və 2…

                HAuCl 4 müxtəlif üsullarla müalicə olunur ...

                HAuCl 4 0.5 μg/ml, 1 μg/ml və 2 fərqli konsentrasiyalarda işlənmiş həll…


                7.6 Karbohidrat, Zülal və Lipid Metabolik Yollarının Əlaqələri

                Bu bölmənin sonunda siz aşağıdakıları edə biləcəksiniz:

                • Karbohidrat mübadiləsinin yollarını, qlikoliz və limon turşusu dövranının zülal və lipid mübadiləsi yolları ilə qarşılıqlı əlaqəsini müzakirə edin.
                • Metabolik yolların niyə qapalı sistem sayılmadığını izah edin

                Canlı hüceyrələrə enerji verən qlükozanın katabolizması haqqında məlumat əldə etdiniz. Ancaq canlılar qida üçün qlükozadan başqa üzvi birləşmələr istehlak edirlər. Bir hinduşka sendviçi hüceyrələrinizdə ATP kimi necə başa çatır? Bu, karbohidratlar, zülallar və lipidlər üçün bütün katabolik yolların nəticədə qlikolizə və limon turşusu dövrü yollarına bağlandığı üçün baş verir (bax Şəkil 7.17). Metabolik yollar məsaməli və bir-biri ilə əlaqəli hesab edilməlidir - yəni maddələr digər yollardan daxil olur və aralıq maddələr başqa yollara ayrılır. Bu yollar qapalı sistemlər deyil! Müəyyən bir yolda olan bir çox substratlar, ara məhsullar və məhsullar digər yollarda reaktivlərdir.

                Digər şəkərlərin qlükoza metabolizmi ilə əlaqəsi

                Qlükozanın bir polimeri olan glikogen, heyvanlarda enerji saxlayan bir molekuldur. Kifayət qədər ATP olduqda, artıq qlükoza həm qaraciyərdə, həm də əzələ hüceyrələrində glikogen olaraq saxlanılır. Qanda şəkərin səviyyəsi aşağı düşərsə, glikogen qlükoza 1-fosfat monomerlərinə (G-1-P) hidroliz olunacaq. Qlükoza mənbəyi olaraq glikogenin olması, məşq zamanı ATP -nin daha uzun müddət istehsal olunmasına imkan verir. Glikogen, həm əzələ, həm də qaraciyər hüceyrələrində qlükoza-1-fosfata (G-1-P) bölünür və qlükoza-6-fosfata (G-6-P) çevrilir və bu məhsul qlikolitik yola daxil olur.

                Saxaroza, qlükoza molekulu və fruktoza molekulu olan bir glikosidik bağla bağlanmış bir disakariddir. Fruktoza həzm zamanı birbaşa qan dövranına sorulan qlükoza və qalaktoza (süd şəkəri dissaxarid laktozasının bir hissəsi) ilə birlikdə üç "pəhriz" monosaxaridindən biridir. Həm fruktoza, həm də qalaktozun katabolizmi qlükoza ilə eyni sayda ATP molekulu istehsal edir.

                Zülalların qlükoza metabolizmi ilə əlaqəsi

                Zülallar hüceyrələrdə müxtəlif fermentlər tərəfindən hidrolizə olunur. Çox vaxt amin turşuları yeni zülalların sintezinə çevrilir. Əgər artıq amin turşuları varsa və ya orqanizm aclıq vəziyyətindədirsə, bəzi amin turşuları qlükoza katabolizminin yollarına daxil olur (Şəkil 7.16). Qeyd etmək çox vacibdir ki, hər bir amin turşusu bu yollara daxil olmamışdan əvvəl öz amin qrupunu çıxarmalıdır. Amin qrupu ammonyaka çevrilir. Məməlilərdə qaraciyər iki ammonyak molekulundan və bir karbon dioksid molekulundan üre sintez edir. Beləliklə, üre, amin turşularından əmələ gələn azotdan əmələ gələn məməlilərdəki əsas tullantı məhsuludur və bədəndən sidiklə çıxır. Qeyd etmək lazımdır ki, amin turşuları hüceyrə tənəffüs siklinin aralıq maddələrindən və reaktivlərdən sintez edilə bilər.

                Lipid və qlükoza metabolizmasının əlaqələri

                Qlükoza yoluna bağlı lipidlərə xolesterol və trigliseridlər daxildir. Xolesterol, hüceyrə membranının elastikliyinə kömək edən və steroid hormonlarının xəbərçisi olan bir lipiddir. Xolesterolun sintezi asetil qrupları ilə başlayır və yalnız bir istiqamətdə davam edir. Proses geri çevrilə bilməz.

                Qliserin və üç yağ turşusunun birləşməsi nəticəsində yaranan trigliseridlər heyvanlarda uzunmüddətli enerji saxlama formasıdır. Heyvanlar ehtiyac duyduğu yağ turşularının çoxunu edə bilərlər. Triqliseridlər həm qlükoza katabolizmasının bəzi hissələri vasitəsilə hazırlana bilər, həm də parçalana bilər. Gliserol, qlikoliz yolu ilə davam edən gliserol-3-fosfata fosforlaşdırıla bilər. Yağ turşuları mitoxondrilərin matrisində baş verən və onların yağ turşusu zəncirlərini asetil qruplarının iki karbonlu vahidlərinə çevirən beta-oksidləşmə adlanan prosesdə katabolizasiya olunur. Asetil qrupları, limon turşusu dövrünə keçən asetil CoA yaratmaq üçün CoA tərəfindən toplanır.

                Təkamül Bağlantısı

                Fotosintez və Hüceyrə Metabolizmasının Yolları

                Fotosintez və hüceyrə metabolizması prosesləri çox mürəkkəb yollardan ibarətdir. Ümumiyyətlə güman edilir ki, ilk hüceyrələr sulu mühitdə - qida maddələrinin "şorbası" - ola bilsin ki, bəzi məsaməli gillərin səthində, bəlkə də isti dəniz mühitində yaranıb. Əgər bu hüceyrələr uğurla çoxalsa və onların sayı durmadan artsa, bundan belə nəticə çıxır ki, hüceyrələr qida maddələrini öz bədənlərinin komponentlərinə köçürdükləri üçün yaşadıqları mühitdən qida maddələrini tükəndirməyə başlayacaqlar. Bu hipotetik vəziyyət, təbii seleksiya ilə, ətraf mühitdə qalan qida maddələrini istifadə edərək və bu qida maddələrinin üzərində yaşaya biləcəkləri materiallara manipulyasiya etməklə mövcud ola biləcək orqanizmlərə üstünlük verərdi. Seçim, əldə edə bildikləri qida maddələrindən maksimum dəyər əldə edə bilən orqanizmlərə üstünlük verəcəkdir.

                Hidrogen atomlarının mənbəyi olaraq sudan istifadə edərək günəş enerjisindən istifadə edən erkən bir fotosintez forması meydana gəldi, lakin bu yol sərbəst oksigen (anoksigenik fotosintez) istehsal etmədi. (Başqa bir oksigenli fotosintez növü, oksigen istehsal etmədi, çünki hidrogen ionlarının mənbəyi kimi su istifadə etmədi, hidrogen sulfid kimi materiallardan istifadə etdi və nəticədə kükürd əmələ gətirdi). Glikolizin bu dövrdə meydana gəldiyi və istehsal olunan sadə şəkərlərdən istifadə edə biləcəyi, lakin bu reaksiyaların karbohidratlarda saxlanan enerjini tam olaraq çıxara bilmədiyi düşünülür. Glikolizin inkişafı, ehtimal ki, fotosintezin təkamülündən əvvəl baş verdi, çünki o, "ilkin şorbada" kortəbii olaraq yığılan materiallardan enerji çıxarmaq üçün çox uyğun idi. Sonrakı bir fotosintez forması sudan elektron və hidrogen mənbəyi olaraq istifadə edərək sərbəst oksigen əmələ gətirdi. Zaman keçdikcə atmosfer oksigenləşdi, lakin oksigen okeanda oksidləşmiş metalları buraxmadan və çöküntüdə “pas” təbəqəsi yaratmadan ilk oksigen fotosintezatorların yaranma tarixini müəyyən etməyə imkan verdi. Aerobik tənəffüsün inkişafına imkan verən bu yeni atmosferdən istifadə etmək üçün uyğunlaşdırılmış canlılar. Oksigen fotosintezin tam prosesi inkişaf etdikdə və atmosfer oksigenləşdikdə, hüceyrələr nəhayət, limon turşusu dövrü və oksidləşdirici fosforlaşmadan istifadə edərək, şəkər molekullarından əhəmiyyətli dərəcədə daha çox enerji çıxarmaq üçün fotosintezlə çıxarılan oksigeni istifadə edə bildilər.


