Məlumat

Şiş Mikromühiti haqqında məlumat üçün məlumat anbarları?

Şiş Mikromühiti haqqında məlumat üçün məlumat anbarları?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Şiş Mikromühiti haqqında məlumat üçün hər hansı məlumat anbarı haqqında hər kəs bilirmi? Mən Xərçəng Gen Atlası və Gen İfadəsi Omnibus verilənlər bazalarını bilirəm, lakin TME-nin (molekulyar) tərkibinə dair məlumatlarla daha çox maraqlanıram. (Mən də daha az spesifik olan verilənlər bazası ilə maraqlanıram.)


St Jude Uşaq Araşdırma Xəstəxanasının PeCan Uşaq Xərçəngi məlumat anbarını görmüsünüzmü?

Onlar uşaq xərçənginin müxtəlif növləri haqqında çoxlu məlumatlara malikdirlər. Bunların hamısı genom və RNT seq şəklindədir. Bununla belə, onların həm də hər cür şişlərdə mutasiyalar və RNT nöqteyi-nəzərindən bu profillərin necə işlədiyini görə bilməniz üçün qurulmuş bir sıra vizualizasiyalar var.


DCB Araşdırma Resursları

DCB, tədqiqatlarında onlara kömək etmək üçün xərçəngi öyrənən alimlər üçün mövcud olan müxtəlif resursları dəstəkləyir. Bu resursların təsvirləri və onlara necə daxil olmaq barədə məlumatlar aşağıda verilmişdir. Tədqiqat alətləri ilə yanaşı, DCB NIH Citizen Science Working Group haqqında məlumatları paylaşır.

Tədqiqatçılar üçün NCI Resursları xərçəng tədqiqatçıları üçün NCI tərəfindən dəstəklənən alətlər və xidmətlər kataloqudur. Resursların əksəriyyəti pulsuzdur və hər kəs üçün əlçatandır.

NCI Mouse Repository siçan xərçəngi modelləri və əlaqəli suşlar üçün NCI tərəfindən maliyyələşdirilən resursdur. Repozitoriya ştammları elmi ictimaiyyətin bütün üzvlərinə (akademik, qeyri-kommersiya və kommersiya) təqdim edir. NCI Mouse Repository suşları krioarxivlənir və dondurulmuş germoplazma (embrionlar və/və ya sperma) kimi paylanır.

MikroRNA-lar (miRNA) gen ifadəsinin mənfi post-transkripsiya tənzimləməsi vasitəsilə fundamental hüceyrə proseslərində mühüm rol oynadığı bilinən kiçik kodlaşdırıcı olmayan RNT molekullarıdır. Milli Xərçəng İnstitutunun Xərçəng Biologiyası Bölməsi (DCB) insan xərçəngində mikroRNT-lərin oynadığı rolu, onların diaqnostik vasitə kimi istifadəsini və xərçəngin müalicəsində terapevtik müdaxilə üçün yeni hədəflər kimi potensial funksiyasını həll etmək üçün səy göstərərək ( NCI) ən məşhur siçan miRNA-larını saxlayan siçan embrion kök hüceyrələrinin (mESC) nəslini dəstəkləmişdir. Xərçəngdə onların rolu haqqında əldə edilmiş yeni məlumatları artırmaq üçün şərti mikroRNT transgenlərini özündə cəmləşdirən 1501 genetik mühəndislik mESC xətti istehsal edilmişdir.

Əlavə məlumat üçün NCI Mouse Repository veb saytına daxil olun.

NCI, bioloji əhəmiyyətli makromolekulların strukturlarını təyin etmək üçün ən müasir makromolekulyar kristalloqrafiya sinxrotron şüa xəttinin tikintisini və idarə edilməsini maliyyələşdirmək üçün Milli Ümumi Tibb Elmləri İnstitutu (NIGMS) ilə əməkdaşlıq etdi. Şüa xətti, GM/CA CAT, Çikaqodan bir qədər kənarda, Argonne Milli Laboratoriyasının ərazisində Qabaqcıl Foton Mənbəsində yerləşir.

NCI, qrant alanlarının istifadəsi üçün ayrılmış əhəmiyyətli miqdarda şüa vaxtına malikdir. Bu obyektə eksperiment aparmaqda maraqlı olan tədqiqatçılar birbaşa şüa xətti ilə əlaqə saxlamalı və ya əlavə məlumat üçün Dr. Anovarul Amin-ə e-poçt göndərməlidirlər.

Çernobıl Toxuma Bankı (CTB)

DCB insan xərçəngi biologiyası üzrə tədqiqat üçün insan bioloji nümunələrini (bionümunələri) və əlaqəli məlumat dəstini toplayan, saxlayan, emal edən və yayan bionümunə resurslarını dəstəkləyir və idarə edir. Çernobıl Toxuma Bankı, 1986-cı ildə Çernobıl qəzasından çox zərər çəkmiş iki ölkənin Rusiya və Ukraynanın fəal iştirakı ilə NCI və digər qlobal tərəfdaş tərəfindən dəstəklənən beynəlxalq əməkdaşlıq layihəsidir. CTB-nin məqsədi Çernobıl qəzasının əsas sağlamlıq nəticəsi olan tiroid xərçənginin biologiyasına dair tədqiqatları dəstəkləyən tədqiqat resursu yaratmaq və saxlamaqdır.

Bu Toxuma Bankı haqqında daha ətraflı məlumat üçün Çernobıl Toxuma Bankının veb saytına daxil olun.

Verner Sindromunun Beynəlxalq Qeydiyyatı

Werner Sindromunun Beynəlxalq Reyestri Verner Sindromu (WS) olan xəstələrdən alınan nümunələrin və məlumatların əsas anbarıdır və 1988-ci ildə WS geninin mövqeli klonlaşdırılması məqsədinin bir hissəsi kimi yaradılmışdır.

Reyestr insan tədqiqat iştirakçılarının limfoblastoidləri və/yaxud fibroblastlarından istifadə edərək, dünyanın hər yerindən yeni damazlıq halları müəyyən edir və genotipləşdirir və klassik WS-nin genetik təsdiqini təmin edir. O, həmçinin Epstein-Barr ilə transformasiya olunmuş periferik qan B limfositləri, ilkin dəri fibroblastları, ölümsüzləşdirilmiş dəri fibroblastları, WRN cDNA konstruksiyaları və s. daxil olmaqla, bu nəsillərdən (həm təsirlənmiş xəstələr, həm də onların klinik cəhətdən təsirlənməmiş bacı-qardaşları) hüceyrə xətlərini və digər materialları qurur və kriomühafizə edir. Bütün bu materiallar tədqiqat üçün mövcuddur.

Bu Reyestr haqqında ətraflı məlumat üçün Verner Sindromu Reyestrinin veb saytına daxil olun.

Bu əsas qurğu antigen-spesifik T hüceyrələrini ləkələmək üçün istifadə edilə bilən həll olunan MHC-peptid tetramer reagentlərinin xüsusi sintezini və paylanmasını təmin edir. Obyekt NCI-dən DCB vasitəsilə idarəedici komitənin iştirakı ilə Milli Allergiya və Yoluxucu Xəstəliklər İnstitutunun müqaviləsi ilə dəstəklənir.

Bu proqram haqqında daha ətraflı məlumat üçün Emory Universitetinin tetramer veb saytına daxil olun.

NCI tərəfindən maliyyələşdirilən tədqiqatçılar üçün reagentlər mövcuddur

Şiş Mikromühit Şəbəkəsi (TMEN) indi NCI tərəfindən maliyyələşdirilən xərçəng tədqiqatçıları üçün mövcud olan bir sıra resurslar yaratdı. Bu resurslara aşağıdakılar daxildir:

  • EHS (Engelbreth-Holm-Swarm) sarkomadan qaynaqlanan laminin zəngin matrisası
    • EHS sarkoması hüceyrədən əldə edilən hüceyrədənkənar matris hovuzu şiş-ev sahibi qarşılıqlı əlaqəsini öyrənmək üçün üçölçülü modellər üzərində işləyənlər üçün mövcuddur.
    • CD10-PE/Cy5, CD140b-Biotin, CD16-PE/Cy5, CD18-PE/Cy5, CD20-PE/Cy5, CD24-FITC, CD24-PE, CD2-PE/Cy5, CD31-Biotin, CD3-PE/ Cy5, CD44-APC, CD44-PE, CD45-PE/Cy5, CD45-PE/Cy7, CD64-Biotin, EGFR-FITC, EGFR-PE, EpCAM-APC, EpCAM-FITC, EpCAM-PE, H2Kd-Biotin, mCD45-PE/Cy5, SAV-PE/Cy5, SAV-PE/Cy7
    • Tərkibində ksenoqraftlar olan insan döş və kolon bərk şişlərinin xarakterik bir şiş bankı. Hər bir şiş növündən dondurulmuş şiş hüceyrələrinin flakonları istifadə üçün saxlanılmışdır. Resipiyentlər kök hüceyrələrin gücləndirilməsinə və öz qurumları üçün mərkəzi bank, eləcə də müəssisələrindən kənarda olan digər müstəntiqlər kimi xidmət etməyə cavabdeh olacaqlar.
    • Bu bankda C57BL/6J və C57BL/6-Tg-(UBC-GFP) 30 Scha/J siçan xəttindən olan sümük iliyi hüceyrələri var ki, lazım olduqda yenidən infuziya edilə bilər.
    • RCAS(A)-GFP – TVa siçanlarında GFP ifadəsi üçün quş retrovirus vektoru. Virus yaratmaq üçün vektorun DF1 hüceyrələrinə daxil edilməsi lazımdır. Normalda DF1 hüceyrələrinin özləri birbaşa siçanlara daxil edilir.
    • RCAS(B)-DsRed - TVb siçanlarında DsRed ifadəsi üçün quş retrovirus vektoru. Virusun yaranması üçün vektorun DF1 hüceyrələrinə daxil edilməsi lazımdır. Normalda DF1 hüceyrələrinin özləri birbaşa siçanlara daxil edilir.

    Bu reagentləri əldə etməkdə maraqlı olan tədqiqatçılar əlavə məlumat və reagent sorğu forması üçün NCI-nin Xərçəng Biologiyası Bölməsi, Dr. Jeff Hildesheim ilə əlaqə saxlamalıdırlar.

    Fizika Elmləri - Onkoloji Şəbəkə Bioresurs Əsas Müəssisəsi (PBCF)

    Fizika Elmləri - Onkoloji Şəbəkə Bioresurs Əsas Mexanizmi (PBCF), NIH tərəfindən maliyyələşdirilən bütün xərçəng tədqiqatçıları üçün mövcud olan qeyri-bədxassəli və xərçəngli hüceyrə xətlərinin, hüceyrə mədəniyyəti reagentlərinin və əlaqəli standart əməliyyat protokollarının təsdiqlənmiş dəstinə malik olan ATCC-də NCI tərəfindən maliyyələşdirilən bir mənbədir. .

    PBCF-nin xüsusiyyətlərinə aşağıdakılar daxildir:
    • Hər bir hüceyrə xəttinin və reagentlərin pulsuz qiyməti (göndərmə və emal ödənişləri tətbiq olunur)
    • Hüceyrə xətlərinin hər bir partiyası eyni lot nömrəsindən və keçid nömrəsindən yaranır, bu da onların birgə tədqiqatlar üçün istifadəsini ideal edir.
    • 8 xərçəng növündən və bədxassəli olmayan analoqlarından 41 fərqli hüceyrə xətti mövcuddur, hamısı ətraflı mədəniyyət SOP-ları ilə
    • Hər bir hüceyrə xəttinin ilk göndərilməsinə media/reagent başlanğıc dəsti daxildir (tələb olunarsa)
    • Bir çox hüceyrə xətləri üçün genomik, proteomik və fiziki səciyyələndirmə məlumatları mövcuddur.

    PBCF hüceyrə xətlərindən istifadə edərək nəşr edilmiş işin məlumat dəstləri PBCF və NCI-ə bildirilməlidir. Mövcud hüceyrə xətlərinin siyahısı və sifariş formaları haqqında məlumat üçün NCI Fizika Elmləri-Onkologiya Şəbəkəsinin Bioresurs veb səhifəsinə daxil olun və ya suallarınız üçün Dr. Nastaran Zahirə e-poçt göndərin.

    Xərçəng Mürəkkəbliyi Bilik Portalı

    Bu İcma Tədqiqat resursu Xərçəng Sistemləri Biologiya Konsorsiumu (CSBC), Fizika Elmləri - Onkologiya Şəbəkəsi (PS-ON) və Xərçəng Toxuma Mühəndisliyi Əməkdaşlıq Təşkilatı (TEC) vasitəsilə yaradılan məlumatlar, tədqiqatlar, alətlər və nəşrlər haqqında məlumat və onlara girişi təmin edir. .

    Əlavə məlumat üçün Xərçəng Mürəkkəbliyi Bilik Portalına müraciət edin.

    Biotibbi Vətəndaş Elmi və Crowdsourcing: NIH Vətəndaş Elmi İşçi Qrupu

    Bu trans-NIH işçi qrupu NIH-nin yüksək elmi və etik standartlarını qoruyan bir şəkildə vətəndaş elmi metodologiyalarının biotibbi tədqiqatlara faydalılığını və mümkün daxil edilməsini araşdırır.

    Vətəndaş elmi tədqiqatın subyektləri və ya tədqiqatın məsləhətçiləri kimi deyil, birbaşa əməkdaşlar və tədqiqat prosesinin özündə tərəfdaşlar kimi ictimaiyyəti cəlb edən tədqiqata birgə yanaşmadır. Vətəndaş elmi müxtəlif formalarda olur və ictimaiyyətin yaradıcılığından və problem həll etmə bacarıqlarından və ənənəvi yanaşmalarla əldə edilə bilməyən vətəndaşlar tərəfindən toplanan məlumatlardan və anlayışlardan faydalanan müxtəlif yanaşmaları əhatə edir.

    Bu işçi qrupu araşdırır, ən yaxşı təcrübələri bölüşür və digər sahələrdə vətəndaş elmini təbliğ edən digər agentliklər və qruplarla müzakirələr aparır. İşçi qrupu, vətəndaş elminin metodologiyasının qəbulunu və biotibbi tədqiqatlara daxil edilməsini davam etdirməkdə maraqlı olan NIH-dən olan proqram işçiləri, elmi araşdırma işçiləri və digərlərindən ibarətdir.


    MondoA-Tioredoxin-Qarşılıqlı Protein Oxusu Kolorektal Xərçəng Mikromühitində Tənzimləyici T-Hüceyrə Kimliyini və Funksiyasını Qorxur.

    Fon və məqsədlər: Kolorektal xərçəngdə intratumoral tənzimləyici T hüceyrələrinin (Tregs) metabolik xüsusiyyətləri və funksiyası birmənalı deyil. Şiş infiltrasiya edən Treglər yüksək qlükoza tükəndirici xüsusiyyətlər nümayiş etdirmək və qlükoza ilə məhdudlaşdırılmış mikromühitə uyğunlaşmaq üçün yenidən proqramlaşdırılır. Qlükoza cavab verən transkripsiya faktoru MondoA Treglərdə yüksək şəkildə ifadə edilir. Bununla belə, MondoA-nın qlükoza məhdudiyyətinə cavab olaraq kolorektal xərçəngə infiltrasiya edən Treglərdəki rolu hələ də aydınlaşdırılmalıdır.

    Metodlar: Treglərdə MondoA-nın şərti olaraq silindiyi siçanlardan və insan kolorektal xərçəng toxumalarından istifadə edərək tədqiqatlar apardıq. Treg metabolizmini qiymətləndirmək üçün dəniz atı və digər metabolik analizlərdən istifadə edilmişdir. Treglərin antitümör toxunulmazlığında rolunu öyrənmək üçün biz subkutan MC38 kolorektal xərçəng modelindən və azoksimetan və dekstran natrium sulfat tərəfindən siçanlarda kolitlə əlaqəli kolorektal xərçəngdən istifadə etdik.

