Məlumat

7.6: Genetik Xəritəçəkmə - Biologiya

7.6: Genetik Xəritəçəkmə - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

İki lokus arasındakı rekombinasiya tezliyi (50%-ə qədər) onlar arasındakı xromosom məsafəsi ilə təqribən mütənasib olduğundan, bir xromosom boyunca və nəhayət, bütün genomda bütün lokusların genetik xəritələrini yaratmaq üçün rekombinasiya tezliklərindən istifadə edə bilərik. Genetik məsafənin vahidləri deyilir xəritə vahidləri (mu) və ya centiMorgans (cM), şərəfinə Thomas Hunt Morgan tələbəsi tərəfindən, Alfred Sturtevantkonsepsiyasını hazırlayan. Genetiklər müntəzəm olaraq rekombinasiya tezliklərini cM-ə çevirirlər: faizlə rekombinasiya tezliyi təxminən cM-də xəritə məsafəsi ilə eynidir. Məsələn, əgər iki lokusun rekombinasiya tezliyi 25% olarsa, onların xromosomda ~25cM aralı olduğu deyilir (Şəkil (PageIndex{9})). Qeyd: bu yaxınlaşma kiçik məsafələr üçün yaxşı işləyir (RF<30%), lakin daha uzun məsafələrdə tədricən uğursuz olur, çünki RF maksimuma 50% çatır. Bəzi xromosomların uzunluğu >100 sm-dir, lakin uclarındakı lokuslar yalnız 50% RF-ə malikdir. Bu uzun xromosomların xəritələşdirilməsi üsulu aşağıda göstərilmişdir.

Nəzərə alın ki, təkcə iki lokusun xəritə məsafəsi bizə bu lokusların xromosomdakı sentromerlər və ya telomerlər kimi digər xüsusiyyətlərə nisbətən oriyentasiyası haqqında heç nə demir.

Xəritə məsafələri həmişə bir anda bir cüt lokus üçün hesablanır. Bununla belə, çoxsaylı cüt-cüt hesablamaların nəticələrini birləşdirərək, a genetik xəritə bir xromosomda çoxlu lokus yarana bilər (Şəkil (PageIndex{10})). Genetik xəritə hər hansı iki yeri ayıran xəritə məsafəsini cM-də və bu lokusların bütün digər xəritələnmiş lokuslara nisbətən mövqeyini göstərir. Genetik xəritə məsafəsi fiziki məsafəyə, yəni iki lokus arasındakı DNT miqdarına təxminən mütənasibdir. Məsələn, in Ərəbidopsis, 1.0 cM təxminən 150.000bp-ə uyğundur və təxminən 50 gen ehtiva edir. cM-də DNT əsaslarının dəqiq sayı orqanizmdən və xromosomdakı xüsusi mövqedən asılıdır; xromosomların bəzi hissələri (“krossover qaynar nöqtələr”) digərlərinə nisbətən daha yüksək rekombinasiya sürətinə malikdir, digər bölgələrdə isə keçid azalıb və çox vaxt heterokromatinin böyük bölgələrinə uyğun gəlir.

Yeni gen və ya lokusu mutasiya və ya polimorfizmlə müəyyən etdikdə, onun xromosomdakı təxmini mövqeyi onu əvvəllər xəritələnmiş genlərlə kəsişdirməklə və sonra rekombinasiya tezliyini hesablamaqla müəyyən edilə bilər. Yeni gen və əvvəllər xəritələnmiş genlər tam və ya qismən əlaqə göstərirsə, rekombinasiya tezliyi yeni genin genetik xəritə daxilində təxmini mövqeyini göstərəcəkdir. Bu məlumat adlanan bir proses vasitəsilə yeni geni kodlayan DNT-nin xüsusi fraqmentini təcrid etmək (yəni klonlaşdırmaq) üçün faydalıdır. xəritəyə əsaslanan klonlama.

Genetik xəritələr həmçinin bitkilərin və heyvanların yetişdirilməsində gen/alelləri izləmək, növlər arasında təkamül əlaqələrini öyrənmək və bəzi insan xəstəliklərinin səbəblərini və fərdi həssaslığını müəyyən etmək üçün faydalıdır.

