Məlumat

Elm adamları yeni bir antijeni və onun epitopunu necə kəşf edirlər?

Elm adamları yeni bir antijeni və onun epitopunu necə kəşf edirlər?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

İnternetdə bütün aşkar edilmiş antigenləri və onların epitoplarını sadalayan bəzi verilənlər bazası tapdım. Bəs elm adamları yeni bir antijeni necə kəşf edirlər? İmmunitet reaksiyasına səbəb olub-olmadığını görmək üçün bədənə yeritməyə çalışırlar? Və nəhayət, əgər bu bir antigendirsə, onların epitoplarını necə bilirlər?


Tamam, üst -üstə düşən bir neçə sualınız var (aydınlıq üçün sualları yenidən yazın):

Elm adamları yeni bir antijeni necə kəşf edirlər?

Bunun müxtəlif məqsədlər üçün tətbiq olunan bir çox yolu var.

Kəşf etmək üçün a təbii antigennormal olaraq immunitet sistemi tərəfindən istehsal olunan bir antikor tərəfindən tanınan bir insan əvvəlcə bu spesifik antikoru ələ keçirmiş olardı. Bu, immunitet sisteminin bir patogenə (məsələn, virus) qarşı təsirli reaksiyasını artırmaq və ya anlamaq üçün bir yanaşma olardı.

Antikoru (və ideal olaraq kodlaşdıran DNT ardıcıllığını) əldə etmək üçün tədqiqatçılar patogendən və ya onun hissələrindən istifadə etməli və ona bağlanan antikorları (və ya B hüceyrələrini) tapmalıdırlar. Bunun üçün patogen (hissəciklər) bir sütuna sabitlənə bilər və qanın sütundan keçməsindən sonra müvafiq antikorlar və B hüceyrələri sütunda qalacaq. Sonra bu hüceyrələrin DNT-si ardıcıllıq ola bilər və ya antikor daha da təmizlənə bilər.

Əksər hallarda, elm adamları bir antigenə qarşı hələ mövcud olmayan bir antikor tapmaq istəyirlər ki, bu da bizi aşağıdakılara aparır:

Elm adamları immunitet reaksiyasına səbəb olub olmadığını görmək üçün bədənə antijen vurmağa çalışırlarmı?

Bəli, bu edilir - ancaq heyvanlarla (əsasən siçovullar, dovşanlar və keçilər). Poliklonal antikorlar birbaşa bu heyvanların qanından çıxarıla bilər, lakin əksər hallarda tədqiqat və ya tibbi məqsədlər üçün monoklonal antikorlar lazımdır. Bunun üçün lazım olan proses daha mürəkkəbdir, lakin daha sonra daha çox miqdarda istədiyiniz antikoru istehsal etmək üçün istifadə edilə bilən bir hüceyrə xəttinə səbəb olur.

Elm adamları bir antikora uyğun epitopu necə bilirlər?

Bir antikorun dəqiq epitopunu tapmağın bir çox yolu var, bunların hamısı ümumiyyətlə epitop xəritələmə olaraq təsvir edilir.

Ən çox yayılmış üsullar ya antikorun bağlanması üçün hansı mövqelərin (amin turşularının) vacib olduğunu görmək üçün ya antijenin sahəyə yönəlmiş mutagenezinə və ya hələ də antikorla bağlana bilən antijenin peptid parçalarına əsaslanır.


Nikolayın cavabını əlavə etmək istərdim.

Bir antijen nədir?

Birincisi və Nikolay bunu dedi, amma mən sadəcə aydınlaşdırmaq istəyirəm ki, antigen antikorların bağladığı hər şeydir. Bu və dan fərqlidir immunogen immunitet sisteminizin antikor istehsalına səbəb olan bir növ antijendir. Ancaq bir antijenin mütləq bir immunogen olması lazım deyil.

Peptidlər, şəkərlər, nuklein turşuları və lipidlər ümumi antigenlərdir, lakin peptidlər yəqin ki, sizə ən çox tanış olan şeylərdir. Adətən, əksər şəkərlər və lipidlər özbaşına immun reaksiya yaratmaqda çətinlik çəkirlər və ümumiyyətlə bir protein (peptid) ilə birləşirlər. Bu məntiqlidir, çünki vücudunuz təbii olaraq çoxlu şəkər və lipidlər istehsal edir və onların hamısına antikor yaratsanız, o, özünə hücum edər.

Bir antijen necə kəşf edilir?

Buna yanaşmağın iki yolu var.

  1. İlk Antikor yanaşması

Tutaq ki, insan hansısa naməlum virusa yoluxsa da, sağ qalır. Növbəti addım iki şeyi etmək olacaq:

  • Alimin laboratoriyada öyrənə bilməsi üçün virusu mədəniyyət edin. Sınırsız bir miqdarda böyümək üçün ən çox virusu becərməlisiniz in vitro. Çölə çıxmaq və təbii olaraq öyrənmək üçün lazım olan bütün virusu tapmaq həqiqətən çətin bir iş olardı.

  • Virusun genotipi. Genləri manipulyasiya etmək və təsirlərinin nə olduğunu görmək üçün viral genomu bilmək lazımdır.

Biz genomun müxtəlif komponentlərini dəyişən virusda dəyişikliklər etməyə başlaya bilərik. Biz bunun xəstənin zərdabında necə dəyişdiyini görə bildik. Serumda virusu bağlayacaq antikorlar olduğundan, zərdab tez-tez zərərsizləşdirilir və ya bağlanan antikorlar üçün müsbət test edilir. İndi A genini virusdan dəyişdirsək və zərdab hələ də bağlayar/neytrallaşdırarsa, A geninin xəstədə immun cavab verən antigen olmadığını güman edə bilərik. B geni mutasiyaya uğrayarsa və serum bağlanmağı dayandırarsa, B geninin bilinməyən virusun antigenidir.

  1. Antigenə ilk yanaşma

Yalnız virusumuz varsa və yoluxmuş xəstəmiz yoxdursa, antigeni tapmaq üçün onu model orqanizmlərə yeritməliyik. Bununla belə, inanılmaz miqdarda viral növləri bildiyimizə görə, virusun antigen komponentinin nə olduğunu ən yaxşı şəkildə təxmin edə bilərik.

Məsələn, 2012-ci ildə bir xəstə xəstələndikdə, onların içərisində Koronavirusun yaxın qohumu olduğu müəyyən edilən virusu ardıcıllıqla göstərdilər. Coronavirus əsas antijeninin sünbül zülalı olduğunu bildikləri üçün, naməlum virusun sünbül zülalı ilə yaxından əlaqəli olan genin də əsas antijen olduğunu zənn etdilər. Bu virusun, əsas antigeninin sünbül zülalı olan Yaxın Şərq tənəffüs sindromu koronavirusu olduğu ortaya çıxdı.


Scripps Araşdırma İnstitutunun alimləri peyvənd hazırlamaq üçün HİV -ə qarşı yeni hücum nöqtəsi tapdılar

ŞƏKİL: The Scripps Araşdırma İnstitutunun bir qrupu, HİV virusu ilə əlaqədar yeni bir həssas sayt tapdı. Burada HİV-1 zərfinin qlikoprotein trimerinin elektron mikroskopik yenidən qurulması göstərilir. daha çox bax

Kredit: Şəkil Christina Corbaci, Scripps Araşdırma İnstitutunun izni ilə.