    Nəticələr: Kolorektal xərçəngi olan xəstələrin təkhüceyrəli RNT ardıcıllığı məlumatlarının təhlili göstərdi ki, intratumoral Treglər MondoA-tioredoksinlə qarşılıqlı təsir göstərən zülal (TXNIP) oxunun aşağı aktivliyi və qlükoza qəbulunun artması ilə xarakterizə olunur. MondoA çatışmazlığı olan Treglər, subkutan MC38 şiş modelində T-köməkçi (Th) hüceyrə tip 1 (Th1) reaksiyalarına daha az immun supressiv və seçmə olaraq təşviq edilmiş olsalar da, Treg spesifik MondoA nokaut siçanları azoksimetan-DSS-nin yaratdığı rəngli xərçəngə daha çox həssas idi. MondoA-TXNIP oxunun mexaniki olaraq boğulması qlükoza qəbulunu və qlikolizi təşviq etdi, Th17 iltihabını asanlaşdıran hiperqlikolitik Th17-yə bənzər Tregləri induksiya etdi, CD8 + T-hüceyrələrinin tükənməsinin səbəb olduğu interleykin 17A-nı təşviq etdi və droveezi. İnterleykin 17A-nın blokadası şişin inkişafını azaldıb və MondoA çatışmazlığı olan siçanların kolorektal kanserogenezə həssaslığını minimuma endirdi.

    Nəticələr: MondoA-TXNIP oxu kolorektal xərçəng mikromühitində Treg şəxsiyyətinin və funksiyasının kritik metabolik tənzimləyicisidir və xərçəng müalicəsi üçün perspektivli hədəfdir.

    Açar sözlər: Kanserogenez Qlükoza İmmunosupressiya İltihab Transkripsiya faktoru.

    Copyright © 2021 AGA İnstitutu. Elsevier Inc tərəfindən nəşr edilmişdir. Bütün hüquqlar qorunur.


    Vaşinqton Universitetinin Açıq Təqaüdü

    Son iyirmi ildə həm hesablama biologiyası, həm də xərçəng biologiyası böyük irəliləyişlər əldə etdi və son 5 ildə ikisinin birləşməsi fərdi hədəflənmiş terapiya və xərçəngin müxtəlifliyi haqqında biliklərimizdə inqilab etməyə kömək etdi. Xərçəngdə şiş hüceyrələri və onların mikromühiti arasında hüceyrə-hüceyrə qarşılıqlı əlaqəsi şiş toxumasının biologiyasının və müalicəvi cavabların kritik təyinediciləridir. Qlioblastoma (GBM) hüceyrələri və endotelial hüceyrələr (EC) arasındakı qarşılıqlı təsirlər güman edilən kök hüceyrə yuvası yaradır. Bu qarşılıqlı təsirlərə vasitəçilik edən genlərin xüsusilə terapevtik hədəflər kimi vacib olacağını fərz etdik. GBM hüceyrələrinin və EC-lərin qarışıq fiziki kokulturasından ifadə məlumatlarını ayırmaq üçün yeni bir hesablama yanaşmasından istifadə edərək, EC-lərə cavab olaraq GBM hüceyrələrində cAMP spesifik fosfodiesteraz PDE7B-nin əvvəllər təsvir olunmamış yuxarı tənzimlənməsini müəyyən etdik. Bundan əlavə, yüksək PDE7B ifadəsinin əksər GBM vəziyyətlərində baş verdiyini və sağ qalmağa mənfi təsir etdiyini gördük. PDE7B həddindən artıq ifadəsi, kök kimi hüceyrə subpopulyasiyasının genişlənməsi, şişin aqressivliyinin artması və kəllədaxili GBM modelində böyümənin artması ilə nəticələndi. Bu dekonvolyutsiya alqoritmi xərçəng biologiyası üçün yeni bir alət təqdim edir, xüsusən də hüceyrə-hüceyrə qarşılıqlı əlaqəsinə baxarkən və bu nəticələr PDE7B-ni GBM-də terapevtik hədəf kimi müəyyən edir.


    Müzakirə

    Toxuma infiltrasiya edən immun və qeyri-immun stromal hüceyrələr gen ifadəsi təcrübələrində ölçülmüş siqnala kömək edir. Bu məlumatı əldə etmək, burada xərçəng nümunələrində təsvir olunan toxuma infiltrasiya edən hüceyrələrin [19] bolluğu haqqında təxminlər verə bilər. Bu məlumatdan istifadə etmək üçün biz istifadəsi asan R paketində tətbiq olunan MCP-sayğac metodunu hazırladıq.

    On fərqli MCP-nin hər biri üçün xal yaradır. Biz təsdiq etdik ki, bu ballar üç fərqli parametrdə dəqiq bolluq təxminləridir: a) MCP əks xalının müsbət və mənfi nümunələri (on hüceyrə populyasiyasının hər birinə nisbətən) yüksək spesifikliklə ayırdığı 4804 doğrulama MCP nümunəsinin transkriptomik profilləri və həssaslıq b) in vitro RNT qarışığı şəraitində, burada biz göstərdik ki, RNT-lərin çıxarıldığı hüceyrə populyasiyalarına uyğun olan MCP əks balları müvafiq hüceyrə populyasiyasının RNT hissəsi ilə yüksək korrelyasiya (Pirson korrelyasiya əmsalları 0,93-0,99 arasında dəyişir). qarışıqda və c) ex vivo şəraitdə MCP əks təxminlərinin müvafiq hüceyrə sıxlığının IHC ölçmələri ilə korrelyasiya olduğunu göstərdik. In vitro parametrindən istifadə edərək, Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 mikroarraylarından istifadə edərkən MCP sayğacının populyasiya üçün aşkarlamanın aşağı həddinin nümunənin ümumi RNT nisbətinin 2%-dən aşağı olduğunu göstərdik. Bu aşkarlama həddi daha həssas gen ifadə üsulları, Nanostring və ya RNT ardıcıllığı analizlərindən istifadə etməklə azaldıla bilər. Biz ardıcıl olaraq iki hüceyrə populyasiyası üçün qPCR məlumatlarından istifadə edərək aşkarlamanın aşağı hədlərini müşahidə etdik (Şəkil 3c).

    Heterojen toxumanın hüceyrə tərkibini kəmiyyətcə xarakterizə etmək üçün digər üsullara, xüsusən də axın sitometriyası və enzimatik İHC daxildir. MCP əks təxminləri konseptual olaraq IHC tərəfindən təxmin edilən hüceyrə sıxlığına (toxuma bölməsində səth vahidinə düşən hüceyrələrin sayı) yaxındır, çünki istehsal edilmiş təxminlər nümunələr üzrə müvafiq hüceyrə populyasiyalarının bolluğunu müqayisə etmək üçün istifadə edilə bilər. Bununla belə, IHC-dən fərqli olaraq, MCP sayğacı tək bir gen ifadəsi təcrübəsi ilə on hüceyrə populyasiyasının eyni vaxtda kəmiyyətini təyin etməyə imkan verir, IHC kəmiyyət göstəriciləri isə adətən bir neçə markerlə məhdudlaşır. IHC təcrübələrində mövcud olan hüceyrələrin məkan lokalizasiyası haqqında məlumatlar, transkriptomik texnologiyalardan istifadə edərkən itirilir. Nümunələrin ətrafdakı toxumalar tərəfindən çirklənməsinin qaçınılmaz olduğu hallarda, MCP-ə qarşı təxminlərin histoloji təsdiqi lazım ola bilər. T-hüceyrə reseptoru və ya B-hüceyrə reseptor lokusları ilə yenidən qurulmuş hüceyrələrin nisbətini təxmin etmək üçün DNT ardıcıllığı məlumatları da istifadə edilə bilər, bu iki populyasiyanın həm bolluğu, həm də repertuarı haqqında məlumat verir. MCP sayğacının təxminlər təqdim etdiyi digər səkkiz populyasiya DNT ardıcıllığı məlumatlarından istifadə etməklə ölçülə bilməz. Bununla belə, T və B hüceyrələrinin klonallığının öyrənilməsi bu hüceyrə populyasiyalarının bolluq təxminlərini tamamlamaq üçün maraqlı bir kovariasiyadır və bu yaxınlarda şiş nümunələrində nümayiş etdirildiyi kimi RNT-seq məlumatlarından əldə edilə bilər [20-22].

    MCP sayğacı, əsaslandığı TM dəstlərini müəyyən etmək üçün ciddi, qərəzsiz və mühafizəkar yanaşma nəticəsində əvvəllər dərc edilmiş digər TM əsaslı metodlardan [11, 12] öz xallarının şərhində daha həssas və spesifikdir ( Şəkil 4b) və ən əsası, eksperimental olaraq kəmiyyətcə təsdiq edilmişdir (Şəkil 3). O, bir nümunə daxilində müxtəlif hüceyrə populyasiyalarının nisbi nisbətlərini təsvir etmək məqsədi daşıyan CIBERSORT [9] kimi axın sitometriyası təcrübələrindən və ya axın sitometriyasından ilhamlanmış hesablama metodlarından konseptual olaraq fərqlənir (Şəkil 4a). Bunun əksinə olaraq, MCP sayğacı xüsusi olaraq bir çox nümunədə müəyyən bir hüceyrə populyasiyasının mütləq bolluğunu müqayisə etmək üçün nəzərdə tutulmuşdur.

    MCP-counter balları nümunələr üzrə müvafiq hüceyrə populyasiyasının bolluğu ilə xətti korrelyasiya edir, lakin onlar ixtiyari vahidlərlə ifadə edilir. Bu ixtiyari vahidlər məlumatları istehsal etmək üçün istifadə olunan gen ifadə platformasından asılıdır və yalnız eyni gen ifadə platformaları ilə istehsal olunan nümunələri müqayisə etmək olar. Buna baxmayaraq, biz göstərdik ki, cəmi 19.000-dən çox şişi təşkil edən və üç fərqli gen ifadə platforması ilə əldə edilən üç böyük şiş məlumat dəsti üzrə nisbi hüceyrə bolluğu əsasən ardıcıldır (Əlavə fayl 2: Şəkil S10), qiymətləndirmək üçün MCP sayğacının istifadəsini təsdiqləyir. hansı nümunələrin hər bir səciyyəvi hüceyrə populyasiyası tərəfindən ən çox və ya ən az infiltrasiya edildiyi. Buna baxmayaraq, MCP-sayğac xalları ümumiləşdirilmiş gen ifadə xüsusiyyətlərinə (məsələn, milyonlarla kilobaza üzrə oxunuşlara) əsaslandığından, bu xülasənin keyfiyyəti aşağı olarsa, onun dəqiqliyi pozula bilər. Bolluğu MCP sayğacı ilə təxmin edilən hüceyrə populyasiyaları adətən toxuma nümunələrində nisbətən aşağı tezliklərdə olur.Beləliklə, nadir transkriptlərin kəmiyyətinin yaxşılaşdırılması üçün bildirilmiş yüksək dərinlikdə (>80 milyon oxunuş) nümunələrin [23] ardıcıllaşdırılması RNT ardıcıllığı nümunələrindən MCP-əks təxminlərinin dəqiqliyini artıra bilər.

    Biz xəstə olmayan insan toxumalarında MCP sayğacının istifadəsini təsvir etdik və nümunələrin məlum immunoloji vəziyyətinə uyğun bolluq təxminlərini müşahidə etdik. 32 qeyri-hematopoetik insan bədxassəli şişlərində orta MCP hüceyrə bolluğunu təsvir etmək üçün MCP sayğacını tətbiq etdik. Bu təhlil şəffaf hüceyrəli böyrək hüceyrəli karsinomasının çox yüksək vaskulyarizasiyasını təsdiqlədi və göstərdi ki, tez-tez viral səbəb olan servikal skuamöz hüceyrəli karsinoma şişləri T limfositlər və xüsusilə sitotoksik T hüceyrələri tərəfindən yüksək dərəcədə infiltrasiya olunur, lakin digər immun alt qruplar tərəfindən orta dərəcədə. Digər nəticələr, məsələn, stromal şişlərin mikromühitində fibroblastik hüceyrələrin yüksək bolluğu (bu, deferensiallaşmış şiş hüceyrələrinin bir hissəsindən yarana bilər) və ya hepatoselüler karsinoma nümunələrinin nisbətən aşağı vaskulyarizasiyası kimi daha təəccüblü göründü. qaraciyərdə endotel hüceyrələri. Bu hallarda MCP sayğacı müəyyən bir xərçəng daxilində histopatoloji bilik və məlumatlar ilə müqayisə edilməlidir.

    MCP-sayğacı immun və stromal mikromühitlərin tərkibinə əsasən oxşar nümunələr kohortunu təbəqələşdirmək və ya zamanla mikromühitin tərkibini izləmək üçün ən uyğundur. MCP sayğacının istifadəsi OS və sitotoksik limfositlər tərəfindən şiş infiltrasiyaları arasında əhəmiyyətli birdəyişənli əlaqənin əsasən müsbət olduğunu təsdiqlədi [4]. Bunun əksinə olaraq, proqnoz və qeyri-immun stromal hüceyrə populyasiyalarının və xüsusilə fibroblastların geniş bolluğu arasında əhəmiyyətli assosiasiyaların MCP sayğacından istifadə etməklə əsasən mənfi olduğu göstərilmişdir. Nəşr edilmiş ədəbiyyata [1, 4, 6, 7] əsasən uyğun gələn bu müşahidələr, xəstələrin digər qruplarında MCP-nin proqnostik dəyərini qiymətləndirmək üçün MCP-sayğacının istifadəsini təsdiqləyir.

    MCP-sayğacı IHC yanaşmalarını tamamlayır, belə ki, o, tək bir gen ifadəsi təcrübəsini istifadə edərək on hüceyrə populyasiyasının təhlilinə imkan verir və beləliklə, histoloji məlumatlardan istifadə edərək təsdiq və məkan olaraq öyrənilə bilən tədqiqat fərziyyələrinin sürətli yaradılmasına imkan verir. Biz onun ağciyər adenokarsinomasını, kolorektal və döş şişlərini mikromühit tərəfindən müəyyən edilmiş alt qruplara ayrıca təsnif etmək üçün istifadəsini xüsusilə təsvir etdik. Bu şəraitdə biz əvvəllər nəşr olunmuş mikromühitə əsaslanan üç şiş təsnifatının proqnostik təsirini təsdiqləyə bildik. Bu nəticələr göstərir ki, MCP-sayğac yeni çox markerli mikromühit təbəqələrinin müəyyənləşdirilməsinə imkan verə bilər.

    MCP sayğacı mənfi nəzarət elementləri arasında 21 müxtəlif anatomik yerdən xərçəng hüceyrə xətlərinin gen ifadə profillərini ehtiva edən verilənlər bazasında müəyyən edilmiş TM-ə əsaslanır və geniş nümunələr diapazonunda tətbiqi təmin edir. Nəzarət nümunələrinin bu böyük müxtəlifliyi, bununla belə, müəyyən bir şəraitdə uyğun ola biləcək TM-ni ləğv edə bilər: məsələn, skrininq proseduru sinirin bədxassəli hüceyrələri tərəfindən ifadə edildiyi üçün NK hüceyrələrinin geniş istifadə olunan markeri olan NCAM1 (CD56) ləğv edildi. və buna görə də beyin nümunələrində NK hüceyrələrinin miqdarını təyin etmək üçün uyğun deyil. Beləliklə, bizim işləyib hazırladığımız ümumi çərçivə daha məhdud orqanlar dəstində araşdırma üçün əlavə TM müəyyən etmək üçün uyğunlaşdırıla bilər.