                2 -ci hissə: bir RNA birləşdirmə maşınının içərisində

                00: 00: 07.19 Mən Yale Universitetindən Anna Marie Pyle
                00: 00: 09.27 və bu gün sizə quruluş haqqında danışacağam
                00:00:12.20 və bir RNT bağlama maşınının funksiyası,
                00: 00: 15.10, katalitik olaraq kəsə bilən bir RNT molekuludur
                00: 00: 18.15 və RNA parçalarını bir -birinə yapışdırın.
                00:00:24.28 Bu gün diqqət edəcəyim maşın Qrup II öz-özünə yapışan intron adlanır
                00:00:29.03 və bu molekul çox böyük bir ribozim və ya katalitik RNT,
                00:00:33.19 öz birləşməsini və öz transpozisiyasını kataliz edə bilən,
                00:00:37.02 bu, əvvəlki əlavə yerlərə qayıtmaq deməkdir.
                00: 00: 41.09 Və bunlar çox böyük fermentlərdir
                00:00:44.01 və onlar təbiətdəki ən böyük ribozimlərdən biridir.
                00: 00: 47.27 Və burada gördüyünüz kimi,
                00:00:49.09 bu, onların kataliz etdiyi reaksiyadır - iki mərhələdən keçir.
                00: 00: 52.21 İlk addımda intron bir quruluşa qatlanır
                00: 00: 56.11, birləşmə reaksiyasını kataliz edə bilər,
                00:00:59.18 su ilə vasitəçilik edilir,
                00: 01: 01.12 və ya intron içərisində adenozinin 2 'hidroksil (2'-OH) qrupu.
                00: 01: 05.15 Bu addımdan sonra lariat aralıq əldə edirsiniz və,
                00: 01: 09.00, ikinci addımda,
                00:01:10.16 5' əlavə sahəsinin 3'-OH qrupu yenidən hücum edir,
                00: 01: 14.22 lariat intron və bağlanmış ekzonlar buraxır.
                00: 01: 19.07 Bu sizə tanış görünməlidir
                00:01:20.13 çünki bu, katalizləşdirilmiş reaksiyanın eyni növüdür
                00: 01: 23.12 nüvə spliceosomunuz tərəfindən,
                00:01:25.06 bütün RNT-lərimizi emal etmək üçün vacib olan birləşdirmə maşınıdır.
                00: 01: 30.14 Bunu nəzərdən keçirmək üçün,
                00: 01: 32.10 anlayın ki, mRNA-larınızdan və ya prekursor mesajlarınızdan çoxu,
                00: 01: 37.15 -də 10 -a qədər intron və bəzən daha çox olur.
                00:01:40.29 Və bunlar spliceosomunuzun funksiyası vasitəsilə aradan qaldırılmalıdır.
                00:01:44.16 Beləliklə, spesifikliyi başa düşməyimiz çox vacibdir
                00:01:47.02 və bu reaksiyanın mexanizmi.
                00:01:50.02 Model sistem olaraq,
                00:01:50.25 Mən Qrup II intron öz-özünə əlavə etmə sisteminə diqqət yetirdim.
                00: 01: 55.03 Bu sistemlər arasındakı fərq qatlanmış quruluşdur
                00: 01: 58.07 intronun özü bu reaksiyanı kataliz edir
                00:02:01.25 heç bir zülal olmadıqda,
                00: 02: 03.25 spliceosoma yüzlərlə zülal tələb edir
                00: 02: 07.23 və çox yüksək səviyyədə qorunmuş RNT molekullarından ibarətdir
                00:02:09.28 eyni reaksiyanı kataliz etmək.
                00: 02: 12.08 Beləliklə, birləşmə mexanikasını anlamaq üçün faydalı paralel sistemlərdir.
                00: 02: 19.21 Beləliklə, II qrup intronların necə göründüyünə bir az daha diqqət yetirək:
                00: 02: 23.02 onların domen arxitekturası və ikincil quruluşu altı qaynaqdan və ya domendən ibarətdir
                00: 02: 27.27 belə bir mərkəzi təkərdən yayılır.
                00: 02: 31.13 Domain 1 və ya ən böyük domen,
                00: 02: 33.14 həmişə əvvəlcə yazılır və qatlanır
                00: 02: 36.23 və bu, bütün digər sahələrin yerləşdiyi iskele sahəsidir.
                00: 02: 40.28 Hədəfləri tanımaq üçün ardıcıllıqları da ehtiva edir
                00:02:44.08 hücum edəcək və parçalanacaq,
                00: 02: 46.02 xüsusən özünün 5 'exon.
                00:02:49.10 Digər domenlər kataliz üçün kritik deyil,
                00: 02: 52.03 ancaq II qrup intronun ən vacib hissəsidir
                00: 02: 54.20, Domain 5 adlanan bu kiçik saç tokasıdır.
                00: 02: 58.16 Bu, II qrup intronun yeganə hissəsidir
                00:03:00.29 Müxtəlif növlər arasında demək olar ki, dəyişməz
                00: 03: 03.25 və bu maraqlıdır, çünki II qrup intronları nəhəng molekullardır.
                00: 03: 07.20 400-1000 ölçülü nukleotidlərdir
                00: 03: 10.23 və burada yalnız bu 34 nukleotidin olması ironikdir
                00:03:14.20 onun ən qorunan xüsusiyyətidir.
                00: 03: 17.16 II qrup intronun digər vacib hissəsi Domain 6,
                00: 03: 20.12 və bu adenozini ehtiva edən sahədir
                00: 03: 22.28, nükleofili ilk birləşmə addımı üçün daşıyır.
                00:03:26.15 Qrup II intronlarının çoxu ilk addım üçün sudan nukleofil kimi istifadə edir.
                00: 03: 31.11 Beləliklə, II qrup intron üçün əsas təşkilati plan budur.
                00: 03: 36.03 Onların reaksiya mexanizmi nədir?
                00:03:38.03 Çox sadə SN2 reaksiyasını katalizləyirlər,
                00:03:41.11 sıra içərisində nükleofilik hücumdur,
                00:03:43.18 2'-OH qrupu olan spirt
                00: 03: 48.23 başqa bir riboza və ya su,
                00: 03: 50.27 bu fosfata xətti hücum,
                00: 03: 53.05 sizə trigonal bipiramidal aralıq verir
                00: 03: 57.07 və bu fosfat və 3'-OH qrupunun sərbəst buraxılması
                00: 04: 01.06 konfiqurasiya tərsinə çevrildi.
                00:04:03.29 Kimyəvi biologiya üsullarından istifadə edərək,
                00: 04: 05.27 Joe Piccirilli bunun bir reaksiya olduğunu anladı
                00:04:09.28 Qrup II intronun nüvəsindəki metal ionları ilə katalizlənir.
                00:04:14.26 Və beləliklə II qrup intronlar, bir çox ribozimlər kimi,
                00: 04: 17.07 amma hamısı deyil,
                00: 04: 17.22 bir metallozimdir və metalları aşağıdakı şəkildə istifadə edir.
                00:04:23.25 O, maqneziumların ayrılan qrupu koordinasiya etdiyini göstərdi
                00: 04: 26.26 və nukleofil
                00:04:27.28 mənfi yük yığılmasını sabitləşdirmək
                00:04:30.23 bu keçid vəziyyətində.
                00: 04: 33.03 Yəni nisbətən sadə bir reaksiyadır
                00:04:34.27 və həm birinci, həm də ikinci addımlarda demək olar ki, eyni reaksiyadır
                00: 04: 37.26 birləşmə.
                00:04:42.10 Beləliklə, biz bu RNT-lərin əsas bədən planını bilirdik
                00:04:44.20 və biz onların hansı reaksiyanı katalizlədiyini bilirdik,
                00: 04: 47.12 amma kimyəvi katalizin dəqiq mexanizmini həqiqətən anlamadıq.
                00: 04: 51.19 Və bu RNT -nin ehtimal olduğunu da bilirdik
                00: 04: 53.22 Hər cür üçüncü ali struktur motivlərinə sahib olmaq.
                00:04:57.24 Beləliklə, bu molekulun arxitekturasını anlamaq istəsək
                00: 05: 00.27 və onun dəqiq mexanizmi,
                00: 05: 03.00 yüksək qətnamə kristal quruluşa ehtiyacımız var idi.
                00: 05: 06.18 Deməli, edə biləcəyimiz şey ikincil quruluşdan getmək idi.
                00: 05: 10.25 və ya adlandırmaq istədiyim kimi molekulun roadkill xəritəsi
                00:05:14.06 üçüncü struktura.
                00: 05: 16.12 Mən sizə bu səyahət haqqında bir az danışacağam
                00:05:18.15 və necə bir əlavə maşının nüvəsini görselleştirmeye başladıq.
                00:05:25.01 Hamısı II Qrup intronun müəyyən edilməsi ilə başladı
                00: 05: 28.02 ki, asanlıqla kristallaşır.
                00:05:29.28 Və biz bu molekulu təxminən 10 il axtardıq,
                00:05:32.24 Qrup II intronlarının çox, çox müxtəlif növlərinə baxır
                00:05:35.08 və son dərəcə sabit və kristallaşa bilən birini tapmağa çalışır.
                00:05:39.09 Nəhayət, asanlıqla kristallaşan birini tapdıq
                00:05:42.29 eubacterium Oceanobacillus iheyensis ardıcıllığında.
                00:05:47.07 Və biz bu molekulu transkripsiya etdikdə,
                00: 05: 49.01, özünü birləşdirdiyini və sabitləşdiyini gördük
                00: 05: 51.20 çox aşağı maqneziumlu fizioloji ionlarda və temperaturda.
                00: 05: 56.08 Beləliklə, perspektivli bir namizəd idi.
                00:05:59.27 Biz daha sonra bu molekulun təxminən 120 fərqli konstruksiyasını yaratmağa davam etdik.
                00: 06: 04.20 qablaşdırmağa çalışmaq üçün
                00:06:07.11 və gözəl kristallar düzəldin
                00:06:09.01 biz strukturu həll edə bildik.
                00: 06: 12.07 Və bu quruluşların hamısının 87 nömrəsi,
                00:06:14.27 nəhayət 3.1 Angstrom qətnaməsinə kristallaşdı,
                00:06:18.11 strukturun həlli üçün hədəf aralığındadır.
                00:06:21.04 Və yalnız bu molekulu necə dəyişdirdiyimizi göstərmək üçün
                00:06:23.23 kristallaşmanı tədricən yaxşılaşdırmaq üçün,
                00: 06: 25.17 bilməlisiniz ki, bütün bu müxtəlif sapların uzunluqlarını dəyişdirdik,
                00:06:29.00 döngə tərkibi,
                00: 06: 30.25 çox şeyi dəyişdi
                00: 06: 32.12 molekulun qablaşdırılmasını və kristalizasiyasını optimallaşdırır.
                00: 06: 37.10 Nəhayət, kristal keyfiyyətinin bu səviyyəsinə çatdıqda,
                00: 06: 43.03 quruluşunu rentgen kristalloqrafiyası ilə həll edə bildik.
                00: 06: 47.07 Və bu rəqəmi sizə göstərmək istəyirəm.
                Oceanobacillus intronun elektron sıxlığını göstərən 00: 06: 49.07,
                00: 06: 53.28 bunu sizə göstərməkdir,
                00: 06: 55.03 elektron sıxlığına ilk dəfə baxdığınız zaman,
                00:06:58.09 və ya kristalloqrafik təcrübənin nəticəsi,
                00: 07: 00.22 görünən gözəl heliksləri görə bilərsiniz
                00: 07: 04.06 və molekulun ümumi planını çox yaxşı görə bilərsiniz
                00:07:07.22 RNT vəziyyətində.
                00:07:09.07 Zülallarda onu görmək çox vaxt daha çətindir
                00:07:11.19 RNT-də olduğundan ikinci dərəcəli struktur xüsusiyyətləri.
                00: 07: 16.18 Deməli, bu, bu molekula ilk baxışımızı göstərirdi.
                00: 07: 21.14 Nəhayət bütün nükleotidləri bu xəritədə modelləşdirə bildikdə,
                00: 07: 26.08 əsasən bu intronun bütün quruluşunu həll edə bildik.
                00: 07: 32.00 Və yaraşıqsız şəkildə görürsən ki, bu, olduqca qloballaşmış bir forma.
                00: 07: 37.01 Bu sadə bir cüt sarmal deyil
                00:07:38.14 və bu, nizamsız bir sıra iplər deyil,
                00: 07: 40.26 çox yığcam bir kürə molekuludur,
                00:07:43.09 qlobular zülal haqqında düşündüyünüz qədər.
                00:07:46.03 Diqqətə layiq olan bir sıra memarlıq xüsusiyyətləri var
                00: 07: 49.10 və bir az sonra bunlara diqqət yetirəcəyəm.
                00: 07: 51.24 Ancaq görürsən ki, burada yuxarıda bir növ iskele var,
                00:07:56.13 və o, aktiv saytın daxil olduğu bir boşluq yaradır.
                00: 08: 00.26 Aktiv sayt bu qırmızı dupleksdir,
                00:08:03.26 və bu daha əvvəl sizinlə danışdığım Domain 5-dir.
                00:08:06.27 Çox, çox yüksək qorunan RNT
                Bir müddətdir tanıdığımız 00: 08: 09.06, ehtimal ki, aktiv saytdır.
                00:08:12.21 Və maraqlısı budur ki, burada ucları çıxaran bu sarmallar,
                00: 08: 18.16 bunlar tez -tez II qrup intronların kodlaya biləcəyi boşluqları ehtiva edir
                00:08:21.28 intron ardıcıllığının özündə daşınan zülallar üçün açıq oxu çərçivələri.
                00:08:27.00 Və maraqlıdır, çünki görə bilərsiniz ki, əgər bu RNT daha böyük olsaydı
                00: 08: 31.19 uzanacaq və mane olmayacaq
                00: 08: 34.04 buraya büküldüyü üçün ribozim aktiv saytı.
                00: 08: 42.17 Beləliklə, bu molekula diqqətlə baxaraq,
                00:08:44.23 biz çox şey öyrənə bildik,
                00: 08: 46.09 və sizə danışacağım ilk şey
                00: 08: 49.05, üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirlər haqqında bizə məlumat verdi
                00: 08: 52.08 və RNT -də üçüncül struktur xüsusiyyətlər.
                00: 08: 54.26 Bu molekulun ortaya qoyduğu bir çox yeni anlayış var idi
                00:08:57.11 və onların əksəriyyəti intron Domain 1 daxilində idi.
                00: 09: 01.20 Xatırladım ki, II qrup intronun ən çox 5'lik domenini dedim
                00:09:05.04 əvvəlcə qatlanır və o, avtonom şəkildə qatlanır
                00:09:07.16 xüsusi bir üçüncü struktura.
                00: 09: 10.14 II qrup intronun strukturunda,
                00:09:12.22 biz bunu burada görə bilərik.
                00:09:14.24 İntronun qalan hissəsi boz rəngə çevrildi
                00:09:17.04 Beləliklə, bütün bu rənglərdə Domain 1-ə diqqət yetirə bilərsiniz.
                00:09:22.11 Bu domen daxilində bir sıra çox maraqlı motivlər var
                00:09:24.11 və mən sizə onlardan bir neçəsini göstərəcəyəm.
                00:09:27.25 Məsələn, bunlardan ikisi mənim diqqət etməyi xoşlayıram burada göstərilir.
                00:09:32.09 Və strukturda harada olduqlarını göstərmək üçün,
                00: 09: 35.07 və bu bölgə burada ikincil quruluşda beş istiqamətli bir qovşaqdır,
                00: 09: 38.25, xəyal edə biləcəyiniz kimi,
                00: 09: 40.01 bütün bu helikopterlər üçün olduqca mürəkkəb bir memarlıq qəbul etməlidir
                00:09:44.03 düzgün istiqamətə işarə etmək və üçüncü qatın meydana gəlməsi üçün.
                00: 09: 48.02 Beləliklə, sizə üçölçülü məkanda bu beş tərəfli qovşağı göstərim.
                00:09:52.11 Buradakı quruluş budur.
                00:09:55.00 Bu, üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirlərin əlamətdar dəstidir
                00: 09: 57.16 və birləşdirilmiş motivlər.
                00:10:00.18 Ən çox sevdiyim, burada T-loop motivi adlanır,
                00:10:03.23 və gördüyünüz bu mavi dönüşdür
                00:10:07.09 strukturlarda tez-tez gördüyümüz motivi xatırladır,
                00:10:11.21 GNRA tetraloop adlanır,
                00: 10: 15.21 amma sanki içərisində bir deşik var:
                00:10:18.01 Bu mövqedə baza çatışmır
                00: 10: 20.07 və gələn bir adenozin ilə doludur
                00: 10: 23.00 molekulun bu boz hissəsindən.
                00: 10: 25.02 Beləliklə, bu RNT -nin çoxu eyni şəkildə bir yerdə saxlanılır
                00: 10: 28.16 köhnə bir masa qurulacaqdı,
                00: 10: 30.25 dirəklərin yivlərə oturması və bir yerdə tutulması ilə
                00: 10: 34.00 bütün iskele bu şəkildə,
                00: 10: 35.27 və əsasən baza yığma qarşılıqlı təsirləri ilə sabitləşdi.
                00: 10: 40.04 Və daha çox qorunan yığma qarşılıqlı əlaqələrini görə bilərsiniz
                00:10:43.14 və burada bu mövqedə formalaşan şəbəkələr.
                00: 10: 47.16 Mənim üçün molekulun başqa bir sevimli hissəsinə Z-çapa deyilir.
                00: 10: 52.01 Və ikincil quruluşda,
                00:10:54.08 bunun mexanizm olduğunu görə bilərik
                00:10:57.03 yaşıl sarmal əslində mükəmməl paralel olur
                00:11:02.09 narıncı sarmal ilə, burada, bu quruluşda gördüyünüz kimi.
                00: 11: 05.18 Deməli, bu iki heliks yan -yana olmalıdır.
                00: 11: 09.00 Bu necə işləyir?
                00: 11: 10.24 İçərisində olan iki döngə aşağıdakı şəkildə bir araya gəlir.
                00: 11: 14.25 Budur, narıncı sarmal, burada yaşıl sarmalın bir hissəsi,
                00: 11: 19.01 və portağal sarmalının əmələ gəlməsi ilə baş verənlər,
                00:11:22.09 Burada normal əsas cütlər olduğunuzu görürsünüz,
                00: 11: 25.20 və sonra bazalardan biri fırlanır
                00:11:27.29 və başqa bir narıncı iplə əsas cüt yaratmaq əvəzinə,
                00:11:31.06 yaşıl iplə əsas cüt təşkil edir.
                00: 11: 34.00 Növbəti qonşusu gəlib bir cütlük təşkil edir
                00: 11: 36.24 başqa bir narıncı iplə,
                00:11:38.14 və sonra növbəti baza yenidən fırlanır,
                00: 11: 41.14, bazlar və iki ip arasındakı əlaqələrin bu ziqzağını meydana gətirərək,
                00:11:46.02 bir tək ipdən daha çox.
                00:11:49.03 Beləliklə, bu üç telli quruluş həqiqətən maraqlı bir yoldur
                00: 11: 51.27 ki, RNT -lər mərkəzi ipin tanınmasını şaxələndirə bilər.
                00:11:59.09 Qoz-fındıq və boltlar üçün başqa bir konsepsiya
                RNA -nı bir araya gətirdiyinə görə ortaya çıxan 00: 12: 01.29
                00:12:04.08 və II Qrup intronu ilə nümunə göstərilmişdir
                00:12:09.11 riboza fermuar motividir.
                00: 12: 11.03 Bu ilk dəfə 1996 -cı ildə Cate və Doudna tərəfindən təsvir edilmişdir
                00: 12: 14.09 ilk yüksək qətnaməli kristalloqrafik quruluşlardan birində
                00: 12: 17.16 kompleks RNT molekuludur.
                00:12:20.16 Və göstərdikləri şey bu mühüm konsepsiyadır:
                00: 12: 24.11 riboz şəkərin 2'-OH qrupu çox yapışqandır
                00: 12: 27.07 və bifurcated hidrogen bağları yarada bilər
                00: 12: 29.28, RNT ipliklərini bir -birinə bağlaya bilir.
                00: 12: 32.23 Beləliklə, burada bir RNA ipiniz varsa,
                00:12:34.25 və burada bir RNT ipi,
                00: 12: 36.19 bir araya gələ bilərlər
                00:12:39.06 2'-OH qruplarının interdigitasiyası ilə.
                00:12:42.23 Qrup II intronun bir çox yerində gördüyümüz də məhz budur.
                00: 12: 47.05 Xüsusilə, burada yuxarıda,
                00:12:49.16 alfa-alfa adlı uzun məsafəli öpüşmə döngəsi qarşılıqlı əlaqəsi var,
                00:12:53.25 və mən sizə bu təsvirdə bu əsas cütləri burada göstərirəm,
                00:12:58.15 həmin qarşılıqlı əlaqənin sonunda,
                00:13:00.07 Burada gördüyünüz kimi RNT zəncirləri bir-birinə çox, çox yaxınlaşır.
                00:13:04.19 Və bunu etdikdə,
                00:13:05.21 fermuarlar və ribozlar və 2'-OH qrupları bu şəbəkəni təşkil edir
                00:13:11.20 bütün ansamblı bir-birinə yapışdırmağa xidmət edir.
                00: 13: 18.21 Beləliklə, üçüncü dərəcəli qarşılıqlı təsirlərdən bəhs etdik
                00: 13: 20.25 bu kompleks quruluş tərəfindən ortaya çıxdı.
                00: 13: 23.14 İndi sizinlə nə baş verdiyini danışmaq istəyirəm
                00:13:25.24 intronun aktiv saytında
                00: 13: 28.02 və kimyanı necə katalizasiya edir.
                00:13:30.29 Beləliklə, məni uzun müddət çaşdıran şeylərdən biri
                00:13:33.00 ikinci dərəcəli quruluşa baxanda
                00: 13: 36.13 və II qrup intronun mühafizəkar xüsusiyyətləri bunlar idi ki,
                00:13:39.11 Domen 5 çox yüksək qorunub saxlanılsa da,
                00:13:42.16 qəribə və yüksək səviyyədə qorunma var idi
                00:13:45.10 Domenlər 2 və 3 arasındakı bu qovşaqda.
                00:13:48.24 Və mən merak etdim, niyə o bir neçə nukleotid o qovşaqdadır
                00: 13: 52.16, Domain 5 kimi qorunur.
                00:13:55.15 Və cavab ortaya çıxan strukturdan gəldi
                00: 13: 57.01 eyni səviyyədə saxlanılmalarının səbəbi
                00: 13: 59.29 eyni struktur quruluşunun bir hissəsidir.
                00: 14: 03.12 O qovşağın daxil olduğunu görə bilərsiniz
                00: 14: 05.08 və o qırmızı sarmalın əsas yivində bağlanır.
                00: 14: 10.05 Yaxından baxanda belə görünür:
                00: 14: 12.09 gözəl üçlü sarmal əmələ gətirir,
                00: 14: 14.17 beləliklə bu qovşaq nukleotidləri daxil olur
                00: 14: 18.01 və əsas yiv kənarı ilə hidrogen bağları əmələ gətirir
                00:14:21.17 Domen 5-in aşağı gövdəsi
                00: 14: 24.05 və başqa biri Domain 5 -in başqa bir sektorundan formalaşır.
                00: 14: 30.04 Beləliklə, bu üçlü sarmal,