LA JOLLA, CA-24 aprel 2014-Beynəlxalq AİDS Peyvəndi Təşəbbüsü (IAVI) ilə işləyən The Scripps Research Institute (TSRI) alimlərinin rəhbərlik etdiyi bir qrup, HİV virusu ilə əlaqədar yeni bir həssas sayt tapdı. Yeni təyin olunan sahə, insan antikorları tərəfindən müxtəlif növ HİV suşlarının yoluxma qabiliyyətini təsirsiz hala gətirəcək şəkildə hücum edilə bilər.

TSRI -nin İmmunologiya və Mikrobiologiya Bölməsinin professoru Dennis R. Burton, "HİV -in çox az bilinən zəiflik saytları var, amma bu işdə yenisini təsvir etdik və bunun bir peyvənd hazırlamaqda faydalı olacağını gözləyirik" dedi. və TSRI-nin La Jolla kampusunda IAVI Neytrallaşdırıcı Anticisim Mərkəzinin (NAC) və Milli Sağlamlıq İnstitutlarının HİV/AİDS Peyvəndi İmmunologiyası və İmmunogen Kəşfetmə Mərkəzinin (CHAVI-ID) elmi direktoru.

Hansen Struktur Biologiya professoru, İnteqrativ Struktur və Hesablama Biologiyası Departamentinin sədri və Skaggs Kimyəvi Biologiya İnstitutunun üzvü İan A. Wilson, "Bu virusda hələ də yeni həssas saytlar tapmağımız çox həyəcanvericidir" dedi. TSRI və NAC və CHAVI-ID üzvü.

Tapıntılar iki məqalədə - biri Burtonun, ikincisi isə NAC və CHAVI-ID-nin üzvü olan TSRI assistenti Endryu B. Ward və Uilsonun rəhbərlik etdiyi jurnalın may sayında dərc olunub. Toxunulmazlıq.

Kəşf, HİV əleyhinə təsirli bir peyvənd hazırlamaq üçün IAVI və NIH tərəfindən dəstəklənən böyük səylərin bir hissəsidir. Belə bir peyvənd virusun qorunub saxlanmış həssas sahələrinə qarşı güclü və uzunmüddətli immunitet reaksiyası yaratmaqla işləyəcək - ştamdan ştamağa çox fərqlənməyən və bir antikor tərəfindən tutulduqda virusu tərk edə bilməz. hüceyrələri yoluxdurur.

HİV ümumiyyətlə bu həssas qorunan yerləri çətin qavranılan şəkərlərin və virus səthinin sürətlə mutasiyaya uğrayan hissələrinin sıx təbəqəsi altında gizlədir. İnfeksiyaya qarşı antikor cavabının çoxu tez mutasiya edən hissələrə qarşı yönəldilmişdir və buna görə də yalnız müvəqqəti təsirlidir.

Yeni tapıntılardan əvvəl elm adamları, virusun qorunan dörd həssas saytına çatmağa qadir olan "geniş şəkildə neytrallaşdıran" antikorların yalnız bir neçə fərqli dəstini müəyyən edə bilmişdilər. Bütün bu yerlər, HİV-in yalnız məruz qalan səth antijeni, viral membrandan cücərən və ev sahibi hüceyrələri tutmaq və nüfuz etmək üçün nəzərdə tutulmuş çiçəyə bənzər zərf (Env) zülalı (gp140) üzərindədir.

Virusun yeni həssas saytının müəyyənləşdirilməsi, IAVI və NAC -ın Afrika, Hindistan, Tayland, Avstraliya, Birləşmiş Krallıq və ABŞ -dakı klinik tədqiqat mərkəzləri ilə əməkdaşlıq etdiyi IAVI Protokolu G -dən alınan qan nümunələrinin testləri ilə başladı. nadir, geniş şəkildə neytrallaşdıran antikorları axtarmaq üçün 1800-dən çox sağlam, HİV pozitiv könüllüdən qan nümunələri. Kiçik bir nümunə seriyasından, həqiqətən də, geniş şəkildə neytrallaşdıran antikorların mövcudluğundan bəhs edən geniş çeşidli HİV izolatlarının test hüceyrələrində infeksiyanı maneə törətdiyi ortaya çıxdı. 2009-cu ildə IAVI, TSRI və Theraclone Sciences alimləri son on ildə görülən İİV-ə qarşı ilk yeni geniş neytrallaşdırıcı antikorları təcrid etməyə və xarakterizə etməyə müvəffəq oldular.

İlk məqalənin əsas müəllifi olan Burton laboratoriyasının tədqiqatçısı Emilia Falkowska və həmkarları tezliklə nümunənin HİV-i zərərsizləşdirən fəaliyyətinin əksəriyyətini təşkil edən bir-biri ilə sıx əlaqəli səkkiz antikor dəstini tapdılar. Elm adamları, bu antikorlar arasında ən geniş iki neytrallaşdırıcının, PGT151 və PGT152, bütün dünyada xəstələrdə tapılan HİV suşlarının böyük bir panelinin təxminən üçdə ikisinin infeksiyasını maneə törədə biləcəyini təyin etdilər.

Maraqlıdır ki, geniş zərərsizləşdirmə qabiliyyətinə baxmayaraq, bu antikorlar Env-də əvvəllər təsvir edilmiş heç bir həssas sahələrə və ya epitoplara bağlanmadı və həqiqətən də Env-in iki protein alt bölməsi olan gp120 və ya gp41-in təmizlənmiş nüsxələrində heç bir yerdə möhkəm bağlana bilmədi. Daha əvvəl təsvir edilən geniş şəkildə neytrallaşdıran HİV antikorları bir və ya digər Env alt birliyinə bağlanır. Tədqiqatçılar, nəticədə, PGT151 və PGT152 -nin yalnız gp120 və ya gp41 -ə deyil, hər ikisinin bitinə bağlandığını təyin etdilər.

Əslində, gp120 və gp41 bir Env strukturunda bir gp120-gp41 kombinasiyası kimi deyil, bir-birinə qarışan üç birləşmə - bioloqların dili ilə desək trimer kimi yığılır. PGT151 və 152 (demək olar ki, eynidir) yalnız bu yetkin və düzgün yığılmış Env trimer quruluşunda meydana gələn bir bağlama sahəsinə sahib olduğu ortaya çıxdı.

"Bunlar, yetkin Env trimerini Env -in bütün digər formalarından birmənalı şəkildə fərqləndirən HİV neytrallaşdıran ilk antikorlardır" dedi Falkowska. "Bu vacibdir, çünki bu, virusun hüceyrələri yoluxdurmaq üçün istifadə etdiyi Env formasıdır."

İki yeni tədqiqatdan ikincisi yeni həssas epitopun ilkin struktur təhlili idi.