Genetik xəritələr bir xromosom boyunca lokusların sırasını göstərmək üçün faydalıdır, lakin məsafələr yalnız təxminidir. Rekombinasiya tezliyi ilə faktiki xromosom məsafəsi arasındakı əlaqə uzun məsafələrə nisbətən qısa məsafələr (aşağı RF dəyərləri) üçün daha dəqiqdir. İki nisbətən uzaq marker arasında müşahidə edilən rekombinasiya tezlikləri baş verən krossoverlərin faktiki sayını düzgün qiymətləndirməyə meyllidir. Bunun səbəbi, lokuslar arasındakı məsafə artdıqca, lokuslar arasında ikinci (və ya daha çox) kəsişmə ehtimalının artmasıdır. Bu, genetiklər üçün problemdir, çünki tədqiq olunan lokuslara gəldikdə, bunlar ikiqat krossoverlər heç bir rekombinasiya hadisəsi baş verməmiş kimi eyni genotiplərə malik gametlər əmələ gətirir (Şəkil (PageIndex{11})) – onların valideyn genotipləri var. Beləliklə, ikili krossover valideyn növü kimi görünəcək və iki (və ya daha çox) krossoverə malik olmasına baxmayaraq, rekombinant sayılmayacaq. Genetiklər bəzən çoxsaylı krossoverlərin mümkünlüyünü nəzərə almaq üçün böyük rekombinasiya tezliklərini tənzimləmək üçün xüsusi riyazi düsturlardan istifadə edəcəklər və beləliklə, iki lokus arasındakı faktiki məsafənin daha yaxşı qiymətləndirilməsini əldə edəcəklər.


Gen xəritəsi

Gen xəritəsi bir genin yerini və genlər arasındakı məsafələri müəyyən etmək üçün istifadə olunan üsulları təsvir edir. [2] Gen xəritəsi gen daxilində müxtəlif yerlər arasındakı məsafələri də təsvir edə bilər.

Bütün genom xəritələşdirilməsinin mahiyyəti molekulyar markerlər toplusunu genomdakı müvafiq mövqelərinə yerləşdirməkdir. Molekulyar markerlər bütün formalarda olur. Genlər, genom xəritələrinin qurulmasında xüsusi bir növ genetik marker kimi nəzərdən keçirilə bilər və hər hansı digər markerlərlə eyni şəkildə xəritələşdirilə bilər.


Geniş gen sorğusu təkamülün yeni tərəflərini ortaya qoyur

Nyu Yorkdakı Rokfeller Universitetindən Mark Stokl AFP-yə bildirib ki, planetin 7,6 milyard insanı, 500 milyon ev sərçəsi və ya 100 min qumbara üçün genetik müxtəliflik "təxminən eynidir".

Tuna balığı üçün tilapiyanı girov qoyan suşi barlarının maskasını açmaq üçün istifadə edilən əl genetik testinin yeni növlərin necə ortaya çıxması da daxil olmaqla təkamül haqqında dərin fikirlər verə biləcəyinə kim şübhə edə bilərdi?

Dünyanın hər yerindən yüzlərlə tədqiqatçı tərəfindən 100.000 heyvan növündən toplanmış və ABŞ hökuməti tərəfindən idarə olunan GenBank məlumat bazasında saxlanılan bu gen şəkillərinin ("DNT barkodları") beş milyonunu araşdırmaq kimin ağlına gələrdi?

Bu, Nyu-Yorkdakı Rokfeller Universitetindən Mark Stoekl və İsveçrədəki Bazel Universitetindəki David Taler olacaq, onlar keçən həftə birlikdə təkamülün necə baş verdiyinə dair birdən çox qərarlı ideyanı alt-üst etməsələr də, bir-birinə qarışdıracaqlar.

Məsələn, böyük, uzaq populyasiyaya malik olan növlərin - qarışqalar, siçovullar, insanlar - zaman keçdikcə daha çox genetik müxtəliflik qazanacağı dərslik biologiyasıdır.

Jurnalda dərc olunan tədqiqatın aparıcı müəllifi Stoeckle, "Cavab xeyrdir" dedi İnsan Təkamülü.

Planetin 7.6 milyard əhalisi, 500 milyon ev sərçəsi və ya 100.000 qumbara üçün genetik müxtəliflik "təxminən eynidir" dedi.

Araşdırmanın bəlkə də ən təəccüblü nəticəsi odur ki, bu gün Yer kürəsindəki 10 növdən 9-u, o cümlədən insanlar 100.000-200.000 il əvvəl yaranıb.