    MCP-sayğac potensial olaraq, incə iynə aspirasiya biopsiyaları kimi, İHC-ə əsaslanan kəmiyyətin qeyri-mümkün olduğu nümunələrdə immun infiltrasiyanı xarakterizə etmək üçün klinik rejimlərə daxil edilə bilər. Bu parametrdə nümunələr adətən bir-bir toplanır. Kəşfiyyat xarakterli analizlər üçün nəzərdə tutulmuş MCP sayğacının cari çox nümunəli istifadəsini tamamlamaq üçün istənilən gen ifadə platformasına yerləşmək və bir sıra kalibrləmə nümunələrindən istifadə etmək olar. Məsələn, burada təsvir edilən in vitro RNT qarışıqları MCP-sayğac bolluğu ballarını qeyri-ixtiyari vahidlərə, məsələn, nümunə daxilində müvafiq hüceyrələrin faizi kimi xəritələməyə kömək edə bilər. Bununla belə, klinik protokollar üçün lazım olan etibarlılığa nail olmaq üçün parametrə xas tənzimləmə tələb oluna bilər.


    İstinadlar

    Reinbach, G. Ueber das Verhalten der Leukocyten bei malignen Tumoren. tağ. f. Klin. Chir 46, 486–562 (1983).

    Lee, J. J., Jacobsen, E. A., McGarry, M. P., Schleimer, R. P. & Lee, N. A. Sağlamlıq və xəstəlikdə eozinofillər: LIAR hipotezi. Clin. Exp. Allergiya 40, 563–575 (2010).

    Rosenberg, H. F., Dyer, K. D. & amp Foster, P. S. Eozinofillər: sağlamlıq və xəstəlikdə dəyişən perspektivlər. Nat. Rev. İmmunol. 13, 9–22 (2013).

    Rothenberg, M. E. & amp Hogan, S. P. Eozinofil. Annu. Rev. İmmunol. 24, 147–174 (2006).

    Andersen, C. L. və başqaları. Qanda eozinofillərin sayının hematoloji bədxassəli şişlər və ölümlə əlaqəsi. am. J. Hematol. 90, 225–229 (2015).

    Fulkerson, P. C. Eozinofillərin inkişafında transkripsiya faktorları və terapevtik hədəflər kimi. Ön. Med. 4, 115 (2017).

    Sanderson, C. J. Interleukin-5, eozinofillər və xəstəlik. qan 79, 3101–3109 (1992).

    Collins, P. D., Marleau, S., Griffiths Johnson, D. A., Jose, P. J. & Williams, T. J. Eozinofillərin in vivo toplanmasına səbəb olmaq üçün interleykin-5 və kemokin eotaksin arasında əməkdaşlıq. J. Exp. Med. 182, 1169–1174 (1995).

    Rothenberg, M. E. et al. Normodens insan eozinofillərinin IL-5-dən asılı olaraq hipodens fenotipinə çevrilməsi inkişaf etmiş canlılıq, sürətlənmiş hipodenslik və davamlı antikordan asılı sitotoksiklik üçün 3T3 fibroblastlardan istifadə edir. J. İmmunol. 143, 2311–2316 (1989).

    Weller, P. F. & Spenser, L. A. Toxuma rezident eozinofillərin funksiyaları. Nat. Rev. İmmunol. 17, 746–760 (2017).

    Lee, J. J. və başqaları. İnsan və siçan eozinofilləri: "eozinofil dediyimiz hər hansı başqa adla qırmızı rəngə boyanır". J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 130, 572–584 (2012).

    Lewis, D. M., Lewis, J. C., Loegering, D. A. & Gleich, G. J. Qvineya donuzunun eozinofil əsas zülalının qranulun nüvəsinə lokallaşdırılması. J. Cell Biol. 77, 702–713 (1978).

    Egesten, A., Alumets, J., von Mecklenburg, C., Palmegren, M. & amp Olsson, I. İmmunoelektron mikroskopik texnika ilə insan eozinofillərində eozinofil kation zülalının, əsas əsas zülalın və eozinofil peroksidazın lokallaşdırılması. J. Histochem. Sitokimya. 34, 1399–1403 (1986).

    Spencer, L. A. və başqaları. İnsan eozinofilləri konstitutiv olaraq tez və differensial şəkildə ifraz olunan çoxsaylı Th1, Th2 və immunorequlyasiya edən sitokinləri ifadə edir. J. Leukok. Biol. 85, 117–123 (2009).

    Ayars, G. H., Altman, L. C., Gleich, G. J., Loegering, D. A. & amp Baker, C. B. Eozinofil və eozinofil qranullarının vasitəçiliyi ilə pnevmosit zədələnməsi. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 76, 595–604 (1985).

    Hamann, K. J. və başqaları. Mikrofilariyaların in vitro məhv edilməsi Brugia pahangiBrugia Malayi eozinofil qranul zülalları tərəfindən. J. İmmunol. 144, 3166–3173 (1990).

    Hisamatsu, K. et al. In vitro insan eozinofil qranulunun əsas əsas zülalının insan burun sinusunun selikli qişasına sitotoksikliyi. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 86, 52–63 (1990).

    Kubo, H., Loegering, D. A., Adolphson, C. R. & amp Gleich, G. J. Şiş hüceyrələri üçün eozinofil qranulunun əsas əsas zülalının sitotoksik xüsusiyyətləri. Int. tağ. Allergiya immunol. 118, 426–428 (1999).

    Arlandson, M. et al. Tiosiyanatın eozinofil peroksidaza oksidləşməsi. Əsas reaksiya məhsullarının xarakteristikası və potensial sulfhidril hədəflənmiş sitotoksiklik sistemi. J. Biol. Kimya. 276, 215–224 (2001).

    MacPherson, J. C. et al. Eozinofillər ağır astma zamanı azot oksidi törəmə oksidantların əsas mənbəyidir: reaktiv azot növlərinin əmələ gəlməsi üçün eozinofillər üçün mövcud olan yolların səciyyələndirilməsi. J. İmmunol. 166, 5763–5772 (2001).

    Rosenberg, H. F. RNase a ribonucleases və host müdafiəsi: inkişaf edən bir hekayə. J. Leukok. Biol. 83, 1079–1087 (2008).

    Ueki, S. və başqaları. Eozinofillərin hüceyrədənkənar DNT tələsinin hüceyrə ölümü insanlarda sərbəst sekresiyaya uyğun eozinofil qranullarının litik şəkildə sərbəst buraxılmasına vasitəçilik edir. qan 121, 2074–2083 (2013).

    Melo, R. C. & amp Weller, P. F. İnsan eozinofillərində lipid bədən orqanoidlərinin mürəkkəbliyini açmaq. J. Leukok. Biol. 96, 703–712 (2014).

    Patel, V. P. və başqaları. İki yeni insan C-C kemokininin molekulyar və funksional xarakteristikası, miyeloid atalarının iki fərqli sinifinin inhibitorları kimi. J. Exp. Med. 185, 1163–1172 (1997).

    Forssmann, U. et al. Eotaxin-2, kemokin reseptoru CCR3 üçün seçici olan və insan eozinofil və bazofil leykositlərində eotaksin kimi fəaliyyət göstərən yeni bir CC kemokinidir. J. Exp. Med. 185, 2171–2176 (1997).

    Shinkai, A. et al. IL-4 ilə stimullaşdırılan damar endotel hüceyrələrində ifadə olunan yeni insan CC kemokin, eotaksin-3, eozinofillərə qarşı güclü aktivlik nümayiş etdirir. J. İmmunol. 163, 1602–1610 (1999).

    Zimmermann, N., Hershey, G. K., Foster, P. S. və Rothenberg, M. E. Astmada Chemokines: kemokinlər və IL-13 arasında əməkdaşlıq qarşılıqlı əlaqə. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 111, 227–242 viktorina 243 (2003).

    Combadiere, C., Ahuja, S. K. & amp Murphy, P. M. İnsan eozinofil CC kemokin reseptorunun klonlaşdırılması və funksional ifadəsi. J. Biol. Kimya. 270, 16491–16494 (1995).

    Ponath, P. D. et al. Molekulyar klonlaşdırma və eozinofillərdə seçici şəkildə ifadə edilən insan eotaksin reseptorunun xarakteristikası. J. Exp. Med. 183, 2437–2448 (1996).

    Daugherty, B. L. et al. İnsan eozinofil eotaksin reseptorunun klonlaşdırılması, ifadəsi və xarakteristikası. J. Exp. Med. 183, 2349–2354 (1996).

    Bertrand, C. P. & Ponath, P. D. CCR3 blokadası astma üçün yeni bir müalicə olaraq. Ekspert. Rəy. Araşdırma. Narkotik 9, 43–52 (2000).

    Yang, M. et al. Eotaxin-2 və IL-5 ağciyərdə IL-13 istehsalını və hava eozinofiliyasını və hiperreaktivliyi tənzimləmək üçün əməkdaşlıq edir. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 112, 935–943 (2003).

    Papa, S. M. və b. IL-13 IL-5 və eotaksinə bağlı mexanizmlə ağciyərə eozinofillərin yığılmasına səbəb olur. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. 108, 594–601 (2001).

    Ellyard, J. I. və başqaları. Eotaksin heparini selektiv şəkildə bağlayır. Eotaksini proteolizdən qoruyan və in vivo kemotaktik aktivliyi gücləndirən qarşılıqlı təsir. J. Biol. Kimya. 282, 15238–15247 (2007).

    Simson, L. et al. IL-5 və CCL11 ilə kanserogenezin tənzimlənməsi: şiş immun nəzarətində eozinofillərin potensial rolu. J. İmmunol. 178, 4222–4229 (2007).

    Hung, K. et al. CD4 + T hüceyrələrinin antitümör immun cavabında mərkəzi rolu. J. Exp. Med. 188, 2357–2368 (1998).

    Zaynagetdinov, R. və b. İnterleykin-5 immun mikromühiti modulyasiya edərək ağciyər metastazını asanlaşdırır. Xərçəng Res. 75, 1624–1634 (2015).

    Ikutani, M. et al. Anadangəlmə IL-5 istehsal edən hüceyrələrin müəyyən edilməsi və onların ağciyər eozinofilinin tənzimlənməsində və antitümör toxunulmazlığında rolu. J. İmmunol. 188, 703–713 (2012).

    Cho, H. et al. CCL11 və CCL24 ifadəsi ilə əlaqəli kolorektal neoplazmalarda eozinofillər. J. Pathol. Tərcümə. Med. 50, 45–51 (2016).

    Teruya-Feldstein, J. et al. Hodgkin xəstəliyi ilə əlaqəli toxumalarda diferensial kemokin ifadəsi: eotaksin ifadəsi və toxuma eozinofiliyasının birbaşa əlaqəsi. qan 93, 2463–2470 (1999).

    Lorena, S. C., Oliveira, D. T., Dorta, R. G., Landman, G. & amp Kowalski, L. P. Şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyası olan və olmayan ağız skuamöz hüceyrəli karsinomalarda eotaksin ifadəsi. Şifahi. Dis. 9, 279–283 (2003).

    Reichman, H. et al. Aktivləşdirilmiş eozinofillər kolorektal xərçəngdə antitümörogen fəaliyyət göstərir. Xərçəng immunol. Res. 7, 388–400 (2019). Bu tədqiqat intratumoral eozinofilləri kütləvi RNT ardıcıllığına məruz qoyan ilk tədqiqatdır ki, bu da eozinofillər üçün güclü IFNγ ilə əlaqəli imzanı ortaya qoyur və bu, ehtimal ki, onların CRC-də antitümörogenik fəaliyyətinə vasitəçilik edir..

    Cheadle, E. J. et al. Eotaxin-2 və kolorektal xərçəng: immun terapiya üçün potensial hədəf. Clin. Xərçəng Res. 13, 5719–5728 (2007).

    Jundt, F. et al. Hodgkin/Reed-Sternberg hüceyrələri fibroblastları T hüceyrələri və eozinofillər üçün güclü kimyəvi cəlbedici olan eotaksin ifraz etməyə vadar edir. qan 94, 2065–2071 (1999).

    Lotfi, R., Lee, J. J. & amp Lotze, M. T. Eozinofilik qranulositlər və zərərlə əlaqəli molekulyar nümunə molekulları (DAMPs): şişlərdə iltihab reaksiyasında rol. J. İmmunother. 30, 16–28 (2007).

    Shik, D., Moshkovits, I., Karo-Atar, D., Reichman, H. & Munitz, A. Interleukin-33, miyeloid hüceyrələrin aktivləşdirilməsinin induksiyası üçün CMRF35 kimi molekul-1 ifadəsini tələb edir. Allergiya 69, 719–729 (2014).

    Dyer, K. D. və Rosenberg, H. F. HMGB1-in fizioloji konsentrasiyaları eotaksin-2-yə (CCL24) cavab olaraq sitokin vasitəçiliyi ilə eozinofilin sağ qalmasına və ya kemotaksisə heç bir təsir göstərmir. PLoS One 10, e0118887 (2015).

    Lin, F., Xue, D., Xie, T. & Pan, Z. HMGB1 hüceyrə kemokin sintezini təşviq edir və Rap1 aktivasiyası vasitəsilə mezenximal stromal hüceyrə miqrasiyasını gücləndirir. Mol. Med. Rep. 14, 1283–1289 (2016).

    Liew, F.Y., Girard, J. P. & Turnquist, H. R. Interleukin-33 sağlamlıq və xəstəlikdə. Nat. Rev. İmmunol. 16, 676–689 (2016).

    Liew, F. Y., Pitman, N. I. & amp McInnes, I. B. IL-33-ün xəstəliklə əlaqəli funksiyaları: IL-1 ailəsindəki yeni uşaq. Nat. Rev. İmmunol. 10, 103–110 (2010).

    Pecaric-Petkovic, T., Didichenko, S. A., Kaempfer, S., Spiegl, N. & Dahinden, C. A. İnsan bazofilləri və eozinofilləri IL-1 ailəsinin yeni üzvü IL-33-ün birbaşa hədəf leykositləridir. qan 113, 1526–1534 (2009).

    Curran, C. S. & Bertics, P. J. İnsan eozinofilləri RAGE ifadə edir, RAGE liqandları istehsal edir, PKC-δ fosforlaşmasını və RAGE liqandına, S100B-yə cavab olaraq gücləndirilmiş canlılıq nümayiş etdirir. Int. İmmunol. 23, 713–728 (2011).

    Chu, V. T. və başqaları. Eozinofillər immunoqlobulin-A-ifadə edən plazma hüceyrələrinin yaranmasına və saxlanmasına kömək edir və bağırsaq immun homeostazına kömək edir. İmmunitet 40, 582–593 (2014).

    Cormier, S. A. və başqaları. Əsas irəliləyiş: bərk şişlərin eozinofil infiltrasiyası ev sahibinin erkən və davamlı iltihablı cavabıdır. J. Leukok. Biol. 79, 1131–1139 (2006).

    Lee, J. J. & amp Lee, N. A. Eozinofil deqranulyasiyası: təkamül izi və ya universal dağıdıcı effektor funksiyası? Clin. Exp. Allergiya 35, 986–994 (2005).

    Dennis, K. L. və başqaları. Adenomatoz poliplər mikrob tərəfindən təhrik edilən fokal iltihabla idarə olunur və IL-10 istehsal edən T hüceyrələri tərəfindən idarə olunur. Xərçəng Res. 73, 5905–5913 (2013).

    Svensson, L. & Wenneras, C. İnsan eozinofilləri müxtəlif taksonomik qruplara aid olan bakteriyalar tərəfindən seçici olaraq tanıyır və aktivləşir. Mikroblar yoluxdurur. 7, 720–728 (2005).

    Bruijnzeel, P. L. və başqaları. Atopik dermatitdə eozinofil miqrasiyası. I: miqrasiya reaksiyalarının artması N-formil-metionil-leysil-fenilalanin, neytrofil aktivləşdirən amil, trombositləri aktivləşdirən amil və trombosit amili 4. J. İnvest. Dermatol. 100, 137–142 (1993).