PGT151 (Ward laboratoriyasının rəhbərliyi ilə) Eng trimer kompleksində elektron mikroskopiyasını rentgen kristalloqrafiyası ilə (Wilson laboratoriyasının rəhbərliyi ilə) PGT151 Fab quruluşu ilə birləşdirən inteqrativ bir yanaşma istifadə edərək, elm adamları yeri görselleştirebildiler. Env trimerdəki PGT151 seriyası bağlama saytının tərkibinə iki şəkər (glikanlar) ilə bir gp41 zülalında bir ləkə, gp120 zülalında bir yamaq və hətta trimer quruluşundakı bitişik gp41 parçası daxildir. " çox mürəkkəb epitop," TSRI-nin Wilson laboratoriyasında tədqiqat işçisi və aspirant Jeong Hyun Lee ilə birlikdə ikinci məqalənin ilk müəllifi olan IAVI Neytrallaşdırıcı Antikor Mərkəzinin üzvü Klaudia Blattner dedi.

Sürpriz bir tapıntı, PGT151 seriyalı antikorların Env trimerinə onun başqa cür kövrək strukturunu sabitləşdirəcək şəkildə bağlanması idi. "Tipik olaraq, yerli Env trimerini təmizləməyə çalışanda parçalanır və bu da öyrənməyi çox çətinləşdirir" dedi Ward. "Bu, onu stabilləşdirən bir antikor tapmaq üçün əsas bir irəliləyiş idi."

PGT151 saytı bir HİV peyvəndi üçün bir hücum nöqtəsi olaraq dəyərli olsa da, onun kəşfi HİV ilə əlaqədar digər oxşar kompleks və həssas epitopların varlığına da işarə edir.

Yuxarıda adları çəkilən elm adamlarına əlavə olaraq, "Geniş neytrallaşdıran HİV antikorları parçalanmış Zərf trimerlərində gp41-in birləşmədən əvvəlki uyğunlaşmasında yeni qlikandan asılı epitopu müəyyənləşdirir" adlı ilk məqalənin müəllifləri Alejandra Ramos, Jeong Hyun Lee, Chi idi. -Hui Liang və Pascal Poignard, hamısı TSRI və IAVI Neytrallaşdırıcı Anticisim Mərkəzindən Alejandro Ramirez, Rayan McBride, Michael B. Zwick və James C. Paulson TSRI-dən Katie J. Doores King's College London Tibb Məktəbindən Ronald Derking, Marit J. van Akademik Tibb Mərkəzindən Gils və Rogier W. Sanders, Amsterdam Sachin S. Shivatare, Chung-Yi Wu və Chi-Huey Wong Academia Sinica, Taypei, Tayvan Po-Ying Chan-Hui və Theraclone Sciences, Inc.-dən Kristine Swiderek, Seattle Yan Liu və Ten Feizi London İmperator Kolleci Maykl S. Seaman, Beth Israel Deaconess Tibb Mərkəzinin Bostondakı Con P. Moore Cornell Universitetinin Weill Tibb Kolleci və Wayne C. Koff, Nyu Yorkdakı IAVI.

İkinci məqaləyə "Sağlam olmayan HİV-1 Env trimerlərindəki gp41-gp120 interfeysində dördüncü, parçalanmaya bağlı bir epitopun struktur təsviri", Kwinten Sliepen, Ronald Derking, Alba Torrents de la Pe ña, Marit van daxildir. Akademik Tibb Mərkəzindən Gils və Rogier W. Sanders, Amsterdam Albert Cupo və Cornell Universitetinin Weill Tibb Kollecindən John P. Moore Jean-Philippe Julien və TSRI və IAVI Neytrallaşdırıcı Anticisim Mərkəzindən Paskal Poignard və Wenjie Peng və James C. Paulson TSRI.

İlk tədqiqatın maliyyələşdirilməsi IAVI Milli Sağlamlıq İnstitutundan (qrant AI33232, HIVRAD P01 AI82362) NIH tərəfindən maliyyələşdirilən HİV/AİDS Peyvəndi İmmunologiyası və İmmunogen Kəşf Mərkəzi (CHAVI-ID) (qrant UM1AI100663) Massachusetts Ragon İnstitutundan gəldi. Hospital, MIT və Harvard və Aids Fonds Netherlands (qrantlar #2011032, #2012041).

İkinci araşdırmanın maliyyələşdirilməsi IAVI, CHAVI-ID (UM1 AI100663) NIH (P30AI036214, HIVRAD P01 AI082362 və R01 AI084817) Kaliforniya Universiteti, San Diego QİÇS Araşdırma Mərkəzi Kaliforniya HİV/AİDS Tədqiqat Proqramı Fondları Hollandiya ( qrant #2011032) Hollandiya Elmi Tədqiqatlar Təşkilatı Avropa Tədqiqat Şurası və Alman Akademik Mübadilə Xidməti.

IAVI -nın bu işi maliyyələşdirməsi qismən Amerika Birləşmiş Ştatlarının Beynəlxalq İnkişaf Agentliyindən (USAID) qaynaqlandı. USAID dünyanın 120-dən çox ölkəsində iqtisadi və humanitar yardım göstərən xarici yardım proqramını idarə edir.

Scripps Araşdırma İnstitutu haqqında

Scripps Tədqiqat İnstitutu (TSRI) biotibbi elmlərdə tədqiqata diqqət yetirən dünyanın ən böyük müstəqil, qeyri-kommersiya təşkilatlarından biridir. TSRI, xərçəng, romatoid artrit, hemofiliya və digər xəstəliklər üçün yeni müalicələrin təməlinin qoyulmasında rolu da daxil olmaqla elm və sağlamlığa verdiyi töhfələrlə beynəlxalq səviyyədə tanınır. 1924-cü ildə xeyriyyəçi Ellen Browning Scripps tərəfindən qurulan Scripps Metabolic Clinic-dən inkişaf edən bir institut, hazırda La Jolla, CA və Yupiter, FL-dəki kampuslarında təxminən 3 min adam çalışır, üç Nobel mükafatı laureatı da daxil olmaqla -Növbəti kəşflərinə doğru çalışın. Biologiya və kimya elmləri namizədi dərəcələri verən institutun magistr proqramı, ölkədəki ən yaxşı onluğa daxildir. Ətraflı məlumat üçün http://www. skripps. edu

Beynəlxalq QİÇS Peyvənd Təşəbbüsü (IAVI), missiyası bütün dünyada istifadə üçün təhlükəsiz, təsirli, əlçatan, profilaktik HİV peyvəndlərinin hazırlanmasını təmin etmək olan qlobal bir kommersiya təşkilatıdır. 1996 -cı ildə qurulan IAVI, 25 ölkədə özəl şirkətlər, akademiklər və vətəndaş cəmiyyəti ortaqları ilə birlikdə QİÇS peyvəndi namizədlərini araşdırmaq, dizayn etmək və inkişaf etdirmək üçün çalışır. Bundan əlavə, IAVI siyasət təhlilləri aparır və AİDS peyvəndi sahəsində bir müdafiəçi kimi xidmət edir. IAVI, HİV və AİDS-ə qarşı mübarizədə HİV-in qarşısının alınması üçün yeni vasitələrin dizaynı və inkişafına yönəldilmiş investisiyalarla mövcud HİV-in qarşısının alınması və müalicə proqramlarının genişləndirilməsini və gücləndirilməsini balanslaşdıran kompleks yanaşmanı dəstəkləyir. IAVI gələcək QİÇS peyvəndinin mövcud olmasını və ehtiyacı olan hər kəs üçün əlçatan olmasını təmin etməyə həsr olunub.