"Bu nəticə çox təəccüblüdür və mən buna qarşı bacardığım qədər mübarizə apardım" dedi Thaler AFP-yə.

Bu reaksiya başa düşüləndir: Heyvanlar həyatının 90 faizinin, genetik olaraq, təxminən eyni yaşda olması faktını necə izah etmək olar?

200.000 il əvvəl şiferi az qala təmizləyən hansısa fəlakətli hadisə olubmu?

Cavabı anlamaq üçün DNT barkodunu başa düşmək lazımdır. Heyvanlarda iki növ DNT var.

Ən çox tanış olduğumuz nüvə DNT, əksər heyvanlarda kişi və qadın valideynlər tərəfindən ötürülür və hər bir fərd üçün genetik planı ehtiva edir.

Tədqiqatçılar 100.000 növ üzrə DNT ştrix-kodlarını təhlil edərkən, demək olar ki, bütün heyvanların insanlarla eyni vaxtda meydana gəldiyini göstərən bir əlamət tapdılar.

DNT-dən ibarət genom cüt-cüt düzülmüş dörd növ molekuldan ibarətdir. İnsanlarda təxminən 20.000 gendə qruplaşdırılmış bu cütlərin üç milyardı var.

Lakin bütün heyvanların mitoxondrilərində də DNT var ki, bu da hər bir hüceyrənin içərisində qidadan alınan enerjini hüceyrələrin istifadə edə biləcəyi formaya çevirən kiçik strukturlardır.

Mitoxondriya 37 gen ehtiva edir və onlardan biri COI olaraq bilinir, DNT barkodunu etmək üçün istifadə olunur.

Növlərdən növə çox fərqlənə bilən nüvə DNT-sindəki genlərdən fərqli olaraq, bütün heyvanlar eyni mitoxondrial DNT dəstinə malikdir və bu, müqayisə üçün ümumi əsas yaradır.

Mitoxondrial DNT də təcrid etmək daha sadə və daha ucuzdur.

Təxminən 2002-ci ildə Kanadalı molekulyar bioloq Paul Hebert - "DNT barkodu" terminini işlətmiş - COI genini təhlil edərək növləri müəyyən etmək üçün bir yol tapdı.

Taler, "Mitoxondrial ardıcıllıq bu bütövlükdə heyvan yanaşması üçün mükəmməl olduğunu sübut etdi, çünki o, iki ziddiyyətli xüsusiyyətin düzgün balansına malikdir" dedi.

Bir tərəfdən, COI gen ardıcıllığı bütün heyvanlar arasında oxşardır, bu, seçmək və müqayisə etməyi asanlaşdırır.

Digər tərəfdən, bu mitoxondrial parçalar hər bir növü ayırd edə biləcək qədər fərqlidir.

"Bu, hər bir heyvan sahəsində mütəxəssis ekspertlər tərəfindən edilən növ təyinatları ilə demək olar ki, mükəmməl üst-üstə düşür" dedi Thaler.

Tədqiqatçılar 100.000 növ üzrə ştrix-kodları təhlil edərkən, demək olar ki, bütün heyvanların insanlarla eyni vaxtda meydana gəldiyini göstərən bir əlamət tapdılar.

Onların gördükləri, nəsillər boyu DNT-də bir insanın sağ qalma şansına nə kömək, nə də zərər verməyən cüzi dəyişikliklər olan "neytral" mutasiyaların dəyişməzliyi idi.

Başqa sözlə, onlar təkamülün təbii və cinsi hərəkətvericiləri baxımından əhəmiyyətsiz idilər.

Yeni bir DNT araşdırması, insanlar da daxil olmaqla, bu gün Yer kürəsindəki 10 növdən doqquzunun 100.000-200.000 il əvvəl meydana gəldiyini göstərdi.

Bu "neytral" mutasiyaların bir-birinə nə qədər oxşar olub-olmaması ağac halqalarına bənzəyir - onlar bir növün təxmini yaşını ortaya qoyur.

Bu, bizi sualımıza qaytarır: niyə bu gün mövcud olan növlərin böyük əksəriyyəti təxminən eyni vaxtda ortaya çıxdı?

Rokfeller Universitetinin İnsan Ətraf Mühit Proqramının direktoru Jesse Ausubel izah etdi ki, ekoloji travma bir ehtimaldır.