                00:14:32.28 bu mövqedə RNT onurğasında kəskin bükülmə ilə birlikdə,
                00:14:37.14 Qrup II intron nüvəsində çox güclü metal ion platforması yaradın.
                00:14:43.15 Bunun baş verməsinin səbəbi, burada təsəvvür edə bilməyinizdir,
                00: 14: 46.27 ki, bir araya gələn çoxlu fosfatlar var
                00: 14: 50.02 çox, çox kiçik bir məkanda,
                00: 14: 51.24 molekulun bu bölgəsindəki elektrostatik potensial
                00: 14: 55.02 həddindən artıq olur
                00: 14: 56.28 və çox əlverişli hala gəlir
                00:14:58.23 xüsusi nöqtələrdə metal ionlarının bağlanmasına.
                00: 15: 02.00 Və həqiqətən görürsən
                00:15:03.14 iki divalent kation bu mövqedə bağlanır
                00:15:06.17 tam 3.9 Angstrom ayrı.
                00: 15: 10.13 Və bu çox vaxt fermentlər üçün bir imzadır
                00: 15: 14.01 riboza və ya deoksiriboza bağlanma katalizatorudur
                00:15:18.14 iki metal ion mexanizmi vasitəsilə.
                00: 15: 23.12 Beləliklə, etdiyimiz iş və əlavə işlər sayəsində
                00:15:26.03 biz bildik ki, bu mövqelərdə 1 və 2 metallar
                00:15:30.01 həqiqətən birləşdirmək üçün lazım olan katalitik metal ionlarıdır,
                00: 15: 33.26, Joe Piccirilli kimyəvi biologiya təcrübələrindən əvvəlcədən söylədiyi kimi.
                00:15:37.29 Və onlar düz qayçı bağlantısının üzərində dayanırlar
                00: 15: 40.13, bu bağı bir hədəf substratına yapışdırın.
                00:15:45.10 Beləliklə, bu çox razı idi, çünki aydın idi
                00:15:47.07 bəzi mənalarda digər fermentlərə bənzər bir metalloenzimimiz var idi
                00: 15: 51.28 və yenə də bunun bütün hekayə olmadığını bilirdik.
                00: 15: 55.05 Və buna görədir ki, kristalloqrafik qətnamədə
                00: 15: 59.01 bu molekulu öyrənmək üçün istifadə edirdik,
                00:16:01.02 biz digər metal ionları ilə uyğun gələn əlavə elektron sıxlığını gördük.
                00: 16: 05.21 Ancaq məlumatlar öz mövqelərini birmənalı şəkildə şərh edəcək qədər yaxşı deyildi.
                00: 16: 09.22 Buna görə də daha çox çalışdıq,
                00: 16: 11.26 həlli artırmaq və anomal səpilmə istifadə etmək,
                00: 16: 14.15, metal ionlarının mövqeyini mismarlamaq üçün bir vasitədir.
                00:16:19.25 Xüsusilə, kristallarımızın ayırdetmə qabiliyyətini yaxşılaşdırdıqda,
                00: 16: 24.07 gördük ki, metal ionları var
                00:16:27.06 həm də bu mövqedə və bu mövqedə.
                00:16:30.18 Və ətrafdakı RNT-nin onlarla qarşılıqlı əlaqəsinə görə,
                00: 16: 34.03 Çox güman ki, bunlar kalium ionlarıdır.
                00:16:37.09 Beləliklə, bu bizim üçün təəccüblü idi,
                00:16:38.26 sadə monovalent kation görünə bilər
                00:16:41.10 aktiv saytda belə mühüm rol oynamaq.
                00:16:45.02 Bu barədə həqiqətən güclü bir bəyanat vermək üçün,
                00:16:46.26 biz onların mövqeyini birmənalı şəkildə müəyyən etməli olduq,
                00:16:49.21 və bu, onları ağır bir ionla əvəz etməklə edildi
                00:16:52.26 X-şüalarını son dərəcə yaxşı difraksiya edir
                00: 16: 56.20 və kalium üçün yaxşı bir təqliddir.
                00: 16: 58.28 Beləliklə, daha 14 kristal quruluşu həll etdik
                Bütün fərqli metal birləşmələrində 00: 17: 02.08.
                00:17:06.09 Xüsusilə, diqqətinizi bu şərtə çəkəcəyəm,
                00: 17: 09.01, kaliumun yerini tallium aldı
                00:17:12.18 və maqnezium eyni saxlanıldı.
                00:17:15.06 Və bu quruluşda,
                00: 17: 16.16 fərq xəritəsindən görə bilərsiniz
                00:17:18.16 tallium dəqiq mövqeləri tutur
                00:17:22.23 hipotez etdiyimiz şey kalium tərəfindən işğal edilmişdir.
                00:17:25.25 Və ion radiusu və funksiyasındakı oxşarlıqlarına görə
                00:17:29.23 və paralel rubidium məlumatları ilə oxşarlıq,
                00: 17: 32.23 eyni şeyi edir,
                00:17:34.16 biz kalium əldə etdiyimizə əmin olduq
                00: 17: 37.09 aktiv saytın əhəmiyyətli bir tərkib hissəsi olaraq.
                00: 17: 43.00 Beləliklə, bu xüsusi quruluş dəstində,
                00: 17: 46.00 pulsuz introna baxdıq,
                00: 17: 48.05 heç bir substrat bağlanmamış,
                00: 17: 50.06 ağlabatan yaxşı bir qətnamədə.
                00: 17: 52.09 Və bu vəziyyətdə aşağıdakı şəkli görə bildik:
                00: 17: 55.08 iki divalent metal ionunun olduğunu görə bildik
                00: 18: 00.16 (substrat olmadıqda su ilə əlaqələndirilir)
                00:18:01.14 və onlara çox, çox yaxın olan kaliumların olduğu aydın idi.
                00: 18: 05.18 Və yaxınlarını K1 və K2 adlandırdıq.
                00: 18: 09.12 Yaxın araşdırma nəticəsində məlum oldu ki, K1 demək olar ki, bir daş kimi görünür
                00:18:13.08 Metal 2 (M2) saytının formalaşması üçün.
                00:18:16.03 Beləliklə, kimya üçün mütləq tələb olunan bu katalitik metal ionu,
                00:18:19.20 liqandların təşkili ilə yerində saxlanılır
                00: 18: 22.25, bu kalium tərəfindən yerləşdirilmişdir.
                00: 18: 25.16 Və sonrakı quruluşlar göstərdi:
                00: 18: 27.03 bir anda sizə xəbər verəcəyim kimi,
                00: 18: 28.29 Bu saytı mutasiya yolu ilə qarışdırarsanız
                00: 18: 33.00 və ya yanlış ölçülü bir metal ionu ilə dəyişdirmə,
                00:18:35.14 Metal 2 bağlanmır və ribozimi öldürür.
                00: 18: 41.14 Deməli, bu bizə izah etmək üçün yalnız bir nəzarət təcrübəsi idi
                00:18:43.17 bütün bu qəribə, anormal səpilmə ionlarında,
                00:18:46.29 biz hələ də ribozim kimyası alırdıq, ya yox.
                00: 18: 50.26 Deməli bu normal şərtdir,
                00: 18: 52.23 burada intron parçasına və ekzonik parçalara yapışan bir prekursor RNT olduğunu görürsünüz.
                00: 18: 58.24 Və burada talliumda görə bilərsiniz.
                00:19:01.02 demək olar ki, daha xoşbəxtdir: siz intron və ekzonik komponentlərə gedən xəbəri görürsünüz,
                00: 19: 06.17 və hətta bir ara vəziyyət vasitəsilə,
                00: 19: 08.06, kalium qutusundan daha sürətli.
                00:19:10.18 Beləliklə, hətta tallium və maqneziumda belə,
                00: 19: 12.28 bu çox xoşbəxt bir fermentdir,
                00:19:14.21 belə ki, talliumun kalium yerlərini əvəz etməsi məntiqlidir.
                00:19:20.11 Beləliklə, indiyə qədər sizə göstərdiyim hər şey intronun məhsul vəziyyətində olmuşdur.
                00: 19: 25.27 Bu, bioloji cəhətdən əhəmiyyətli bir vəziyyətdir
                00: 19: 28.09 çünki bu sərbəst intron tərs birləşmə qabiliyyətinə malikdir
                00: 19: 32.16 oxşar ardıcıllığa malik RNT -lərə və hətta DNT -yə.
                00:19:36.14 Bunun əhəmiyyəti var,
                00:19:37.29 amma eyni zamanda çox maraqlı idim
                00:19:39.29 birləşmədə aktiv sahənin rolu,
                00:19:42.20 və mən birləşdirmənin ilk addımını vizuallaşdırmaq istədim.
                00: 19: 45.21 Birləşdirməyə baxmaq üçün 5 'eksonunuz olmalıdır
                00: 19: 48.04, intronun ilk sahəsinə bağlıdır.
                00: 19: 51.19 Beləliklə, bu tikinti idi
                00: 19: 52.24, əvvəllər sizə dediyim məlumat üçün istifadə edildi,
                00:19:56.29 yenisini yaratmalı olduq
                00: 19: 58.13 və tamamilə yeni bir quruluş ansamblı həll edin
                00: 20: 01.25, 5 'exon əlavə olunur.
                00: 20: 03.18 Və biz bunu etdik.
                00: 20: 06.07 Həm də bütün bu qeyri -adi metal ionlarının iştirakı ilə.
                00:20:09.28 Və aşağıdakı maraqlı şeyi görürsünüz
                00:20:11.29 5' ekson əlavə edildikdə:
                00: 20: 14.20, kimya baş verəcəyi yerdəki əlaqəni görə bilərsiniz.
                00: 20: 17.20, katalitik maqnezium ionlarının üzərinə qoyulur
                00: 20: 21.18 və kəsilmiş fosfatın hazır vəziyyətdə olduğunu görə bilərsiniz
                00: 20: 23.13 nükleofilik su ilə hücum ediləcək,
                00: 20: 25.29 da müşahidə edə bildik.
                00:20:28.24 Və iki kalium görə bilərsiniz
                00:20:30.13 aktiv saytı dəstəkləməkdə mühüm rol oynayır.
                00: 20: 33.24 Bu quruluşu kalsiumun iştirakı ilə əldə etdik
                00: 20: 36.22 və bu xüsusi vəziyyətdə fosfat parçalanmamışdır.
                00:20:40.03 Ancaq maqnezium əlavə etdiyiniz zaman,
                00:20:42.12 dekolte görürsünüz
                00: 20: 43.25 və parçalanmış fosfatın köç etdiyini görürsünüz
                00: 20: 46.05 bu mövqedən kalium 2 -yə keçir.
                00: 20: 49.27 Beləliklə, bu, kalium 2 -nin mexanizmdə əsas rol oynadığını söyləyir:
                00: 20: 53.26 sabitləşmə üçün vacibdir
                00: 20: 55.18 ilk addım reaksiyasının məhsuludur.
                00: 20: 58.12 Beləliklə, hər bir metal ionu bütün prosesdə mühüm rol oynayır.
                00: 21: 06.05 Beləliklə, mən sizə K1 və K2 haqqında yeni dedim.
                00:21:07.29 M1 və M2,
                00:21:09.09 amma bunun səni düşündürməsinə imkan verməyin
                00: 21: 11.18 ki, bunlar strukturdakı yeganə vacib metallardır.
                00: 21: 14.13 Bunlar kimya üçün çox vacib olanlardır.
                00:21:16.21 lakin metal ionlarının tutulması ilə bağlı gördüyümüz əlavə işlər
                00: 21: 20.22 bütün bu RNT bizə çoxlu metal ionlarının olduğunu göstərir
                00:21:24.29 Bu RNT-də yüksək doluluq var
                00: 21: 27.24 və müxtəlif üçüncü quruluş motivlərini dəstəkləyir.
                00: 21: 31.28 Metal ionları RNT molekullarının təşkilində mühüm rol oynayır
                00:21:36.28 və buna görə də biz bunları da araşdırmağa davam edirik.
                00: 21: 43.12 Bəs indiyə qədər nə öyrəndik?
                00:21:46.05 İntron bizə kimyəvi səviyyədə pre-mRNT birləşmə mexanizmi haqqında öyrətdi,
                00: 21: 50.07, eyni zamanda RNT ilə əlaqəli bəzi yeni fikirlər ortaya çıxardı.
                00: 21: 54.18 Bizə aşağıdakı anlayışlar göstərilir:
                00: 21: 57.03 ki, ribozim kimyası üçün yalnız iki valentli ionlar vacib deyil,
                00: 22: 01.19 monovalent ionlar da rol oynaya bilər.
                00:22:04.13 və kalium həm quruluşda, həm də katalizdə xüsusilə vacibdir.
                00:22:09.29 II qrup intron birləşməsi zamanı,
                00: 22: 11.14 kalium 1 və 2 -nin hər birinin rol oynadığını görürük
                00:22:14.24 vacib olan mexanizmdə.
                00:22:16.26 Bu o deməkdir ki, II qrup intronlar,
                00: 22: 18.00 və bəlkə də digər ribozimlər,
                00: 22: 19.22 sadə iki metal ionu fermenti deyil.
                00:22:23.00 Əslində, protein fermentləri kimi,
                00:22:24.18 onlar metal klasterlərdən istifadə edə bilərlər,
                00:22:26.26 zülal dünyasında çox, çox yayılmış bir nümunədir.
                00:22:30.23 Beləliklə, müxtəlif növ ionlardan ibarət heteronuklear metal klasterləri,
                00: 22: 34.13 vacib bir mövzu ola bilər.
                00:22:37.19 Və bu da bizi ona gətirir ki, üst-üstə düşəndə
                00: 22: 40.01 zülal fermentləri olan II qrup intronun aktiv yeri,
                00: 22: 43.07 vacib paralelləri görə bilərsiniz
                00: 22: 44.13 kimya etdikləri şəkildə.
                00: 22: 49.13 Beləliklə, indi sizə bir az danışacağam
                00:22:51.11 Bu quruluşun natrium formasından öyrəndiklərimiz,
                00:22:54.23, çünki o, bizə ilk dəfə bir var olduğunu ortaya qoydu
                00: 22: 57.26 II qrup intron aktiv sahəsindəki alternativ uyğunluq.
                00:23:01.14 Bunu necə şərh etdiyimizi sizə deyəcəyəm.
                00: 23: 05.00 Beləliklə, uzun müddətdir bilirik ki, təsadüfən tamponlarınızı düzəltmisinizsə,
                00: 23: 08.18 və ya iştirak edən bir reaksiyaya hər hansı bir natrium əlavə edin
                00:23:11.22 işlədiyimiz II Qrup intronlarından hər hansı biri,
                00: 23: 14.05 heç bir reaksiya kimyası görmürsən.
                00: 23: 15.24 Heç bir birləşmə görmürsünüz.
                00:23:17.17 Beləliklə, bu məntiqlidir, çünki natrium kalium ilə eyni ion radiusuna malik deyil
                00: 23: 21.16 və kalium sahələrinə sığmır.
                00:23:24.12 Və əminik ki, intronun natrium formasının olduğunu görürük.
                00:23:27.11 alternativ aktiv sayt uyğunluğunu qəbul edir.
                00: 23: 32.14 Konformasiyalı keçid kimi görünən şeyi görürük
                00: 23: 35.01 iki təməlin fırlanmasını ehtiva edən iki birləşmə mərhələsi arasında,
                00: 23: 39.11 biri burada, biri burada.
                00:23:42.14 Gördüyümüz odur ki, intronun əvvəlki formasında,
                00:23:44.24 Burada bu əsas yiv üçlüyü var
                00:23:47.29 və RNT onurğasında sıx dönüşünüz var,
                00:23:50.20 və natrium şəklində, bu əsaslardan ikisi çevrilmişdir.
                00: 23: 54.22 Bir halda 70 dərəcə
                00: 23: 56.05 və bir halda katalitik guanozin molekullarından biri
                00: 23: 59.21 bu mövqedən bura qədər hərəkət edir.
                00: 24: 02.17 indi tamamilə fərqli bir sahə ilə əlaqə qurur: Alan 3.
                00:24:06.26 Bu cür memarlıq yenidən təşkili baş verdikdə,
                00: 24: 10.02 Aktiv sahədəki metal ionları əslində tərk edir
                00: 24: 13.02 və aktiv saytda böyük bir açıq çuxur yaradır.
                00: 24: 17.02 Bu əslində lazımdır
                00: 24: 18.08, çünki birləşmə addımları arasında
                00:24:21.02 İlk addım üçün reaktivlər yoldan çıxmalıdırlar
                00:24:23.24 və ikinci addım üçün reaktivlər daxil olmalıdır.
                00: 24: 26.10 Beləliklə, bunun ola biləcəyini fərz etdik
                00: 24: 29.10 addımlar arasında baş verməli olan yenidən tənzimləmə
                00: 24: 32.03, lazım olan dəyişiklikləri edə bilərsiniz
                00: 24: 34.04, birləşmənin ikinci mərhələsini stimullaşdırmaq və prosesi başa çatdırmaq üçün.
                00: 24: 38.15 Beləliklə, təsəvvür edirsinizsə ki, II qrupun intron birləşməsi
                00:24:40.29 daha əvvəl izah etdiyim kimi, bu iki addımla yer alır,
                00:24:44.11 yaxından bu aşağıdakı şəkildə baş verə bilər.
                00: 24: 47.14 Bilirik ki, əvvəllər aktiv saytın tənzimlənməsi
                00: 24: 51.00 və birləşmənin ilk addımından dərhal sonra,
                00:24:52.29 belə görünür,
                00:24:54.11 iki katalitik metal ionları və dəstəkləyici kaliumlar ilə.
                00: 24: 58.19 Və hipotez etdik ki, bir ara
                00: 25: 01.05 iki dövlət arasında iki əsasın fırlanmasını nəzərdə tutur.
                00: 25: 06.18 Bundan sonra baş verir və birləşmənin ikinci addımı qurulur,
                00: 25: 09.22 aktiv saytın islahatını alırsınız
                00: 25: 13.05 və metal ionları və başlanğıc vəziyyətinə qayıdın.
                00: 25: 20.16 Beləliklə, aktiv saytın təşkili haqqında düşünsək
                İlk birləşmə addımı üçün 00: 25: 24.22,
                00:25:26.08 yəni kimya üçün səlahiyyətli sayt,
                00:25:30.10 biz bu məlumatı götürə bildik
                00: 25: 33.12 və birləşmənin təkamülü haqqında çox şey öyrənin
                00: 25: 37.18 eukaryotlarda.
                00:25:40.03 Bunun səbəbi Qrup II intron quruluşudur
                00: 25: 43.02, memarlığın necə olduğunu düşünmək üçün bir növ yol xəritəsi kimi xidmət etdi
                00:25:46.16 eukaryotik spliceosom təşkil edilə bilər.
                00: 25: 50.21 Və bunu düşünməyimin səbəbi aşağıdakılardır.
                00:25:53.14 Domain 5, bütün aktiv sayt elementlərini ehtiva edən bu yüksək qorunan motiv,
                00: 25: 58.10 burada ikinci dərəcəli bir quruluşda göstərilmişdir.
                00:26:01.16 Və bunlar nöqtəli xətlərdə,
                00: 26: 03.11, kristal quruluşumuzla ortaya çıxan üçüncü qarşılıqlı təsirləri göstərdi.
                00: 26: 08.01 Və bilirik ki, həqiqətən qorunmuş RNT molekullarından biridir
                00: 26: 12.05 spliceosomunuzda,
                00: 26: 13.13 U6 kiçik nüvə RNT adlanır,
                00:26:16.00, II qrup intronlarda həmişə Domain 5-i xatırladan ikinci dərəcəli bir quruluşa malikdir,
                00:26:22.05 və uzun illər insanlar aralarında oxşarlığın olduğunu fərz edirdilər.
                00: 26: 25.11 Hətta oxşar yerlərdə iki metal ionu bağladılar.
                00:26:29.11 Ancaq həll etdiyimiz struktur
                00:26:31.17 U6-nın bir hissəsini təklif etdi
                00: 26: 33.19 eyni molekulyar qarşılıqlı təsir göstərə bilər
                00: 26: 36.03 II qrup intronda müşahidə etdik.
                00:26:39.14 Və Joe Piccirilli laboratoriyalarının son işi
                00:26:42.18 və John Stahley Çikaqo Universitetində,
                00:26:45.08 spliceosomal RNT istifadə edərək,
                00:26:48.02 həqiqətən spliceosomal aktiv sahənin olduğunu göstərdi
                00: 26: 50.26 II qrupa çox oxşayır.
                00:26:53.24 Və əslində, spliceosomun M1 və M2
                00: 26: 57.02 eyni şəkildə yerləşdirilir,
                00: 26: 58.28 və proqnozlaşdırılan əsaslara görə,
                00: 27: 00.12 II qrup intronda müşahidə olunduğu kimi.
                00: 27: 03.08 Beləliklə, bu həyəcan vericidir, çünki o deməkdir ki,
                00:27:05.19 çoxdan proqnozlaşdırıldığı kimi,
                00:27:07.29 Qrup II intronlar və spliceosom
                00: 27: 09.20 ortaq bir təkamül əcdadını paylaşa bilər.
                00:27:15.04 Beləliklə, yekunlaşdırmaq üçün,
                00: 27: 17.28 Oceanobacillus II qrup intronlarının tədqiqi yolu ilə,
                00: 27: 20.17, bir RNA bağlama maşınının quruluşunu və aktiv yerini görüntülədik,
                00:27:24.21 Qrup II nüvəsindəki metal ionlarını təyin etdik,
                00: 27: 27.21 həm monovalentlər, həm də iki valentlər üçün vacib rollar tapmaq
                00: 27: 30.18 quruluş və kimya.
                00:27:32.24 Bu ribozim yeni metal ion klasterindən istifadə edir,
                00: 27: 35.25, yəni RNT kimyasının protein kimyasından o qədər də fərqlənmədiyi mənasını verir.
                00:27:40.02 Metal klaster substrat olmadan da toxunulmazdır,
                00:27:42.21 demək olar ki, bu fermentin dişləri var deməkdir
                00: 27: 45.08 bunun mənası var, çünki II qrup intronlar DNT -yə hücum edə bilən retroelementlərdir.
                00: 27: 51.04 Və inanırıq ki, struktur dəyişikliyi gördük
                00: 27: 53.06 iki qatlama mərhələsi arasında
                00:27:55.02 və biz onun xüsusiyyətlərini xarakterizə etməyə başlaya bilərik.
                00:27:58.25 Və başqalarının işinə görə,
                00:28:00.11 indi aydın oldu ki, II qrup intronlar və spliceosom
                00:28:03.03 demək olar ki, eyni aktiv sayta malikdir.
                00: 28: 06.15 Beləliklə, II qrup quruluşu həqiqətən faydalı oldu
                00: 28: 07.27 çünki bizə kimya, quruluş və təkamül haqqında öyrədir.
                00: 28: 12.29 Beləliklə, bu işlərin hamısı üç çox istedadlı adam tərəfindən edildi:
                00: 28: 16.19 Nav Toor,
                00:28:17.29 Marco Marcia,
                00: 28: 19.09 və Kevin Keating,
                00: 28: 20.11 Raj Rajashankarın böyük köməyi ilə
                00: 28: 22.12 və Olga Fedorova.
                00: 28: 23.09 Və bu insanlara zəhmətlərinə və fədakarlıqlarına görə çox borcluyam.
                00:28:26.26 Bu təqdimatı dinlədiyiniz üçün çox sağ olun.


