Məlumat

Qış_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 - Biologiya

Qış_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

2020_SS1_Bis2a_Facciotti_Reading_21 ilə əlaqəli öyrənmə məqsədləri

  • Replikasiya, transkripsiya, tərcümə, əks transkripsiya prosesləri və müxtəlif mümkün məhsulların (yəni mRNT, tRNT, rRNT, fermentlər, struktur zülallar, replikasiya olunmuş xromosomlar) mümkün taleyi daxil olmaqla mərkəzi doqmanın əsas komponentlərini və onlar arasındakı əlaqələri təsvir edin. və s.).
  • RNT strukturlarını modelləşdirən illüstrasiyalar yaradın. Bunlar bir neçə səviyyəli təfərrüat və abstraksiyanı əhatə etməlidir ki, bunlara karikatura modelləri daxildir:
    • a. üç nukleotid və onların fosfodiester bağları.
    • b. mRNT və tRNT-nin böyüdülmüş təsviri.

  • Genomik bölgənin mücərrəd modelini nəzərə alaraq, DNT ardıcıllığının mücərrəd təsvirləri kimi xətti genom koordinatında çəkilmiş həndəsi obyektlər kimi təmsil olunan genlərin, promotorların və digər funksional elementlərin təsvirlərini düzgün şərh edin.
  • Transkripsiya vahidinin struktur elementlərinin hər birinin rollarını müzakirə etmək üçün transkripsiya vahidinin modelindən istifadə edin. Transkripsiya edilənləri, tərcümə oluna bilənləri və digər rollara xidmət edənləri müəyyənləşdirin.
  • Dinamik modelini (şifahi, rəsm və s.) yaradın proses reaktivləri, məhsulları, fermentləri, transkripsiyanın baş verməsi üçün lazım olan DNT-də yerləri ehtiva edən transkripsiya və bu komponentlərin qarşılıqlı əlaqəsi proses zamanı müxtəlif vaxtlarda DNT şablonu ilə.
  • Eukaryotik gen transkriptlərinin tərcümədən əvvəl necə işləndiyini və bunun funksional müxtəliflik yaratmaq üçün əhəmiyyətini təsvir edin.

Genetik məlumat axını

Bakteriyalarda, arxeyalarda və eukariotlarda DNT-nin əsas rolu sözügedən orqanizmi yaratmaq üçün tələb olunan təlimat dəstini kodlayan irsi məlumatı saxlamaqdır. Kimyəvi tərkibi (genomdakı nukleotidlərin ardıcıllığı və bəzi kimyəvi modifikasiyalar) tez oxumaqda çox yaxşılaşdıq.

edilir

ona), biz hələ də daxilindəki bütün məlumatı və onun istifadə etdiyi bütün mexanizmləri etibarlı şəkildə necə deşifrə edəcəyimizi bilmirik.

oxunur

və sonda ifadə edilir.

Bununla belə, genetik kodun oxunması və ifadəsi ilə bağlı bəzi əsas prinsiplər və mexanizmlər vardır ki, onların əsas addımları

başa düşülür

və bu, bütün bioloqlar üçün konseptual alətlər dəstinin bir hissəsi olmalıdır. Bu proseslərdən ikisi DNT-də yazılmış genetik kodun hissələrinin müvafiq polimer RNT-nin molekullarına uyğunlaşması və RNT kodunun müvafiq olaraq zülallara oxunması və kodlaşdırılması olan transkripsiya və tərcümədir.

BIS2A-da, biz anlayışı inkişaf etdirməyə diqqət yetiririk

proses

transkripsiya (xatırlayın ki, Enerji Hekayəsi prosesi təsvir etmək üçün rubrikadır) və onun genetik məlumatın ifadəsindəki rolu. Biz funksional problemlərə diqqət yetirməklə (problemin həlli/dizayn problemi rubrikasının bəzi hissələrini daxil etməklə) transkripsiya ilə bağlı müzakirəmizi motivasiya edirik.

həll olunsun

baş verəcək proses. Sonra prosesin necə olduğunu təsvir edirik

istifadə olunur

Təbiət tərəfindən müxtəlif funksional RNT molekulları (müxtəlif struktur, katalitik və ya tənzimləyici rolları ola bilər) yaratmaq üçün, o cümlədən xəbərçi RNT (

mRNT

) zülalları sintez etmək üçün lazım olan məlumatı daşıyan molekullar. Eynilə, biz tərcümə prosesi, ribosomların zülalları sintez etməsi prosesi ilə bağlı çətinliklərə və suallara diqqət yetiririk.