"Viruslar, buz dövrləri, uğurlu yeni rəqiblər, ov itkisi - bütün bunlar heyvan populyasiyasının kəskin şəkildə azaldığı dövrlərə səbəb ola bilər" dedi AFP-yə araşdırmanı şərh edərkən.

"Bu dövrlərdə bir genetik yeniliyin populyasiyanı süpürməsi və yeni bir növün yaranmasına töhfə verməsi daha asandır."

Lakin sonuncu əsl kütləvi yox olma hadisəsi 65,5 milyon il əvvəl, ehtimal olunan asteroid zərbəsinin quruya bağlı dinozavrları və Yerdəki bütün növlərin yarısını məhv etdiyi zaman baş verdi. Bu o deməkdir ki, əhalinin "darboğazı" ən yaxşı halda yalnız qismən izahatdır.

"Ən sadə təfsir odur ki, həyat daim inkişaf edir" dedi Stokl.

"Ehtimal ki, təkamülün bütün dövrlərində - o dövrdə yaşayan heyvanlar nisbətən yaxınlarda yaranıblar."

Bu baxımdan, bir növ ya yeni bir şeyə çevrilənə qədər, ya da nəsli kəsilmədən əvvəl yalnız müəyyən bir müddət yaşayır.

Və yenə də - tədqiqatın başqa bir gözlənilməz tapıntısı - növlərin çox aydın genetik sərhədləri var və aralarında çox şey yoxdur.

"Əgər fərdlər ulduzdursa, növlər qalaktikalardır" dedi Taler. "Onlar boş ardıcıllıq məkanının genişliyində yığcam klasterlərdir."

O, "arada olan" növlərin olmamasının Darvini də çaşdıran bir şey olduğunu söylədi.


Təşəkkürlər

Biz bu tədqiqatda iştirak edən bütün şəxslərə və DNT genotipləşdirmə dəstəyinə görə T. Nguyen və M. Beaudoin-ə təşəkkür edirik. Biz əlyazmanın tənqidi oxunmasına görə S. Rayçaudhuriyə, statistik məsləhətə görə G. Boucherə və Oraq Hüceyrə Xəstəliyinin Kooperativ Tədqiqi (CSSCD) əsas komponentlərini təmin etdiyi üçün CARe Sickle Cell Disease işçi qrupuna təşəkkür edirik. Bu iş Fondation de l'Institut de Cardiologie de Montréal (G.L.) tərəfindən maliyyələşdirilib və Doris Duke Xeyriyyə Fondunun (G.L. və J.N.H.-ya) Klinik Tədqiqatda İnnovasiyalar Mükafatı qrantı ilə dəstəklənib. Resequencing xidmətləri Vaşinqton Universiteti, Genom Elmləri Departamenti tərəfindən ABŞ Federal Hökuməti ilə Milli Ürək, Ağciyər və Qan İnstitutundan N01-HV-48194 nömrəli müqavilə əsasında təmin edilmişdir.


Şəxsi elmi, tədqiqat və təhsil məqsədləriniz üçün bu məqaləni endirin və çap edin.

Tək bir buraxılış alın Elm cəmi 15 ABŞ dollarına.

Elm

Cild 370, Buraxılış 6522
11 dekabr 2020-ci il

Məqalə Alətləri

Bu məqalə üçün xəbərdarlıq əlavə etmək üçün daxil olun.

Hannes Braberg , İqnasiya Echeverria , Stefan Bohn , Peter Cimermancic , Enthony Shiver , Richard Alexander , Jiewei Xu , Michael Shales , Raghuvar Dronamraju , Shuangying Jiang , Gajendradhar Dwivedi , Kajendradhar Dwivedi , Kajendradhar Dwivedi , Derekütenq , Derekütenq . , Rikkardo Pellarin , Dina Schneidman , Joel S. Bader , James S. Fraser , John Morris , James E. Haber , Brian D. Strahl , Carol A. Gross , Junbiao Dai , Jef D. Boeke , Andrej Sali , Nevan J. Krogan

İn vivo zülal kompleksi strukturlarının müəyyən edilməsi üsulu genetik pozğunluqlardan fenotipik göstəricilərdən istifadə edir.