                Lehninger Principles Of Biochemistry Haqqında 7-ci Nəşr Pdf

                Lehninger Biokimya Prinsipləri Pdf 7 -ci nəşr Pdf Pulsuz Yükləmə, ilk nəşrindən bəri bir sinif sevimlisidir. Tez -tez öyrənilməyən bir intizama aydınlıq və uyğunluq gətirən biokimyaya klassik bir girişdir, sahə və#8217 -lərin klassik nüvəsi, hər zaman bu sahədə əldə edilən nailiyyətləri şagirdlərə çatmaq üçün heyranedici bir qabiliyyətlə birləşdirərək təzə hazırlanmışdır.

                Lehninger Principles Of Biochemistry 7th Edition Pdf, biokimya kursunun tədrisində əsas problemlərin həllində müəllimləri dəstəkləyən yenilənmiş pedaqogikanı təqdim edir.

                BİYOKİMYA Lehninger Prinsipləri Pdf 7 -ci Nəşr Pdf Pulsuz Yükləmə Biokimya elmində böyük irəliləyişlərin daxil edilməsi Biokimyanın lehninger prinsiplərinin 6 -cı nəşri pdf kitabının hər bölməsi biokimyanın ən vacib irəliləyişlərini daxil etmək üçün hərtərəfli yeniləndi, məsələn: * Amiloidin yeni müzakirəsi zülal qatlanması kontekstində xəstəliklər

                (Fəsil 4) * Membran əyriliyi və ona təsir edən zülallar, amfitropik zülallar və həlqəvi lipidlər haqqında yeni material daxil etmək üçün lipid salları və caveolalar haqqında genişləndirilmiş və yenilənmiş bölmə

                (Fəsil 11) * Yeni Qutu 24-2, Epigenetika, Nukleosomların Strukturu və Histon Variantları irsiyyətdə epigenetik məlumatın ötürülməsində histon modifikasiyası və nukleosom çökməsinin rolunu təsvir edir. məlumat əldə etmək üçün istifadə olunan üsullar haqqında yenilənmiş məlumatlar, məsələn: * Oligosakkarid quruluşunun təyin edilməsində MALDI-MS istifadə

                (Böl. 7) * Protein analizi və təmizlənməsi üçün etiketlərdən istifadə (Böl. 9) TIBBİ MÜALİFƏ NÜMUNƏLƏRİ Tibbi maraq göstərən materialı ifadə etmək üçün bir simvol istifadə olunur. Biokimyanın tibb və ümumiyyətlə sağlamlıq problemləri ilə əlaqəli bir çox yeni nümunələr daxil edilmişdir. Müəlliflərin məqsədi tələbələrin biokimyanı öyrənmək və onun həyat və planetlə əlaqəsini anlamaqdır. XÜSUSİ MÖVZU: OBİZLİK VƏ DİYABETLƏR İLƏ METABOLİZMİ ANLAMAQ Obezite və onun tibbi nəticələri-ürək-damar xəstəlikləri və şəkərli diabet sənayeləşmiş dünyada sürətlə epidemiya halına gəlir və bu nəşr kitab boyu piylənmə ilə sağlamlıq arasındakı biokimyəvi əlaqələrə dair yeni materialları ehtiva edir. Şəkərli diabet mövzusu, maddələr mübadiləsi və nəzarəti ilə bağlı bütün fəsillər boyunca inteqrasiya edən bir mövzu təmin edir.

                YENİ PROBLEM HƏLL EDƏN ARAÇLAR * Yeni mətndə işlənmiş nümunələr, şagirdlərin kəmiyyət problemi həll etmə bacarıqlarını inkişaf etdirməsinə kömək edir və onları ən çətin tənliklərdən keçir. * 100-dən çox yeni fəsil sonu problemi, şagirdlərə öyrəndiklərini tətbiq etmək üçün əlavə imkanlar verir.

                * Yeni Məlumat Analizi Problemləri (hər fəslin sonunda bir dəfə) şagirdləri öyrəndiklərini sintez etməyə və biliklərini ədəbiyyatdan alınan məlumatların təfsirinə tətbiq etməyə təşviq edir. ORGANİK KİMYA TEMELLERİNE DİQQƏT Bu, tələbələrə Üzvi Kimya modulunda öyrəndiklərini çəkərək biokimyanı anlamağa kömək edir.