Biz tez-tez bioloji sistemlərdə əsas genetik məlumat axınını "mərkəzi dogma" kimi tanınan sxemdə təsvir edirik (aşağıdakı şəklə bax). Bu sxem DNT-də kodlanmış məlumatın transkripsiya vasitəsilə RNT-yə daxil olduğunu və nəticədə zülallara çevrildiyini bildirir. Əks transkripsiya (DNT-nin və RNT şablonunun yaradılması) və replikasiya kimi proseslər də müxtəlif formalarda məlumatın yayılması mexanizmlərini təmsil edir. Lakin bu sxem məlumatın necə olacağı barədə heç nə demirkodlaşdırılırvə ya modeldə təsvir olunan molekul tiplərinin müxtəlif təbəqələri arasında tənzimləyici siqnalların hərəkət mexanizmləri haqqında. Buna görə də, aşağıda göstərilən sxem hər hansı bir bioloqun leksikonunun demək olar ki, tələb olunan hissəsi olsa da, bəlkə dəköhnəənənə, tələbələr həmçinin məlumat axını mexanizmlərinin daha mürəkkəb olduğunu bilməlidirlər (biz getdikcə bəziləri haqqında öyrənəcəyik və "mərkəzi dogma" yalnız bəzi əsas yolları təmsil edir).

Şəkil 1. Genetik məlumat axını.
Atribut:Mark T. Facciotti (orijinal iş)

Genotipdən fenotipə

Aşağıdakı bölmələrdə vacib bir anlayış genetik məlumat arasındakı əlaqədir genotip, və ifadənin nəticəsi, the fenotip. Bu iki termin və ikisini birləşdirən mexanizmlər olacaqmüzakirə olunsunnövbəti bir neçə həftə ərzində təkrar-təkrar - bu lüğətdən istifadə etməkdə bacarıqlı olmağa başlayın.

Şəkil 2. DNT-də olacaq məlumatifadə olunsuntranskripsiya iləsaxlanılır5'-dən 3' istiqamətində oxunan fərdi nukleotidlərin ardıcıllığında. Məlumatın DNT-dən RNT-yə çevrilməsi (transkripsiya adlanan proses) həmin məlumatı olduğu kimi işlək ola bilən müvəqqəti nüsxəyə ifadə edir (məs.tRNT,rRNT) və ya zülal yaratmaq üçün tələb olunan məlumatı kodlayan mesaj (məs.mRNT). Hüceyrələr istifadə edirmRNTtərcümə vasitəsilə zülalların yaradılması üçün şablon kimi. Burada iki fərqli DNT ardıcıllığını göstəririk. Hər bir DNT ardıcıllığındakı fərqlər iki fərqli istehsalı ilə nəticələnirmRNA-lar, sonra iki fərqli zülalın sintezi. Nəhayət, bu fərqli zülallar siçanlarda iki fərqli örtük rəngi yaradır.

Genotip orqanizmin DNT-sində saxlanılan məlumatlara, nukleotidlərin ardıcıllığına və onun genlərinin tərtibinə aiddir. Fenotip boy, çəki, istehsal olunan ATP miqdarı, laktoza metabolizə etmək qabiliyyəti və ətraf mühitin stimullarına reaksiya kimi ölçə biləcəyiniz hər hansı fiziki xüsusiyyətə aiddir. Genotip fərqləri, həttacüzi, təbii seleksiyaya məruz qalan müxtəlif fenotiplərə səbəb ola bilər. Yuxarıdakı rəqəm bu fikri əks etdirir. Onu da qeyd edək ki, biz klassik şəkildə genotip və fenotip əlaqəsi haqqında danışarkənkontekstiçoxhüceyrəli orqanizmlər, bu nomenklatura və əsas anlayışlar bütün orqanizmlərə, hətta bakteriya və arxeya kimi təkhüceyrəli orqanizmlərə də aiddir.

Genlər

Gen nədir? A gen bir orqanizmin genomunda funksional RNT-ni kodlayan DNT seqmentidir (məsələn,

rRNT

,

tRNT

,

və s

.)

və ya

protein məhsulu (fermentlər, tubulin və s.). Ümumi gen tənzimləyici bölgələri kodlayan elementləri və transkripsiya edilmiş vahidi kodlayan bölgəni ehtiva edir.