IAVI -nın işi bir çox donorların səxavətli dəstəyi ilə mümkün oldu: Bill & Melinda Gates Vəqfi Danimarka Xarici İşlər Nazirliyi İrlandiya Yardımı Yaponiya Maliyyə Nazirliyi Hollandiya Xarici İşlər Nazirliyi Norveç İnkişaf Əməkdaşlıq Agentliyi (NORAD) ) Birləşmiş Krallıq Beynəlxalq İnkişaf Departamenti (DFID) və ABŞ Beynəlxalq İnkişaf Agentliyi (USAID). IAVI donorlarının tam siyahısı http://www. iavi. təşkilat. Bu tədqiqatlar qismən Amerika xalqının USAID vasitəsilə verdiyi səxavətli dəstək sayəsində mümkün oldu. Məzmun müəlliflərin məsuliyyətindədir və mütləq USAID və ya Amerika Birləşmiş Ştatları Hökumətinin fikirlərini əks etdirmir.

İmtina: AAAS və EurekAlert! EurekAlert -də yayımlanan xəbərlərin düzgünlüyünə görə məsuliyyət daşımır! təşkilatlara töhfə verməklə və ya EurekAlert sistemi vasitəsilə hər hansı bir məlumatdan istifadə etməklə.


Bir baxışda

Rh qan qrupunun antigenləri

Antigenlərin sayı 49: D, C, E, c və e ən əhəmiyyətlilərindəndir
Antigen spesifikliyi Zülal
Amin turşularının ardıcıllığı əksər Rh antijenlərinin spesifikliyini müəyyən edir.
Antigen daşıyan molekullar Bilinməyən funksiyası olan zülallar
RhD və RhCE zülalları, RBC membranının ayrılmaz hissəsi olan transmembran, çox keçidli zülallardır. RhCE zülalı C/c antigenini (2 -ci hüceyrədaxili döngədə) və E/e antijenini (4 -cü hüceyrədaxili döngədə), üstəgəl bir çox digər Rh antijenini, məsələn, C w, C x kodlaşdırır.
Əksər hüceyrə səthi molekullarından fərqli olaraq, Rh zülalları glikozilləşdirilməmişdir (tərkibində oliqosakkaridlər yoxdur), lakin RhAG adlı RBC membran glikoproteini ilə yaxından əlaqəlidirlər. Rh-RhAG kompleksinin funksiyası ammonium və ya karbon qazının daşınmasını əhatə edə bilər. RhD zülalı D antigenini kodlayır.
Molekulyar əsas RHD və RHCE adlı iki gen Rh antijenini kodlaşdırır.
Rh genləri 97% eynidir və onlar 1-ci xromosomda bir-birinin yanında yerləşir. D/d polimorfizmi ən çox bütün RHD geninin silinməsindən yaranır. C/c polimorfizmi, dörd amin turşusu dəyişikliyinə səbəb olan dörd SNP -dən yaranır, onlardan biri (S103P) C və ya c antigen spesifikliyini təyin edir. E/e polimorfizmi tək amin turşusu dəyişikliyinə (A226P) səbəb olan tək SNP-dən (676G𡤬) yaranır.
Rh antigenlərinin tezliyiD: 85% qafqazlılar, 92% qaralar, 99% asiyalılar
C: 68% Qafqazlılar, 27% Zəncilər, 93% Asiyalılar
E.: 29% Qafqazlılar, 22% Zəncilər, 39% Asiyalılar
c: 80% qafqazlılar, 96% qaralar, 47% asiyalılar
e: 98% qafqazlılar, 98% qaralar, 96% asiyalılar (1)
Rh fenotiplərinin tezliyiRh haplotipi DCe: ən çox Qafqazlılar (42%), Yerli Amerikalılar (44%) və Asiyalılarda (70%)
Rh haplotip Dce: ən çox qaradərililərdə (44%)
Rh D-mənfi fenotip: ən çox qafqazlılarda (15%), qaralarda daha az rast gəlinir (8%) və nadir hallarda asiyalılarda (1%) (1)

Rh antigenlərinə qarşı istehsal olunan antikorlar

Antikor növü Əsasən IgG, bəzi IgM
Rh antikorlarının əksəriyyəti IgG tiplidir.
Antikor reaktivliyi Hemoliz qabiliyyəti
Rh antikorları nadir hallarda komplementi aktivləşdirir. Eritrositlərə bağlanır və dalaqda məhv olmaq üçün qeyd edirlər (damardaxili hemoliz).
Transfuziya reaksiyası Bəli, adətən gecikmiş hemolitik transfuziya reaksiyaları
Anti-D, anti-C, anti-e və anti-c ağır hemolitik transfuziya reaksiyalarına səbəb ola bilər. Hemoliz adətən ekstravaskulyar olur (1).
Yenidoğanın hemolitik xəstəliyi Bəli — HDN -in ən çox yayılmış səbəbi.
D antijeni ana alloimmunizasyonunun 50% -ni təşkil edir (2).
Anti-D və anti-c ciddi xəstəliklərə səbəb ola bilər.
Anti-C, anti-E və anti-e yüngül və orta dərəcədə xəstəliyə səbəb ola bilər.

T Hüceyrə Reseptorları Antikor Heterodimerlerdir

T hüceyrə reaksiyaları bir antigen təqdim edən hüceyrə və ya bir hədəf hüceyrə ilə birbaşa təmasa bağlı olduğundan, T hüceyrələri tərəfindən hazırlanan antigen reseptorları, B hüceyrələri tərəfindən hazırlanan antikorlardan fərqli olaraq, yalnız membrana bağlı formada mövcuddur və ifraz olunmur. Bu səbəbdən T hüceyrə reseptorlarını təcrid etmək çətin idi və ilk dəfə biokimyəvi olaraq 1980 -ci illərdə təsbit edildi. Həm sitotoksik, həm də köməkçi T hüceyrələrində reseptorlar antikorlara bənzəyir. Onlar iki disulfidlə əlaqəli polipeptid zəncirindən (α və β adlanır) ibarətdir ki, bunların hər biri iki Ig-bənzər domendən, biri dəyişən və bir sabitdən ibarətdir (Şəkil 24-42A). Üstəlik, T hüceyrə reseptorunun hüceyrədənkənar hissəsinin üçölçülü quruluşu rentgen şüalarının difraksiyası ilə müəyyən edilmişdir və o, Y şəkilli antikor molekulunun bir qoluna çox bənzəyir (Şəkil 24-42B).