Fon

Becərilən soya, Glisin maks (L.) Merr., vəhşi əcdadından Çində əhliləşdirilib, G. soja Sieb. və Şərqi Asiyada geniş coğrafi yayılıma malik olan Zucc. Soyanın əhliləşdirildiyi addımların dəqiq seriyası hələ də məlum olmasa da, aralarındakı fərq G. maksG. soja baş verib

0,8 milyon il əvvəl genomlararası müqayisə analizinə əsaslanaraq [1]. Divergensiyadan sonrakı uzun müddət və çox güman ki, çoxsaylı əhliləşdirmə hadisələri çoxlu sayda lokalizasiya ilə nəticələndi Glisin maks müxtəlif mühitlərə uyğunlaşan landraces [2]. Hal-hazırda, 45.000 qoşulma var G. maks in ex situ bütün dünyada kolleksiyalar [3]. Əhliləşdirmədən sonra soya son əsrdə intensiv təkmilləşdirmə səylərinə məruz qalmışdır. Genetik müxtəlifliyin zahirən nəhəng rezervuarına baxmayaraq G. maks, bu torpaq növlərinin yalnız 346-sı (0,77%) damazlıq təhlili əsasında 1923-2005-ci illər arasında buraxılmış 1300 Çin soya sortunun nüvə töhfəsinin 76,29%-ni təşkil edir [4]. 1947 və 1988-ci illər arasında buraxılan əsas müasir ABŞ soya sortları Çinin şimal-şərqindəki kiçik bir ərazidən yalnız 80 birləşmə ilə izlənilə bilər. Kollektiv valideynliyin təqribən 86%-i 80 torpaq irqindən yalnız 17-nin payına düşür [5]. Bu torpaq irqləri yüksək məhsuldarlıq, azaldılmış budaqlanma və biotik və abiotik stressə qarşı müqavimət kimi kənd təsərrüfatı məhsuldarlığına və məhsuldarlığına nəzarət edən xüsusiyyətləri artırmaqla müasir seleksiyaçılar üçün sortların inkişafı üçün genetik material təmin etdi. Nəticə etibarilə, soya sortlarının genomu əhliləşdirmə və sonrakı genetik təkmilləşdirmə zamanı bu əlamətləri idarə edən genlərdə güclü seçimlə qarşılaşmış ola bilər.

Aqronomik əlamətlərin dəyişməsinə kömək edən bu seçilmiş gen sinfini necə aşkar etmək olar? Tarixən, kəmiyyət əlamətlərin yerinin (QTL) xəritələşdirilməsi fenotipik dəyişkənliyin altında yatan genomik bölgələri lokallaşdırmaq üçün istifadə edilmişdir. Rekombinant inbred xətt xəritəçəkmə populyasiyasının inkişafı zamanı bir neçə nəsil ərzində yalnız kiçik sayda rekombinasiya hadisələri toplana bildiyindən, bu yanaşma nadir hallarda namizəd genlərinin təcrid olunmasına səbəb olmuşdur [6]. Tarixi rekombinasiya hadisələrindən istifadə edən assosiasiya xəritələşdirilməsi ardıcıllıq səviyyəsində mürəkkəb əlamət variasiyasının disseksiyası üçün əlaqə xəritəsinin güclü alternativinə çevrilmişdir [7-9]. Soyada, genom boyu assosiasiya tədqiqatı (GWAS) xəstəliklərə qarşı müqavimət, məhsuldarlıq və keyfiyyətlə əlaqəli əlamətlər kimi müxtəlif əlamətlərin tədqiqi üçün istifadə edilmişdir [10-12].