Genlər qazana bilər mutasiyalar— nukleotidlərin tərkibində və ya ardıcıllığında — kodlaşdırma və ya tənzimləyici bölgələrdə dəyişikliklər kimi müəyyən edilir. Bu mutasiyalar bir neçə nəticəyə gətirib çıxara bilər: (1) nəticədə ölçülə bilən heç nə baş vermir; (2) gen artıq ifadə olunmur; və ya (3) gen məhsulunun ifadəsi və ya davranışı

(

s) fərqlidir. Eyni paylaşan orqanizmlərin populyasiyasında

gen

genin müxtəlif variantları

məlumdur

kimi allellər. Fərqli allellər fərdlərin fenotiplərində fərqliliklərə səbəb ola bilər və selektiv təzyiq altında biologiyada müxtəlifliyə töhfə verə bilər.

Bu lüğət terminlərini və əlaqəli anlayışları öyrənməyə başlayın. Onda olacaqsan

bir qədər

növbəti mühazirələrdə onlara daha ətraflı nəzər saldığımız zaman onlarla tanış oluruq.

Şəkil 3. Bir genibarətdirbir RNT və ya protein məhsulunun tənzimləyici bölgələri ilə müşayiət olunan kodlaşdırma bölgəsi.Kodlaşdırma bölgəsi transkripsiya edilirdaxilRNThansısonra tərcümə olunurproteinə çevrilir.

DNT-dən RNT-yə transkripsiya

Bölmə xülasəsi

Bakteriyalar, arxeyalar və eukariotlar genomlarından genləri transkripsiya etməlidirlər. Hüceyrə yeri fərqli ola bilsə də (eukariotlar nüvədə transkripsiyanı həyata keçirir; bakteriya və arxeya sitoplazmada transkripsiyanı həyata keçirir), bu təbəqələrin hər birindən olan orqanizmlərin bu prosesi həyata keçirməsi mexanizmləri aşağıdakılardır:əsaslı olaraqeyni və bilərxarakterizə olunsunüç mərhələdən ibarətdir: başlanğıc, uzanma və sonlanma.

Qısatranskripsiyaya ümumi baxış

TranskripsiyaprosesiDNT seqmentinin RNT surətinin yaradılması. Çünki bu a proses, biz transkripsiya haqqında funksional anlayışı inkişaf etdirmək üçün Enerji Hekayəsi rubrikasını tətbiq etmək istəyirik. Transkripsiya başlamazdan əvvəl molekullar sistemi necə görünür? Sonda nə kimi görünür? Transkripsiya zamanı maddənin hansı çevrilmələri və enerji köçürmələri baş verir və bu prosesi nə kataliz edir? Biz də proses haqqında düşünmək istəyirikDizayn Çağırışımövqe. Əgər bioloji vəzifə RNT-nin kimyəvi dilində DNT nüsxəsini yaratmaqdırsa, digər nukleotid polimer prosesləri haqqında biliklərimizi nəzərə alaraq, əsaslı şəkildə fərziyyə irəli sürə və ya gözləyə bilərik.qalib gəlmək? Təbiətin bu problemləri müxtəlif yollarla həll etdiyinə dair sübut varmı? Transkripsiyanın uğurunun meyarları nə kimi görünür? Siz fikir əldə edirsiniz.

Transkripsiya üçün bəzi əsas tələblərin sadalanması

Gəlin əvvəlcə bəzi təməl biliklərimizdən istifadə edərək və məqsəd ikiqat zəncirli DNT molekulunun bir zəncirinin bir parçasının RNT surətini çıxarmaq olarsa, transkripsiya zamanı nələrin baş verəcəyini təsəvvür edərək, qarşıda duran vəzifələri nəzərdən keçirək. Görəcəyik ki, bəzi əsas məntiqdən istifadə edərək, bizə vacib sualların və bilməli olduğumuz bir çox şeyləri çıxarmağa imkan verir

qaydasında

prosesi düzgün təsvir etmək.

Təsəvvür edək ki, biz dizayn etmək istəyirik

nanomachin

/ transkripsiyanı aparacaq nanobot. Bəzilərini istifadə edə bilərik

Dizayn Çağırışı

lazım olan problemləri və alt problemləri müəyyən etmək üçün düşünmək

həll olunsun

kiçik robotumuz tərəfindən.

• Maşın haradan başlamalıdır? Milyonlarla milyardlarla baza cütləri arasında maşın harada olmalıdır

istiqamətləndirilmək

?
• Maşın harada dayanmalıdır?
• Başlama və dayandırma saytlarımız varsa, bu məlumatı kodlaşdırma yollarına ehtiyacımız olacaq ki, maşınımız

(

s) bu məlumatı oxuya bilər - bu necə olacaq

yerinə yetirilsin

?
• DNT-nin neçə RNT nüsxəsini hazırlamalıyıq?
• RNT nüsxələrinin nə qədər sürətli olması lazımdır

edilsin

?
• Nüsxələrin nə dərəcədə dəqiq olması lazımdır

edilsin

?
• Proses nə qədər enerji alacaq və enerji haradan gələcək?