    Svensson, L. et al. Ev tozu gənəsi allergen formil peptid reseptoru və formil peptid reseptoruna bənzər 1 vasitəsilə insan eozinofillərini aktivləşdirir. Avro. J. İmmunol. 37, 1966–1977 (2007).

    da Silva, J. M. və başqaları. Ağız kanserogenezində CCL3/CCR5 oxunun aktuallığı. Hədəf 8, 51024–51036 (2017).

    Hirai, H. və başqaları. Siçan kolon xərçəngi metastazını təşviq edən qaraciyər mikromühitində miyeloid hüceyrələrin CCR1 vasitəçiliyi ilə yığılması. Clin. Exp. Metastaz 31, 977–989 (2014).

    Gatault, S., Legrand, F., Delbeke, M., Loiseau, S. & Capron, M. Şiş əleyhinə reaksiyada eozinofillərin iştirakı. Xərçəng immunol. İmmun digər. 61, 1527–1534 (2012).

    Davis, B. P. və Rothenberg, M. E. Eozinofillər və xərçəng. Xərçəng immunol. Res. 2, 1–8 (2014).

    Qian, B. Z. & Pollard, J. W. Makrofaq müxtəlifliyi şişin inkişafını və metastazını artırır. Hüceyrə 141, 39–51 (2010).

    Biswas, S. K. & amp Mantovani, A. Makrofaqların plastikliyi və lenfosit alt qrupları ilə qarşılıqlı əlaqə: bir paradiqma kimi xərçəng. Nat. İmmunol. 11, 889–896 (2010).

    Fridlender, Z. G. et al. TGF-β ilə şişlə əlaqəli neytrofil fenotipinin qütbləşməsi: "N1" və "N2" TAN. Xərçəng Hüceyrəsi 16, 183–194 (2009).

    Mesnil, C. et al. Ağciyərdə yaşayan eozinofillər fərqli tənzimləyici eozinofil alt dəstini təmsil edir. J. Clin. İnvestisiya edin. 126, 3279–3295 (2016). Bu araşdırma, allergenlə mübarizə aparan siçanların ağciyərlərində əks fəaliyyət göstərən iki fərqli eozinofil populyasiyasını ortaya qoyur..

    Furbert-Harris, P. M. et al. Aktivləşdirilmiş eozinofillər prostat vəzinin şiş hüceyrələrində metastazın qarşısını alan E-kaderin molekulunu tənzimləyir. Cell Mol. Biol. 49, 1009–1016 (2003).

    Munitz, A. et al. 2B4 (CD244) insan eozinofillərində ifadə edilir və işləyir. J. İmmunol. 174, 110–118 (2005).

    Kataoka, S., Konishi, Y., Nishio, Y., Fujikawa-Adachi, K. & Tominaga, A. Hepatosellüler karsinomaya qarşı IL-5 və eotaksin tərəfindən aktivləşdirilmiş eozinofillərin antitümör fəaliyyəti. DNT Hüceyrə Biol. 23, 549–560 (2004).

    Lucarini, V. et al. IL-33 şiş böyüməsini məhdudlaşdırır və eozinofillər vasitəsilə melanoma daşıyan siçanlarda ağciyər metastazını maneə törədir. Onkoimmunologiya 6, e1317420 (2017).

    Gatault, S. et al. IL-18, LFA-1 və ICAM-1-i tənzimləməklə kolon karsinoma hüceyrə xəttinə qarşı eozinofil vasitəçiliyi ilə şiş öldürücü fəaliyyətdə iştirak edir. J. İmmunol. 195, 2483–2492 (2015).

    Legrand, F. et al. İnsan eozinofilləri kolon karsinoma hüceyrələrinə qarşı TNF-α və qranzim A vasitəçiliyi ilə şiş öldürücü fəaliyyət göstərir. J. İmmunol. 185, 7443–7451 (2010).

    Andreone, S. et al. IL-33, eozinofillərin xərçəng hüceyrələrinə CD11b/CD18 vasitəçiliyi ilə yapışmasını və şiş hüceyrələrinin öldürülməsinə səbəb olan sinaps-polyarizasiya olunmuş deqranulyasiyanı təşviq edir. Xərçənglər 11, 1664 (2019).

    Taylor, R., Lee, T. D. və amp Hoskin, D. W. Şiş öldürücü eozinofillərin MCA-38 kolon adenokarsinoma hüceyrələrinə yapışması protein tirozin kinaz aktivasiyasını əhatə edir və effektor hüceyrədə yüksəlmiş siklik AMP ilə azalır. Int. J. Oncol. 13, 1305–1311 (1998).

    Graziano, R. F., Looney, R. J., Shen, L. & amp Fanger, M. W. FcyR vasitəçiliyi ilə eozinofillərin öldürülməsi. J. İmmunol. 142, 230–235 (1989).

    Furbert-Harris, P. M. et al. Aktivləşdirilmiş eozinofillər MCF-7 döş çoxhüceyrəli şiş sferoidlərinə sızır. Antixərçəng Res. 23, 71–78 (2003).

    Mattes, J. et al. T helper 2 hüceyrələri tərəfindən sitotoksik T hüceyrələrinə davamlı şişlərin immunoterapiyası: eotaksin və STAT6-dan asılı proses. J. Exp. Med. 197, 387–393 (2003).

    Xing, Y. et al. CCL11-induksiya etdiyi eozinofillər qan damarlarının əmələ gəlməsini maneə törədir və şiş nekrozuna səbəb olur. Gen hüceyrəsi 21, 624–638 (2016).

    Yaffe, L. J. və Finkelman, F. D. Səth IgD-nin çarpaz bağlanması ilə T hüceyrəsini əvəz edən amil üçün B-limfosit reseptorunun induksiyası. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 80, 293–297 (1983).

    Carretero, R. et al. Eozinofillər şiş damarlarını normallaşdırmaq və CD8 + T hüceyrələrinin infiltrasiyasını artırmaqla xərçəngin rədd edilməsini təşkil edir. Nat. İmmunol. 16, 609–617 (2015). Bu zərif tədqiqat eozinofillərin damar sistemini tənzimləməklə TME-ni formalaşdırdığını göstərir və daha sonra nümayiş etdirir ki, IFNγ ilə aktivləşdirilmiş və TNF ilə aktivləşdirilmiş eozinofillər CD8-i gücləndirərək şişin rədd edilməsini təşviq edir. + T hüceyrələrinin toplanması və əyri makrofaq qütbləşməsi.

    Xie, F. et al. TSLP tərəfindən induksiya edilən eozinofillərin infiltrasiya və funksional tənzimlənməsi uşaqlıq boynu xərçəngi hüceyrəsinin yayılmasına kömək edir. Xərçəng Lett. 364, 106–117 (2015).

    Zhang, B. et al. TSLP, uşaqlıq boynu xərçəngi hüceyrələri və eozinofillər arasında qarşılıqlı əlaqəni gücləndirərək insan göbək venasının endotel hüceyrələrinin angiogenezini təşviq edir. Oncol. Lett. 14, 7483–7488 (2017).

    Stathopoulos, G. T. et al. Hostdan alınan interleykin-5 adenokarsinoma səbəb olan bədxassəli plevral efüzyonu təşviq edir. am. J. Respir. Tənqid. Qulluq Med. 182, 1273–1281 (2010).

    Eiro, N. et al. Döş karsinomalarının iltihablı molekulyar profili ilə uzaq metastazın inkişafı arasında əlaqə. PLoS One 7, e49047 (2012).

    Martinelli-Klay, C. P., Mendis, B. R. & Lombardi, T. Eozinofillər və oral skuamöz hüceyrəli karsinoma: qısa bir baxış. J. Oncol. 2009, 310132 (2009).

    Wong, D. T., Bowen, S. M., Elovic, A., Gallagher, G. T. & Weller, P. F. Eozinofil ablasyonu və şiş inkişafı. Şifahi. Oncol. 35, 496–501 (1999).

    Puxeddu, I. et al. İnsan periferik qan eozinofilləri angiogenezə səbəb olur. Int. J. Biochem. Hüceyrə Biol. 37, 628–636 (2005).

    Panaqopoulos, V. et al. İltihabi peroksidazlar, şiş mikromühitinin tənzimlənməsi yolu ilə siçanlarda döş xərçənginin inkişafını təşviq edir. Int. J. Oncol. 50, 1191–1200 (2017).

    Walsh, M. T., Connell, K., Sheahan, A. M., Gleich, G. J. & Costello, R. W.Eozinofil peroksidaza epidermal böyümə faktoru-2 vasitəsilə hüceyrə proliferasiyasını stimullaşdırır. am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 45, 946–952 (2011).

    Hennigan, K. et al. Eozinofil peroksidaza, HER2 reseptorunun əlaqəsi və aşağı axın MAPK hüceyrə siqnalı ilə β1-inteqrin qruplaşması ilə hüceyrələri aktivləşdirir. Clin. İmmunol. 171, 1–11 (2016).

    Curran, C. S., Evans, M. D. & Bertics, P. J. Glioblastoma hüceyrələri tərəfindən GM-CSF istehsalı eozinofillərin sağ qalmasında, aktivləşdirilməsində və şiş hüceyrələrinin yayılmasının artması üçün böyümə faktorunun istehsalında funksional rola malikdir. J. İmmunol. 187, 1254–1263 (2011).

    Yasukawa, A. et al. Eozinofillər bronxial epitel hüceyrələrinin epiteliyadan mezenxima keçidinə kömək edir. PLoS One 8, e64281 (2013).

    Kratochvill, F. et al. TNF M2 şiş makrofaqlarının yaranmasına qarşı tarazlıq yaradır. Cell Rep. 12, 1902–1914 (2015).

    Odemuyiwa, S. O. et al. Qabaqcıl cəhət: insan eozinofilləri indoleamin 2,3-dioksigenaz vasitəsilə T hüceyrə alt dəstinin seçimini tənzimləyir. J. İmmunol. 173, 5909–5913 (2004).

    Astigiano, S. et al. Eozinofil qranulositləri insan kiçik hüceyrəli olmayan ağciyər xərçəngində indoleamin 2,3-dioksigenaz vasitəçiliyi ilə immun qaçışını təşkil edir. Neoplaziya 7, 390–396 (2005).

    Simon, H. U. et al. İnterleykin-2 hipereozinofiliya və Wells sindromunda eozinofillərin deqranulyasiyasını əsaslandırır. Avro. J. İmmunol. 33, 834–839 (2003).

    Sosman, J. A. və başqaları. Rekombinant interleykin-4 qəbul edən xərçəng xəstələrində eozinofilin aktivləşməsinə dair sübutlar: tək interleykin-4-ün təsiri və interleykin-2 tətbiqindən sonra. Clin. Xərçəng Res. 1, 805–812 (1995).

    Ellem, K. A. və başqaları. Bir hadisə hesabatı: immunoterapiya üçün qranulosit/makrofaq-koloniya-stimullaşdırıcı-faktor-transduksiya edilmiş otoloji melanoma hüceyrələrinin ilk insan istifadəsinin immun reaksiyaları və klinik gedişatı. Xərçəng immunol. İmmun digər. 44, 10–20 (1997).

    Gebhardt, C. et al. İpilimumab ilə melanoma müalicəsində yeni proqnozlaşdırıcı markerlər kimi miyeloid hüceyrələr və əlaqəli xroniki iltihab faktorları. Clin. Xərçəng Res. 21, 5453–5459 (2015).

    Webster, R. M. İmmunitet nəzarət nöqtəsi inhibitorları: biz indi haradayıq? Nat. Rev. Drug. Discov. 13, 883–884 (2014).

    Pardoll, D. M. Xərçəng immunoterapiyasında immun nəzarət məntəqələrinin blokadası. Nat. Rev. Xərçəng 12, 252–264 (2012).

    Martens, A. et al. İpilimumab ilə müalicə olunan inkişaf etmiş melanoma xəstələrinin klinik nəticəsi ilə əlaqəli ilkin periferik qan biomarkerləri. Clin. Xərçəng Res. 22, 2908–2918 (2016).

    Lang, B. M. et al. Gündəlik həyat şəraitində metastatik melanoma - vemurafenib və ipilimumab əleyhinə müasir terapevtik agentlərlə uzunmüddətli sağ qalma. Med. Oncol. 35, 24 (2018).

    Moreira, A., Leisgang, W., Schuler, G. & Heinzerling, L. Eozinofilik melanoma xəstələrinin proqnozu və onun immunoterapiyaya cavabda əhəmiyyəti üçün biomarker kimi hesablanır. İmmunoterapiya 9, 115–121 (2017).

    Hude, I. et al. Leykosit və eozinofillərin sayı, PD1 inhibisyonu ilə müalicə olunan residiv və ya refrakter klassik Hodgkin lenfoma xəstələrində irəliləməsiz sağ qalmağı proqnozlaşdırır. Br. J. Hematol. 181, 837–840 (2018).

    Weide, B. et al. Pembrolizumab ilə müalicə olunan melanoma xəstələrinin nəticələri üçün ilkin biomarkerlər. Clin. Xərçəng Res. 22, 5487–5496 (2016).

    Rafei-Shamsabadi, D., Lehr, S., von Bubnoff, D. & amp Meiss, F. Yalnız nəzarət nöqtəsi inhibitorlarına əsas terapevtik müqaviməti olan metastatik melanoma olan xəstələrdə sistemli nəzarət nöqtəsi inhibitorları və intralezyonel interleukin-2-nin uğurlu kombinasiyası. Xərçəng immunol. İmmun digər. 68, 1417–1428 (2019).

    Alenmyr, L. et al. CTLA-4 blokadası aerozollaşdırılmış allergenə məruz qalan sadəlövh siçanlarda hava yollarının iltihabını təşviq edir, lakin inhalyasiya tolerantlığının qarşısını ala bilmir. Scan. J. İmmunol. 62, 437–444 (2005).

    Zheng, X. et al. CTLA4 blokadası eozinofillərin yığılması ilə döş şişlərində damarların normallaşmasına kömək edir. Int. J. Xərçəng 146, 1730–1740 (2020). Bu tədqiqat eozinofillərin CTLA4 blokadası ilə ortaya çıxan antitümör reaksiyasında mühüm effektor hüceyrələr olduğuna dair ilk mexaniki sübut təqdim edir..

    House, I. G. et al. Makrofaqdan əldə edilən CXCL9 və CXCL10 immun nəzarət nöqtəsinin blokadasından sonra antitümör immun cavabları üçün tələb olunur. Clin. Xərçəng. Res. 26, 487–504 (2019).

    Wolf, M. T. və başqaları. Bioloji iskele ilə əlaqəli tip 2 immun mikromühit şiş meydana gəlməsini maneə törədir və nəzarət nöqtəsi immunoterapiyası ilə sinergiya yaradır. Sci. Tərcümə. Med. 11, eat7973 (2019).

    Spolski, R., Li, P. və Leonard, W. J. IL-2-nin biologiyası və tənzimlənməsi: molekulyar mexanizmlərdən insan terapiyasına qədər. Nat. Rev. İmmunol. 18, 648–659 (2018).

    Rosenberg, S. A. IL-2: insan xərçəngi üçün ilk effektiv immunoterapiya. J. İmmunol. 192, 5451–5458 (2014).

    Van Gool, F. et al. İnterleykin-5 istehsal edən qrup 2 anadangəlmə limfoid hüceyrələri interleykin-2 terapiyası nəticəsində yaranan eozinofiliyaya nəzarət edir. qan 124, 3572–3576 (2014).

    Huland, E. & amp Huland, H. İnterleykin-2 ilə müalicə olunan xəstələrdə şişlə əlaqəli eozinofiliya: mesane xərçəngi hüceyrələrində zəhərli eozinofil deqranulyasiyasının sübutu. J. Xərçəng Res. Clin. Oncol. 118, 463–467 (1992).