                * Yeni Bölmə 13.2, Kimyəvi Məntiq və Ümumi Biyokimyəvi Reaksiyalar, bütün metabolik reaksiyaların əsasını təşkil edən ümumi biokimyəvi reaksiya növlərindən bəhs edir. * Kimyəvi məntiq mərkəzi metabolik yolların müzakirələrində gücləndirilir.

                * Mexanizm rəqəmləri tələbələrə reaksiya prosesini başa düşməyə kömək etmək üçün addım-addım təsvirlərə malikdir.

                * Reaksiya mexanizmlərinin təqdimatında, kitabda rast gəlinən ilk ferment mexanizmi ilə ətraflı şəkildə izah edilən və izah edilən bir sıra konvensiyalardan istifadə edilir. * Yeni problemlərin bəziləri kimyəvi mexanizmlərə yönəlir və mexanik mövzuları gücləndirir. ƏSAS KONVENSİYƏLƏR AÇIQ EDİLDİ Hər bir biokimyəvi mövzunun və biokimyəvi ədəbiyyatın başa düşülməsi üçün zəruri olan bir çox konvensiyalar mətndən ayrılıb və vurğulanır. Bu Açar Konvensiyalar, şagirdlərin tez-tez söylənmədən mənimsəmələri gözlənilən bir çox fərziyyə və konvensiyaların açıq ifadələrini ehtiva edir (məsələn, peptid ardıcıllığı amino-karboksiterminal ucuna, soldan sağa nukleotid ardıcıllığı 5 ′-dən 3 &# 8217end, soldan sağa). Bu kitab, animasiya ferment mexanizmləri və biokimyəvi üsullar, interaktiv sınaqlar, molekulyar quruluş dərsləri və interaktiv sınavlar da daxil olmaqla anlayışa və öyrənməyə kömək edəcək bir çox öyrənmə vasitəsi təqdim edən bir yoldaş veb saytı (www.whfreeman.com/lehninger5e) tərəfindən dəstəklənir.


                Lehninger Biokimya Prinsipləri Haqqında 7 -ci Nəşr Pdf Yüklə

                Aydın yazı və illüstrasiyalar… Çətin anlayışların aydın izahları… Biokimyanın yollarının aydın şəkildə izahı hazırda başa düşülür və tətbiq olunur. 35 ildən çoxdur ki, ən çox satılan nəşrdən sonra nəşr olunan Lehninger Principles Of Biochemistry 7th Edition Pdf Download, bu müəyyən edən prinsipləri praktiki olaraq tətbiq edərək, şagirdləri biyokimyanın əsaslarını tutarlı bir şəkildə tanıtmağa yönəltdi.

                Bu lehninger biokimya nəşri ilə tələbələr yüksək ötürücülü DNT ardıcıllığı, rentgen kristalloqrafiyası, genlərin manipulyasiyası və gen ifadəsi və digər üsullardan yaranan yeni məlumatlarla qarşılaşacaqlar. Əlavə olaraq, biokimya lehninger istifadə edən tələbələr, müasir biokimyanın yollar arasındakı qarşılıqlı təsirlərə diqqət yetirmək üçün təkcə metabolik yolları araşdırmaqdan necə uzaqlaşdığını görəcəklər. Onlar həmçinin biokimyanın insan xəstəliklərinin (xüsusən də şəkərli diabet) öyrənilməsi ilə əlaqəsi və təkamül nəzəriyyəsinin biokimyəvi tədqiqatdakı əhəmiyyətli rolu haqqında yenilənmiş anlayış əldə edəcəklər.

                Biokimya lehninger prinsiplərinin yeni nəşri bu əlamətdar mətni yeni bir dövrə gətirir. Sələfləri kimi, Lehninger Principles Of Biochemistry 7th Edition Free Download, çoxlu sayda yeni tapıntıları özündə cəmləşdirən mövcud elm və davamlı konsepsiyalarla diqqətli bir tarazlıq qurur, ancaq biokimyanın əsas prinsiplərini izah etməyə kömək edənlər.

                Bu geniş məzmun dəyişiklikləri, eləcə də yeni incəsənət və güclü yeni öyrənmə texnologiyaları Lehninger Principles of Biochemistry pdf-nin bu nəşrini indiyədək ən təsir edici edir.


                Mücərrəd

                Böyümənin dayandırılması-spesifik 2 (GAS2) zülal ailəsinin üzvləri ehtimal olunan aktin bağlayan (CH) domenindən və mikrotubul bağlayan (GAR) domenindən ibarətdir və spektraplakinlərin miniversiyaları hesab olunur. GAS2 ailəsində dörd üzv var, yəni. GAS2, GAS2L1, GAS2L2 və GAS2L3. GAS2 böyüməyi dayandıran spesifik zülallar ailəsi kimi müəyyən edilsə də, müxtəlif GAS2 ailə üzvləri arasında ifadə nümunələrində, qarşılıqlı təsir xüsusiyyətlərində və bioloji məsələlərdə və ya xəstəliklərdə əhəmiyyətli fərqlər bu günə qədər sistemli şəkildə nəzərdən keçirilməmişdir. Bu səbəbdən, GAS2 ailə üzvlərinin strukturları və funksiyaları ilə bağlı mövcud sübutları ümumiləşdirdik.Bu araşdırma, GAS2 ailə üzvlərinin sitoskeletonun yenidən qurulması, hüceyrə dövrü, apoptoz və xərçəng inkişafı da daxil olmaqla bir çox bioloji proseslərə cəlb olunmasının hərtərəfli molekulyar anlaşılmasını asanlaşdırır.


                İçindəkilər

                Ökaryotik hüceyrə dövrü dörd fərqli mərhələdən ibarətdir: G.1 faza, S fazası (sintez), G.2 faza (birlikdə interfaza kimi tanınır) və M fazası (mitoz və sitokinez). M fazasının özü iki sıx əlaqəli prosesdən ibarətdir: hüceyrə nüvəsinin bölündüyü mitoz və hüceyrənin sitoplazmasının bölünərək iki qız hüceyrəsi meydana gətirdiyi sitokinez. Hər mərhələnin aktivləşdirilməsi əvvəlki mərhələnin düzgün gedişindən və tamamlanmasından asılıdır. Bölünməni müvəqqəti və ya geri dönən şəkildə dayandırmış hüceyrələrin G adlanan sakitlik vəziyyətinə girdiyi deyilir.0 faza.

                dövlət Faza Qısaltma Təsvir
                İstirahət Boşluq 0 G0 Hüceyrənin dövrü tərk etdiyi və bölünməsini dayandırdığı bir mərhələ.
                İnterfaza Boşluq 1 G1 Boşluq 1-də hüceyrələr ölçüdə artır G1 keçid məntəqəsi nəzarət mexanizmi hər şeyin DNT sintezi üçün hazır olmasını təmin edir.
                Sintez S Bu mərhələdə DNT replikasiyası baş verir.
                Boşluq 2 G2 DNT sintezi ilə mitoz arasındakı boşluq zamanı hüceyrə böyüməyə davam edəcək. The G2 keçid məntəqəsi nəzarət mexanizmi hər şeyin M (mitoz) fazasına və bölünməyə hazır olmasını təmin edir.
                Hüceyrə bölünməsi Mitoz M Hüceyrə böyüməsi bu mərhələdə dayanır və hüceyrə enerjisi nizamlı olaraq iki qızı hüceyrəyə bölünməyə yönəlib. Mitozun ortasında bir nəzarət nöqtəsi (Metafaza nəzarət nöqtəsi) hüceyrənin hüceyrə bölünməsini tamamlamağa hazır olmasını təmin edir.

                Hüceyrə bölünməsindən sonra, qızı hüceyrələrin hər biri yeni bir dövrün interfazasına başlayır. İnterfazanın müxtəlif mərhələləri adətən morfoloji cəhətdən fərqlənməsə də, hüceyrə dövrünün hər bir fazası hüceyrəni hüceyrə bölünməsinin başlanmasına hazırlayan xüsusi biokimyəvi proseslərin ayrı dəstinə malikdir.

                G0 mərhələ (sakitlik) Redaktə edin

                G0 hüceyrənin dövrü tərk etdiyi və bölünməsini dayandırdığı bir istirahət mərhələsidir. Hüceyrə dövrü bu mərhələdən başlayır. Çoxhüceyrəli eukaryotlarda proliferativ olmayan (bölünməyən) hüceyrələr ümumiyyətlə sakit G-yə daxil olurlar.0 dövlətdən G.1 və uzun müddət, bəlkə də sonsuza qədər sakit qala bilər (tez -tez neyronlarda olduğu kimi). Bu, tamamilə fərqlənmiş hüceyrələr üçün çox yaygındır. Bəzi hüceyrələr G-yə daxil olur0 faza yarı daimidir və post-mitotik hesab olunur, məsələn, bəzi qaraciyər, böyrək və mədə hüceyrələri. Bir çox hüceyrə G -yə girmir0 və orqanizmin ömrü boyu bölünməyə davam edir, məsələn, epiteliya hüceyrələri.

                "Post-mitotik" sözü bəzən həm sakit, həm də qocalmış hüceyrələrə aiddir. Hüceyrə qocalması DNT zədələnməsinə və xarici stresə cavab olaraq baş verir və ümumiyyətlə G -də bir həbs meydana gətirir1. Hüceyrə qocalması hüceyrənin nəslini cansız edə bilər, bu, çox vaxt belə zədələnmiş hüceyrənin apoptozla özünü məhv etməsinə biokimyəvi alternativdir.

                Interfaza Düzəlişi

                İnterfaza yeni əmələ gələn hüceyrə və onun nüvəsində yenidən bölünmə qabiliyyətinə çatmazdan əvvəl baş verən bir sıra dəyişikliklərdir. Buna hazırlıq mərhələsi və ya intermitoz da deyilir. Tipik olaraq, interfaza hüceyrə dövrü üçün tələb olunan ümumi vaxtın ən azı 91% -i üçün davam edir.

                İnterfaza üç mərhələdə davam edir, G1, S və G2sonra mitoz və sitokinez dövrü. Hüceyrənin nüvə DNT məzmunu S fazasında təkrarlanır.

                G1 faza (Birinci böyümə fazası və ya Post mitotik boşluq fazası) Düzəliş edin

                Əvvəlki M fazının sonundan DNT sintezinin başlanğıcına qədər, interfaza içərisində olan ilk faza G deyilir1 (G göstərir boşluq). Buna böyümə mərhələsi də deyilir. Bu fazada M fazasında xeyli yavaşlayan hüceyrənin biosintetik fəaliyyəti yüksək sürətlə bərpa olunur. G -nin müddəti1 eyni növün müxtəlif hüceyrələri arasında belə çox dəyişkəndir. [3] Bu mərhələdə hüceyrə zülal tədarükünü artırır, orqanoidlərin (mitoxondriya, ribosomlar kimi) sayını artırır və ölçüləri böyüyür. G -də1 fazada hüceyrənin üç variantı var.

                • Hüceyrə dövrünə davam etmək və S fazasına girmək üçün
                • Hüceyrə dövrünü dayandırın və G daxil edin0 fərqləndirmə mərhələsi.
                • G -də həbs olun1 faza görə G -yə girə bilər0 faza və ya hüceyrə dövrünə yenidən daxil olun.

                Qərar verən nöqtəyə yoxlama nöqtəsi (məhdudiyyət nöqtəsi) deyilir. Bu yoxlama nöqtəsi məhdudlaşdırma nöqtəsi və ya START adlanır və G tərəfindən tənzimlənir1G -dən keçməyə səbəb olan /S siklinləri1 S fazasına. G-dən keçid1 yoxlama nöqtəsi hüceyrəni bölünməyə məcbur edir.

                S fazası (DNT replikasiyası) Redaktə edin

                Sonrakı S fazası DNT sintezi başa çatdıqda, bütün xromosomlar replikasiya edildikdə, yəni hər bir xromosom iki bacı xromatiddən ibarət olduqda başlayır. Beləliklə, bu fazada hüceyrədəki DNT-nin miqdarı ikiqat artmışdır, baxmayaraq ki, ploid və xromosomların sayı dəyişməmişdir. Bu mərhələdə RNT transkripsiyası və zülal sintezi dərəcələri çox aşağıdır. Bunun istisnası, əksəriyyəti S fazasında baş verən histon istehsaldır. [4] [5] [6]

                G2 mərhələ (artım) Redaktə edin

                G2 faza DNT replikasiyasından sonra baş verir və hüceyrəni mitoza hazırlamaq üçün protein sintezi və sürətli hüceyrə böyüməsi dövrüdür. Bu mərhələdə mikrotubullar bir mil (preprofaza) yaratmaq üçün yenidən təşkil olunmağa başlayır. Mitoz fazaya keçməzdən əvvəl hüceyrələr G-də yoxlanılmalıdır2 xromosomlardakı hər hansı bir DNT zədəsi üçün nəzarət nöqtəsi. G2 nəzarət nöqtəsi əsasən şiş zülalı p53 tərəfindən tənzimlənir. DNT zədələnərsə, p53 ya DNT -ni təmir edər, ya da hüceyrənin apoptozunu tetikler. Əgər p53 funksional deyilsə və ya mutasiyaya uğrayırsa, zədələnmiş DNT olan hüceyrələr hüceyrə dövrü boyunca davam edə bilər və xərçəng inkişafına səbəb olur.

                Mitotik faza (xromosomların ayrılması) Redaktə edin

                Nisbətən qısa M mərhələsi nüvə bölünməsindən (karyokinez) ibarətdir. Hüceyrə dövrünün nisbətən qısa bir dövrüdür. M fazası mürəkkəbdir və yüksək səviyyədə tənzimlənir. Hadisələrin ardıcıllığı bir fəaliyyət qrupunun tamamlanmasına və digərinin başlamasına uyğun olaraq mərhələlərə bölünür. Bu mərhələlər ardıcıl olaraq belə tanınır:

                Mitoz bir eukaryotik hüceyrənin hüceyrə nüvəsindəki xromosomları iki nüvədə iki eyni dəstəyə ayırması prosesidir. [7] Mitoz prosesi zamanı cüt xromosomlar kondensasiya olunur və bacı xromatidləri hüceyrənin əks tərəflərinə çəkən mikrotubullara yapışırlar. [8]

                Mitoz yalnız eukaryotik hüceyrələrdə baş verir, lakin müxtəlif növlərdə fərqli şəkildə baş verir. Məsələn, heyvan hüceyrələri "açıq" mitoz keçir, burada nüvə zərfləri xromosomlar ayrılmadan əvvəl parçalanır, göbələklər isə məsələn Aspergillus nidulansSaccharomyces cerevisiae (maya) xromosomların bütöv bir hüceyrə nüvəsində bölündüyü "qapalı" bir mitozdan keçir. [9]

                Sitokinez fazası (bütün hüceyrə komponentlərinin ayrılması) Redaktə edin

                Mitozdan dərhal sonra nüvələri, sitoplazmanı, orqanelləri və hüceyrə membranını bu hüceyrə komponentlərinin təxminən bərabər paylarını ehtiva edən iki hüceyrəyə bölən sitokinez gedir. Mitoz və sitokinez birlikdə ana hüceyrənin genetik olaraq bir -biri ilə və ana hüceyrəsi ilə eyni olan iki qızı hüceyrəyə bölünməsini təyin edir. Bu hüceyrə dövrünün təxminən 10% -ni təşkil edir.