Bunlar yalnız bəzi əsas suallardır. İstəsələr, daha dərin qaza bilərlər. Bununla belə, bunlar artıq bizim bu proses üçün yaxşı hisslər əldə etmək üçün kifayət qədər yaxşıdır. Diqqət yetirin ki, bu sualların bir çoxu DNT replikasiyasını başa düşmək üçün lazım ola biləcəyini düşündüyümüz suallara olduqca oxşardır.

Transkripsiyanın tikinti blokları

RNT-nin tikinti blokları

Nukleotidlərin quruluşu ilə bağlı müzakirəmizdən xatırlayaq ki, RNT-nin quruluş blokları DNT-dəkilərə çox oxşardır. RNT-də tikinti blokları nukleotid trifosfatlardan ibarətdiribarətdirriboza şəkəri, azotlu əsas və üç fosfat qrupundan ibarətdir. DNT-nin tikinti blokları ilə RNT-nin blokları arasındakı əsas fərqlər bundan ibarətdirRNT molekulları əmələ gəlirriboza şəkərləri olan nukleotidlərin (dezoksiriboza şəkərlərindən fərqli olaraq) və tərkibində nukleotid olan urasil (DNT-dəki timidindən fərqli olaraq) uridindən istifadə edin. Aşağıda qeyd edin ki, urasil və timin struktur olaraq çox oxşardırlar - urasildə sadəcə metil (CH) yoxdur.3) timinlə müqayisədə funksional qrup.

Şəkil 1. Nukleotidlərin əsas kimyəvi komponentləri.
Atribut:Mark T. Facciotti (orijinal iş)

Transkripsiyanın başlanğıcı

Promouterlər

Müəyyən bir DNT parçasının (transkripsiya) RNT nüsxəsini yaratmaqdan məsul olan zülallar əvvəlcə elementin başlanğıcını tanıya bilməlidirlər.köçürmək. A təşviqatçı topluca transkripsiya mexanizmi kimi tanınan müxtəlif zülalların bağlandığı və transkripsiyaya başladığı bir DNT ardıcıllığıdır. Əksər hallarda promotorlar tənzimlədikləri genlərin yuxarı hissəsində (kodlaşdırma bölgəsinə 5') mövcuddur. Promotorun xüsusi ardıcıllığı çox vacibdir, çünki o, hüceyrənin genin müvafiq kodlaşdırma hissəsini hər zaman, bəzən və ya nadir hallarda transkripsiya etdiyini müəyyən edir. Promotorlar növlər arasında fərqli olsa da, oxşar ardıcıllığın bir neçə elementibəzən qorunub saxlanılır. Da, də-10-35Başlama yerinin yuxarı hissəsində iki bölgə vartəşviqatçıkonsensus bir çox promotorlar və müxtəlif növlər arasında oxşar ardıcıllıqlar və ya bölgələr. Bəzi təşviqatçılar konsensus ardıcıllığına (ən çox yayılmış ardıcıllıq elementlərini ehtiva edən ardıcıllıq) çox oxşar bir ardıcıllığa sahib olacaqlar, digərləri isə çox fərqli görünəcəklər. Bu ardıcıllıq dəyişiklikləri transkripsiyaya başlamaq üçün transkripsiya mexanizminin promotorla bağlana biləcəyi gücə təsir edir. Bu, transkriptlərin sayına nəzarət etməyə kömək ediredilirvə nə qədər tez-tez hazırlanırlar.

Şəkil 2. (a) Genin ümumi diaqramı. Genin tərkibinə promotor ardıcıllığı, tərcümə olunmamış bölgə (UTR) və kodlaşdırma ardıcıllığı daxildir. (b) Bir neçə güclü E. coli siyahısıtəşviqatçıardıcıllıqlar. -35 qutu və -10 qutuyüksək səviyyədə qorunub saxlanılırgüclü promouter siyahısı boyunca ardıcıllıqlar. Zəif təşviqatçılar bu ardıcıllıqla müqayisədə daha çox baza cüt fərqinə malik olacaqlar.
Mənbə: http://www.discoveryandinnovation.co...mühazirə12.html

Bakterial və eukaryotik promotorlar

Bakterial hüceyrələrdə -10 bölgəsi adlanan -10 konsensus ardıcıllığı AT zəngin, çox vaxt TATAAT-dır. -35 ardıcıllığı, TTGACA,

tanınır

və proteinlə bağlanır σ. Bir dəfə bu protein-DNT qarşılıqlı əlaqəsi

edilir

, əsas RNT polimerazının alt bölmələri sahəyə bağlanır. AT assosiasiyalarının nisbətən aşağı sabitliyi səbəbindən AT-lə zəngin -10 bölgəsi DNT şablonunun açılmasını asanlaşdırır və

bir neçəfosfodiesteristiqrazlar edilir

.