    Abdel-Wahab, Z. et al. İnsan melanoma hüceyrələrinin interleukin-2 geni ilə ötürülməsi şişi azaldır və ev sahibinin antitümör toxunulmazlığını artırır: çılpaq siçan modeli. Hüceyrə immunol. 159, 26–39 (1994).

    Rivoltini, L. və başqaları. İnterleykinin subkutan tətbiqi ilə müalicə olunan xərçəng xəstələrinin eozinofillərinin in vitro şiş əleyhinə fəaliyyəti 2. İnterleykinin rolu 5. Int. J. Xərçəng 54, 8–15 (1993).

    Vlad, A. M. və başqaları. Platinə davamlı və ya platinə davamlı yumurtalıq xərçəngi olan xəstələrdə peritondaxili interleykin-2-nin II faza sınağı. Xərçəng immunol. İmmun digər. 59, 293–301 (2010).

    Ruffell, B., DeNardo, D. G., Affara, N. I. & amp Coussens, L. M. Xərçəng inkişafında limfositlər: şiş əleyhinə toxunulmazlığa qarşı qütbləşmə. Sitokin Böyümə Faktoru Rev. 21, 3–10 (2010).

    Reichman, H., Karo-Atar, D. & Munitz, A. Şiş mikromühitində eozinofillər üçün yaranan rollar. Trendlər Xərçəng 2, 664–675 (2016).

    Widmer, M. B., Acres, R. B., Sassenfeld, H. M. & Grabstein, K. H. İnsan periferik qanından sitolitik hüceyrə populyasiyalarının B hüceyrə stimullaşdırıcı amil 1 (interleykin 4) ilə tənzimlənməsi. J. Exp. Med. 166, 1447–1455 (1987).

    Rothenberg, M. E., Luster, A. D. & amp Leder, P. Murine eotaxin: endotel hüceyrələrində və interleykin 4 ilə induksiya olunan şişin yatırılmasında induksiya olunan bir eozinofil kemoatraktantı. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 92, 8960–8964 (1995).

    Tepper, R. I., Pattengale, P. K. & amp Leder, P. Murine interleukin-4 in vivo güclü şiş əleyhinə fəaliyyət göstərir. Hüceyrə 57, 503–512 (1989).

    Khazaie, K. və başqaları. Şiş hüceyrəsi ilə peyvənd edilmiş siçanların sümük iliyində hərəkətsiz şiş hüceyrələrinin davamlılığı uzunmüddətli immunoloji müdafiə ilə əlaqələndirilir. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 91, 7430–7434 (1994).

    Tepper, R. I., Coffman, R. L. və Leder, P. İnterleykin-4-ün antitümör təsiri üçün eozinofildən asılı mexanizm. Elm 257, 548–551 (1992). Bu tədqiqat göstərir ki, atimik çılpaq siçanlarda IL-4-ün konstitutiv ifadəsi şiş böyüməsinin azalması ilə əlaqəli şişlə əlaqəli eozinofil infiltratı yaradır və eozinofillərin xərçəngdə rolu ilə bağlı əlavə araşdırmaları stimullaşdırır..

    Saleh, M. Siçovul C6 glioma reqressiyasında şişdən əldə edilən mIL-4-ün rolu. Int. J. Oncol. 10, 1223–1227 (1997).

    Addison, C., Gauldie, J., Muller, W. & amp Graham, F. İnterleykin-4-ü ifadə edən adenoviral vektor şişi tənzimləyir və fare döş xərçəngi modelində reqressiyaya səbəb olur. Int. J. Oncol. 7, 1253–1260 (1995).

    Gao, K. və başqaları. IL-33-ün transgenik ifadəsi CD8 + T hüceyrələrini və NK hüceyrələrini aktivləşdirir və siçanlarda şiş böyüməsini və metastazını maneə törədir. Xərçəng Lett. 335, 463–471 (2013).

    Perales-Puchalt, A. et al. IL-33, allergik mikromühitə səbəb olan metastatik peritoneal xərçəngin inkişafını gecikdirir. Onkoimmunologiya 8, e1515058 (2019).

    Hollande, C. et al. Dipeptidil peptidaz DPP4 (CD26) inhibisyonu şiş böyüməsinin IL-33-dən asılı eozinofil vasitəçiliyi ilə idarə olunduğunu aşkar edir. Nat. İmmunol. 20, 257–264 (2019).

    Lu, B., Yang, M. & amp Wang, Q. İnterleukin-33 şişlərin meydana gəlməsində, şiş immun yayınmasında və xərçəng immunoterapiyasında. J. Mol. Med. 94, 535–543 (2016).

    Dougan, M., Dranoff, G. & Dougan, S. K. GM-CSF, IL-3 və IL-5 sitokinlər ailəsi: iltihab tənzimləyiciləri. İmmunitet 50, 796–811 (2019).

    Hoeller, C., Michielin, O., Ascierto, P. A., Szabo, Z. & amp Blank, C. U. İnkişaf etmiş melanoma olan xəstələrdə qranulosit-makrofaq koloniya stimullaşdırıcı amilin istifadəsinin sistematik nəzərdən keçirilməsi. Xərçəng immunol. İmmun digər. 65, 1015–1034 (2016).

    Dranoff, G. et al. Sıçan qranulosit-makrofaq koloniyasını stimullaşdıran amil ifraz etmək üçün hazırlanmış şüalanmış şiş hüceyrələri ilə peyvənd güclü, spesifik və uzunmüddətli anti-şiş toxunulmazlığını stimullaşdırır. Proc. Natl akad. Sci. ABŞ 90, 3539–3543 (1993).

    McNeel, D. G. et al. Sipuleucel-T qəbul edən metastatik kastrasiyaya davamlı prostat xərçəngi olan kişilərdə eozinofillərdə müvəqqəti artım uzun müddət sağ qalma ilə əlaqələndirilir. Xərçəng immunol. Res. 2, 988–999 (2014).

    Correale, P. et al. Kiçik hüceyrəli olmayan ağciyər xərçənginin iki həftədə bir gemsitabin və dosetaksel ± qranulosit-makrofaq koloniyasını stimullaşdıran amil və aşağı dozalı aldesleykin ilə ikinci sıra müalicəsi. Xərçəng Biol. Orada. 8, 497–502 (2009).

    Yang, D. et al. Eozinofildən əldə edilən nörotoksin dendritik hüceyrələrdə TLR2-MyD88 siqnal yolunu aktivləşdirmək üçün həyəcan siqnalı kimi çıxış edir və Th2 immun cavablarını gücləndirir. J. Exp. Med. 205, 79–90 (2008).

    Klion, A. D., Ackerman, S. J. & Bochner, B. S. Eozinofillərin insan sağlamlığına və xəstəliklərinə töhfələri. Annu. Rev. Pathol. 15, 179–209 (2020).

    Kuang, F. L. və başqaları. Hipereozinofilik sindrom üçün yüksək dozalı mepolizumab müalicəsinin uzunmüddətli klinik nəticələri. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. Təcrübə edin. 6, 1518–1527.e5 (2018).

    Murphy, K. et al. Eozinofilik astması olan xəstələrdə reslizumabın uzunmüddətli təhlükəsizliyi və effektivliyi. J. Allergiya Klinikası. İmmunol. Təcrübə edin. 5, 1572–1581.e3 (2017).

    Andersen, C. L. və başqaları. Qatı şişlərin inkişafı üçün biomarker kimi müntəzəm qan nümunələrində eozinofiliya - Kopenhagen İbtidai Baxım Diferensial Sayı (CopDiff) verilənlər bazasına əsaslanan bir araşdırma. Acta Oncol. 53, 1245–1250 (2014).

    Popov, H., Donev, I. S. & amp Ghenev, P. Təkrarlanan sidik kisəsi xərçəngində şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyasının kəmiyyət təhlili. Cureus 10, e3279 (2018).

    Lowe, D., Fletcher, C. D. & Gower, R. L. Sidik kisəsində şişlə əlaqəli eozinofiliya. J. Clin. Patol. 37, 500–502 (1984).

    Onesti, C. E. et al. Neoadjuvant müalicə alan üçlü-mənfi və hormon reseptor-mənfi/HER2-müsbət döş xərçəngi xəstələrində periferik qan eozinofillərinin sayının proqnozlaşdırıcı və proqnostik rolu. Hədəf 9, 33719–33733 (2018).

    Ownby, H. E., Roi, L. D., Isenberg, R. R. & Brennan, M. J. Periferik limfosit və eozinofil ilkin döş xərçəngində proqnoz göstəriciləri kimi hesablanır. Xərçəng 52, 126–130 (1983).

    Spiegel, G. W., Əşrəf, M. & amp Brooks, J. J. Eozinofillər servikal skuamöz neoplastik lezyonlarda işğal üçün bir marker kimi. Int. J. Gynecol. Patol. 21, 117–124 (2002).

    van Driel, W. J. et al. Uşaqlıq boynu xərçənginin şişlə əlaqəli eozinofilik infiltratı daha az effektiv immun cavab üçün göstəricidir. zümzümə. Patol. 27, 904–911 (1996).

    Prizment, A. E. et al. Şiş eozinofil infiltrasiyası və kolorektal xərçəng xəstələrinin sağ qalma müddəti: Ayova Qadın Sağlamlığı Araşdırması. Mod. Patol. 29, 516–527 (2016).

    Fernandez-Acenero, M. J., Galindo-Gallego, M., Sanz, J. & amp Aljama, A. Kolorektal karsinomada şişlə əlaqəli eozinofilik infiltratın proqnostik təsiri. Xərçəng 88, 1544–1548 (2000).

    Pretlow, T. P. et al. Proqnostik göstərici kimi insan kolon karsinomalarının eozinofil infiltrasiyası. Xərçəng Res. 43, 2997–3000 (1983).

    İşibaşı, S. və başqaları. İnsan özofagus skuamöz hüceyrəli karsinomasında şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyası. Xərçəng əleyhinə. Res. 26, 1419–1424 (2006).

    Zhang, Y. et al. Birincili kiçik hüceyrəli özofagus karsinomasında şiş infiltrasiya edən iltihablı hüceyrələrin klinik təsiri. Int. J. Mol. Sci. 15, 9718–9734 (2014).

    Songun, I. et al. Onkoproteinlərin ifadəsi və eozinofilik və limfositar infiltratların miqdarı mədə xərçəngində proqnostik faktor kimi istifadə edilə bilər. Hollandiya mədə xərçəngi qrupu (DGCG). Br. J. Xərçəng 74, 1783–1788 (1996).

    Iwasaki, K., Torisu, M. & Fujimura, T. Bədxassəli şiş və eozinofillər. I. Mədə xərçəngində proqnostik əhəmiyyəti. Xərçəng 58, 1321–1327 (1986).

    von Wasielewski, R. et al. Doku eozinofiliyası düyünlü sklerozan Hodgkin xəstəliyində pis proqnozla güclü şəkildə əlaqələndirilir və məlum proqnostik faktorlara imkan verir. qan 95, 1207–1213 (2000).

    Enblad, G., Sundstrom, C. & Glimelius, B. Hodgkin xəstəliyində eozinofillərin infiltrasiyası, limfa düyünlərinin cəlb edilməsi proqnozu proqnozlaşdırır. Hematol. Oncol. 11, 187–193 (1993).

    Dedi, M. et al. Doku eozinofiliyası: laringeal skuamöz neoplazmalarda stromal invaziyanın qiymətləndirilməsi üçün morfoloji marker. BMC Clin. Patol. 5, 1 (2005).

    Thompson, A. C., Bradley, P. J. & amp Griffin, N. R. Şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyası və qırtlaq karsinoması üçün uzunmüddətli proqnoz. am. J. Surg. 168, 469–471 (1994).

    Dorta, R. G. və başqaları. Şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyası ağız boşluğunun skuamöz hüceyrəli karsinomalarında proqnostik faktor kimi. Histopatologiya 41, 152–157 (2002).

    Jain, M. et al. Doku eozinofiliyasının ağız epitelial displaziyasında və oral skuamöz hüceyrəli karsinomada proqnostikator kimi qiymətləndirilməsi - görüntü təhlili tədqiqatı. Patol. Res. Int. 2014, 507512 (2014).

    Rakesh, N., Devi, Y., Majumdar, K., Reddy, S. S. & Agarwal, K. Şişlə əlaqəli toxuma eozinofiliyası ağız boşluğunda skuamöz hüceyrəli karsinomada lokal residivlərin proqnozlaşdırıcısı kimi. J. Clin. Exp. Dent. 7, e1–e6 (2015).

    Bishara, S. et al. Yumurtalıq xərçəngində proqnostik göstəricilər kimi müalicədən əvvəl ağ qan hüceyrələrinin alt növləri. Avro. J. Obstet. Ginekol. Reprod. Biol. 138, 71–75 (2008).

    Steel, J. L. et al. Xərçənglə əlaqəli simptom qrupları, eozinofillər və hepatobiliar xərçəngdə sağ qalma: kəşfiyyat tədqiqatı. J. Ağrı Simptomlarının İdarə Edilməsi. 39, 859–871 (2010).

    Shinke, G. et al. Hepatiktomiyadan sonra leykositlərin postoperatif pik sayı xolangiokarsinoma üçün əhəmiyyətli bir proqnoz faktorudur. Mol. Clin. Oncol. 10, 531–540 (2019).

    Meyerholz, D. K., Griffin, M. A., Castilow, E. M. & amp Varga, S. M. RSV peyvəndi ilə gücləndirilmiş iltihab modelində fare eozinofilinin aşkarlanması üçün histokimyəvi üsulların müqayisəsi. Toksikol. Patol. 37, 249–255 (2009).

    Yamaguchi, Y. et al. Hematopoetik inkişafda nəsil keçidinin modelləri: yeni miyeloid törədilən eozinofil hüceyrə xətti (YJ) trilineage potensialını nümayiş etdirir. Lösemi 12, 1430–1439 (1998).

    Macias, M. P. et al. Yeni bir fare eozinofil əsas əsas zülal (mMBP) geninin müəyyən edilməsi: mMBP-2-nin klonlaşdırılması və xarakteristikası. J. Leukok. Biol. 67, 567–576 (2000).

    Willetts, L. et al. Ağciyər toxumasının biopsiyalarında gizli eozinofillərin immunodeteksiyası kəskin ağciyər zədələnməsində sağ qalmağı proqnozlaşdırmağa kömək edə bilər. Tənəffüs. Res. 12, 116 (2011).

    Erjefalt, J. S. və başqaları. Eozinofil qranulositlərinin deqranulyasiya nümunələri eozinofil tərəfindən idarə olunan xəstəliyin determinantları kimi. Toraks 56, 341–344 (2001).

    Doyle, A. D. və başqaları. Eozinofil peroksidaza lokusuna homoloji rekombinasiya Cre rekombinazını eksklüziv olaraq eozinofillərdə ifadə edən siçanların ştammı yaradır. J. Leukok. Biol. 94, 17–24 (2013).

    Grace, J. O. et al. Hipotezlərin inkişafı üçün ictimai, genom miqyasında, siçan eozinofil ifadə məlumatlarının təkrar istifadəsi. J. Leukok. Biol. 104, 185–193 (2018).

    Zhu, F., Liu, P., Li, J. & amp Zhang, Y. Eotaxin-1, CCR3-ERK yolunun aktivləşdirilməsi və MMP-3 ifadəsinin tənzimlənməsi yolu ilə prostat xərçəngi hüceyrələrinin işğalını təşviq edir. Oncol. Rep. 31, 2049–2054 (2014).

    Levina, V. et al. Yumurtalıq xərçəngində eotaksin-1 siqnalının rolu. Clin. Xərçəng Res. 15, 2647–2656 (2009).