Yuxarıda qeyd olunan QTL və assosiasiya təhlili metodlarından başqa, selektiv süpürmə təhlili potensial aqrotexniki əhəmiyyət kəsb edən yerləri aşkar etmək üçün istifadə edilə bilən başqa bir yanaşmadır. Selektiv tarama seçilmiş allelin yaxınlığında tək nukleotid polimorfizmlərinin (SNP) allel tezliklərini dəyişdirir və (i) yerli dəyişkənliyin azalmasına, (ii) genetik dəyişkənliyin təhrif edilmiş modelinə, (iii) artan əlaqə balanssızlığına (LD) səbəb olur. və (iv) genişləndirilmiş haplotip quruluşu [13, 14]. Bu xüsusiyyətlər genomu son uyğunlaşmada iştirak edən genləri skan etmək üçün istifadə edilə bilər. Bu yaxınlarda qarğıdalıda əhliləşdirmə və təkmilləşdirmə zamanı həddindən artıq allel tezliyinin differensasiyasını skan etmək üçün populyasiyalar arası kompozit ehtimal nisbəti (XP-CLR) metodundan [13] istifadə edilmişdir. Təxminən, qarğıdalı genomunun 7,6%-i çoxsaylı seçim imzalarını göstərdi və 3040 genin təkmilləşmədə iştirak etdiyi aşkar edildi [15]. Soya vəziyyətində, çoxsaylı tədqiqatlar elit soya sortları, torpaq irqləri və yabanı qohumlar arasında yerli dəyişkənliyin və müxtəlif LD nümunələrinin təzadlarına diqqət yetirmişdir. G. soja. [16–19]. 8-in genom ardıcıllığı arasında son genomlararası müqayisələr G. sojaG. maks girişlər müsbət seçim imzalarını göstərən 682 geni müəyyən etdi, o cümlədən bəzi nəsillərə xas genlər və surət sayı dəyişikliyi olan genlər [1]. Bununla belə, bu tədqiqatların əksəriyyətində ya dayaz seçmə [1, 16, 19], statistik metodların zəif gücü [17] və ya məhdud genom əhatəsində [18] məhdudiyyətlər var idi. Buna görə də bir çox seçim siqnalları aşkarlanmamış qala bilər.

Bu tədqiqatda 342 ənənəvi landrace və 1062 təkmilləşdirilmiş soya xəttinin genotiplənməsi üçün yüksək sıxlıqlı fərdiləşdirilmiş oliqonukleotid massivi (52,041 SNP) istifadə edilmişdir. Nukleotid müxtəlifliyi, əlaqə tarazlığı və populyasiya strukturunda kəmiyyət dəyişikliyi əsasında XP-CLR statistikası [13] yetişdirmə ilə hədəflənmiş əlamətlər üçün seçimdən ən çox təsirlənən genom bölgələrini müəyyən etmək üçün istifadə edilmişdir. Müxtəlif mühitlərdən toplanmış 9 aqrotexniki əlamət məlumatı ilə birlikdə, GWAS tərəfindən bu əlamətlərin əsasını təşkil edən əhəmiyyətli sayda lokus müəyyən edilmişdir. Konkret olaraq müəyyən etməyi qarşımıza məqsəd qoymuşuq (i) genom boyu genetik müxtəlifliyə seleksiyanın nə dərəcədə təsir göstərdiyi, (ii) soyanın yaxşılaşdırılması zamanı seleksiyadan təsirlənmiş genomun bölgələri və (iii) namizəd bölgələrimizin yetişdirmə ilə hədəflənən əlamətlərin seçilməsindən təsirlənən genlər üçün həqiqətən zəngin olub-olmaması.


Giriş seçimləri

Tək məqalə alın

Tam məqalə PDF-ə dərhal giriş.

Vergi hesablanması yoxlama zamanı yekunlaşacaq.

Jurnalına abunə olun

2019-cu ildən etibarən bütün məsələlərə dərhal onlayn giriş. Abunəlik hər il avtomatik yenilənəcək.

Vergi hesablanması yoxlama zamanı yekunlaşacaq.