Eukaryotik promotorlar prokaryotik promotorlardan daha böyük və mürəkkəbdirlər, lakin hər ikisi AT ilə zəngin bir bölgəyə malikdir - eukariotlarda

adətən adlanır

TATA qutusu. Məsələn, siçan timidin kinaz genində,

TATA qutusu yerləşir

saat

təxminən -30

. Bu gen üçün TATA qutusunun dəqiq ardıcıllığı TATAAAA-dır, 5'-dən 3' istiqamətində oxunur

şablon olmayan

ip. Bu ardıcıllıq ilə eyni deyil E. coli -10 bölgə ancaq hər ikisinin keyfiyyətini paylaşır

varlıq

AT ilə zəngin element.

Tək bakterial polimeraza əvəzinə, əksər eukariotların genomları hər biri on və ya daha çox protein alt vahidindən ibarət üç müxtəlif RNT polimerazını kodlayır. Hər bir eukaryotik polimeraza da kimi tanınan fərqli bir zülal dəsti tələb edir transkripsiya amilləri onu promouterə cəlb etmək. Bundan əlavə, digər transkripsiya faktorları ordusu, gücləndiricilər kimi tanınan zülallar və səsboğucular hər bir promotordan RNT sintezini tənzimləməyə kömək edir. Gücləndiricilər və səsboğucular transkripsiyanın səmərəliliyinə təsir göstərir, lakin təsir göstərir

lazım deyil

transkripsiyanın başlanması və ya onun gedişi üçün. Bazal transkripsiya faktorları a-nın formalaşmasında həlledici əhəmiyyətə malikdir ilkin hazırlıq kompleksi sonradan transkripsiyanın başlaması üçün RNT polimerazı cəlb edən DNT şablonunda.

Transkripsiyanın başlanğıcı RNT polimerazanın bağlanması ilə başlayır təşviqatçı. Transkripsiya üçün DNT ikiqat sarmal lazımdırqismən boşalmaqelə bir ip ola bilər kikimi istifadə olunsunRNT sintezi üçün şablon. Açılış bölgəsiadlanıra transkripsiya qabarcığı.

Şəkil 3. Uzatma zamanı RNT polimeraza DNT şablonu boyunca izləyir, sintez edirmRNT5'-dən 3' istiqamətə doğru açır və sonra DNT-ni olduğu kimi geri sararoxunur.

Uzatma

Transkripsiya həmişə ondan irəli gəlir şablon ipi, cüt zəncirli DNT-nin iki zəncirindən biri. RNT məhsulu şablon zəncirini tamamlayır və demək olar ki, eynidirşablon olmayanstrand, adlanır kodlaşdırma xətti, istisna olmaqla, RNT DNT-də olan timin (T) əvəzinə urasil (U) ehtiva edir. Uzatma zamanı bir ferment çağırılır RNT polimeraza DNT şablonu boyunca davam edir, DNT şablonu ilə əsas cütləşmə yolu ilə nukleotidləri DNT replikasiyasına bənzər şəkildə əlavə edir, fərq isə RNT zəncirinin olmasıdır.sintez olunurDNT şablonuna bağlı qalmır. Uzatma davam etdikcə DNTdavamlı olaraq açılmışdırəsas fermentdən qabaqda və onun arxasına qayıt. Qeyd edək ki, sintez istiqaməti ilə eynidirsynthebacımDNT-də - 5' - 3'.

Şəkil 4. Uzatma zamanı RNT polimeraza DNT şablonu boyunca izləyir, sintez edirmRNT5'-dən 3' istiqamətində, DNT-nin açılması və sonra geri sarılmasıoxunur.