    Hitoshi, Y. et al. IL-5 reseptor-müsbət B hüceyrələrinin paylanması. Ly-1(CD5) + B hüceyrələrində IL-5 reseptorunun ifadəsi. J. İmmunol. 144, 4218–4225 (1990).

    Varricchi, G. et al. Eozinofillər: xərçəngdə görünməyən qəhrəmanlar? Onkoimmunologiya 7, e1393134 (2018).

    Chen, B., Khodadoust, M. S., Liu, C. L., Newman, A. M. & Alizadeh, A. A. CIBERSORT ilə immun hüceyrələrə infiltrasiya edən şişin profilləşdirilməsi. Metodlar Mol. Biol. 1711, 243–259 (2018).


    MÜZAKİRƏ

    Xərçəng immunoterapiyası son illərdə xərçəng müalicəsinə bir paradiqma dəyişikliyi gətirdi. TME-də kompleks hüceyrə tipli kompozisiyaları və ifadə heterojenliyini deşifrə etmək üçün çoxsaylı scRNA-seq verilənlər bazası yaradılmışdır. Bununla belə, TME scRNA-seq məlumatlarının təkrar istifadəsi üçün yaxşı seçilmiş, vahid şəkildə işlənmiş və şərh edilmiş məlumat portalı hələ də mövcud deyil. Bu kontekstdə biz TISCH-ni xərçəng bioloqları üçün TME-də tək hüceyrəli gen ifadəsini araşdırmaq və vizuallaşdırmaq üçün hərtərəfli tək hüceyrəli veb portal kimi təqdim edirik. TISCH mövcud tək hüceyrəli şiş resursları ilə müqayisədə bir sıra üstünlüklər göstərir. Birincisi, TISCH, 27 xərçəng növündən təxminən 2 milyon hüceyrənin tək hüceyrəli transkriptom atlası da daxil olmaqla, məlumatımız üçün ən əhatəli TME tək hüceyrəli məlumat portalıdır. TISCH-də mövcud olan müxtəlif hüceyrə növləri və xərçəng növləri istifadəçilərə TME heterojenliyini sistematik və bütöv şəkildə araşdırmaq imkanı verir. İkincisi, bütün TISCH məlumat dəstləri vahid şəkildə işlənmiş, annotasiya edilmiş və əl ilə seçilmişdir ki, bu da çarpaz tədqiqatların müqayisəsi üçün maneələri aradan qaldırır və məlumatların təkrar istifadəsinə üstünlük verir. Nəhayət, təqdim edilən meta-məlumatla TISCH xərçəng müalicəsi üçün potensial klinik göstəriciləri göstərən müxtəlif xəstələr, immunoterapiya müalicə qrupları və cavab qrupları arasında müqayisə aparmağa imkan verir.

    Xülasə, TISCH TME təkhüceyrəli transkriptomik məlumatları üçün faydalı repozitordur. O, tək hüceyrəli rezolyusiyada çoxlu məlumat dəstləri arasında hüceyrə fərqlərinin interaktiv gen ifadəsi vizuallaşdırılması üçün istifadəçi dostu veb resurs təqdim edir. TISCH xərçəng bioloqları və immuno-onkoloqlar üçün TME-də gen tənzimlənməsi və immun siqnalizasiyanı öyrənmək, yeni dərman hədəflərini müəyyən etmək və terapiya cavabı haqqında fikirlər vermək üçün dəyərli mənbə olacaq. Gələcəkdə biz TISCH-i təkmilləşdirmək üçün səy göstərməyə davam edəcəyik. Yeni məlumat dəstlərini inteqrasiya etmək üçün biz müntəzəm olaraq veb resurslarını saxlayacağıq. Biz həmçinin TISCH-də gen-gen birgə ifadəsi və tək hüceyrə səviyyəsində ekspressiya korrelyasiyalarına əsaslanan hüceyrə-hüceyrə qarşılıqlı əlaqəsi kimi yeni funksiyaları təmin edəcəyik. Artan sayda ictimai TME scRNA-seq məlumatı mövcud olduğundan, biz TISCH veb resursunun davamlı inkişafının və texniki xidmətinin daha geniş xərçəng tədqiqat cəmiyyətinə fayda verəcəyini gözləyirik.


    İstinadlar

    Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Xərçəng statistikası, 2019 (ABŞ statistikası). CA Xərçəng J Clin. 201969(1):7–34. https://doi.org/10.3322/caac.21551.

    Howlader N, Noone AM, Krapcho M, Miller D, Brest A, Yu M, et al., redaktorlar. SEER xərçəng statistikası icmalı, 1975-2017, Milli Xərçəng İnstitutu. Bethesda 2020. https://seer.cancer.gov/csr/1975_2017/, 2019-cu ilin Noyabr SEER məlumatlarının təqdim edilməsinə əsaslanır.

    Yachida S, Lacobuzio-Donahue CA. Metastatik pankreas xərçənginin patologiyası və genetikası. Arch Pathol Lab Med. 2009:133(3):413–22.

    Kruger S, Haas M, Burger PJ, Ormanns S, Modest DP, Westphalen CB və s. İzolyasiya olunmuş ağciyər metastazları metastatik pankreas xərçəngində əlverişli alt qrup müəyyən edir. Pankreatologiya. 201616:593–8 Elsevier B.V.

    Deeb A, Haque SU, Olowokure O. Pankreas xərçəngində ağciyər metastazları, sağ qalma təsiri varmı? J Gastrointest Oncol. 20156: E48–51 Pioneer Bioscience Publishing.

    Yamashita K, Miyamoto A, Hama N, Asaoka T, Maeda S, Omiya H və s. Pankreas duktal adenokarsinomanın təkrarlanması kimi ağciyər metastazının sağ qalma təsiri. Dig Surg. 201532(6):464–71. https://doi.org/10.1159/000439545.

    Tumeh PC, Hellmann MD, Hamid O, Tsai KK, Loo KL, Gubens MA, et al. Melanoma və NSCLC olan xəstələrdə qaraciyər metastazı və anti-PD-1 monoklonal antikor ilə müalicənin nəticəsi. Xərçəng İmmunol Res. 20175:417-24 Amerika Xərçəng Araşdırmaları Assosiasiyası Inc.

    Tazdait M, Mezquita L, Lahmar J, Ferrara R, Bidault F, Ammari S, et al. PD-1 və ya PDL-1 inhibitor terapiyası zamanı metastatik NSCLC-də cavab nümunələri: RECIST 1.1, IRRECIST və iRECIST meyarlarının müqayisəsi. Eur J Xərçəng.201888:38–47 Elsevier Ltd.

    Oliver AJ, Lau PKH, Unsworth AS, Loi S, Darcy PK, Kershaw MH, et al. Toxumadan asılı şiş mikromühitləri və onların immunoterapiya reaksiyalarına təsiri. Ön immunol. 20189:70 Frontiers Media S.A.

    Sharma G, Colantuoni C, Goff LA, Fertig EJ, Stein-O'Brien G. projectR: PCA, NMF, korrelyasiya və klasterləşdirmə vasitəsilə köçürmə öyrənilməsi üçün R/Biokeçirici paketi. Valensiya A, redaktor. Bioinformatika. 202036:3592–3 Oxford University Press.

    Jin X, Demere Z, Nair K, Ali A, Ferraro GB, Natoli T, et al. İnsan xərçəngi hüceyrə xətlərinin metastaz xəritəsi. Təbiət. 2020588(7837):331–6. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2969-2 Təbiət Araşdırmaları.

    Foley K, Rucki AA, Xiao Q, Zhou D, Leubner A, Mo G, et al. Semaphorin 3D avtokrin siqnalı mədəaltı vəzi xərçəngində anneksin A2-nin metastatik roluna vasitəçilik edir. Elmi siqnal. Dos Adv Sci. 20158(388):ra77.

    Hingorani SR, Wang L, Multani AS, Combs C, Deramaudt TB, Hruban RH, et al. Trp53R172H və KrasG12D siçanlarda xromosom qeyri-sabitliyini və geniş metastatik pankreatik kanal adenokarsinomasını təşviq etmək üçün əməkdaşlıq edir. Xərçəng Hüceyrəsi. 20057(5):469–83. https://doi.org/10.1016/j.ccr.2005.04.023.

    Li B, Li T, Pignon JC, Wang B, Wang J, Shukla SA və s. İnsan xərçənglərinin şiş infiltrasiya edən T hüceyrə repertuarının mənzərəsi. Nat Genet. 201648(7):725–32. https://doi.org/10.1038/ng.3581 Nature Publishing Group.

    Kinkead HL, Hopkins A, Lutz E, Wu AA, Yarchoan M, Cruz K, et al. STING əsaslı neoantigen hədəflənmiş peyvəndi nəzarət nöqtəsi modulyatorları ilə birləşdirmək siçan mədəaltı vəzi xərçəngində antitümör toxunulmazlığını artırır. JCI Insight NLM (Medline). 20183(20):e122857.

    Yoshimura K, Soares KC, Jaffee E, Schulick RD, Olino K, Jain A və s. Qaraciyər metastazlarının preklinik siçan modeli. J Vis Exp. 2014(91):e51677. MyJoVE Korporasiyası.

    Warde-Farley D, Donaldson SL, Comes O, Zuberi K, Badrawi R, Chao P, et al. GeneMANIA proqnozlaşdırma serveri: genlərin prioritetləşdirilməsi və gen funksiyasının proqnozlaşdırılması üçün bioloji şəbəkə inteqrasiyası. Nuklein turşuları Res. 201038(əlavə_2):W214–20. https://doi.org/10.1093/nar/gkq537.

    Wang J, Sanmamed MF, Datar I, Su TT, Ji L, Sun J, et al. Fibrinogen kimi protein 1 LAG-3-ün əsas immun inhibitor liqandıdır. Hüceyrə. 2019176:334–347.e12 Cell Press.

    Nagarsheth N, Wicha MS, Zou W. Xərçəng mikromühitində Chemokines və xərçəng immunoterapiyasında onların aktuallığı. Nat Rev İmmunol. 2017:17(9):559–72 Təbiət Nəşriyyat Qrupu.

    O'Donnell JS, Long GV, Scolyer RA, Teng MWL, Smyth MJ. PD1/PDL1 yoxlama nöqtəsinin inhibəsinə qarşı müqavimət. Xərçəng Müalicəsi Rev. 2017:9:71–81 W.B. Saunders Ltd.

    Simonetti O, Goteri G, Lucarini G, Filosa A, Pieramici T, Rubini C və s. CCL27 və CCR10 ifadəsinin melanoma inkişafında və immun qaçışında potensial rolu. Eur J Xərçəng. 200642(8):1181–7. https://doi.org/10.1016/j.ejca.2006.01.043.

    Tselepis A, Grant AJ, Walker LSK, Bertus Eksteen DH, Miles A, Curbishley SM. CCR10 CCL28 istehsalını ifadə edən tənzimləyici T hüceyrələri və epitelial iltihabın cəlb edilməsi 2021-ci ilə bağlıdır.

    Obermajer N, Muthuswamy R, Odunsi K, Edwards RP, Kalinski P. PGE 2 ilə səbəb olan CXCL 12 istehsalı və CXCR4 ifadəsi yumurtalıq xərçəngi mühitində insan MDSC-lərinin yığılmasına nəzarət edir. Xərçəng Res. 201171(24):7463–70. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-11-2449 NIH Public Access.

    Chen Y, Ramjiawan RR, Reiberger T, Ng MR, Hato T, Huang Y, et al. Şiş mikromühitində CXCR4 inhibisyonu siçanlarda sorafeniblə müalicə olunan hepatoselüler karsinomada anti-proqramlaşdırılmış ölüm reseptoru-1 immunoterapiyasını asanlaşdırır. Hepatologiya. 201561:1591–602 John Wiley and Sons Inc.

    Li J, Byrne KT, Yan F, Yamazoe T, Chen Z, Baslan T, et al. İmmun hüceyrə infiltrasiyasının heterojenliyinin və immunoterapiyaya cavabın əsasında şiş hüceyrəsinin daxili amilləri dayanır. İmmunitet. 201849:178–193.e7.

    Stein-O'Brien GL, Clark BS, Sherman T, Zibetti C, Hu Q, Sealfon R, et al. Hüceyrə ölçüləri, platformalar, toxumalar və növlər arasında öyrənmənin ötürülməsi üçün hüceyrə şəxsiyyətinin parçalanması. Hüceyrə sistemi. 20198:395–411.e8 Cell Press.

    Fernandez E, Mahmud YD, Veigas F, Rocha D, Balzarini M, Lujan HD və s. MIXTURE: gen ifadəsi məlumatlarına əsaslanan immun şiş mikromühitinin qiymətləndirilməsi üçün təkmilləşdirilmiş alqoritm. bioRxiv. 2019: 726562. https://doi.org/10.1101/726562. Cold Spring Harbor Laboratoriyası.

    Thorsson V, Gibbs DL, Brown SD, Wolf D, Bortone DS, Ou Yang TH, et al. Xərçəngin immun mənzərəsi. İmmunitet. 201848:812–830.e14 Cell Press.

    Feig C, Jones JO, Kraman M, Wells RJB, Deonarin A, Chan DS, et al. FAP-ifadə edən karsinoma ilə əlaqəli fibroblastlardan CXCL12-nin hədəflənməsi pankreas xərçəngində anti-PD-L1 immunoterapiyası ilə sinergiya yaradır. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013110(50):20212–7. https://doi.org/10.1073/pnas.1320318110.

    Greene GF, Kitadai Y, Pettaway CA, Von Eschenbach AC, Bucana CD, Fidler IJ. In situ messenger RNT hibridləşdirmə texnikasından istifadə edərək çılpaq siçanlara implantasiya edilmiş insan prostat karsinoma hüceyrələrində metastazla əlaqəli gen ifadəsinin metastatik potensial ilə korrelyasiyası. J Pathol. 1997150(5):1571–82.

    Singh RK, Bucana CD, Gutman M, Fan D, Wilson MR, Fidler IJ. İnsan böyrək hüceyrəli karsinoma hüceyrələrində əsas fibroblast böyümə faktorunun orqan yerindən asılı ifadəsi. J Pathol. 1994145(2):365–74.

    Hoover M, Adamian Y, Brown M, Maawy A, Chang A, Lee J, et al. FFPE nümunələrindən RNT çıxarılması üçün yeni üsul ortotopik və subkutan pankreas xərçəngi xəstələrindən əldə edilən ksenoqraftlar arasında biomarker ifadəsində əhəmiyyətli fərqləri aşkar edir. Hədəf. 20178:5885–94 Impact Journals MMC.

    Nakamura T, Fidler IJ, Coombes KR. Metastatik insan mədəaltı vəzi xərçəngi hüceyrələrinin gen ifadə profili orqan mikromühitindən asılıdır. Xərçəng Res. 200767(1):139–48. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-06-2563.

    Choudhury A, Moniaux N, Ulrich AB, Schmied BM, Standop J, Pour PM və s. İnsan pankreas şişlərində MUC4 mucin ifadəsi orqan mühitindən təsirlənir: TGFβ2-nin mümkün rolu. Br J Xərçəng. 200490(3):657–64. https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6601604.

    Zhan B, Wen S, Lu J, Shen G, Lin X, Feng J, et al. Pankreas xərçənginin ortotopik və subkutan ksenoqraft arasında metabonomik fərqin müəyyən edilməsi və səbəbləri. Hədəf. 20178:61264–81 Impact Journals MMC.

    Gutman M, Singh RK, Xie K, Bucana CD, Fidler IJ. İnsan melanoma hüceyrələrində interleykin-8 ifadəsinin orqan mühiti ilə tənzimlənməsi. Xərçəng Res. 199555(11):2470–5.

    Hensel JA, Khattar V, Ashton R, Lee C, Siegal GP, Ponnazhagan S. Şişin yeri yerli və uzaq immun hüceyrə tipinə və sayına təsir göstərir. İmmun İltihab Dis. 20175(1):85–94. https://doi.org/10.1002/iid3.144.