                Sitokinez adətən mitozla birlikdə baş verdiyi üçün "mitoz" çox vaxt "M fazası" ilə əvəz olunur. Bununla belə, mitoz və sitokinezin ayrı-ayrılıqda baş verdiyi bir çox hüceyrə var, endoreplikasiya adlanan prosesdə çoxlu nüvəli tək hüceyrələr əmələ gətirir. Bu ən çox göbələklər və çamur küfləri arasında baş verir, lakin müxtəlif qruplarda olur. Hətta heyvanlarda sitokinez və mitoz müstəqil olaraq, məsələn, meyvə milçəklərinin embrion inkişafının müəyyən mərhələlərində baş verə bilər. [10] Mitozdakı səhvlər apoptoz vasitəsilə hüceyrə ölümü ilə nəticələnə bilər və ya xərçəngə səbəb ola biləcək mutasiyalara səbəb ola bilər.

                Hüceyrə dövrünün tənzimlənməsi, hüceyrənin sağ qalması üçün vacib olan prosesləri, o cümlədən genetik zədələnmənin aşkarlanması və təmiri, habelə nəzarətsiz hüceyrə bölünməsinin qarşısının alınmasıdır. Hüceyrə dövrünü idarə edən molekulyar hadisələr nizamlı və yönləndiricidir, yəni hər bir proses ardıcıl şəkildə baş verir və dövranı "əksinə çevirmək" mümkün deyil.

                Siklinlərin və CDK -lərin rolu

                Tənzimləyici molekulların iki əsas sinifi, siklinlər və siklindən asılı kinazlar (CDK), hüceyrə dövrü boyunca bir hüceyrənin irəliləyişini təyin edir. [11] Leland H. Hartwell, R. Timothy Hunt və Paul M. Nurse bu mərkəzi molekulları kəşf etdikləri üçün 2001 -ci ildə Fiziologiya və Tibb üzrə Nobel Mükafatını qazandılar. [12] Siklinləri və CDK -ları kodlayan genlərin bir çoxu bütün eukaryotlar arasında qorunur, lakin ümumiyyətlə, daha mürəkkəb orqanizmlər daha çox fərdi komponentləri özündə birləşdirən daha mürəkkəb hüceyrə dövrü idarəetmə sistemlərinə malikdir. Müvafiq genlərin çoxu ilk növbədə mayaların öyrənilməsi ilə müəyyən edilmişdir Saccharomyces cerevisiae [13] mayadakı genetik nomenklatura bu genlərin çoxunu dublyaj edir XNM ("hüceyrə bölünmə dövrü" üçün) sonra bir identifikasiya nömrəsi, məsələn. cdc25 və ya cdc20.

                Siklinlər tənzimləyici alt vahidləri və CDK -ları aktivləşdirilmiş bir heterodimer siklinin katalitik alt bölmələrini heç bir katalitik aktivliyə malik deyil və ortaq siklin olmadıqda CDK -lar hərəkətsizdir. Bağlı bir siklin tərəfindən aktivləşdirildikdə, CDK-lar, hüceyrə dövrünün növbəti mərhələsinə koordinasiyalı girişi təşkil etmək üçün hədəf zülalları aktivləşdirən və ya təsirsiz hala gətirən fosforlaşma adlı ümumi biokimyəvi reaksiya həyata keçirir. Fərqli siklin-CDK birləşmələri hədəf alınan aşağı zülalları təyin edir. CDK-lar hüceyrələrdə konstitutiv olaraq ifadə edilir, siklinlər isə müxtəlif molekulyar siqnallara cavab olaraq hüceyrə dövrünün xüsusi mərhələlərində sintez olunur. [14]

                Siklin-CDK qarşılıqlı təsirinin ümumi mexanizmi

                Pro-mitotik hüceyrədənkənar siqnal aldıqdan sonra G1 siklin-CDK kompleksləri hüceyrəni S fazasına hazırlamaq üçün aktivləşir, transkripsiya faktorlarının ifadəsini təşviq edir, bu da öz növbəsində S siklinlərin və DNT replikasiyası üçün lazım olan fermentlərin ifadəsini təşviq edir. G1 siklin-CDK kompleksləri eyni zamanda S fazası inhibitorları kimi fəaliyyət göstərən molekulların deqradasiyasını təşviq edir. Bir protein hər yerdə olduğu üçün, proteazom tərəfindən proteolitik parçalanma üçün hədəflənir. Bununla birlikdə, tək hüceyrə səviyyəsində E2F transkripsiya dinamikasının son bir araşdırmasının nəticələri, G1 siklin-CDK fəaliyyətlərinin, xüsusən D-CDK4/6 siklininin, hüceyrə dövrü girişinin öhdəliyindən daha çox vaxtın tənzimlənməsi olduğunu iddia edir. . [15]

                Aktiv S siklin-CDK kompleksləri G zamanı yığılmış pre-replikasiya komplekslərini təşkil edən fosforilat zülalları1 DNT replikasiyası mənşəyinin mərhələsi. Fosforlaşma iki məqsədə xidmət edir: hər bir artıq yığılmış pre-replikasiya kompleksini aktivləşdirmək və yeni komplekslərin əmələ gəlməsinin qarşısını almaq. Bu, hüceyrə genomunun hər hissəsinin bir dəfə və yalnız bir dəfə təkrarlanmasını təmin edir. Replikasiyadakı boşluqların qarşısını almağın səbəbi olduqca aydındır, çünki vacib genlərin hamısını və ya bir hissəsini itirməyən qızı hüceyrələr öləcək. Bununla belə, gen nüsxəsi sayının təsirləri ilə bağlı səbəblərdən bəzi genlərin əlavə nüsxələrinə sahib olmaq da qız hüceyrələri üçün zərərlidir.

                S və G zamanı sintez edilən, lakin təsirsizləşən mitotik siklin-CDK kompleksləri2 fazalar, xromosom kondensasiyası və mitotik mil yığımında iştirak edən aşağı zülalları stimullaşdıraraq mitozun başlamasını təşviq edir. Bu prosesdə aktivləşdirilən kritik kompleks, xromosomal kinetoxor ilə əlaqəli struktur zülalların parçalanmasını təşviq edən anafazanı təşviq edən kompleks (APC) olaraq bilinən ubiquitin ligazadır. APC, telofaza və sitokinezin davam etməsini təmin edərək, parçalanma üçün mitotik siklini də hədəfləyir. [16]

                Siklin-CDK komplekslərinin xüsusi hərəkəti Edit

                Siklin D, hüceyrədaxili siqnallara (məsələn, böyümə faktorlarına) cavab olaraq, hüceyrə dövrünə daxil olan hüceyrələrdə istehsal olunan ilk siklindir. Siklin D səviyyəsi, çoxalmayan istirahət edən hüceyrələrdə aşağı qalır. Əlavə olaraq, CDK4/6 və CDK2 də qeyri-aktivdir, çünki CDK4/6 INK4 ailə üzvləri (məsələn, p16) tərəfindən bağlanır və kinaz fəaliyyətini məhdudlaşdırır. Eyni zamanda, CDK2 kompleksləri p21 və p27 kimi CIP/KIP zülalları tərəfindən inhibə edilir, [17] Hüceyrənin mitogen stimullar tərəfindən tetiklenen hüceyrə dövrünə daxil olması vaxtı gəldikdə, siklin D səviyyəsi artır. Bu tetikleyiciye cavab olaraq, siklin D, mövcud CDK4/6 ilə bağlanaraq, aktiv siklin D-CDK4/6 kompleksini meydana gətirir. Cyclin D-CDK4/6 kompleksləri, öz növbəsində, retinoblastoma həssaslıq zülalını (Rb) mono-fosforilləşdirir. Qeyri-fosforilləşdirilmiş Rb şiş bastırıcı hüceyrə dövrünün çıxışını stimullaşdırmaqda və G0 həbsini (qocalıq) saxlamaqda fəaliyyət göstərir. [18]

                Son bir neçə onillikdə, pRB zülallarının siklin D-Cdk4/6-vasitəli fosforilləşmə ilə təsirsiz hala gətirildiyi bir model geniş qəbul edilmişdir. Rb 14+ potensial fosforiləşmə sahəsinə malikdir. Cyclin D-Cdk 4/6 tədricən Rb-ni hiperfosforilatlanmış vəziyyətə gətirir, bu da pRB-E2F komplekslərinin dissosiasiyasını tetikler və bununla da G1/S hüceyrə sikli geninin ifadəsini və S fazasına irəliləyişini induksiya edir. [19]

                Bununla belə, son tədqiqatın elmi müşahidələri göstərir ki, Rb üç növ izoformada mövcuddur: (1) G0 vəziyyətində fosforlaşdırılmamış Rb (2) mono-fosforilləşdirilmiş Rb, həmçinin "hipo-fosforilləşdirilmiş" və ya "qismən" olaraq da adlandırılır. erkən G1 vəziyyətində fosforlu Rb və (3) son G1 vəziyyətində aktiv olmayan hiperfosforilləşmiş Rb. [20] [21] [22] G1-in erkən hüceyrələrində mono-fosforlu Rb 14 fərqli izoform olaraq çıxır, hər birində fərqli E2F var. bağlama yaxınlığı. [22] Rb'nin yüzlərlə fərqli zülal ilə əlaqəli olduğu təsbit edildi [23] və fərqli mono-fosforiləşmiş Rb izoformlarının fərqli protein ortaqlarına sahib olması fikri çox cazibədar idi. Rb-nin digər zülallarla birləşməsi və Rb-nin funksional fərqli formalarını yaradır. [25] Bütün fərqli mono-fosforilləşmiş Rb izoformları E2F transkripsiya proqramını maneə törədir və hüceyrələri G1-fazada həbs edə bilir. E2F tənzimləməsindən kənara çıxan kriptional çıxışlar. [25]

                Ümumiyyətlə, pRb-nin E2F-ə bağlanması E-tipli siklinlər də daxil olmaqla müəyyən G1/S və S keçid genlərinin E2F hədəf geninin ifadəsini maneə törədir. RB-nin qismən fosforilasiyası E2F hədəf gen ifadəsinin Rb-vasitəçiliyi ilə bastırılmasını de-repressiya edir, siklin E-nin ifadəsinə başlayır. Hüceyrənin siklin E aktivləşməsinə keçməsinə səbəb olan molekulyar mexanizm hazırda məlum deyil, lakin siklin E səviyyəsi yüksəldikcə, aktiv siklin E-CDK2 kompleksi əmələ gəlir və Rb hiper fosforlaşma ilə təsirsiz hala gətirilir. [22] Hiperfosforilatlı Rb, E2F -dən tamamilə ayrılır, bu da hüceyrələrin S fazasına keçməsi üçün geniş bir E2F hədəf geninin daha çox ifadəsini tələb edir [1]. Son zamanlarda, D-Cdk4/6 siklininin Rb-nin C-terminallı alfa-sarmal bölgəsinə bağlandığı müəyyən edilmişdir, bu da digər siklinlər, siklin E, A və B-dən daha çox siklin D ilə fərqlənir. [26] Rb fosforiliyinin struktur analizi Rb-nin bir çox Siklin-Cdk kompleksi vasitəsi ilə fərqli bir səviyyədə fosforlaşdığını dəstəkləyir. Bu, eyni zamanda bir növ Rb hiperfosforlaşma mexanizmi vasitəsi ilə bütün mono-fosforlu Rb izoformlarının eyni anda keçid kimi təsirsiz hala gətirilməsinin mövcud modelini mümkün edir. Əlavə olaraq, siklin D- Cdk 4/6 spesifik Rb C-terminal sarmalının mutasion təhlili göstərir ki, siklin D-Cdk 4/6-nın Rb-yə bağlanmasının pozulması Rb fosforiliyinin qarşısını alır, G1-də hüceyrələri həbs edir və Rb-in şiş bastırıcıdakı funksiyalarını gücləndirir. . [26] Bu siklin-Cdk ilə idarə olunan hüceyrə dövrü keçid mexanizmi hüceyrə çoxalmasına imkan verən hüceyrə dövrünə bağlı bir hüceyrəni idarə edir. Xərçəngli bir hüceyrə böyüməsi, tez-tez Cyclin D-Cdk 4/6 aktivliyinin tənzimlənməsi ilə müşayiət olunur.

                Hiperfosforilləşmiş Rb E2F/DP1/Rb kompleksindən ayrılır (o, E2F-yə cavab verən genlərlə bağlıdır, onları transkripsiyadan effektiv şəkildə "bloklayır") E2F-ni aktivləşdirir. E2F-nin aktivləşdirilməsi siklin E, siklin A, DNT polimeraz, timidin kinaz və s. Kimi müxtəlif genlərin transkripsiyası ilə nəticələnir. Beləliklə, C siklin E hüceyrəni G-dən itələyən siklin E-CDK2 kompleksini meydana gətirərək CDK2-yə bağlanır.1 S fazasına (G.1G-ni başlatan /S2/M keçidi). [27] Siklin B-cdk1 kompleksinin aktivləşməsi nüvə zərfinin parçalanmasına və profilaktikanın başlamasına səbəb olur və sonradan onun deaktivasiyası hüceyrənin mitozdan çıxmasına səbəb olur. [14] Mühəndisləşdirilmiş flüoresan məruzəçi hüceyrələrdən istifadə etməklə tək hüceyrə səviyyəsində E2F transkripsiya dinamikasının kəmiyyət tədqiqi kanonik dərslik modelinə meydan oxuyaraq hüceyrə dövrü girişinin nəzarət məntiqini başa düşmək üçün kəmiyyət çərçivəsini təmin etdi. Myc kimi E2F yığımının amplitüdünü tənzimləyən genlər, hüceyrə dövrü və S faza girişdəki öhdəliyi təyin edir. G1 siklin-CDK fəaliyyətləri hüceyrə dövrü girişinin sürücüsü deyil. Bunun əvəzinə, onlar ilk növbədə E2F artımının vaxtını tənzimləyirlər və bununla da hüceyrə dövrünün inkişaf tempini modullaşdırırlar. [15]

                İnhibitorların redaktəsi

                Endogen Düzəliş

                İki gen ailəsi, cip/kip (CDK ilə qarşılıqlı təsir göstərən protein/Kinaz inhibitor zülal) ailəsi və INK4a/ARF (Inhibitor Kinase 4/Aalternativ Rtükənmə Frame) ailə, hüceyrə dövrünün irəliləməsinin qarşısını alır. Bu genlər şiş əmələ gəlməsinin qarşısının alınmasında vasitəçi olduqları üçün şiş bastırıcıları olaraq bilinirlər.

                The cip/kip ailə p21, p27 və p57 genlərini ehtiva edir. G-də hüceyrə dövranını dayandırırlar1 siklin-CDK komplekslərinə bağlanma və inaktivləşdirmə mərhələsi. p21 p53 tərəfindən aktivləşdirilir (bu da, məsələn, radiasiya səbəbiylə DNT zədələnməsindən qaynaqlanır). p27, böyümə inhibitoru olan Transforming Growth Factor β (TGF β) tərəfindən aktivləşdirilir.