Şəkil 5. Transkripsiya zamanı nukleotidlərin əlavə edilməsi nukleotidlərin əlavə edilməsinə çox oxşardırinDNT replikasiyası. RNTpolimerləşir5'-dən 3'-ə qədər və hər bir nukleotid əlavə edildikdə, afosfoanhidridbağdırhidrolizə olunurferment tərəfindən daha uzun bir polimer və iki qeyri-üzvi fosfatın sərbəst buraxılması ilə nəticələnir.
Mənbə: http://utminers.utep.edu/rwebb/html/...həsrət.html

Bakterial və eukaryotik uzanma

Bakteriyalarda uzanma, onun sərbəst buraxılması ilə başlayır σ polimerazadan bir alt vahid. -nin dissosiasiyası σ əsas fermentin sintez edərək DNT şablonu boyunca davam etməsinə imkan verir

mRNT

saniyədə təxminən 40 nukleotid sürətlə 5'-dən 3'-ə qədər. Uzatma davam etdikcə DNT

davamlı olaraq sökülür

əsas fermentdən qabaqda və onun arxasına qayıt. DNT və RNT arasındakı əsas cütləşməsi, sabitliyini qorumaq üçün kifayət qədər sabit deyil

mRNT

sintez komponentləri. Bunun əvəzinə, RNT polimeraza uzanmasını təmin etmək üçün DNT şablonu ilə yeni yaranan RNT zəncirləri arasında sabit bağlayıcı rolunu oynayır.

kəsilmir

vaxtından əvvəl.

Eukariotlarda, polimerazanın başlanğıc kompleksinin əmələ gəlməsindən sonra

azad edilir

digər transkripsiya faktorlarından və

uzadılmasına icazə verilir

polimeraza sintezi ilə prokaryotlarda olduğu kimi davam etmək

pre-mRNT

5'-dən 3' istiqamətində. Daha əvvəl müzakirə edildiyi kimi, RNT polimeraza II eukaryotik genlərin əsas hissəsini transkripsiya edir, buna görə də bu bölmədə bu polimerazanın uzanma və sonlanmanı necə həyata keçirdiyinə diqqət yetiriləcəkdir.


Mümkün NB müzakirəsi Nöqtə

DNT replikasiyasının başlanğıcı üçün enerji hekayəsini + transkripsiyanın başlanması üçün enerji hekayəsi ilə uzanma + uzanma ilə müqayisə edin və müqayisə edin.


Xitam

Bakteriyalarda

Bir dəfə gen

transkripsiya edilir

, bakterial polimeraza DNT şablonundan ayrılmalı və yeni yaradılmış molekulları azad etməlidir.

mRNT

. Transkripsiya edilən gendən asılı olaraq iki növ sonlandırma siqnalı var. Biri

a

zülal əsaslı, digəri isə RNT əsaslıdır. Rho-dan asılı sonlanma

nəzarət olunur

ilə

rho

artan polimeraza boyunca izləri olan protein

mRNT

zəncir. Genin sonuna yaxın polimeraza DNT şablonunda bir sıra G nukleotidləri ilə qarşılaşır və o, dayanır. Nəticədə,

rho

zülal polimeraza ilə toqquşur. rho ilə qarşılıqlı əlaqə azad edir

mRNT

transkripsiya qabarcığından.

Rho-müstəqil xitam

nəzarət olunur

DNT şablon zəncirindəki xüsusi ardıcıllıqla. Polimeraza transkripsiya edilən genin sonuna yaxınlaşdıqda, CG nukleotidləri ilə zəngin bir bölgə ilə qarşılaşır. The

mRNT

öz üzərinə qatlanır və tamamlayıcı CG nukleotidləri bağlanır

birlikdə

. Nəticə stabildir saç sancağı bu, polimerazanın dərhal dayanmasına səbəb olur

transkripsiya etməyə başlayır

AT nukleotidləri ilə zəngin bir bölgə. Tamamlayıcı UA bölgəsi

mRNT

transkript şablon DNT ilə yalnız zəif qarşılıqlı əlaqə yaradır. Bu, dayanmış polimeraza ilə birlikdə, əsas fermentin parçalanması və yenisini azad etməsi üçün kifayət qədər qeyri-sabitliyə səbəb olur.

mRNT

transkript.

Eukariotlarda

Müxtəlif polimerazlar üçün transkripsiyanın dayandırılması fərqlidir. Prokaryotlardan fərqli olaraq, eukariotlarda RNT polimeraza II ilə uzanma baş verir1,000– Transkripsiya olunan genin sonundan kənarda 2000 nukleotid. Bu əvvəlcədənmRNTquyruqsonra çıxarılırzamanı dekolte iləmRNTemal.Digər tərəfdən, RNTI və III polimerazlar xitam siqnallarını tələb edir. RNT polimeraza I tərəfindən transkripsiya edilmiş genlər spesifik 18-nukleotid ardıcıllığını ehtiva edir.tanınırsonlandırma zülalı ilə. RNT polimeraza III-də sonlanma prosesi a daxildirmRNTsaç tokası oxşarüçünprokaryotlarda transkripsiyanın rho-müstəqil dayandırılması.