    Zhao X, Li L, Starr TK, Subramanian S. Şişin yeri kolon xərçənginin siçan modellərində immun reaksiyasına təsir göstərir. Oncotarget Impact J MMC. 20178:54775–87.

    Devaud C, Westwood JA, John LB, Flynn JK, Paquet-Fifield S, Duong CPM və s. Fərqli anatomik yerlərdə olan toxumalar müalicəyə reaksiyalara təsir etmək üçün şiş mikromühitini düzəldə və dəyişə bilər. Mol Ther. 201422:18–27 Təbiət Nəşriyyat Qrupu.

    Lu Y, Shiau F, Yi W, Lu S, Wu Q, Pearson JD və s. İnsan tor qişasının təkhüceyrəli analizi inkişafa nəzarət edən təkamüllə qorunan və növə xas mexanizmləri müəyyən edir. Dev Cell. 202053:473–491.e9 Cell Press.

    Stein-O'Brien GL, Clark BS, Sherman T, Zibetti C, Hu Q, Sealfon R, et al. Hüceyrə Ölçmələri, Platformalar, Toxumalar və Növlər arasında Transfer Öyrənilməsi üçün Hüceyrə Kimliyinin Parçalanması. Hüceyrə sistemi. 20198:395-411.e8 Cell Press.

    Efremova M, Vento-Tormo M, Teichmann SA, Vento-Tormo R. CellPhoneDB: çox alt birlikli liqand-reseptor komplekslərinin birləşmiş ifadəsindən hüceyrə-hüceyrə rabitəsini çıxarmaq. Nat Protoc. 202015(4):1484–506. https://doi.org/10.1038/s41596-020-0292-x Təbiət Araşdırmaları.

    Cherry C, Maestas DR, Han J, Andorko JI, Cahan P, Fertig EJ, et al. Biomaterialların cavabının tək hüceyrə atlasından hüceyrələrarası siqnal dinamikası. bioRxiv. 2020:2020.07.24.218537. https://doi.org/10.1101/2020.07.24.218537. Cold Spring Harbor Laboratoriyası.

    Browaeys R, Saelens W, Saeys Y. NicheNet: ligandları hədəf genlərə bağlayaraq hüceyrələrarası əlaqənin modelləşdirilməsi. Nat Metodları. 202017(2):159–62. https://doi.org/10.1038/s41592-019-0667-5 Təbiət Araşdırmaları.

    Giesen C, Wang HAO, Schapiro D, Zivanovic N, Jacobs A, Hattendorf B, et al. Kütləvi sitometriya ilə subcellular rezolyusiyaya malik şiş toxumalarının yüksək multipleksləşdirilmiş təsviri. Nat Metodları. 201411(4):417–22. https://doi.org/10.1038/nmeth.2869 Nature Publishing Group.

    Goltsev Y, Samusik N, Kennedy-Darling J, Bhate S, Hale M, Vazquez G, et al. CODEX multipleksləşdirilmiş təsviri ilə siçan dalaq arxitekturasının dərin profili. Hüceyrə. 2018174:968–981.e15 Cell Press.

    Marks V. İlin metodu: məkan baxımından həll edilmiş transkriptomika. Nat Metodları. 202118(1):9–14. https://doi.org/10.1038/s41592-020-01033-y Təbiət Araşdırmaları.

    Lipson EJ, Lilo MT, Ogurtsova A, Esandrio J, Xu H, Brothers P, et al. Bazal hüceyrəli karsinoma: PD-L1/PD-1 yoxlama nöqtəsinin ifadəsi və PD-1 blokadasından sonra şişin reqressiyası. J İmmun Digər Xərçəng. 20175:23 BioMed Central Ltd.

    Yanik EL, Kaunitz GJ, Cottrell TR, Succaria F, McMiller TL, Ascierto ML, et al. HİV statusunun anal skuamöz hüceyrəli karsinomaya yerli immun reaksiyası ilə birləşməsi: immunoterapiya üçün təsirlər. JAMA Oncol. 20173(7):974–8. https://doi.org/10.1001/jamaoncol.2017.0115 Amerika Tibb Assosiasiyası.

    Ho WJ, Yarchoan M, Charmsaz S, Munday RM, Danilova L, Sztein MB, et al. Çox panelli kütləvi sitometriya anti-PD-1 terapiyası vasitəsilə şişi drenaj edən limfa düyünlərində B və T hüceyrə bölməsinin yenidən qurulmasını aşkar edir. JCI Insight. 20205(2):e132286 Amerika Klinik Tədqiqat Cəmiyyəti.

    Hartmann FJ, Simonds EF, Bendall SC. Multipleksləşdirilmiş insan tək hüceyrə analizi üçün universal canlı hüceyrə barkod platforması. Sci Rep. 20188:10770 Nature Publishing Group.

    Chevrier S, Crowell HL, Zanotelli VRT, Engler S, Robinson MD, Bodenmiller B. Asma və görüntüləmə kütlə sitometriyasında siqnal yayılmasının kompensasiyası. Hüceyrə sistemi. 20186:612–620.e5 Cell Press.

    Patro R, Duggal G, Love MI, Irizarry RA, Kingsford C. Salmon transkript ifadəsinin sürətli və qərəzli kəmiyyətini təmin edir. Nat Metodları. 201714(4):417–9. https://doi.org/10.1038/nmeth.4197 Nature Publishing Group.

    Colaprico A, Silva TC, Olsen C, Garofano L, Cava C, Garolini D və s. TCGAbiolinks: TCGA məlumatlarının inteqrativ təhlili üçün R/Bioconductor paketi. Nuklein turşuları Res. 201644(8):e71. https://doi.org/10.1093/nar/gkv1507.

    Robins HS, Campregher PV, Srivastava SK, Wacher A, Turtle CJ, Kahsai O, et al. αβ T hüceyrələrində T-hüceyrə reseptorlarının β-zəncir müxtəlifliyinin hərtərəfli qiymətləndirilməsi. qan. 2009114:4099–107.

    Hopkins AC, Yarchoan M, Durham JN, Yusko EC, Rytlewski JA, Robins HS, et al. İmmunoterapiya ilə müalicə olunan pankreatik kanal adenokarsinomasında sağ qalma ilə əlaqəli T hüceyrə reseptor repertuarının xüsusiyyətləri. JCI Insight NLM (Medline). 20183(13):e122092

    Weber LM, Nowicka M, Soneson C, Robinson MD. diffcyt: Yüksək ayırdedici klasterləşdirmə vasitəsilə yüksək ölçülü sitometriyada diferensial kəşf. Kommun Biol. 2019:2:183 Springer Science and Business Media MMC.

    Van Gassen S, Callebaut B, Van Helden MJ, Lambrecht BN, Demeester P, Dhaene T, et al. FlowSOM: sitometriya məlumatlarının vizuallaşdırılması və şərhi üçün özünü təşkil edən xəritələrdən istifadə. Sitometriya A. 201587(7):636–45. https://doi.org/10.1002/cyto.a.22625.

    Becht E, McInnes L, Healy J, Dutertre CA, Kwok IWH, Ng LG, et al. UMAP istifadə edərək tək hüceyrəli məlumatların vizuallaşdırılması üçün ölçülərin azaldılması. Nat Biotexnol. 201937(1):38–47. https://doi.org/10.1038/nbt.4314 Nature Publishing Group.

    Robinson MD, Mccarthy DJ, Smyth GK. edgeR: rəqəmsal gen ifadə məlumatlarının diferensial ifadə analizi üçün biokeçirici paketi. Bioinforma Tətbiq Qeydi. 201026(1):139–40. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp616.

    Smyth GK, Smyth GK. Limma: mikroarray məlumatları üçün xətti modellər. In: Gentlem R, Carey V, Dudoit S, Irizarry R, ​​Huber W, redaktorlar. R və Bioconductor istifadə edərək bioinformatika və hesablama biologiyası həlləri, cild. 420.

    Love MI, Huber W, Anders S. DESeq2 ilə RNT seq məlumatları üçün qat dəyişikliyinin və dispersiyanın moderativ qiymətləndirilməsi. Genom Biol. 201415:550 BioMed Central.

    Ho W. Metastatik mədəaltı vəzi xərçənginin ağciyər və qaraciyər şişinin mikromühitlərinin multi-omic profili sahəyə xüsusi immun-tənzimləyici yolları aşkar edir [İnternet]. Github. 2021 Buradan əldə etmək olar: https://github.com/wonjho/KPC_Mets.

    Ho W. KPCMets_İmmun [İnternet]. Axın Repozitoriyası. 2021 Buradan əldə etmək olar: http://flowrepository.org/id/FR-FCM-Z3MW.

    Ho W. Metastatik mədəaltı vəzi xərçənginin ağciyər və qaraciyər şişinin mikromühitlərinin multi-omic profili sahəyə məxsus immun-tənzimləyici xüsusiyyətləri aşkar edir [İnternet]. Gene Expr. Omnibus. 2021. Buradan əldə etmək olar: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE172106.


    VERİLƏNİ ANLAMAQ

    Müasir maşın öyrənmə üsulları bu problemlərin həlli üçün zəmin yaradır, bizə mürəkkəb məlumat dəstlərini sadələşdirməyə və TME-nin reaksiya kinetikası və onun xəstəliyin inkişafı ilə əlaqəsi haqqında bioloji mənalı fərziyyələri müəyyən etməyə imkan verir (Şəkil 1). Nəzarətsiz maşın öyrənməsi və şəbəkə təhlili tədqiqatçıların yeni fərziyyələr yaratmaq üçün onları araşdıra bilməsi üçün bu məlumat dəstlərinin ölçülərini və mürəkkəbliyini azaltmaq üçün güclü vasitədir. Nəzarət edilən üsullar daha sonra yüksək ölçülü ölçmələri nəticələrin dəqiq proqnozlarına və ya xüsusi mexaniki fərziyyələrin kəskin sınaqlarına çevirmək üçün istifadə edilə bilər. Bununla belə, bu üsulların son faydası kritik olaraq onların məlumatlarının keyfiyyətindən və bütövlüyündən və istehsal etdikləri nümunələrin və proqnozların kliniki təsdiqindən asılıdır.

    Bu yaxınlarda elan edilən Şiş Profiler Araşdırması (1) TME-nin xəstəlikdəki rolu haqqında anlayışımızı inkişaf etdirmək üçün əhəmiyyətli potensiala malik bu istiqamətdə maraqlı yeni səydir. Onun dizaynının üç aspekti onu TME üçün nümunəvi tədqiqata çevirir: (i) böyük və müxtəlif əhali üçün ətraflı multiomik TME və kinetik məlumatlarla maşın öyrənmə metodlarının inteqrasiyası (ii) xərclərin, texniki ekspertizanın çevrilməsinin davamlı modelinin hazırlanması, analiz məhdudiyyətləri, məlumat platforması inteqrasiyası və tələb olunan infrastruktur və (iii) kompleks məlumat dəstləri vasitəsilə xəstə və şişə xas zəiflikləri, yəni dəqiq tibb müəyyən edərək klinik praktikanı dəyişdirmək üçün profilləşdirmə və maşın öyrənmə nəticələrindən istifadə.


    Başlıq

    Müəllif

    Buraxılış ili

    Sənəd növü

    Dərəcə

    Dərəcə Adı

    Diplomların verilməsi şöbəsi

    Biologiya (Hüceyrə Biologiyası, Mikrobiologiya, Molekulyar Biologiya)

    Baş Professor

    Komitə üzvü

    Komitə üzvü

    Komitə üzvü

    Açar sözlər

    3D, turşu, karbonik anhidraz IX, qlikoliz, pH, protonlar

    Mücərrəd

    Xərçəng mürəkkəb və heterojen bir xəstəlikdir. Fərqli xərçəng növləri arasında təkcə əhəmiyyətli dəyişkənlik deyil, eyni xərçəng növü olan xəstələr arasında və daxilində də böyük dəyişkənlik var. Şişlərin içərisində xərçəng hüceyrələri, stromal hüceyrələr və immun hüceyrələr də daxil olmaqla bir çox hüceyrə növü var. Şiş mikromühiti tez-tez sağlam hüceyrələri pro-tümorigen olmağa vadar edir. Hüceyrə metabolizması şiş mikromühitindəki dəyişikliklərə çox həssasdır və xərçəngin aqressivliyini müəyyən etmək və terapiyaya cavabı proqnozlaşdırmaq üçün ölçülə bilər. Bu dissertasiyada biz mikromühitin, xüsusilə aşağı pH-nın şişlər daxilində hüceyrə tiplərinin fenotipinə, metabolizminə və funksiyasına necə təsir etdiyini və nəticədə bunun metastaz və terapevtik nəticə ilə necə əlaqəli olduğunu başa düşməyi hədəfləyirik.

    Fəsil 2: Təəssüf ki, maddələr mübadiləsinin ölçülməsi çətindir, çünki metabolizm dinamikdir və istifadə etdiyimiz modellərdən asılı olaraq dəyişə bilər. Hazırkı tədqiqatlar xərçəngin 2D modellərindən, yəni düz, plastik qablarda və ya qablarda böyüdülmüş xərçəng hüceyrə xətlərindən istifadə edir. 2D mədəniyyətlər daha yüksək konsentrasiyalarda qida maddələrinə, dərmanlara məruz qalır və plastilə yapışdığına görə hüceyrə səthinin həcmi azalır, bu da yapışma zülallarının ifadəsinin dəyişməsinə səbəb olur. 2D modellər şişi in vivo dəqiqliklə əks etdirmir və bu, in vitro və in vivo nəticələr arasında uyğunsuzluqlarla nəticələnə bilər. 3D-də böyüyən xərçəng hüceyrə xətləri in vivo baş verənləri daha yaxşı əks etdirir. Biz 3D hüceyrə kulturalarının metabolik profilini çıxarmaq və onları birbaşa 2D hüceyrə mədəniyyətləri ilə müqayisə etmək üçün in vitro canlı hüceyrə alətləri və metodologiyası hazırladıq. Bundan istifadə edərək, metabolik inhibitorlara və kemoterapevtiklərə cavab olaraq 2D və 3D hüceyrə mədəniyyətlərinin bazal metabolizmində fərqləri müşahidə etdik. Siçan orqanlarından və şişlərindən yaranan 3D mikrotoxumaların profilini yaratmaq üçün bu metodologiyanı daha da genişləndirdik. Normal orqanlardan (ürək, böyrək) əldə edilən mikrotoxumaların metabolik profilləri eyni orqandan alınan mikrotoxumaları müqayisə edərkən ardıcıl idi. Ürək və böyrək mikrotoxumalarının kardio- və ya nefrotoksinlərlə müalicəsi toxuma mübadiləsinə erkən və nəzərəçarpacaq təsir göstərmişdir.

    Bunun əksinə olaraq, eyni şişlərin müxtəlif bölgələrindən əldə edilən mikrotoxumalar histologiya ilə əlaqəli əhəmiyyətli metabolik heterojenlik nümayiş etdirdi. Beləliklə, morfologiyanın və quruluşun maddələr mübadiləsinə təsirini başa düşmək üçün mürəkkəb mikrotoxumaların metabolik profili lazımdır. Bu metodun dərman toksikliyinin təkrarlana bilən, erkən və həssas ölçüsü və potensial dərman skrininq metodologiyası kimi istifadə olunmaq potensialı var. Bundan əlavə, bu metodologiya in vitro 2D tədqiqatları və in vivo heyvan tədqiqatları arasında eksperimental dizaynı təkmilləşdirmək üçün mühüm bir addımdır.