Şəkil 24-42

T hüceyrə reseptorunun heterodimeri. (A) Reseptorun α və β polipeptid zəncirindən ibarət olduğunu göstərən sxematik rəsm. Hər bir zəncir təxminən 280 amin turşusu uzunluğundadır və iki Ig-ə bənzər domenlərə bükülmüş böyük hüceyrədənkənar hissəyə malikdir (daha çox. )

α və β zəncirlərini kodlayan gen seqmentlərinin hovuzları müxtəlif xromosomlarda yerləşir. Antikor ağır zəncirli hovuzlar kimi, T hüceyrə reseptor hovuzları da ayrıdır V, D,J timusda T hüceyrələrinin inkişafı zamanı sitenin spesifik rekombinasiyası ilə bir araya gətirilən gen seqmentləri. Bir istisna olmaqla, B hüceyrələrinin antikor müxtəlifliyi yaratmaq üçün istifadə etdiyi bütün mexanizmlər də T hüceyrələri tərəfindən T hüceyrə reseptorlarının müxtəlifliyini yaratmaq üçün istifadə olunur. Həqiqətən də eyni V (D) J. rekombinaz, əvvəllər müzakirə edilən RAG zülalları da daxil olmaqla istifadə olunur. T hüceyrə reseptorlarının şaxələndirilməsində işləməyən mexanizm antigenlə idarə olunan somatik hipermutasiyadır. Beləliklə, reseptorların yaxınlığı aşağı olaraq qalır (Ka

10 5 -10 7 litr/mole), hətta immun cavabında gec. Müxtəlif ko-reseptorların və hüceyrə hüceyrələrinin yapışma mexanizmlərinin T hüceyrəsinin antigen təqdim edən bir hüceyrəyə və ya hədəf hüceyrəyə bağlanmasını necə gücləndirdiyini və T hüceyrə reseptorlarının aşağı yaxınlığını kompensasiya etməyə kömək etdiyini daha sonra müzakirə edirik.

T hüceyrələrinin kiçik bir azlığı, α və β zəncirləri etmək əvəzinə, γ və δ zəncirlərindən ibarət fərqli, lakin əlaqəli bir reseptor heterodimeri yaradır. Bu hüceyrələr inkişafın erkən dövründə yaranır və əsasən epiteliyada (məsələn, dəri və bağırsaqda) olur. Onların funksiyaları qeyri -müəyyəndir və onları daha ətraflı müzakirə etməyəcəyik.

B hüceyrələrindəki antigen reseptorlarında olduğu kimi, T hüceyrə reseptorları da bir antigenlə aktivləşdirilmiş reseptordan hüceyrənin içərisinə siqnalın ötürülməsində iştirak edən bir sıra dəyişməz membrana bağlı zülallarla plazma membranında sıx birləşirlər. Bu zülalları daha sonra daha ətraflı müzakirə edəcəyik. Ancaq əvvəlcə sitotoksik və köməkçi T hüceyrələrinin necə fəaliyyət göstərdiyini və yad antigeni tanımasının xüsusi üsullarını nəzərdən keçirməliyik.


SARS-CoV-2 əleyhinə Monoklonal Antikorlar istehsal edən Enzolytics, Inc (ENZC) Biotech üzərində Güclü Çalışma

Enzolytics, Inc (ENZC), cümə axşamı günü .25 işarəsinin altındakı qısa bir düşmədən bəri gündəlik 10 milyonlarla dollar həcmində güclü bir dalğalanma cədvəllərini yüksəldir. ENZC əsas liqa yarışçısıdır və son bir neçə ay ərzində ENZC, BioClonetics və Enzolytics arasında tarixi birləşməni başa vurduğu üçün 0,958 səhm üzrə əfsanəvi bir nəticə əldə etdi. monoklonal antikorlar hazırda COVID-19-un müalicəsi üçün anti-SARS-CoV-2 (CoronaVirus) monoklonal antikorları istehsal etmək üçün istifadə olunur.

Koronavirus peyvəndlərinin elm adamlarının gözlədiyi virusun yeni kəşf edilmiş variantına qarşı təsirli olmadığı getdikcə daha aydın görünür. Koronavirus pandemiyasının inkişafının hər günü ilə çoxlu aktiv terapevtiklərə ciddi ehtiyac daha aydın olur. ENZC, COVID-19 müalicəsi üçün monoklonal antikorların istifadəsində qabaqcıllardan biridir. Bu yaxınlarda ENZC, hədəflənmiş anti-SARS-CoV-2 monoklonal anticisimləri istehsal etdiyi Koronavirusda on bir qorunmuş, gözlənilən dəyişməz sayt (epitoplar) müəyyən etdi. Kompüter analizindən (Süni İntellekt [AI]) istifadə edərək, Şirkətin genetik və molekulyar biologiya məlumat elmi qrupu hazırda məlum olan 50,512-dən çox Koronavirus təcridini yoxlayıb və gözlənilən dəyişilməz olan qorunan saytları müəyyən edib. Kurasiya edilən virus təcridləri üzərində müəyyən edilmiş 11 konservləşdirilmiş ardıcıllıq təhlil edilən 50,512 Koronavirus izolyatının bütünlükdə 98,71%-dən 99,29%-ə qədər konservasiya edilmiş olması əsasında müəyyən edilmişdir. Şirkət bu kəşfləri əhatə edən hərtərəfli patent müraciəti təqdim etmişdir.

Enzolytics, zəifləyici yoluxucu xəstəliklərin müalicəsi üçün öz zülallarının kommersiyalaşdırılmasına sadiq olan bir dərman inkişaf etdirən şirkətdir. ENZC sürətlə əqli mülkiyyət portfelini qurur və keçən il çoxsaylı patentlər təqdim edir. Ən son olaraq, keçən ay Şirkət, ABŞ Patent Bürosundan "Məməlilərin Onurğa Kordunun İmmun Faktorundan İzole Edilmiş Nüvə Proteinləri - Müalicə üçün Əczaçılıq Kompozisiyası" üçün patent ərizəsinin verilməsini təsdiq edən rəsmi sənəd qəbzini aldığını bildirdi. O vaxtdan bəri ENZC bir sıra yeni müraciətlər etdi. Şirkət yaxınlarda Enzolytics a Dallas və College Station, Texas biyoteknoloji şirkətinin yoluxucu xəstəliklərə qarşı tam insan monoklonal antikorları (mAbs) istehsal etmək üçün mülkiyyət texnologiyasına sahib olan tamamilə sahibi olan BioClonetics Immunotherapeutics, Inc ilə birləşdi.

Microcapdaily bu barədə xəbər verir ENZC BioColnetics əvvəldən birləşir Bu yaxınlarda bildirmişdir: “ Enzolytics Inc. ENZC: son vaxtlar səhm başına .50-ni keçən və müntəzəm olaraq gündə 25 milyon ABŞ dollarını aşan ENZC kiçik hərflərlə böyük liqa qaçışçısına çevrildi. Enzolytics və onun yeni törəmə şirkəti BioClonetics, HİV/AİDS müalicəsi üçün 2025 -ci ilə qədər 30 milyard dollar dəyərində olması gözlənilən bir bazarın geri dönməz Pepsin Fraksiyonu peptid molekulunun lisenziyalaşdırma hüquqlarına malikdir. lakin yoluxucu xəstəliklərin müalicəsi, HİV və Koronavirusu hədəf alan tamamlayıcı terapiya platformaları. Enzolytics, arxasında böyük bir liqa səviyyəli idarəetmə qrupu cəlb etdi və həm HİV əleyhinə, həm də covid-19 əleyhinə əlavə monoklonal antikorlar istehsal edən Klinik Araşdırmalar İnstitutunun Texas A & ampM Universitetinin kampusundakı laboratoriya imkanlarını genişləndirdi. Bu genişlənmə Enzolytics -in həm HİV virusuna, həm də koronavirusa qarşı monoklonal antikorların istehsalını başa çatdırmasına və kampusdakı biofarma mütəxəssisləri ilə əməkdaşlıq etməsinə imkan verir. Microcapdaily, birləşmə məqaləmizdə elan edildikdən bir gün sonra ENZC haqqında ilk dəfə məlumat verdi: "BioClonetics LOI Sparks Enzolytics Inc (OTCMKTS: ENZC)" Sentyabrın 16 -da ENZC .01 -dən aşağı qiymətə ticarət edildikdə.