Arxeyada

Arxeyada transkripsiyanın dayandırılması həyatın digər iki sahəsinə nisbətən daha az öyrənilmişdir.hələ də yaxşı başa düşülmür. Funksional təfərrüatlar, ehtimal ki, mövcud mexanizmlərə bənzəyirgörülübhəyatın digər sahələrində detallar kənardadırəhatə dairəsibu kurs.

Mobil yer

Bakteriyalarda və arxeyalarda

Bakteriyalarda və arxeyalarda transkripsiya baş verirsitoplazma,DNT haradayerləşir. Çünki DNT-nin yeri və beləliklə də transkripsiya prosesifiziki olaraq ayrılmırlarhüceyrənin qalan hissəsindən tərcümə tez-tez transkripsiya bitməmişdən əvvəl başlayır. Bu o deməkdir kimRNTbakteriyalarda vəarxeyaistifadə olunurbütövlükdə istehsal etməzdən əvvəl bir zülal üçün şablon kimimRNT. Məkan seqreqasiyasının olmaması həm də bu proseslər üçün çox az zaman seqreqasiyasının olması deməkdir. Şəkil 6 eyni vaxtda baş verən transkripsiya və tərcümə proseslərini göstərir.

Şəkil 6. Transkripsiya zamanı nukleotidlərin əlavə edilməsi nukleotidlərin əlavə edilməsinə çox oxşardırinDNT replikasiyası.
Mənbə:Mark T. Facciotti (öz işi)

Eukariotlarda....

Eukariotlarda transkripsiya prosesifiziki olaraq ayrılırhüceyrənin qalan hissəsindən, nüvənin içərisində sequestered. Bu iki şeylə nəticələnir:themRNTtamamlanırtərcümə başlamazdan əvvəl və "tənzimləmək" və ya "redaktə etmək" üçün vaxt varmRNTtərcümə başlamazdan əvvəl. Bu proseslərin fiziki ayrılması eukariotlara dəyişmək şansı verirmRNTömrünü uzatmaq üçünmRNTvə ya hətta protein məhsulunu dəyişdirəcəkistehsal olunsunetibarənmRNT.

MRNTemal

5' G-qapağı və 3' poli-A quyruğu

Nə vaxteukaryotikgentranskripsiya edilir, hüceyrə nüvədəki ilkin transkripti bir neçə yolla emal edir. Eukaryotik hüceyrələrdəyişdirməkmRNA-larpoli-A quyruğu əlavə etməklə 3' sonunda. A qalığının bu qaçışıəlavə olunurgenomik DNT-ni şablon kimi istifadə etməyən bir ferment tərəfindən. ThemRNA-lar5' ucunun kimyəvi modifikasiyası var, 5'-qapaq adlanır. Məlumatlar göstərir ki, bu dəyişikliklər hər ikisinin ömrünü uzatmağa kömək edirmRNT(sitoplazmada onun vaxtından əvvəl parçalanmasının qarşısını almaq) və kömək etməkmRNTtərcüməyə başlayın.

Şəkil 7. qabaqcadanmRNA-laremal olunurbir sıra addımlarla.İntronlarçıxarılır, 5' qapaq və poli-A quyruğuəlavə olunur.
Mənbə: http://www.discoveryandinnovation.co...mühazirə12.html

Mümkün NB müzakirəsi Nöqtə

Transkriptomika orqanizmin və ya populyasiyanın transkriptomunun və ya bütün RNT molekullarının tam dəstinin öyrənilməsini əhatə edən “-omikanın” bir qoludur. Transkriptom(lar)ı öyrənməkdən hansı məlumatı əldə edə bilərsiniz? Transkriptomik analizin həllinə kömək edə biləcəyi hər hansı gözəl elmi sual haqqında düşünə bilərsinizmi? Təhlillər apararkən nəzərə alına bilən transkriptomik yanaşmalar üçün hansı məhdudiyyətlər var?


Alternativ bağlama

Birləşmə əksər eukaryotiklərdə baş verirmRNA-larhansı intronlarçıxarılıretibarənmRNTardıcıllıq və ekzonlarbağlanırbirlikdə. Bu çox daha qısa yarada bilərmRNTilkin transkripsiyadan daha çox. Splicing hüceyrələrin qarışdırılmasına və uyğunlaşmasına imkan verirhansıekzonlardaxil edilirfinalamRNTməhsul. Aşağıdakı şəkildə göstərildiyi kimi, bu, birdən çox zülalın bir gen tərəfindən kodlanmasına səbəb ola bilər.