    Fəsil 3: Yeni metodologiyaların inkişafı və alətlərin inkişafı elmi tədqiqatda irəliləyişə səbəb ola bilər. Bizim metodumuz şiş daxilində tez-tez digər vasitələrlə əldən verilən metabolik heterojenliyi vurğulayır. Şişin heterojenliyinin hələ öyrənilməmiş komponentlərindən biri də kənar və nüvə arasındakı əsaslı fərqdir. Davam edən intratumoral təkamül eyni şişin müxtəlif bölgələrindən olan xərçəng hüceyrələri arasında molekulyar dəyişikliklərdə aydın görünür. Bununla belə, tək genetik məlumatlar ətraf mühitin seçmə qüvvələri və əsas Darvinin dinamikasını idarə edən hüceyrə fenotipik uyğunlaşmaları haqqında çox az məlumat verir. Biz üç spontan siçan xərçəngində (TRAMP və PTEN siçanlarında prostat xərçəngi, KPC siçanlarında mədəaltı vəzi xərçəngi) müşahidə etdik ki, mədəniyyətdə sabit qalan fərqli niş-konstruksiya adaptiv strategiyaları olan iki subpopulyasiya var. Bir populyasiya, şişlərin invaziv kənarında olan "pioner" fenotip dediyimiz şeydir. Pionerlər, tənzimlənən aerob qlikoliz və karbonik anhidraz -9 (CA-IX) kimi proton ixrac edən mexanizmlərin yüksəldilməsi yolu ilə asidik mühit yaradan invaziv hüceyrələrdir. Müşahidə olunan digər metabolik əhali "mühəndis" fenotipi dediyimiz şeydir.Mühəndislər şişlərin nüvəsində yerləşirlər, onlar qeyri-invazivdirlər və tənzimlənən angiogenezə malikdirlər. Bu mühəndis hüceyrələr oksidləşdirici maddələr mübadiləsinə daha çox güvənməklə metabolik olaraq normala yaxındır. İntratumoral təkamül, şişlərin müxtəlif bölgələrində fərqli fitness üstünlükləri olan hüceyrələr yaradan baş verir. Bu hüceyrələr məqsədyönlü şəkildə üstünlük verdiyi əraziyə, yəni kənar və nüvəyə miqrasiya edə bilər və ya təsadüfən orada sona çata bilər və bir dəfə orada, onların fenotipi dəyişən mikromühit şəraitinə məruz qaldıqda dəyişə bilər və ya sabitləşə bilər. Bizim hallarda, bu hüceyrələr bir çox nəsillər üçün becərildi və onların metabolik profilləri sabit idi, bu da seçilmiş fenotiplərin sabit olduğunu göstərir.

    TRAMP prostat xərçənglərində bu alt populyasiyaların Darvinist qarşılıqlı əlaqəsi araşdırılmışdır. Kompüter simulyasiyaları proqnozlaşdırıldı və təcrübələr təsdiq etdi ki, invaziv, turşu istehsal edən, proliferativ (C2) "pioner" hüceyrələri qeyri-invaziv, angiogenik, sakit (C3) "mühəndis" hüceyrələrə nisbətən fitness üstünlüyünü qoruyub saxlayır. Bu, çox güman ki, işğalı təşviq etməklə və immunitet reaksiyasını maneə törətməklə idarə olunur. Müalicə olunmamış şişlərin immunohistokimyəvi analizi təsdiqlədi ki, C2 hüceyrələri daim böyüyür və TRAMP prostat şişlərində C3 hüceyrələrindən daha çox olur. Bununla belə, C2 adaptiv strategiya fenotipi səmərəsiz enerji istehsalı (yəni, aerob qlikoliz) səbəbindən yüksək xərc tələb edir. Riyazi model simulyasiyaları mikro-mühit hüceyrədənkənar pH (pHe) kiçik pozğunluqlarının C2 strategiyasının xərc/fayda nisbətini dəyişdirə və C3 hüceyrələri üçün seçə biləcəyini proqnozlaşdırdı. Tampon terapiyasından istifadə edərək pH-ın dəyişdirilməsi, NaHCO3, TRAMP siçan modelində pH-ı artırdı və C2 üzərində C3 mühəndis hüceyrələrinin böyüməsini təşviq edərək, şişin aşağı dərəcəli qalmasına imkan verdi və qurulmuş şişləri müalicə edərkən metastazı azaldır. Ətraf mühit seçmə qüvvələrinin intratumoral Darvinist qarşılıqlı təsirlərinin və xərçəng hüceyrələrinə uyğunlaşma strategiyalarının riyazi modelləri göstərdi ki, şiş trayektoriyası pH-ın dəyişdirilməsi kimi kiçik, lakin seçici bioloji qüvvələrin tətbiqi ilə daha az invaziv yola yönəldilmişdir.

    Şişlərin invaziv kənarlarında tapılan pioner hüceyrələr yüksək qlikolitik metabolizmə malik olurlar və asidik mikromühit yaradırlar. Bu hüceyrələr yerli işğal və xərçəngin inkişafı üçün lazımdır. Buna görə də, bu turşu mikromühitin şişin digər komponentlərinə təsirini görmək maraqlı idi. Biz glikolitik metabolizmin və aşağı pH-nın şişin üç komponentinə necə təsir etdiyini öyrəndik: stroma, immun bölmə və xərçəng hüceyrələrinin özləri.

    Xərçəngin glikolitik metabolizması hüceyrənin normal böyüməsi üçün lazım olan həyati vacib qidaları birləşdirir və bu, ətrafdakı hüceyrə növlərini yanacaq üçün digər metabolitlərdən istifadə etməyə məcbur edir. Bunun baş verdiyi sahələrdən biri sümük metastazlarıdır. Sümük stroması və xərçəng hüceyrələri arasında metabolik qarşılıqlı əlaqənin metastazları gücləndirdiyini müəyyən etdik. Tədqiqatımızda qeyri-metastatik MCF7 hüceyrələri ilə müqayisədə yüksək qlikolitik üçlü mənfi MDA-MB-231 xərçəng hüceyrələrinin daha çox laktat buraxdığını və in vivo olaraq osteolitik sümük metastazı meydana gətirdiyini nümayiş etdirdik. In vitro, xərçəng hüceyrələri tərəfindən yaradılan laktatın osteoklastlar tərəfindən oksidləşdirici metabolizm üçün yanacaq kimi istehlak edildiyi və nəticədə sümükdə Tip I kollagenin rezorbsiyasını artırdığı göstərildi. Laktatın osteoklastlara daşınması, osteoklastların differensasiyası zamanı əhəmiyyətli dərəcədə tənzimlənən ifadə ilə və MCT-1 inhibitoru, 7-(N-benzil-N-metilamino)-2-okso-2H-xromen- istifadə edərək göstərildiyi kimi MCT1 tərəfindən vasitəçilik edilmişdir. Osteoklastlarda I tip kollagen rezorbsiyasını pozan 3-karboksilik turşu. Birlikdə, bu məlumatlar göstərir ki, sümük mikromühitində qlikolitik məmə xərçəngi hüceyrələri tərəfindən buraxılan laktat osteolitik lezyonların meydana gəlməsini təşviq edir və sümük metastazları olan xəstələrdə MCT1 inhibitorlarının yeni bir terapevtik yanaşma kimi istifadə edilməsi üçün əsas verir.

    Bundan əlavə, xəstələrdə sümük metastazının ümumi simptomlarından biri ağrıdır (xərçəngin səbəb olduğu sümük ağrısı - CIBP). Sümük metastatik xərçəng hüceyrələrinin yüksək laktat səviyyələri və asidik mikromühit yaradan yüksək qlikolitik olduğunu göstərdik. Biz şiş mikromühitindəki turşunun CIBP-nin səbəbi ola biləcəyini irəli sürdük ki, bu da əlavə araşdırma tələb etdi. Sümüyə metastatik bir sahə kimi üstünlük verən döş xərçəngi hüceyrələrinin çox yüksək hüceyrədənkənar proton axını və turşu-əsas balansı (MCT4, CA9 və V-ATPase) ilə əlaqəli pompalar/ion daşıyıcıları olduğunu aşkar etdik. Asidoz sümükdəki nosiseptorları stimullaşdıra və həssaslaşdıra bilər və hiperaljeziya ilə nəticələnə bilər. Xərçənglə əlaqəli fibroblastların, mezenximal kök hüceyrələrin və osteoblastların asidik pH-a məruz qalması iltihablı və nosiseptiv vasitəçilərin (NGF, BDNF, IL6, IL8, IL1b və CCL5) ifadəsini artırdı. Bundan əlavə, sümük metastazları modellərində V-ATPase hədəfləmə vasitəsilə intratumoral turşulaşmanın pozulması CIBP-ni əhəmiyyətli dərəcədə azaldır. CIBP olan xəstələr üçün mövcud müalicələr çox vaxt səmərəsiz olur, lakin bizim in vivo nəticələrimiz klinik olaraq potensial yeni müalicə prospektini təmin edən xəstələrlə əlaqələndirilir. Anketlə ölçülən xəstələrdə ağrı, iltihab və nosiseptiv vasitəçilərin istehsalının daha yüksək səviyyələri ilə əlaqələndirilir, məs. Stromal hüceyrələr tərəfindən IL6 və IL8, şiş mikromühitlərinin pro-şiş stromasını meydana gətirdiyini göstərir. Xüsusilə, bir klinik sınaq (NCT01350583) sümük ağrısını azaltmaq üçün köməkçi olaraq Na-bikarbonatın (pH yüksəltmək üçün) I faza sınaqında 9 xəstəni müalicə etdi. Tədqiqat genişlənməsə də, xəstənin bildirdiyi CIBP-də əhəmiyyətli bir azalma oldu. Xülasə, sümük iliyində intratumoral turşulaşma CIBP-ni təşviq edən şişlə əlaqəli stromanı aktivləşdirə bilər və bu tapıntı inkişaf etmiş xərçəngdə palliativ müalicələr üçün yeni bir hədəf təklif edir.

    Fəsil 4: İmmun hüceyrələr şiş hüceyrələrinin yaratdığı stresli mikromühit şəraitinə məruz qalan şişin başqa bir komponentidir. Tədqiqatlarımızda diqqətimizi immun sisteminin effektor T hüceyrələrinə, yəni qranzim B-nin sərbəst buraxılması vasitəsilə şiş hüceyrələrini öldürmə potensialına malik olan CD8+ limfositlərinə yönəltmişik. CD8+ T hüceyrələri normal şəraitdə effektiv ömrü azaldan nəzarət nöqtəsi inhibitor zülallarının ifadəsi ilə tənzimlənir. və ya T hüceyrələrinin fəaliyyətinin qarşısını alır. Yoxlama nöqtəsi blokadası inhibitorları kimi immunoterapiya T hüceyrələrinin davamlılığını artırır və bir çox xəstələrdə davamlı reaksiyalara səbəb olur. Bununla belə, bir çox şiş növləri və bir çox xəstələr minimal reaksiya göstərmiş və ya heç bir reaksiya göstərməmişdir və bunun səbəbi bilinmir. Müzakirə etdiyimiz kimi, aqressiv şişlər tez-tez turşudur və biz aşağı pH-nın həm xərçəng hüceyrələrinə, həm də stromaya təsirini görmüşük. Bununla belə, turşunun T hüceyrələrinə təsiri aydın deyil. Buna görə turşuluğun T hüceyrə funksiyasına təsirini başa düşməyi hədəflədik. Biz tapdıq ki, aktivləşdirilmiş siçan T hüceyrələri əsasən qlikolitik metabolizmə əsaslanır, effektor funksiyasını azaldır və aşağı pH şəraitində qlikolizi azaldır. Xüsusilə, turşu hüceyrədaxili laktatı artıran və hüceyrədaxili pH-ı azaldan laktatın hüceyrədən xaricə daşınmasının qarşısını alaraq qlikolizi inhibə edir, nəticədə qlikolizin aşağı tənzimlənməsi ilə nəticələnir. Tampon terapiyasından istifadə edərək bərk şişlərin pH-nın dəyişdirilməsi immunoterapiyaların effektivliyini artırdı. Bu tapıntılar göstərdi ki, bərk şişlərdə turşuluq immunoterapiyaya cavab vermək üçün vacib olan T hüceyrə effektor funksiyasını maneə törədir. İntratumoral asidozun azaldılması ilə biz şişlərdə və indiyədək az fayda görmüş xəstələrdə immunoterapiya reaksiyasını yaxşılaşdıra bilərik.

    Fəsil 5: Tədqiqatlarımızda biz aşağı pH-ın xərçəng hüceyrələrinin yüksək qlikolitik metabolizmi ilə yarandığını fərz edirik. Bununla belə, karbonik anhidraz IX kimi hüceyrə turşusunun ixracında iştirak edən zülalların ifadəsi tez-tez invaziv kənarlardakı pioner hüceyrələr kimi yüksək səviyyəli qlikoliz nümayiş etdirən hüceyrələrdə eyni vaxtda ifadə edilir. Turşu ixracı qlükozanın alınmasına və metabolizminə səbəb olarsa nə olar? Əvvəlki iş şiş turşuluğunu artan invazyon və metastaz ilə güclü şəkildə əlaqələndirir və şiş turşuluğunun neytrallaşdırılması bir çox sistemdə metastazların meydana gəlməsinin qarşısını ala bilər. Bununla belə, korrelyasiya səbəb-nəticə deyil. Biz asidozun plazma membranı proton ixracatçılarının ifadəsi ilə turşu istehsalının induksiyası ilə sistemli şəkildə metastaza səbəb ola biləcəyi fərziyyəsini sınaqdan keçirdik. Metabolik turşu istehsalından asılı olmayaraq turşu istehsalını yaratmaq üçün iki "funksiya qazanma" sistemi hazırladıq. Maya proton nasosunu, H-ATPase (PMA1) və ya proton ixrac edən ekzofasial insan karbonik anhidrazı 9 (CA-IX) həddindən artıq ifadə edərək turşu istehsal edən hüceyrələri hazırladıq. In vitro tədqiqatlar hər iki proton ixracatçısının metastatik olmayan insan xərçəngi hüceyrə xəttlərində ifadəsini göstərdi, aerob qlikoliz, miqrasiya və işğalı artırdı. In vivo, turşu istehsal edən hüceyrələr artan kortəbii və eksperimental metastazlarla əlaqəli daha yüksək dərəcəli şişlər meydana gətirdi. Tampon terapiyası ilə turşuluğun neytrallaşdırılması metastazı azaldır. Buna görə də, H + ixracının artan nisbətləri aerob qlikolizin artmasına səbəb ola bilər (Varburq effekti) və metastatik olmayan hüceyrələri geniş metastaz əmələ gətirənlərə çevirə bilər. Beləliklə, biz təklif edirik ki, metastazla əlaqəli dəyişənlər turşu istehsalının artması ilə aktivləşdirilə və gücləndirilə bilər və beləliklə, asidoz metastazın sistemli səbəbidir.

    Bütövlükdə, aşağı pH-ın şişlərdə çoxlu müxtəlif hüceyrə növlərinə təsirini, bunun onların funksiyasına necə təsir etdiyini və xərçəngin aqressivliyi və müalicəyə cavab reaksiyasını başa düşə bildik.


    Videoya baxın: Uşaqlarda beyin şişləri haqqında məlumat. (Sentyabr 2022).


Şərhlər:

  1. Leicester

    Məncə, onlar yanılırlar. Mən bunu sübut etməyə qadirəm. Mənə PM-də yazın, müzakirə edin.

  2. Ner

    Mesaj çıxarılır

  3. Fontaine

    I congratulate, the brilliant thought

  4. Vincent

    Tamamilə sizinlə razıdır. Idea good, it agree with you.

  5. Mejora

    Çox yaxşı cümləniniz olmadan nə edəcəyik

  6. Keaton

    Digər çatışmazlıqlar da var

  7. Byreleah

    Dəstək üçün sizə təşəkkür etmək üçün forumda xüsusi olaraq qeydiyyatdan keçdi.



Mesaj yazmaq