Enzolytics, bura gəlməsi üçün böyük şeylərdən bəhs edən bir güc evi qrupunu tez bir zamanda özünə cəlb etdi. Onlar bu yaxınlarda Tibb Məsləhət Şurasına Ronald Moss, M.D.-ni təyin etdilər. Cənab Moss son 25 il ərzində çoxsaylı biotexnologiyalar üzrə rəhbər vəzifələrdə çalışıb. IND və NDA təcrübəsi də daxil olmaqla, Mərhələ I, II və III klinik sınaqlarda proqramlara rəhbərlik etməkdə geniş klinik və tənzimləyici idarəetmə təcrübəsinə malikdir. Şirkətin baş elmi işçisi cənab Henry Zhabilov, müalicəvi zülallardan istifadə edərək bir neçə klinik sınağı idarə etmişdir. O, HİV və xərçəngin immunoterapiyası ilə əlaqədar bir neçə ABŞ patentinin və şirkətin IPF platformasına əsaslanan bir immunitet gücləndiricinin ixtiraçısıdır.

ENZC -də daxili çömçəni öyrənmək üçün E -poçtunuzu aşağıdakı qutuya daxil edərək Microcapdaily.com -a Abunə Olun.

Yeni birləşən şirkətlərə, karyerası ərzində 200-dən çox patent iddiası qaldıran və Federal Məhkəmələrdə və ABŞ Patentində mühakimə olunan bir çox əlamətdar patent mübahisələrində baş məsləhətçi vəzifəsini icra edən tanınmış bir əqli mülkiyyət vəkili olan CEO və çoxlu səhmdar Charles S. Cotropia rəhbərlik edir. və Ticarət Nişanı İdarəsi. Cənab Cotropia, BioCLonetics'i bir çox yoluxucu xəstəliklərə qarşı insan antikorları istehsal edən insan hüceyrə xətləri yaratmaq üçün BioCLonetics mülkiyyət üsuluna öncülük edən qardaşı Dr. Joseph Cotropia ilə birlikdə qurdu. Bir hüceyrə (CLONE 3 kimi təyin olunur) bir çox testlərdə və 5 Müstəqil tədqiqatda İİV virusunu bütün dünyada məlum olan növlərin 98%-də zərərsizləşdirmək üçün nümayiş etdirilmişdir.

Bir neçə həftə əvvəl Şirkət 50%-nin sahibi olduğu Bolqarıstan Məhdud Məsuliyyətli Cəmiyyətini Beynəlxalq Tibbi Tərəfdaşlar (“IMPL”) yaratmaq üçün Əsas Nizamnaməni icra etdi. Şirkətin IMBL -dəki tərəfdaşları, Avropa Tibb Agentliyi (“EMA ”) standartlarına uyğun olaraq Klinik sınaqların xərclərini və Şirkət üçün EMA icazəsi üçün müraciət xərclərini maliyyələşdirəcək bir qrup uğurlu Bolqarıstan iş adamıdır. HİV müalicəsi üçün ITV-1 patentli terapevtiklər. EMA ilə Amerika Birləşmiş Ştatları Federal Narkotik İdarəsi (“FDA ”) arasındakı Qarşılıqlı Tanınma Sazişinə (“MRA ”) əsasən, şirkət ITV-1 birləşməsi üçün EMA icazəsinin verilməsinin ENZC və FDA tərəfindən tanınması üçün #8217s müalicəsi. IMBL, EMA standartlarına uyğun olaraq tələb oluna bilən klinik sınaqlara başlamaq üçün Klinika Dizaynını cəlb etmək üçün danışıqlara başladı. Şirkət, lisenziyalı və patentli müalicələrinin bütün mövcud və hələ də kəşf edilməmiş imkanlarını kommersiyalaşdırmaq səylərini davam etdirdikcə, IMBL -in əlavə edilməsi və EMA icazəsi almağın faydaları, ENZC və səhmdarları üçün potensial dəyər artımı.

Şirkətin cari və əvvəlki ilin Maliyyə Hesabatlarının Auditləri davam edir və Auditdən keçmiş Hesabatlar dərc edildikdən sonra OTCQB üçün ərizə təqdim etmək üçün hazırlanır. Şirkət, iki illik yoxlamanı ən qısa müddətdə tamamlamağı planlaşdırır, lakin OTC Markets Pink Əsas Açıqlama Təlimatlarına uyğun olaraq 31 dekabr 2021 İllik Hesabat Maliyyə Hesabatlarını təqdim edəcək. Şirkət 31 Dekabr 2020-ci il üçün Əsas Açıqlama Təlimatlarına uyğun olaraq maliyyə hesabatlarının təqdim edilməsinin 31 Mart 2021-ci il tarixinə qədər olan son həftələrdə təqdim edilməsini gözləyir.

Bu yaxınlarda ENZC, hədəflənmiş anti-SARS-CoV-2 monoklonal antikorları istehsal etdiyi Koronavirusda on bir qorunmuş, gözlənilən dəyişməz sayt (epitoplar) müəyyən etdi. Kompüter analizindən (Süni Zəka [AI]) istifadə edərək, şirkətin genetik və molekulyar biologiya məlumat elmləri qrupu, hazırda məlum olan 50,512 -dən çox Coronavirus izolatını araşdırdı və gözlənilən dəyişilməz olan qorunan saytları təyin etdi. Müalicə olunan virus izolatlarında müəyyən edilmiş 11 konservləşdirilmiş ardıcıllıq, təhlil edilən 50,512 Coronavirus izolatının hamısında 98,71% -dən 99,29% -ə qədər saxlanılması əsasında müəyyən edilmişdir.

ENZC bu kəşfləri əhatə edən hərtərəfli patent müraciəti etdi. Bu ilkin ərizə ABŞ -da verilmişdir və 153 ölkənin üzv olduğu Beynəlxalq Patent Əməkdaşlığı Müqaviləsi (PCT) vasitəsi ilə beynəlxalq patent təminatı tələb etmək üçün uzadılacaqdır. Axtarılan patent əhatə dairəsinə kəşf edilmiş epitop/antijenlər, peyvənd iddiaları, antikor iddiaları və epitop/antijenlərlə əlaqəli profilaktik/terapevtik üsul iddiaları üzrə patent iddiaları daxildir.

Before completing the Artificial Intelligence analysis of the 50,512 SARS-CoV-2 isolates to identify conserved epitopes, the Company’s scientists predicted a specific target epitope that is correlative in structure to the site on the HIV virus to which the Company has produced a monoclonal antibody that has been shown to neutralize the HIV virus. The prediction was that this site would be conserved as is the correlative site on the HIV virus. The AI analysis of the 50,512 SARS-CoV-2 isolates identified this predicted site on the virus as 99% conserved across all 50,512 isolates. This primary site on the SARS-CoV-2 virus has also been confirmed as existing (100%) in the U.S. SARS-CoV-2 virus and the virus variants which have surfaced in United Kingdom, Brazil and South Africa, which are now in the U.S. This epitope on the SARS-Cov-2 virus is included in the first being targeted by the Company in its production of epitope specific monoclonal antibodies. The Company’s focus is on producing monoclonal antibodies that target immutable sites to avoid “virus escape”.