7.6: Genetik Xəritəçəkmə - Biologiya

Data mərkəzimizdə texniki xidmətə görə 8 saat. Bu interval işin gedişatından asılı olaraq potensial olaraq daha qısa ola bilər. Narahatçılığa görə üzr istəyirik. *** --> *** DAVID data mərkəzimizdəki texniki xidmətlə əlaqədar 24/6/2011-ci il tarixində saat 17:00-dan 26/6/2011-ci il EST Bazar günü saat 15:00-a qədər işləməyəcək. Bu interval işin gedişatından asılı olaraq potensial olaraq daha qısa ola bilər. Narahatçılığa görə üzr istəyirik. *** --> *** Hazırda biz müxtəlif proqramlaşdırma dillərindən DAVID-ə daxil olmağa imkan verən yeni DAVID Veb Xidmətimiz üçün Beta istifadəçilərini qəbul edirik. Giriş üçün bizimlə əlaqə saxlayın. *** --> *** Siyahının yüklənməsi və çevrilməsi üçün Gen Simvolunun xəritələşdirilməsi dəyişdi. Ətraflı məlumat üçün DAVID forum elanına baxın. --> *** Müxtəlif proqramlaşdırma dillərindən DAVID-ə daxil olmağa imkan verən yeni DAVID Veb Xidmətini elan edir. Daha çox məlumat. *** --> *** DAVID 6.8 23/2/2016 Cümə axşamı, 9AM-1PM EST arasında təmir üçün işləməyəcək *** -->
*** DAVID 6.8-ə xoş gəlmisiniz ***
*** Əgər siz DAVID 6.7 axtarırsınızsa, lütfən inkişaf saytımıza daxil olun. ***
-->
*** Yenilənmiş Bilik bazası ilə DAVID 6.8-ə xoş gəlmisiniz (ətraflı məlumat). ***
*** Əgər siz DAVID 6.7 axtarırsınızsa, lütfən inkişaf saytımıza daxil olun. ***
-->
*** Yenilənmiş Bilik bazası ilə DAVID 6.8-ə xoş gəlmisiniz (ətraflı məlumat). ***
*** DAVID 6.7 server hazırda texniki xidmət üçün sıradan çıxıb. ***
--> *** Zəhmət olmasa oxuyun: Data mərkəzinə texniki xidmət göstərilməsi ilə əlaqədar DAVID 17 İyun Cümə günü saat 16:00-dan 19 İyun Bazar günü saat 16:00-a qədər oflayn olacaq və daha tez onlayn olmaq imkanı ilə. *** -->


Genetik marker

Redaktorlarımız təqdim etdiyinizi nəzərdən keçirəcək və məqaləyə yenidən baxılıb-bağlanmayacağınıza qərar verəcək.

Genetik marker, nuklein turşuları və ya digər genetik əlamətlər ardıcıllığında hər hansı bir dəyişiklik. Genetik markerlər, ilk növbədə, bir populyasiyanın fərdlərini fərqli formalara ayıran fasiləsiz genetik variasiyalar olan polimorfizmlərdən ibarətdir (məsələn, AB qan qrupuna qarşı ABO və ya sarı saçlı qırmızı saça qarşı). Genetik markerlər genetik xəritələşmədə, xüsusən də eyni xromosomda bir-birinə yaxın yerləşən və birlikdə miras qalmağa meylli olan müxtəlif allellərin mövqelərinin müəyyən edilməsində əsas rol oynayır. Bu cür əlaqə qrupları xəstəlik riskinə təsir edən naməlum genləri müəyyən etmək üçün istifadə edilə bilər. Texnoloji irəliləyişlər, xüsusən də DNT ardıcıllığı, insan genomunda dəyişən saytların kataloqunu xeyli artırdı.

Çoxsaylı polimorfizm növləri tək nukleotid polimorfizmləri (SNP), sadə ardıcıllıq uzunluğu polimorfizmləri (SSLPs) və məhdudlaşdırma fraqment uzunluğu polimorfizmləri (RFLPs) daxil olmaqla, genetik markerlər kimi xidmət edir. SSLP-lərə təkrar ardıcıllıqlar, mini-peyklər (tandem təkrarlarının dəyişən sayı və ya VNTRs) və mikropeyklər (sadə tandem təkrarları, STR) kimi tanınan variasiyalar daxildir. Əlavələr/delesiyalar (indels) genetik markerin başqa bir nümunəsidir.

İnsan genomunda ən çox yayılmış marker növləri SNP, STR və indeldir. SNP-lər DNT seqmentində əsas tikinti bloklarından yalnız birinə - adenin (A), guanin (G), timin (T) və ya sitozinə (C) təsir göstərir. Məsələn, əksər fərdlərdə ACCTGA ardıcıllığı olan genomik yerdə bəzi şəxslər əvəzinə ACGTGA ehtiva edə bilər. Bu misaldakı üçüncü mövqe SNP hesab olunacaq, çünki dəyişən mövqedə C və ya G allelinin meydana çıxma ehtimalı var. Hər bir fərd hər bir valideyndən bir DNT nüsxəsini miras aldığı üçün hər bir insanda iki tamamlayıcı DNT nüsxəsi var. Nəticədə, yuxarıdakı nümunədə üç genotip mümkündür: homozigot CC (dəyişən mövqedə C allelinin iki nüsxəsi), heterozigot CT (bir C və bir T alleli) və homozigot TT (iki T alleli). Üç genotip qrupu, bir genetik epidemiologiya mühitində maraq nəticəsi ilə assosiasiyaları qiymətləndirmək üçün "məruz qalma" kateqoriyaları kimi istifadə edilə bilər. Belə bir assosiasiya müəyyən edilərsə, tədqiqatçılar həmin bölgədə maraq nəticəsində birbaşa bioloji təsir göstərən xüsusi DNT ardıcıllığını müəyyən etmək üçün qeyd olunan genomik bölgəni daha da araşdıra bilərlər.