                The INK4a/ARF ailəsi CDK4-ə bağlanan və G-də hüceyrə dövrünü dayandıran p16 INK4a daxildir.1 p53 tənəzzülünün qarşısını alan faza və p14 ARF.

                Sintetik redaktə

                Cdc25 sintetik inhibitorları hüceyrə dövrünün dayandırılması üçün də faydalı ola bilər və buna görə də antineoplastik və xərçəng əleyhinə agentlər kimi faydalı ola bilər. [28]

                Bir çox insan xərçəngi hiperaktivləşdirilmiş Cdk 4/6 fəaliyyətinə malikdir. [29] Siklin D-Cdk 4/6 funksiyalarının müşahidələrini nəzərə alaraq, Cdk 4/6-nın inhibəsi bədxassəli şişin yayılmasının qarşısını almalıdır. Nəticədə, elm adamları sintetik Cdk4/6 inhibitorunu icad etməyə çalışdılar, çünki Cdk4/6 şiş əleyhinə effektivlik üçün terapevtik bir hədəf olaraq xarakterizə edildi. Üç Cdk4/6 inhibitoru-palbociclib, ribociclib və abemaciclib-hal-hazırda ilkin mərhələdə və ya metastatik, hormon-reseptor pozitiv (HR-pozitiv, HR+), HER2-mənfi (HER2-) döş xərçənginin müalicəsində klinik istifadə üçün FDA təsdiqini almışdır. . [30] [31] Məsələn, palbosiklib, ER-pozitiv/HER2-mənfi inkişaf etmiş döş xərçəngi üçün yaxşılaşmış nəticələr göstərmiş, ağızdan aktiv CDK4/6 inhibitorudur.Əsas yan təsir dozanın azaldılması ilə idarə oluna bilən neytropeniyadır. [32]

                Cdk4/6 hədəfli terapiya yalnız Rb -nin ifadə edildiyi xərçəng növlərini müalicə edəcək. Rb itkisi olan xərçəng hüceyrələri Cdk4/6 inhibitorlarına əsas müqavimət göstərir.

                Transkripsiya tənzimləyici şəbəkə Redaktə edin

                Mövcud sübutlar göstərir ki, yarı avtonom transkripsiya şəbəkəsi hüceyrə dövrünü tənzimləmək üçün CDK-siklin mexanizmləri ilə birlikdə fəaliyyət göstərir. Bir neçə gen ifadəsi araşdırması Saccharomyces cerevisiae hüceyrə dövrü boyunca ifadəsini dəyişən 800–1200 gen təyin etdilər. [13] [33] [34] Hüceyrə dövrünün müəyyən nöqtələrində yüksək səviyyədə transkripsiya olunur və dövrün qalan hissəsi boyunca daha aşağı səviyyədə qalır. Müəyyən edilmiş genlər toplusu, hesablama metodları və onları müəyyən etmək üçün istifadə edilən meyarlar səbəbiylə tədqiqatlar arasında fərqlənsə də, hər bir iş maya genlərinin böyük bir hissəsinin müvəqqəti olaraq tənzimləndiyini göstərir. [35]

                Dövri olaraq ifadə olunan bir çox gen, həm də vaxtaşırı ifadə olunan transkripsiya faktorlarından qaynaqlanır. Tək genli nokautların bir ekranında hüceyrə dövrünün inkişaf qüsurlarını göstərən 48 transkripsiya faktoru (bütün vacib olmayan transkripsiya faktorlarının təxminən 20% -i) müəyyən edilmişdir. [36] Yüksək məhsuldarlıq texnologiyalarından istifadə edilən genom tədqiqatları, maya genlərinin təşviqçilərinə bağlanan transkripsiya faktorlarını təyin etdi və bu tapıntıları müvəqqəti ifadə nümunələri ilə əlaqələndirmək, fazaya xas gen ifadəsini idarə edən transkripsiya faktorlarının müəyyənləşdirilməsinə imkan verdi. [33] [37] Bu transkripsiya faktorlarının ifadə profilləri əvvəlki mərhələdə pik həddə çatan transkripsiya faktorları ilə idarə olunur və hesablama modelləri göstərmişdir ki, bu transkripsiya faktorlarının CDK-avtonom şəbəkəsi sabit vəziyyətdə salınımlar yaratmaq üçün kifayətdir. gen ifadəsi). [34] [38]

                Eksperimental dəlillər də göstərir ki, gen ifadəsi CDK mexanizmindən asılı olmayaraq vəhşi tipli hüceyrələrin bölünməsində müşahidə olunan dövrə uyğun olaraq salına bilər. Orlando və s. həm yabanı tip hüceyrələrdə, həm də bütün S faza malik olmayan və mitotik siklinsiz hüceyrələrdə periyodik olaraq təyin etdikləri bir qrup 2771 genin ifadəsini ölçmək üçün mikroarraylardan istifadə etmişlər.clb1,2,3,4,5,6). Təhlil edilən 1271 gendən 882-si siklin çatışmazlığı olan hüceyrələrin G.1 və S fazası. Bununla belə, yoxlanılan genlərin 833-ü vəhşi tip və mutant hüceyrələr arasında davranış dəyişikliyi göstərdi ki, bu da bu genlərin CDK-siklin mexanizmi tərəfindən birbaşa və ya dolayı yolla tənzimləndiyini göstərir. Mutant hüceyrələrdə vaxtında ifadə olunmağa davam edən bəzi genlər, mutant və vəhşi tipli hüceyrələrdə də fərqli səviyyələrdə ifadə edilmişdir. Bu tapıntılar göstərir ki, transkripsiya şəbəkəsi CDK-siklin osilatorundan asılı olmayaraq salına bilsə də, hüceyrə dövrü hadisələrinin düzgün vaxtını təmin etmək üçün hər ikisini tələb edən bir şəkildə birləşdirilir. [34] Digər işlər göstərir ki, hüceyrə dövrü transkripsiya faktorlarının Cdk1 tərəfindən translasiyadan sonrakı modifikasiyası olan fosforlaşma hədəf genlərin vaxtını ciddi şəkildə idarə etmək üçün transkripsiya faktorlarının lokalizasiyasını və ya fəaliyyətini dəyişə bilər. [36] [39] [40]

                Salınımlı transkripsiya maya hüceyrəsi dövrünün irəliləməsində əsas rol oynasa da, CDK-siklin mexanizmi erkən embrion hüceyrə siklində müstəqil şəkildə fəaliyyət göstərir. Midblastula keçidindən əvvəl zigotik transkripsiya baş vermir və B tipli siklinlər kimi bütün lazımlı zülallar anadan yüklənmiş mRNA-dan tərcümə olunur. [41]

                DNT replikasiyası və DNT replikasiyasının mənşəyi fəaliyyəti Edit

                Sinxron mədəniyyətlərin təhlili Saccharomyces cerevisiae Hüceyrə dövrünün irəliləməsini gecikdirmədən DNT replikasiyasının başlanmasına mane olan şəraitdə mənşə lisenziyasının 3' uclarına yaxın mənşəli genlərin ifadəsini azaldır və aşağı axın mənşələrinin yuxarı axını genlərinin ifadəsini tənzimləyə biləcəyini ortaya qoyur. [42] Bu, DNT replikasiya mənşəli fəaliyyəti ilə mRNT ifadəsi arasında qlobal səbəb koordinasiyasının riyazi modelləşdirilməsinin əvvəlki proqnozlarını təsdiqləyir [43] [44] [45] və göstərir ki, DNT mikroarray məlumatlarının riyazi modelləşdirilməsi əvvəllər naməlum olanı düzgün proqnozlaşdırmaq üçün istifadə edilə bilər. bioloji tənzimləmə üsulları.

                Hüceyrə dövrü nəzarət nöqtələri hüceyrə dövrünün gedişatını izləmək və tənzimləmək üçün hüceyrə tərəfindən istifadə olunur. [46] Nəzarət nöqtələri zəruri faza proseslərinin yoxlanılmasına və DNT zədələnməsinin bərpasına imkan verən xüsusi nöqtələrdə hüceyrə dövrünün irəliləməsini maneə törədir. Nəzarət nöqtəsi tələbləri yerinə yetirilməyincə hüceyrə növbəti mərhələyə keçə bilməz. Yoxlama məntəqələri adətən hüceyrə dövrünün müxtəlif mərhələlərində hüceyrənin gedişatını izləyən və diktə edən tənzimləyici zülallar şəbəkəsindən ibarətdir.

                Normal insan hüceyrələrində tək zəncirli DNT zədələrinin təxminən 1%-nin hüceyrə dövrü başına hüceyrə başına təxminən 50 endogen DNT cüt zəncirinin qırılmasına çevrildiyi təxmin edilir. [47] Bu cür cüt telli qırılmalar ümumiyyətlə yüksək sədaqətlə düzəldilsə də, təmirdəki səhvlərin insanlarda xərçəng nisbətinə əhəmiyyətli qatqı təmin etdiyi düşünülür. [47]

                Zədələnmiş və ya natamam DNT-nin qız hüceyrələrinə ötürülməməsini təmin etmək üçün bir neçə yoxlama nöqtəsi var. Üç əsas nəzarət məntəqəsi mövcuddur: G1/S keçid məntəqəsi, G.2/M keçid məntəqəsi və metafaza (mitotik) keçid məntəqəsi. Başqa bir nəzarət nöqtəsi, hüceyrələrin olgunluğunun yoxlanıldığı Go yoxlama nöqtəsidir. Hüceyrələr hələ hazır olmadıqları üçün bu keçid məntəqəsini keçə bilməsələr, bölünməkdən kənarlaşdırılacaqlar.

                G1/S keçid, hüceyrə dövrünün sürətini məhdudlaşdıran bir addımdır və məhdudlaşdırma nöqtəsi olaraq da bilinir. [14] Hüceyrənin DNT-ni tam şəkildə təkrarlamaq üçün kifayət qədər xammalın (nukleotid əsasları, DNT sintaza, xromatin və s.) olub-olmadığını burada yoxlayır. Sağlam olmayan və ya qidalanmayan hüceyrə bu keçid məntəqəsində ilişib qalacaq.

                G2/M nəzarət nöqtəsi hüceyrənin iki qız hüceyrəsi üçün kifayət qədər sitoplazma və fosfolipidlərə malik olmasını təmin etdiyi yerdir. Ancaq bəzən daha da əhəmiyyətlisi, kopyalamağın doğru vaxt olub olmadığını yoxlayır. Bir çox hüceyrənin eyni anda çoxalması lazım olduğu vəziyyətlər var (məsələn, böyüyən bir embrion, blastula ortasına çatana qədər simmetrik bir hüceyrə paylamasına sahib olmalıdır). Bu, G-yə nəzarət etməklə həyata keçirilir2/M keçid məntəqəsi.

                Metafaza nəzarət nöqtəsi kifayət qədər kiçik bir nəzarət nöqtəsidir, çünki bir hüceyrə metafazada olduqdan sonra mitoz keçirməyi öhdəsinə götürür. Ancaq bu, vacib olmadığını söyləmək deyil. Bu nəzarət nöqtəsində, hüceyrə mili meydana gətirdiyini və anafaza başlamazdan əvvəl bütün xromosomların iş mili ekvatorunda hizalanmasını yoxlayır. [48]

                Bunlar üç "əsas" nəzarət nöqtəsi olsa da, bütün hüceyrələr təkrarlamaq üçün bu keçid məntəqələrinin hər birindən bu qaydada keçməməlidir. Bir çox xərçəng növü, hüceyrələrin müxtəlif keçid məntəqələrində sürətlənməsinə və ya ümumiyyətlə atlamasına imkan verən mutasiyalardan qaynaqlanır. Demək olar ki, ardıcıl olaraq S -dən M -ə S fazasına keçid. Bu hüceyrələr nəzarət nöqtələrini itirdikləri üçün meydana gələ biləcək DNT mutasiyalarına əhəmiyyət verilmir və qız hüceyrələrinə ötürülür. Bu, xərçəng hüceyrələrinin eksponensial olaraq mutasiyaların yığılmasına meylli olmasının bir səbəbidir. Xərçəng hüceyrələrindən başqa, bir çox tam fərqli hüceyrə növləri artıq təkrarlanmır, buna görə də hüceyrə dövrünü tərk edərək G -də qalırlar0 ölənə qədər. Beləliklə, mobil nəzarət nöqtələrinə olan ehtiyac aradan qaldırılır. DNT zədələnməsinə qarşı hüceyrə dövrü reaksiyasının alternativ bir modeli də təklif edilmişdir ki, bu da replikasiyadan sonrakı yoxlama nöqtəsi kimi tanınır.

                Nəzarət nöqtəsi tənzimlənməsi orqanizmin inkişafında mühüm rol oynayır. Cinsi çoxalmada yumurta döllənmə baş verdikdə, sperma yumurtaya bağlandıqda yumurtaya dölləndiyini bildirən siqnal faktorlarını buraxır. Digər şeylər arasında, bu, indi döllənmiş oositi əvvəllər hərəkətsiz vəziyyətdə olan G -dən qayıtmağa vadar edir0, hüceyrə dövrünə və mitotik çoxalmaya və bölünməyə geri dön.

                p53 hər iki G-də nəzarət mexanizmlərinin işə salınmasında mühüm rol oynayır1/S və G.2/M keçid məntəqələri. p53-ə əlavə olaraq, yoxlama məntəqəsi tənzimləyiciləri xərçəngin böyüməsi və yayılmasındakı rolları üçün ciddi şəkildə araşdırılır.

                Atsushi Miyawaki və iş yoldaşlarının qabaqcıl işi hüceyrə dövrünün flüoresan görüntülənməsinə imkan verən flüoresan ubiquitination əsaslı hüceyrə dövrü göstəricisini (FUCCI) inkişaf etdirdi. Başlanğıcda, yaşıl bir floresan zülal, mAG, hGem (1/110) və narıncı bir floresan protein (mKO) ilə birləşdi.2) hCdt1 (30/120) ilə birləşdi. Qeyd edək ki, bu birləşmələr nüvə lokalizasiya siqnalı və deqradasiya üçün ubiquitinasiya yerləri olan fraqmentlərdir, lakin funksional zülallar deyil. Yaşıl flüoresan zülal S, G zamanı hazırlanır2və ya M fazası və G zamanı pozulmuşdur0 ya da G.1 mərhələdə, portağal floresan protein G əsnasında meydana gəlir0 ya da G.1 fazada və S, G zamanı məhv edilmişdir2və ya M fazası. [49] Uzaq qırmızı və yaxın infraqırmızı FUCCI siyanobakteriyalardan əldə edilən flüoresan zülaldan (smURFP) və bakteriofitokromdan əldə edilən flüoresan zülaldan (film bu linkdə tapılıb) istifadə edilməklə hazırlanmışdır. [50]

                Hüceyrə dövrü komponentlərinin nizamsızlığı şiş əmələ gəlməsinə səbəb ola bilər. [51] Yuxarıda qeyd edildiyi kimi, hüceyrə dövrü inhibitorları, RB, p53 və s. Kimi bəzi genlər mutasiya etdikdə, hüceyrənin nəzarətsiz çoxalmasına və şiş əmələ gəlməsinə səbəb ola bilər. Şiş hüceyrələrində hüceyrə dövrünün müddəti normal hüceyrə dövrünə bərabər və ya daha uzun olsa da, aktiv hüceyrə bölünməsində olan hüceyrələrin nisbəti (G-də sakit hüceyrələrə qarşı)0 faza) şişlərdə normal toxumadan xeyli yüksəkdir. [ sitat lazımdır ] Beləliklə, apoptoz və ya qocalma nəticəsində ölən hüceyrələrin sayı eyni qaldığından hüceyrə sayında net bir artım var.