Şəkil 8. DNT-də saxlanılan məlumat sonludur.Bəzi hallarda, orqanizmlər müxtəlif son məhsullar yaratmaq üçün bu məlumatları qarışdıra və uyğunlaşdıra bilər. Eukariotlarda alternativ birləşmə müxtəlif birləşmələrin yaradılmasına imkan verirmRNTməhsulları, hansıöz növbəsindəistifadə olunurmüxtəlif protein ardıcıllığı yaratmaq üçün tərcümədə. Bu, nəticədə fərqli zülal formalarının istehsalına və beləliklə də fərqli protein funksiyalarının yaranmasına səbəb olur.
Mənbə: http://www.discoveryandinnovation.co...mühazirə12.html


Kitabları nəzərdən keçirin

Statistika Öyrənməyə Giriş son iyirmi ildə biologiyadan maliyyəyə, marketinqdən astrofizikaya qədər sahələrdə yaranmış geniş və mürəkkəb məlumat dəstlərini anlamlandırmaq üçün vacib alətlər dəsti olan statistik öyrənmə sahəsinin əlçatan icmalını təqdim edir. Bu kitab, müvafiq tətbiqlərlə yanaşı, ən mühüm modelləşdirmə və proqnozlaşdırma üsullarından bəzilərini təqdim edir. Mövzulara xətti reqressiya, təsnifat, yenidən nümunə götürmə üsulları, daralma yanaşmaları, ağac əsaslı metodlar, dəstək vektor maşınları, klasterləşdirmə və s. daxildir. Təqdim olunan metodları göstərmək üçün rəngli qrafika və real dünya nümunələri istifadə olunur. Bu dərsliyin məqsədi elm, sənaye və digər sahələrdə praktikantlar tərəfindən bu statistik öyrənmə üsullarından istifadəni asanlaşdırmaq olduğundan, hər bir fəsildə olduqca populyar açıq mənbəli statistik proqram platforması olan R-də təqdim olunan təhlil və metodların tətbiqi ilə bağlı təlimat var. . Müəlliflərdən ikisi statistika və maşın öyrənməsi tədqiqatçıları üçün məşhur istinad kitabı olan “Statistik Öyrənmə Elementləri”ni (Hastie, Tibşirani və Fridman, 2-ci nəşr 2009) birgə yazmışdır. Statistik öyrənməyə giriş eyni mövzuların çoxunu əhatə edir, lakin daha geniş auditoriya üçün əlçatan səviyyədədir. Bu kitab öz məlumatlarını təhlil etmək üçün qabaqcıl statistik öyrənmə üsullarından istifadə etmək istəyən həm statistiklər, həm də qeyri-statistiklər üçün nəzərdə tutulub. Mətn yalnız xətti reqressiyanın əvvəlki kursunu və matris cəbri haqqında məlumatın olmadığını nəzərdə tutur.


Giriş seçimləri

1 il ərzində jurnala tam giriş əldə edin

Bütün qiymətlər NET qiymətləridir.
ƏDV daha sonra ödəniş zamanı əlavə olunacaq.
Vergi hesablanması yoxlama zamanı yekunlaşacaq.

ReadCube-da vaxt məhdud və ya tam məqaləyə giriş əldə edin.

Bütün qiymətlər NET qiymətləridir.


TƏŞƏKKÜR

Bu iş Milli Bitki Genomu Tədqiqat İnstitutunun və Elm və Texnologiya Departamentinin əsas qrantı tərəfindən dəstəklənir - SERB Başlanğıc tədqiqat qrantı üçün AP. MT, Hökumətin Biotexnologiya Departamentinə təşəkkür edir. Ramalingaswami Təqaüdü (qrant № BT/HRD/35/02/2006) şəklində maliyyə yardımı üçün Hindistan. PKT TATA İnnovasiya Təqaüdü şəklində maliyyə dəstəyinə görə Nyu-Dehli Biotexnologiya Departamentinə təşəkkür edir. Müəlliflər e-resurslara çıxışı təmin etdiyinə görə DBT-eLibrary Consortium-a (DeLCON) minnətdardırlar.



Şərhlər:

  1. Goltigrel

    Çox mübahisəlidir, amma düşünməli bir şey var

  2. Amot

    Səhv olduğunuzu nəzərdə tuturam. Müzakirə edəcəyik. PM-də mənə yaz.

  3. Asopus

    Hmm ... belə olur.

  4. Aveneil

    Razıyam, əla mesaj



Mesaj yazmaq