In addition to patenting Company’s findings of conserved sites on the SARS-CoV-2 (Coronavirus), the Company is also filing patent applications covering the conserved sites on the HIV virus. Filings will be made in the U.S. Patent Office and then extended for international coverage through the PCT covering 153 countries.

As the Company has previously reported, it is also curating (analyzing) the amino acid sequences of other major viruses and will file patent applications claiming the identified antigens/epitopes and associated therapeutics. Using AI analysis, the Company is now identifying and will claim the conserved epitopes/antigens on the infectious diseases caused by HIV-2, Influenza A and B, H1N1 influenza, Respiratory syncytial virus (RSV), Small-Pox, Ebola Virus, Tetanus, Diphtheria, HTLV-1/2, Rabies, Herpes zoster, Varicella zoster, Anthrax, Mason-Pfizer monkey virus (MPMV), Visna virus (VISNA) and mouse mammary tumor virus (MMTV). Patent applications will be filed claiming the inventive findings. Patent claims will cover the discovered epitope/antigens, with proposed vaccine claims, antibody claims, and related prophylactic/therapeutic method claims relating to these identified epitope/antigens.

For more on ENZC Subscribe Right Now!

Enzolytics , Inc. (ENZC) is rocketing up the charts on a powerful surge of 10s of millions of dollar volume daily since a brief dip below the .25 mark on Thursday. ENZC is a major league runner and powerhouse stock over the past few months ENZC has seen a legendary run to recent highs of 0.958 per share as it completes the historic merger between BioClonetics and Enzolytics the new biotech is getting noticed as its technology for producing fully human monoclonal antibodies is currently being employed to produce anti-SARS-CoV-2 ( CoronaVirus ) monoclonal antibodies for treating COVID-19. It is becoming increasingly evident that Coronavirus vaccines are not as effective against newly discovered variant of the virus as scientists had hoped. With each day of progression of the Coronavirus pandemic, the dire need for multiple active therapeutics becomes more evident. ENZC is a pioneer in using monoclonal antibodies for treating COVID-19. Recently ENZC has identified eleven conserved, expectedly immutable sites (epitopes) on the Coronavirus against which it is producing targeted anti-SARS-CoV-2 monoclonal antibodies. Using computer analysis (Artificial Intelligence [AI]), the Company’s genetics and molecular biology data science team has now screened more than 50,512 Coronavirus isolates currently known and has identified conserved sites which expectedly are immutable. The 11 conserved sequences identified on the virus isolates curated have been identified on the basis that they are 98.71% to 99.29% conserved over the entirety of the 50,512 Coronavirus isolates analyzed. The Company has filed a comprehensive patent application covering these discoveries. Since a brief dip Investors are looking for a powerhouse move back to recent highs a break over .91 and its an all-out blue-sky breakout We will be updating on ENZC when more details emerge so make sure you are subscribed to Microcapdaily so you know what’s going on with ENZC.


Aşkarlama

Aşkarlama is typically achieved using one of two methods: (a) colorimetric or enzyme-mediated detection and (b) fluorescence-based detection.

İçində colorimetric method, the bound primary or secondary antibody is conjugated to a substrate which yields a precipitating product when converted by an enzyme. This precipitate is visible as colored staining when viewed by light microscopy.

İçində fluorescence-based detection method, antibody bound to the antigen of interest in the tissue is directly or indirectly conjugated to a fluorophore (also sometimes called a fluorochrome), a molecule that fluoresces in the presence of light of a specific wavelength.


Vaccine Ingredients

Injecting something into your body can be concerning for some, especially when you're unsure of what's inside the needle. We're here to take the mystery out of a vaccine's ingredients.

A vaccine contains a part of a germ (bacteria or virus) that is called an antigen. The antigen has already been killed or disabled before it's used to make the vaccine, so it can't make you sick. Antigens are substances, often a protein, that stimulate the body to produce an immune response to protect itself against attacks from future actual disease exposure. In addition, vaccines contain other ingredients that make them safer and more effective, including preservatives, adjuvants, additives and residuals of the vaccine production process. Because specific ingredients are necessary to make a vaccine, even though they are eventually removed, trace amounts can still remain. These residuals can include small amounts of antibiotics and egg or yeast protein. The American Academy of Pediatrics also provides a good explanation about what's inside the vaccine needle.

If you're a parent concerned that your child may be exposed to too many antigens, there's no need to worry: Today's vaccines contain far less antigens than in the past, thanks to advances in biomedical science. Additionally, children's bodies are well equipped to handle many antigens at the same time. A healthy baby can accommodate multiple vaccinations because vaccines, and the antigens they contain are designed for babies' immune systems. In fact, babies can handle significantly more antigens than those that are found in vaccines.

A few years ago, much attention was placed on thimerosal, an organic form of mercury (also called ethylmercury) that prevents vaccines from being contaminated. This form of mercury is different from methylmercury, which can damage the nervous system. Although thimerosal has been shown to be safe, now all routine childhood vaccines are produced in thimerosal-free form. This includes the flu vaccine.


How are Antibodies Produced?

How are Antibodies Produced?
Although detailed mechanics of the immune response are beyond the scope of this site, it is useful, in the context of developing a custom antibody, to have an overview of how antibodies are produced by the immune system.

When an organism’s immune system encounters a foreign molecule (typically a protein) for the first time, specialized cells such as macrophages and dendritic cells capture the molecule and begin breaking it down so that it can present these antigens to B cell lymphocytes.

Once Antigen Presentation to the B cell lymphocytes has occurred, a process known as Somatic Hypermutation allows the B cell to begin coding for a new antibody that will contain a unique Antigen Binding Site in the variable region that is capable of binding specifically to an epitope from the antigen.

Each B cell lymphocyte produces one unique antibody against one unique epitope.

Once antibodies with sufficient specificity to the epitope can be encoded, the B cell begins to release antibodies into the bloodstream. These antibodies then bind specifically with the foreign molecule and allow the immune system to eliminate the molecule from the system.

In some cases, these antibodies can disable pathogens such as viruses directly due to the binding action. In other cases, such as with bacterial pathogens, these antibodies bind to surface proteins on the bacterium’s surface, thereby signaling to the rest of the immune system that the pathogen should be destroyed.

After the foreign molecule has been eliminated, B cells remain in the bloodstream ready to produce antibodies if the antigen is encountered again.

From the perspective of developing a custom antibody against a protein antigen, the immune system captures the protein, breaks it down into individual epitopes and presents these epitopes to the B cells so that development of antibodies specific to those epitopes can begin. These antibodies can then be collected directly in the serum or by isolating the individual B cells that produce antibody against the epitope of interest. With a full-length protein antigen, there will typically be multiple B cells generating antibodies against multiple epitopes from different regions of the protein.


2. MATERIALS AND METHODS

2.1. Sequence alignment of 66 epitopes in IEDB database to SARS𠄌oV𠄂 spike protein

We downloaded the spike protein amino acid sequence of SARS𠄌oV𠄂 isolate Wuhan‐Hu𠄁 from GenBank (GenBank ID: <"type":"entrez-protein","attrs":<"text":"QHD43416.1","term_id":"1791269090","term_text":"QHD43416.1">> QHD43416.1). The sequences of the 66 epitopes containing pentapeptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were from Lucchese G's report and checked in the IEDB database. 4 Then, the sequences of these epitopes were aligned with the amino acid sequence of SARS𠄌oV𠄂 spike protein to obtain 66 peptides at the corresponding sequence position of SARS𠄌oV𠄂 spike protein, which might be candidate epitopes of a vaccine.