Bəzi Xərçənglərin Niyə Böyüdüyünü və Yayıldığını, Digərlərinin Nəyə görə Böyümədiyini Araşdırın

İllərdir ki, həkimlər və tədqiqatçılar bütün xərçəng növlərinin eyni olmadığını qeyd edirlər. Bəzi xəstələrin şişləri olduqca yavaş böyüyür və heç vaxt ilk yarandıqları yerdən kənara yayılmır. Amma digər xəstələrdə şişləri sürətlə böyüyür və od kimi yayılır.

1980-ci illərin əvvəllərində, HER2 adlı mutasiyaya uğramış genin həddindən artıq hüceyrə böyüməsini və bölünməsini stimullaşdıra biləcəyi kəşfindən sonra, bir çox elm adamı müəyyən genlərin xərçəngin böyüməsinə və sürətlə yayılmasına səbəb ola biləcəyi ilə maraqlanırdı. Dünyadakı tədqiqatçılar xərçəngin böyüməsinə təkan verən genləri axtarmağa başladılar.


Biologiyada böyük məlumatların evi

Biz alimlərə bəşəriyyətin xeyrinə olan kəşflər etmək üçün mürəkkəb məlumatlardan istifadə etməyə kömək edirik.

Seçilmiş mövzu

Kembric Universitetinin tədqiqatçıları plastik parçalanma və zərərsizləşdirici pestisidlər kimi yeni tətbiqlər üçün uyğun fermentləri müəyyən etmək üçün EMBL-EBI-nin metagenomika məlumat resursundan MGnify istifadə edirlər.

Son xəbərlər

Tədbirlərimiz

Avropa Bioinformatika İnstitutu (EMBL-EBI) Avropanın həyat elmləri üzrə flaqman laboratoriyası olan EMBL-nin bir hissəsidir. EMBL-EBI və təsirimiz haqqında ətraflı.

Tədqiqatınızı zənginləşdirmək üçün açıq məlumat resurslarımızı araşdırın. Məlumatları nəzərdən keçirin, təhlillər aparın və ya öz nəticələrinizi paylaşın.

Tədqiqat qruplarımız, postdoktoral proqramlarımız və PhD Proqramımız haqqında məlumat əldə edin.

Karyera mərhələsindən və ya sektorunuzdan asılı olmayaraq bioinformatika və elmi xidmətlər üzrə dünya üzrə aparıcı təlimlərə daxil olun.

Bilik mübadiləsi Sənaye Proqramımızı araşdırın və tərcümə tərəfdaşlığı və layihələrində iştirak edin.

Biz ELIXIR node kimi bütün Avropada bioloji məlumatların təmin edilməsinin koordinasiyasını dəstəkləyirik.

COVID-19 zamanı işə qəbul

Biz yeni işçiləri işə götürməyə və ofislərimizə qayıtmaq təhlükəsiz olana qədər onları uzaqdan idarə etməyə davam edirik.

EMBL-EBI adlı yerdə işləyir

Enerjinizi və bacarıqlarınızı həqiqətən vacib olan bir işə cəmləyin: texnologiyadan bəşəriyyətə fayda verən kəşflərə töhfə vermək üçün istifadə edin.

Sərhədsiz elm

Biz bərabərlik və müxtəlifliyin qürurlu tərəfdarıyıq. Biz dünyanın hər yerindən işçiləri işə götürürük və Böyük Britaniyanın immiqrasiya məhdudiyyətlərindən azad olmağı təklif edirik.



Şərhlər:

  1. Samunris

    Interested in making money for a webmaster?

  2. Ellery

    Və niyə bu qədərdir? Düşünürəm ki, niyə bu fərziyyəni aydınlaşdırmır.

  3. Polydeuces

    Təbrik edirəm, yeri gəlmişkən, bu fikir lazımdır

  4. Demogorgon

    Düşünürəm ki, o səhvdir. Bunu sübut edə bilərəm. PM-də mənə yazın, sizinlə danışır.



Mesaj yazmaq