                Hüceyrə dövrünü aktiv şəkildə keçirən hüceyrələr xərçəng müalicəsində hədəflənir, çünki DNT hüceyrə bölünməsi zamanı nisbətən məruz qalır və buna görə də dərman və ya radiasiya ilə zədələnməyə həssasdır. Bu həqiqət, xərçəng müalicəsində debulking olaraq bilinən bir proseslə istifadə edilir, əhəmiyyətli bir şiş kütləsi çıxarılır ki, bu da qalan şiş hüceyrələrinin əhəmiyyətli bir hissəsini G -dən itələyir.0 G1 faza (qida, oksigen, böyümə faktorları və s. əlçatanlığının artması ilə əlaqədar). Debulking prosedurundan sonra şüa və ya kemoterapi, hüceyrə dövrünə yeni girmiş bu hüceyrələri öldürür. [14]

                Kültürdə ən sürətli velosiped sürən məməlilər, bağırsaq epitelindəki kript hüceyrələri, 9-10 saat qədər qısa bir dövrə malikdir. İstirahət edən siçan dərisindəki kök hüceyrələrin dövrü 200 saatdan çox ola bilər. Bu fərqin çoxu G-nin müxtəlif uzunluğu ilə bağlıdır1, dövrün ən dəyişkən mərhələsi. M və S çox fərqli deyil.

                Ümumiyyətlə, hüceyrələr son M və G-də ən çox radiohəssasdır2 fazaları və gec S fazasında ən davamlıdır.

                Hüceyrə dövrü daha uzun və əhəmiyyətli dərəcədə uzun G olan hüceyrələr üçün1 fazada, G -nin sonunda ikinci müqavimət zirvəsi var1.

                Müqavimət və həssaslıq nümunəsi hüceyrədəki sulfhidril birləşmələrinin səviyyəsi ilə əlaqələndirilir. Sülfhidril hüceyrələri radiasiya zərərindən qoruyan təbii maddələrdir və S -də ən yüksək səviyyələrdə və mitoz yaxınlığında ən aşağı səviyyədə olmağa meyllidir.

                Homoloji rekombinasiya (HR), DNT cüt telli qırılmaların təmiri üçün dəqiq bir prosesdir. HR G1 fazasında demək olar ki, yoxdur, S fazada ən aktivdir və G -də azalır2/M. [52] Homolog olmayan son birləşmə, daha az dəqiq və daha çox mutagen prosesdir ki, ikiqat lifli qırılmaların bərpası üçün hüceyrə dövrü ərzində aktivdir.


                İçindəkilər

                Protein yığılması müxtəlif səbəblərə görə baş verə bilər. Bu səbəblərin aşağıda təsnif edilə biləcəyi dörd sinif var.

                Mutasiyaların redaktəsi

                DNT ardıcıllığında baş verən mutasiyalar zülalın amin turşusu ardıcıllığına təsir edə bilər və ya təsir etməyə bilər. Sıra təsirləndikdə, fərqli bir amin turşusu zülalın qatlanmasına təsir edən yan zəncirlər arasındakı qarşılıqlı təsirləri dəyişə bilər. Bu, eyni yanlış açılmış/açılmamış zülal və ya fərqli bir zülal ilə birləşən zülalın açıq hidrofob bölgələrinə səbəb ola bilər.

                Təsirə məruz qalan zülalların özlərindəki mutasiyalara əlavə olaraq, zülalların yığılması dolayı yolla zülalların yenidən qatlanma yolu (molekulyar şaperonlar) və ya ubiquitin-proteazom yolu (ubiquitin ligases) kimi tənzimləyici yollardakı mutasiyalar vasitəsilə də baş verə bilər. [9] Chaperones, zülalın bükülməsi üçün təhlükəsiz bir mühit təmin edərək zülalların yenidən qatlanmasına kömək edir. Ubiquitin ligazları, ubiquitin modifikasiyası ilə zülalları hədəf alır.

                Protein sintezi ilə bağlı problemlər Redaktə edin

                Protein aqreqasiyası transkripsiya və ya tərcümə zamanı baş verən problemlər nəticəsində yarana bilər. Transkripsiya zamanı DNT mRNA-ya kopyalanır və mRNA əmələ gətirmək üçün RNT emalına məruz qalan pre-mRNA zənciri meydana gətirir. [10] Tərcümə zamanı ribosomlar və tRNA mRNA ardıcıllığını bir amin turşusu sırasına çevirməyə kömək edir. [10] Əgər hər iki addımda səhv mRNT zəncirinin və/yaxud yanlış amin turşusu ardıcıllığının yaradılması zamanı problemlər yaranarsa, bu, zülalın yanlış qatlanmasına səbəb ola bilər və zülalın yığılmasına səbəb ola bilər.

                Ətraf mühitin stresləri Redaktə edin

                Ekstremal temperatur və pH və ya oksidləşdirici stres kimi ətraf mühit stresləri də zülal birləşməsinə səbəb ola bilər. [11] Belə xəstəliklərdən biri kriyoglobulinemiyadır.

                Yüksək temperatur amin turşusu qalıqları arasındakı kovalent olmayan qarşılıqlı təsirləri zəiflədə və sabitləşdirə bilər. Zülalın pH aralığının xaricindəki pHlar, kovalent olmayan qarşılıqlı təsirləri artıra və ya azalda bilən amin turşularının proton vəziyyətini dəyişə bilər. Bu da daha az sabit qarşılıqlı təsirlərə səbəb ola bilər və zülalın açılmasına səbəb ola bilər.

                Oksidləşdirici stresə reaktiv oksigen növləri (ROS) kimi radikallar səbəb ola bilər. Bu qeyri-sabit radikallar amin turşusu qalıqlarına hücum edərək yan zəncirlərin (məsələn, aromatik yan zəncirlər, metionin yan zəncirləri) oksidləşməsinə və/və ya polipeptid bağlarının parçalanmasına səbəb ola bilər. [12] Bu, proteini düzgün bir yerdə saxlayan kovalent olmayan qarşılıqlı təsirləri təsir edə bilər ki, bu da zülalın stabilizasiyasına səbəb ola bilər və zülalın açılmasına səbəb ola bilər. [11]

                Yaşlanma Düzəlişi

                Hüceyrələrdə protein birləşmələrini geri qaytara və ya parçalaya bilən mexanizmlər var. Ancaq hüceyrələr yaşlandıqca bu nəzarət mexanizmləri zəifləyir və hüceyrə aqreqatları həll etməkdə daha az qabiliyyətli olur. [11]

                Zülalların yığılmasının qocalmada səbəbli proses olduğuna dair fərziyyə indi sınaqdan keçirilə bilər, çünki gecikmiş qocalmanın bəzi modelləri əlimizdədir. Zülal aqreqatlarının inkişafı qocalma prosesidirsə, yaşlanmanın yavaşlaması zamanla proteotoksisitənin sürətinə heç bir təsir göstərməyəcəkdir. Bununla belə, əgər qocalma proteotoksisiteyə qarşı qoruyucu mexanizmlərin fəaliyyətinin azalması ilə əlaqələndirilirsə, yavaş qocalma modelləri azalmış aqreqasiya və proteotoksisite göstərəcək. Bu problemi həll etmək üçün bir neçə toksiklik təhlili aparılmışdır C. elegans. Bu tədqiqatlar göstərdi ki, insulin/IGF siqnalının (IIS) aktivliyinin azaldılması, görkəmli yaşlanma tənzimləyici yolu neyrodegenerasiya ilə əlaqəli zəhərli zülal birləşməsindən qoruyur. Bu yanaşmanın etibarlılığı, məməlilərdə IGF-1 siqnal yolunun aktivliyinin azalması olaraq Alzheimer model siçanlarını xəstəliklə əlaqəli davranış və biokimyəvi pozğunluqlardan qoruduğu üçün test edilmiş və təsdiq edilmişdir. [13]

                Bir sıra tədqiqatlar göstərdi ki, zülalların yığılmasına hüceyrə reaksiyaları yaxşı tənzimlənir və təşkil edilir. Protein aqreqatları hüceyrədəki müəyyən sahələrdə lokalizasiya edilir və prokaryotlarda (E.coli) və eukaryotlarda (maya, məməlilər hüceyrələrində) bu lokalizasiyalar üzərində tədqiqatlar aparılmışdır.

                Bakteriyaların redaktəsi

                Bakteriyalardakı aqreqatlar asimmetrik olaraq hüceyrənin qütblərindən birinə - "daha qədim qütbə" çatır. Hüceyrə bölündükdən sonra köhnə qütblü qız hüceyrələr zülal aqreqatını alır və məcmu olmayan qız hüceyrələrindən daha yavaş böyüyür. Bu, bakteriya populyasiyasında protein birləşmələrini azaltmaq üçün təbii bir seçim mexanizmi təmin edir. [14]

                Maya Edit

                Maya hüceyrələrindəki protein birləşmələrinin çoxu molekulyar şaperonlar tərəfindən yenidən qatlanır. Bununla belə, oksidləşmə ilə zədələnmiş zülallar və ya parçalanma üçün qeyd olunan zülallar kimi bəzi aqreqatlar yenidən qatlana bilməz. Əksinə, sona çatacaqları iki bölmə var. Protein aqreqatları, nüvə membranının yaxınlığındakı Juxtanuclear keyfiyyətə nəzarət bölməsində (JUNQ) və ya vakuolun yaxınlığındakı Çözünməz Zülal Yatağında (IPOD) lokallaşdırıla bilər. maya hüceyrələri. [11] Protein aqreqatları, hər yerdə yerləşdikdə və tənəzzülə uğrayanda JUNQ -da lokalizasiya olunur. Toplanmış və həll olunmayan zülallar IPOD -da daha qalıcı bir çöküntü kimi lokalizasiya olunur. Buradakı zülalların otofajiya ilə xaric edilə biləcəyinə dair sübutlar var. [15] Bu iki yol birlikdə işləyir, çünki proteazom yolu çox işlədilərkən zülallar IPOD -a gəlir. [15]

                Məməli hüceyrələri Redaktə edin

                Məməli hüceyrələrində bu zülal aqreqatlarına "aqresomlar" deyilir və hüceyrə xəstələndikdə əmələ gəlir. Bunun səbəbi, hüceyrədə mutasiya edildikdə yarana bilən heterolog zülallar olduqda məcmuların əmələ gəlməsinə meyllidir. E3 ubiquitin ligazası, səhv bağlanmış zülalları tanıyır və onları ubiquinasiya edə bilir. HDAC6 daha sonra qeyd olunan aqreqatları mikroborucuqların təşkili mərkəzinə (MTOC) çatdırmaq üçün ubiquitin və motor zülal dineyinə bağlana bilər. Orada, MTOC -nu əhatə edən bir sahəyə yığılırlar. Şaperonları və proteazomları gətirir və otofagiyanı aktivləşdirirlər. [16]

                Hüceyrədə zülal aqreqatlarının aradan qaldırılmasından məsul olan iki əsas protein keyfiyyətinə nəzarət sistemi vardır. Qarışıq zülallar, iki-şaperon sistemi ilə yenidən qatlana bilər və ya ubiquitin proteazom sistemi və ya otofajiya ilə pozula bilər. [17]

                Yenidən qatlama redaktəsi

                Bi-chaperone sistemi, protein parçalanması və yenidən qatlanması üçün Hsp70 (E.colidə DnaK-DnaJ-GrpE və mayada Ssa1-Ydj1/Sis1-Sse1/Fe1) və Hsp100 (E.colidə ClpB və Hsp104) şaperonlarından istifadə edir. . [18]

                Hsp70 protein aqreqatları ilə qarşılıqlı əlaqədə olur və Hsp100-ü qəbul edir. Hsp70 aktivləşdirilmiş Hsp100-ü sabitləşdirir. Hsp100 zülallarında tək polipeptidləri ayırmaq üçün yivləmə fəaliyyəti üçün istifadə olunan aromatik məsamə döngələri var. Bu işləmə işi N-ucunda, C-ucunda və ya polipeptidin ortasında başlaya bilər. Polipeptid, hər addımda bir ATP istifadə edərək, Hsp100 vasitəsilə bir sıra addımlarla köçürülür. [18] Polipeptid açılır və sonra ya özü, ya da istilik şoku zülallarının köməyi ilə yenidən qatlanmasına icazə verilir. [19]

                Deqradasiya Redaktəsi

                Səhv qatlanmış zülallar ubiquitin-proteasome sistemi (UPS) vasitəsilə aradan qaldırıla bilər. Bu, zülalları deqradasiya üçün qeyd etmək üçün ubiquinates edən E1-E2-E3 yolundan ibarətdir. Eukariotlarda zülallar 26S proteazomu tərəfindən parçalanır. Məməlilərin hüceyrələrində, E3 ligaz, karboksi terminal Hsp70 qarşılıqlı protein (CHIP), Hsp70 ilə əlaqəli zülalları hədəf alır. Mayada E3 ligazaları Doa10 və Hrd1 endoplazmik retikulum zülallarında oxşar funksiyalara malikdir. [20]

                Yanlış qatlanmış zülallar, zülal aqreqatlarının lizosoma çatdırıldığı otofagiya vasitəsilə də aradan qaldırıla bilər. [20]

                Yetkin zülal aqreqatlarının özlərinin zəhərli olduğu düşünülsə də, son sübutlar əslində ən zəhərli olan yetişməmiş protein aqreqatları olduğunu göstərir. [21] [22] Bu aqreqatların hidrofobik hissələri hüceyrənin digər komponentləri ilə qarşılıqlı əlaqə qura və onları zədələyə bilər. Hipotezlər, zülal birləşmələrinin toksikliyinin hüceyrə komponentlərinin tutulma mexanizmləri, reaktiv oksigen növlərinin əmələ gəlməsi və membrandakı xüsusi reseptorlara bağlanma və ya membranların pozulması ilə əlaqəli olmasıdır. [23] Membran keçiriciliyindən daha yüksək molekulyar çəkili növlərin məsul olduğunu müəyyən etmək üçün kəmiyyət təhlili istifadə edilmişdir. [24] Məlumdur ki, zülal aqreqatları in vitroda süni fosfolipid billayerlərini destabilizasiya edə bilər, bu da membranın keçiriciliyinə səbəb olur.


                Videoya baxın: Zulal sintezi (Oktyabr 2022).