2.2. Detection of nonsynonymous mutation sites of SARS𠄌oV𠄂 spike protein

As nonsynonymous mutation sites in the viral amino acid sequence may affect the recognition of vaccine antigens, vaccine candidate antigens are generally more inclined to choose conservative sequences. 7 , 8 Therefore, the inclusion of mutation sites in candidate epitopes of SARS𠄌oV𠄂 should be avoided as much as possible. We searched the 2019 Novel Coronavirus Resource (2019nCoVR, https://bigd.big.ac.cn/ncov) from the China National Center for Bioinformation (CNCB) to obtain high‐quality genomic data of SARS𠄌oV𠄂 clinical isolates. A total of 1218 isolates from 34 countries around the world sampled from June 1, 2020 to June 30, 2020 were selected for analysis. The detailed countries are shown in Table S1. We focused on counting nonsynonymous mutations that cause amino acid changes in spike protein single‐nucleotide polymorphism (SNPs). The amino acid sites with nonsynonymous mutations that appeared twice or more in 1218 isolates were considered to be easily mutated. The obtained 66 peptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were checked for the presence of the easily mutated amino acid sites, and peptides containing the easily mutated sites should be noted in subsequent screening.

2.3. Screening candidate vaccine epitopes in spike protein

The immune protective antigens in the peptides of SARS𠄌oV𠄂 spike protein were predicted using immunoinformatics tool Vaxijen v2.0, 9 the toxic peptides were predicted using ToxinPred 10 and the allergenic peptides were predicted using AllergenFP v.1.0. 11 The ability of the epitopes to induce interferon‐γ (IFN‐γ), interleukin𠄄 (IL𠄄), and IL� secretion was predicted using IFNepitope, 12 IL4Pred, 13 and IL�Pred, 14 respectively. The peptides with nonantigenic protection, toxicity, or allergenicity were removed, and the remaining peptides were used as antigen epitopes for subsequent screening. The solvent accessibility of each amino acid of spike protein (template 6xr8.1 15 ) was predicted by SWISS‐MODEL 16 to screen the epitopes that were more likely to be exposed on the surface of the spike protein. ABCpred 17 and IEDB Bepipred Linear Epitope Prediction 2.0 18 were used to predict B�ll epitopes. NetMHC 4.0 Sever, 19 Rankpep, 20 ਊnd SYFPEITHI 21 were used to predict T�ll epitopes and HLA molecules. As different HLA types are expressed at dramatically different frequencies in different ethnicities, 22 after obtaining the results of HLA class I and class II molecules recognized by these epitopes, we predicted the coverage rate of each epitope in different populations using Population Coverage in IEDB Analysis Resource. 22 Although some epitopes contained easily mutated sites, some of them might be strong neutralizing epitopes which might induce strong protections and should also be considered in vaccine design. Therefore, according to the above analysis, the selected vaccine candidate epitopes for SARS𠄌oV𠄂 were predicted to be relatively conservative, immunoprotective, nontoxic, and nonallergenic,ਊnd਌ould promote the secretion of cytokines and more likely to be exposed on the surface of the spike protein. They were both B‐ and T�ll epitopes, which could identify a certain number of HLA molecules and had high coverage rates in different populations.

2.4. Acquisition, analysis, and screening of vaccine candidate sequences

The selected vaccine candidate epitopes were connected by different linkers (no linker, GGGGS, GGGSGGG, EAAAK, GPGPG, AAY, and KK, respectively) to obtain vaccine candidate sequences. Bioinformatics tools were used to analyze and screen the vaccine candidate sequences. PredictProtein was used to predict the amino acid composition, secondary structure composition, solvent accessibility, and gene ontology terms of the candidate sequences. 23 The flexibility and antigenic index of the candidate sequences were predicted using DNAStar software. 24 Expasy ProtParam tool was used to predict the half‐life and stability of the candidate proteins. 25 Finally, through a comprehensive analysis, the best candidate vaccine sequences were selected and will be prepared into vaccines and their immune effects verfied through animal experiments.


NIH Scientists Identify Atomic Structure of Novel Coronavirus Protein

The atomic-level structure of the SARS-CoV-2 spike protein in its prefusion conformation. The receptor binding domain, the part of the spike that binds to the host cell, is colored green.

The atomic-level structure of the SARS-CoV-2 spike protein in its prefusion conformation. The receptor binding domain, the part of the spike that binds to the host cell, is colored green.

NIAID scientists working with investigators from the University of Texas at Austin (UT) identified the atomic structure of an important protein on the surface of the novel coronavirus (SARS-CoV-2, formerly called 2019-nCoV). The findings appear in the peer-reviewed journal Elm. The authors note that the findings will aid in the design of candidate vaccines and the development of treatments for COVID-19, the disease caused by the new virus, which was first identified in China in December 2019.

Like other coronaviruses, SARS-CoV-2 particles are spherical and have mushroom-shaped proteins called spikes protruding from their surface, giving the particles a crown-like appearance. The spike binds and fuses to human cells, allowing the virus to gain entry. However, coronavirus infection can be prevented or slowed if this process is disrupted.

Scientists in China shared the genome of a SARS-CoV-2 virus isolate to a global database, which NIAID and UT experts used to start their work determining the spike structure. The spike undergoes a massive rearrangement as it fuses the virus and cell membranes. The researchers confirmed that the original spike stabilized in its prefusion conformation is more likely to preserve targets for infection-blocking antibodies induced by a vaccine.

Importantly, the new data supports NIAID’s approach to a gene-based vaccine for COVID-19 and will also be useful in other vaccine approaches including protein-based vaccines and other nucleic acid or vector-based delivery approaches. NIAID scientists designed the stabilized spike antigen based on previous knowledge obtained from studying other coronavirus spike structures. NIAID and the biotechnology company Moderna, based in Cambridge, Massachusetts, are developing a messenger RNA (mRNA) vaccine, which directs the body’s cells to express the spike in its prefusion conformation to elicit an immune response.

The new research also confirms that the structure of the SARS-CoV-2 spike is very similar to that of the coronavirus responsible for the global outbreak of severe acute respiratory syndrome in 2003 that was eventually contained (known as SARS-CoV). However, despite the similarities, the paper shows that some monoclonal antibodies developed to target SARS-CoV do not bind to the new coronavirus, indicating that antibodies that recognize the SARS-CoV from 2003 will not necessarily be effective in preventing or treating COVID-19, the disease caused by the new virus.

Recent reports show that the novel virus and SARS-CoV also bind to the same receptor on the host cell. However, NIAID and UT scientists determined that SARS-CoV-2 binds more easily to this receptor as compared to SARS-CoV, which could potentially explain why SARS-CoV-2 appears to spread more efficiently from human-to-human. However, more data is needed to investigate this possibility, the authors note.

This research was supported by the NIAID Intramural Research Program and a NIAID grant to the University of Texas at Austin (R01-AI127521).


Videoya baxın: ESSE NƏDİR? (Noyabr 2022).